TRAVAUX DIRIGES SPECIAUX DE L’UE BIOS 3086

Année académique 2021/2022

FICHE DE TD N°1 :

I- EVALUATION DES RESSOURCES

1- Définition des thèmes et expression

Nucléotide, nucléoside, ADN, ARN, réplication, plasmide, génome, gène, biologie moléculaire,
nucléoïde, traduction ; transcription, épissage ; réplisome, chromosome, codon, réparation de
l’ADN, ADN polymérase,

2- Questions à réponses courtes

A- Combien de base azotée existe-t-il ? classer les en deux groupes suivant leur
configuration de base, faire une représentation de la structure de chacune de ces bases
azotées et attribuer une nomenclature chimique à chacune d’elle.
B- Comparaison entre nucléotide et nucléoside
C- Citer les différents nucléosides et les nucléotides correspondants.
D- Comment se fait l’hybridation des nucléotides
E- Dans un tableau, établir une comparaison entre l’ADN et l’ARN
F- Quel est le type de liaison qui lie les nucléotides d’un brin d’ADN ? et celle qui lie
les deux brins d’ADN
G- Pourquoi dit-on que la molécule d’ADN est antiparallèle ?
H- Expliquer le modèle semi conservatif de la réplication de l’ADN
I- À quel moment de la cellule le chromosome est-il visible ?
J- Donner la configuration d’un chromosome bactérien
K- Citer 3 techniques permettant d’explorer les différentes formes que peuvent prendre
les chromosomes bactériens
L- Donner la formule chimique de l’ATP
M- Classifier ces bases en fonction de leur structure de base et donner les structures chimiques
des différentes bases azotées.
N- Ecrire la structure d'un nucléoside 3' monophosphate
3- Questions à choix multiples

QUESTION 1. Parmi les propositions suivantes, choisir celle qui ne correspond pas à
des nucléosides de l'ADN- cocher une seule réponse

A) Guanosine B) Thymidines C) Adénosine D) Cytosine

QUESTION 2. Parmi les propriétés de l'ADN, choisir la proposition fausse : - cocher

une seule réponse -

A) La forme prépondérante de l'ADN dans les cellules est la double

hélice droite

B) Dans sa configuration ADN-B, il y a environ 10 paires de bases

par tour d'hélice

C) L'hélice se forme grâce à un appariement spécifique base purique

base pyrimidique

D) Les bases puriques et pyrimidiques sont parallèles à l'axe de l'hélice

E) L'extrémité 3' d'une chaîne polynucléotidique est terminée par un

groupement hydroxyle

QUESTION 3. Parmi les propositions suivantes relatives à la structure de l'ADN,

laquelle est fausse ? - cocher une seule réponse -

A) L'ADN est riche en charges électriques négatives

B) L'ADN génomique est constitué de l'assemblage de deux chaînes

polynucléotidiques

C) L'ADN adopte une structure en double hélice

D) Le pas de l'hélice -forme B- est d'environ 34 nanomètres

E) L'unité de base d'un brin d'ADN est représentée par un nucléotide

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QUESTION 4. Parmi les informations suivantes relatives aux purines, indiquer
l'information exacte - cocher une seule réponse

A) L'hypoxanthine est une base naturelle des acides nucléiques

B) La liaison des purines avec le pentose d'un nucléotide s'effectue au

niveau de l'atome d'azote 9 du cycle purine

C) L'adénine possède un substituant amine secondaire

D) Le noyau purine est un hétérocycle à neuf carbones

E) Il existe deux bases puriques dans l'ADN et trois bases puriques

dans l'ARN

QUESTION 5. Choisir l'information fausse relative aux nucléosides cocher une seule
réponse -

A) Dans le cas de nucléosides dérivés de bases puriques, l’atome 1’ du

pentose est lié avec l’atome N9 de la base azotée

B) Un nucléoside est une structure formée par l’association entre une

base azotée et un sucre

C) Dans le cas de nucléosides dérivés de bases pyrimidiques, l’atome

1’ du pentose est lié avec l’atome N1 de la base azotée

D) Un nucléoside contient une liaison Béta-N-glycosidique

E) L’appellation des nucléosides dérivés des bases pyrimidiques se

termine par -osine

QUESTION 6. Choisir l'information fausse concernant les bases pyrimidiques et

puriques des acides nucléiques - cocher une seule réponse -

A) Elles absorbent fortement à la longueur d'onde 260 nm qu'a la

longueur 280 nm

B) Présentent des dérivés méthylés

C) Elles sont dépourvues de liaisons N-H

D) Le noyau purine est présent dans l'adénine et la guanine

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E) Le noyau pyrimidine est présent dans l'uracile, la thymine et la
cytosine

QUESTION 7 Choisir l'information fausse concernant les nucléosides : cocher une

seule réponse

A) Les nucléosides avec une base purique sont : l'adénosine et la

guanosine

B) Possèdent une base purique ou pyrimidique

C) Les nucléosides avec une base pyrimidique sont : l'uridine, la

cytidine et la thymidine

D) La liaison base-ose est généralement alpha N-osidique

E) Possèdent un sucre, le ribose ou le 2'-désoxy-ribose

QUESTION 8. Choisir l'information fausse concernant les nucléotides cocher une

seule réponse -

A) Dans l'adénosine 5'-triphosphate, il existe des liaisons esters

phosphoriques de type : [=PO-O-PO=]

B) Les nucléotides résultent de la formation d'une liaison ester entre

l'ose du nucléoside et l'acide phosphorique

C) Ils possèdent : une base -purique ou pyrimidique-, un ose et de

l'acide phosphorique

D) Les nucléosides après phosphorylation -généralement en -5' de l'ose

sont transformés en nucléotides correspondants

E) A pH neutre -pH = 7-, les groupements phosphates des nucléotides

sont ionisés et présentent des charges électriques négatives

QUESTION 9. Choisir l'information correcte concernant le sucre des nucléosides : -

cocher une seule réponse -

A) Le sucre est en conformation alpha

B) Le sucre est un cétohexose

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 C) Le sucre des nucléosides est porteur d’au moins une fonction
hydroxyle

D) Le sucre est le L-ribose pour l’ARN et le L-désoxyribose pour

l’ADN

E) Les atomes de carbone des sucres sont numérotés de 1’ à 6’

QUESTION 10. Choisir l'information fausse concernant le tétranucléotide (à

désoxyribose) suivant : 5' -TCAG- 3' -choisir une seule réponse- :

A) L'extrémité -3' est libre -OH

B) La séquence tétra nucléotidique complémentaire -à désoxyribose-

est : 5' -CTGA- 3'

C) Il peut être clivé par des exonucléases

D) L'extrémité -5' n'est pas phosphorylée

E) Il comporte deux groupements phosphodiesters

QUESTION 11. Choisir l'information fausse concernant les polynucléotides : -choisir

une réponse- :

A) Ils contiennent des liaisons phosphodiesters

B) Par convention, leur lecture s'effectue dans le sens 5'à 3'

C) Dans un polynucléotide circulaire, l'extrémité -3' du sucre ne

présente pas de groupe -OH libre

D) L'extrémité 3' comporte un groupement phosphate

E) Ils comportent des charges négatives à pH = 7 provenant des

groupements ionisés phosphates

Exercice

Exercice 1 Soient les molécules d’ADN suivantes. Si chacune d’elles est mise en contact
avec une ADN polymérase et les quatre désoxynucléotides triphosphates, dites si la
synthèse se produit ou non dans chaque cas :

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Exercice 2
Regardez attentivement les structures des molécules suivantes :

1. A votre avis, que se passerait-il si la didésoxycytidine triphosphate (ddCTP) était

ajoutée à la réaction de réplication de l’ADN en large excès par rapport à la
concentration de désoxycytidine triphosphate (dCTP) ?
2. Que se passerait-il si ddCTP était ajoutée à 10% de la concentration de dCTP ?
3. A votre avis, que se passerait-il si la didésoxycytidine monophosphate (ddCMP)
était ajoutée à la réaction de réplication de l’ADN en large excès ou à 10% de la
concentration de dCTP ?
EXERCICE 3.

a) D'après l'étude de Chargaff sur la composition en bases, lesquelles des

propositions qui suivent pourraient-elles caractériser tout échantillon d'ADN non viral
?

b) Si la teneur en C d'une préparation d'ADN bicaténaire est de 15%, quelle est la

teneur en A ? Justifiez votre réponse.

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c) Pour quelle raison les 2 brins de la molécule d'ADN restent-ils associés ? Quelle
partie de la molécule est impliquée ? Que se passe-t-il quand on augmente la T ?
Comment visualise-t-on le phénomène ? Comment l'appelle-t-on ?

EXERCICE 5

Parmi les liaisons du groupe A quelles sont celles qui relient dans chacun des cinq cas
les éléments du groupe B.

Groupe A
A - ester phosphate
B anhydride d'acide
C - liaisons Hydrogène
D - liaison N-glycosidique
E aucune
Groupe B
1 - deux désoxyribonucléotides successifs dans un ADN
2 - nucléoside et H3P04
3 - deux bases dans une même chaîne d'un ADN double
brin
4 - deux bases dans une paire de bases
5 - ribose et adénine
6- deux phosphates d'un nucléotide polyphosphate