MYCOLOGIE MEDICALE

Dr Alexandre EXISTE, MD, MSc, MGP

 Documents de Référence
• Anofel / Association des enseignants français
de Parasitologie et Mycologie Médicales.
Editions 2016.
• Mycologie Médicale par Olivier
LORTHOLARY/Editions Flammarion 2013.
• Medical Mycology par les presses de Chicago
University, Oct 2012.
• www.nlm.nih.gov/Health Information.
 Définition
• Mycologie: Branche des sciences biologiques
étudiant les mycoses.
• Mycose: infection provoquée par
développement chez un vivant de
champignons microscopiques ou
micromycètes.
 Micromycètes
• Très répandus et nombreux dans la nature
(plus de 100.000 espèces décrites). Quelques
centaines potentiellement pathogènes pour
l’homme ou l’animal.
• Eucaryotes, i.e des organismes faits de cellules
avec des noyaux bien définis.
 Micromycètes
• Se distinguent de bactéries et actinomycètes
(procaryotes), des végétaux (absence de
racine et de tige), et des algues (absence de
chlorophylle).
• Sont hétérotrophes, i.e. nécessitent matière
carbonée préformée.
 Micromycètes

• Vivent en saprophytes ou en commensaux,

parfois en symbiotes ou en parasites.
• Habitat le plus courant: le sol.
 Reproduction. Classification
• Deux modalités de reproduction connues :
- l’une dite imparfaite, par des spores asexuées.
- l’autre par des spores sexuées, dite parfaite.
 Reproduction. Classification 2
• Parfois, forme parfaite et forme imparfaite
portent deux appellations différentes.
Ex : Cryptococcus neoformans et Filobasidiella
neoformans.
• De type sexué ou asexué, formes de
reproduction des mycètes: base de leur
classification.
 Classification Pratique
• Champignons lévuriformes et champignons
filamenteux.
• Ensemble des composants d’un champignon:
thalle.
 Champignons filamenteux
Thalle formé d’un système de filaments plus
ou moins ramifiés. Est constitué d’hyphes
(filaments en forme de tubules) cloisonnées
ou non, le mycélium.
 Champignons Lévuriformes
• Thalle formé d’un ensemble d’éléments
unicellulaires, les levures.
• Levures sont arrondies ou ovalaires.
• Se reproduisent par bourgeonnement.
• Dans des situations particulières peuvent
donner naissance à un filament mycélien.
Aspect de levures à la coloration de Gram, on
peut visualiser les parois (translucides) qui
entourent les cellules.
Le bourgeonnement
 Mycètes Dimorphiques
• Comme Histoplasma capsulatum, se
présentent:
- dans le sol et in vitro sous certaines conditions
de température (25-30oC) sous forme
filamenteuse,
- et à l’état parasitaire in vivo, comme in vitro
dans des conditions particulières de culture à
37oC, sous forme de levure.
Désignation des maladies mycosiques
Le Nom dérive :
• le plus souvent, du nom du champignon
responsable:
- Aspergillus : aspergillose, Candida : candidose,
- Cryptocoque : cryptococcose,
- Histoplasme : histoplasmose,
- Dermatophyte : dermatophytie…
Désignation des maladies fongiques 2
• Parfois de la partie du corps envahie par le
micromycète parasite:
- Peau : dermatomycose,
- Ongle : onychomycose,
- Oreille : otomycose…,
 Désignation des maladies mycosiques 3

• Parfois encore du langage vernaculaire ou

médical selon origine géographique du patient
ou localisation de la lésion:
- Muguet : atteinte muqueuse buccale par
Candida ;
- Favus : teigne à Trichophyton schoenleinii ;
 Désignation des maladies mycosiques 4

- Pied d’athlète : mycose des pieds liée aux

dermatophytes ;
- Pied de Madura : mycétomes fongiques ou
actinomycosiques.
Habitat des champignons pathogènes
> Excepté certains dermatophytes parasites
adaptés, la plupart champignons pathogènes
peuvent encore libres.
- D’où sources d’infestation diverses:
. Terre, air, végétaux d’une part,
. D’autre part, homme et animaux malades ou
porteurs asymptomatiques.
 Vie saprophytique des champignons
4 groupes de mycètes:
- Exosaprophytes:
• de loin les plus nombreux. Bcp d’espèces dans
la terre, svt en relation avec plantes. Certains
fréquemment pathogènes :
> Dermatophytes telluriques,
Microsporum gypseum, Trichophyton
mentagrophytes…,
 Exosaprophytes 2
• Champignons dimorphiques :
- H. capsulatum,
- Coccidioides immitis,
- Sporothrix schenckii…,
- Agents des chromomycoses et des
blastomycoses américaines.
- Agents de mycétomes comme
Madurella mycetomatis, Leptosphaeria
senegalensis…
 Exosaprophytes 3
• D’autres sont pathogènes occasionnels,
« opportunistes » ou facultatifs comme:
Aspergillaceae, les champignons à paroi claire
(Fusarium, Scedosporium, Scopulariopsis…)
ou les dématiés « champignons noirs »
(Alternaria, Cladosporium, Exophiala…)
 Endosaprophytes
• Vivent dans cavités naturelles de l’animal ou
de l’homme.
- Ex: Candida albicans,
Candida (Torulopsis) glabrata.
 Endo-exosaprophytes
Se développent soit dans milieu extérieur, soit
dans cavités naturelles de l’animal ou de
l’homme.
Ex: Cryptococcus neoformans. Vit aussi bien
dans jabot des pigeons, dans leurs fientes et
dans différentes substances sucrées.
 Endo-exosaprophytes 2
• Cas aussi de:
- C. tropicalis,
- C. pseudotropicalis,
- C. krusei…,
- des champignons arthrosporés comme
Geotricum candidum. Saprophytes facultatifs
de l’homme et de l’animal se développant
aussi dans terre, fruits, céréales.
 Episaprophytes
Champignons se rencontrant avec une grande
constance sans provoquer de lésions à la
surface du tégument.
Le plus typique chez l’homme est:
- Malassesia furfur rencontré sur près de 100%
des hommes.
Prolifération à l’origine de lésions chez
certains sujets : pityriasis versicolor, pityriasis
capitis.
 Vie parasitaire aux dépens de l’homme
Certains champignons parasitent l’homme.
Espèces anthropophiles strictes, de
contamination inter-humaine.
- Cas des dermatophytes définitivement adaptés
à la kératine humaine.
- Microsporum langeronii, Trichophyton
violaceum et Trichophyton soudanense sont
agents des principales teignes humaines.
 Vie parasitaire aux dépens de
l’homme 2
- Trichophyton rubrum (anthropophile strict),
responsable de la plupart des intertrigos des
pieds, est aujourd’hui le plus répandu des
dermatophytes.
• Dans ces cas, l’homme est le contaminateur
disséminant spores et filaments de ces
champignons responsables de mycoses.
 Vie parasitaire aux dépens de
l’homme 3
Espèces strictement humaines vivent sur le sol
grâce à des substrats nutritifs d’origine
humaine (cheveux, fragments d’ongles,
squames…) tombés à terre.
Contamination au contact du sol, des douches
familiales ou collectives, des plages, des
piscines et provoquant intertrigos interdigito-
plantaires, onyxis du pied.
 Etats pathologiques dus aux
champignons
Trois types :
1o) Intoxications : par ingestion de toxine de
champignons vénéneux (amanites phalloïdes…)
2o) Mycotoxinoses : dues à toxines élaborées par
des micromycètes développés sur des aliments.
Ex : - aflatoxine d’Aspergillus flavus probablement
responsable de cancer primitif du foie en Afrique
noire;
Etats pathologiques dus aux champignons

- ergot, forme de résistance de Claviceps

purpurea, responsable du « feu de St-
Antoine » au Moyen-Age.
. Intoxications et mycotoxinoses ne sont pas des
mycoses car ne sont ni infectieuses ni
contagieuses.
Etats pathologiques dus aux champignons

3o) Mycoses :
Conséquence du parasitisme de la peau, des
muqueuses, des viscères, du système nerveux
central, du systeme squelettique… par les
micromycètes. Sont infectieuses, souvent
contagieuses.
 Facteurs favorisant les mycoses
• Deux types:
- Intrinsèques
. Physiologiques:
Nouveau-né comme sujet âgé porteur de
prothèses dentaires très vulnérables à
candidose buccale.
Candidose vaginale 3 à 4 fois plus fréquente
chez femme enceinte au 3e trimestre.
Facteurs favorisant les mycoses 2
Hommes particulièrement touchés par:
. histoplasmose africaine,
. blastomycose,
. Mycétome.
Dus aux professions ou au mode de vie des
sujets et régions concernés.
 Pathologiques
Maladie sous-jacente favorise et permet
développement de mycose latente.
Ex: Candidose oropharyngée (muguet)
souvent révélatrice du SIDA.
Cryptococcose complique parfois l’évolution
de cette affection.
 Pathologiques 2
- Candidose à répétition peut révéler diabète.
- Aspergillose se développe sur lésions
bronchiques préexistantes ou chez IDs.
- Facteurs locaux comme hyperhydrose,
macération, attrition des tissus favorisent
installation d’une mycose.
Facteurs extrinsèques et iatrogènes
- Antibiothérapie antibactérienne peut
favoriser développement candidose digestive.
- Traitement immunosuppresseur
(antimitotique, corticoïde) à l’origine de
. candidose,
. cryptococcose,
. aspergillose,
. ou mucormycose.
Facteurs extrinsèques et iatrogènes 2
- Aplasie médullaire, réalisée pour greffe de
moelle, peut se compliquer d’aspergillose
pulmonaire invasive.
- Rôle des cathéters veineux ou artériels dans
candidoses à C. parapsilopsis, malasseziose.
- Chirurgie digestive favorise diffusion de C.
albicans.
Facteurs extrinsèques et iatrogènes 3
• Brûlures étendues peuvent se compliquer
d’aspergillose.
• Chirurgies cardiaques ou de transplantation
présentent risques fongiques majeurs.
• Mycoses de plus en plus fréquentes parmi
maladies nosocomiales dont candidoses et
aspergilloses sont les plus nombreuses.
Diagnostic de ces affections difficile à établir.
Facteurs extrinsèques et iatrogènes 4

• Humidité liée à certaines conditions de

travail,
comme buanderie, confiserie, piscine,
nécessite hygiène particulière
pour prévenir développement de mycoses.
Facteurs extrinsèques et iatrogènes 5
• Rôle important de vêtements et chaussures.
Textiles synthétiques, hydrophobes,
- provoquent gonflement de la couche cornée
et alcalinisation facilitant grandement
pénétration des dermatophytes.
- Candida albicans préfère, au contraire, un
milieu acide.
 Sources de contamination
Environnement (sol, végétaux), humain ou
animal.
• A partir de l’environnement.
- Un grand nombre de champignons
contaminent l’homme à partir du milieu
extérieur.
- Risques différents selon origine
géographique ou séjours effectués.
 Sources de contamination 2
• Dermatophytes géophiles peuvent pénétrer
tégument à la faveur d’une abrasion
superficielle.
• Inoculation par écharde fréquente dans
sporotrichoses, chromomycoses et
maduromycoses.
 Sources de contamination 3
• Contamination aérienne habituelle
dans histoplasmose, coccidioïdomycose,
aspergillose.
Ces mycoses sont caractérisées par l’absence
de contagiosité interhumaine.
A partir d’un homme ou d’un animal
Champignons anthropophiles se transmettent
par contagion interhumaine.
- Infestation du nouveau-né par Candida
albicans généralement par la mère au
moment du passage vaginal.
- Inversement, nourrisson peut contaminer
mamelon de la nourrice si atteint de
candidose buccale.
A partir d’un homme ou d’un animal 2
- Candidose génitale peut être une mst.
- Teignes scolaires sont de contagion assez facile.
- Favus (T. schoenleinii) nécessite pour sa
transmission long temps de contact,
généralement dans le milieu familial.
- Espèces responsables des mycoses animales
s’attrapent directement des animaux
domestiques ou sauvages, ou indirectement.
 Voies d’entrée dans l’organisme
Sont très diverses:
• Voie cutanée ou transcutanée
Fréquente dans dermatophyties, levuroses, plus
rares dans d’autres mycoses comme les
mycétomes.
• Voie muqueuse
Aussi très répandue (Candida, Aspergillus).
Voies d’entrée dans l’organisme 2
• Voie pulmonaire
Spores de cert champignons pathogènes sont
inhalées.
Primo-invasion souvent pulmonaire dans:
- aspergillose,
- histoplasmose,
- cryptococcose…
Voies d’entrée dans l’organisme 3
• Voie digestive
Effraction muqueuse digestive favorise
dissémination lymphatique ou hématogène de
certaines espèces comme:
- Candida albicans,
- Geotrichum candidum,…
• Voie péritonéale.
Dialyse péritonéale peut être à l’origine d’une
infestation par champignon opportuniste.
 Voies d’entrée dans l’organisme 4
• Voie sanguine
- Complication iatrogène. Se produit lors de
mise en place de cathéter.
- A l’origine de foyers candidosiques profonds
dus à C. krusei, C. parapsilosis, C. tropicalis, C.
glabrata,
Agents fréquents de septicémies
nosocomiales.
 Dissémination
• Champignons pathogènes se disséminent à la
surface ou dans l’organisme par différents
mécanismes.
Certaines mycoses sont souvent plurifocales.
• Autocontamination.
Dans candidoses, à partir de lésions buccales
ou génitales, ongles servent souvent d’agents
d’auto-contamination.
 Dissémination
• Contigüité
Cas des candidoses qui se propagent dans
tube digestif, à partir de cavité buccale, ou
dans appareil génital féminin.
• Voie hématogène ou lymphatique
Est responsable de foyers métastatiques:
Candidoses, cryptococcoses, aspergilloses, … .
 REPONSES TISSULAIRES DE L’ORGANISME A
L’AGRESSION MYCOSIQUE
• Mycoses superficielles tant que limitées à
couche cornée (Pytiriasis versicolor,
dermatophyties)
ou à surface des muqueuses (candidoses),
ne sollicitent pas le mésenchyme
et présentent peu de réaction cellulaire.
 REPONSES TISSULAIRES DE L’ORGANISME A
L’AGRESSION MYCOSIQUE 2

• En revanche, mycoses tissulaires entraînent

phénomènes inflammatoires classiques, avec
réactions élémentaires habituelles :
- vasculaires,
- suppurées,
- granulomateuses,
- nécrosantes,
- ou fibreuses.
REPONSES TISSULAIRES DE L’ORGANISME
A L’AGRESSION MYCOSIQUE 3
• Néanmoins, un agencement caractéristique
oriente le diagnostic :
- le nodule mycosique.
- Comporte 3 couches concentriques autour
d’une plage centrale.
REPONSES TISSULAIRES DE L’ORGANISME
A L’AGRESSION MYCOSIQUE 4
Structure « en cocarde », comportant :
- un noyau purulent (zone des polynucléaires),
- une couronne d’histiocytes et de macrophages
(zone histiocytaire),
- un granulome polymorphe (zone
granulomateuse),
- une fibrose périphérique (zone fibreuse).
 Caractères Généraux d’une Mycose
• Un même champignon peut être à l’origine de
plusieurs localisations chez l’homme avec des
syndromes cliniques très divers.
• Aspergillus fumigatus de même que plusieurs
autres champignons peuvt être à l’origine :
- d’une lésion cutanée,
- d’une lésion pulmonaire,
- d’une septicémie avec localisation viscérale
profonde,
Caractères Généraux d’une Mycose 2
- d’une otite,
- d’une sinusite,
- d’une réaction allergique ou atopique.
Un champignon peut églt entraîner une
mycétide, lésion cutanée non fertile, donnant
prélèvements négatifs, réaction allergique à
distance d’un foyer mycosique superf ou prfd.
Disparaît avec foyer de genèse. Traitement
intertrigo pieds peut guérir dyshidrose mains.
Caractères Généraux d’une Mycose 3
• Mycoses viscérales profondes sont
caractérisées par une période prépatente
- très longue,
- souvent silencieuse cliniquement et
biologiquement.
- Quand les lésions se manifestent, elles sont
dans la majeure partie des cas indolores.
- Sont des affections essentiellement
chroniques.
Caractères Généraux d’une Mycose 4
• Formes septicémiques disséminées peuvent
donner signes généraux intenses et nécessiter
une thérapeutique d’urgence.
• Diagnostic doit reposer sur des éléments de
certitude :
• mise en évidence du pathogène à l’examen
direct et/ou histo-pathologique à partir
prélèvements effectués dans des conditions
parfaitement définies.
Caractères Généraux d’une Mycose 5
• Détermination espèce en cause par cultures à
des températures adéquates.
• Arguments sérologiques sont parfois utiles et
peuvent intervenir dans le diagnostic.
• Ces derniers devront toujours être confrontés
aux données cliniques et radiologiques.
 MODALITES DE PRELEVEMENTS
Diagnostic biologique affections mycosiques
repose sur qualité des prélèvements.
Aussi, est-il recommandé de:
- laisser le biologiste effectuer les
prélèvements de peau et des phanères
- ne pas envoyer au labo malades sous Rxt
antifg.
Recherche par examen direct et culture sur
milieu de Sabouraud.