Bio cel – cours 2

Les cels contiennent des organites qui ont a peu près la taille d’une bactérie.

(saut de ligne à chaque fois que le professeur change de diapo)

L’endocytose est la formation de vésicules sur la mb cellulaire, elles se transforment en endosome

qui est un petit corpuscule a l’int de la cel. Certains de ces endosomes se transforment en lysosomes,
dans lesquels ont lieu une lyse du contenu intérieur. Il y a d’autres vésicules, comme les peroxysomes
qui vont nous intéresser.

On travaille sur l’endocytose. Parfois sur les livres on voit différents noms pour l’endocytose, dont la
pinocytose. On va parler d’une cellule modèle qui n’existe pas en vrai, pour apprendre les processus
généraux qui ont lieu dans toutes nos cels. Parfois on fera des parenthèses pour voir les spécificités.

Pinocytose est une endocytose avec de petites particules, les endosomes réalisés sont plus petits. Ils
ont vu que des vésicules se formaient dans les 80’s, ils ont imaginé une cel qui était en train de boire,
ils ont appelé ca pinocytose. Mais la cel ne boit pas et ne mange pas, elle fait des vésicules. On voit
que c’est foncé et ca entoure un espace blanc : c’est une coupe de membrane.

La pinocytose est quand la cel boit, phagocytose est quand la cel mange, mais on reste sur le terme
d’endocytose. Image d’un macrophage, la structure cellulaire englobe une structure grise, surement
des protéines. On est a peu près a 10µm de diamètre. C’est un globule rouge, car c’est une cel, mais
elle n’a pas de noyau. Elle est très homogène. Donc c un macrophage qui consomme un GR, il est
dégradé par phagocytose, qui est une endocytose.

La phagocytose repose sur l’interaction de la mb cellulaire. Pour identifier qq chose qui a phagocyter,
ces structures sont étiquetées par des anticorps, ces anticorps sont en contact avec des récepteurs
en surface. L’interaction est donc celle d’un récepteurs avec une bactérie ici par exemple, couverte
d’anticorps.

Cela nous mené vers les diff formes d’endocytose : phagocytose pour des particules plutôt grande,
pinocytose pour les petites bactéries (les deux sont classique). Ou une bactérie par ex couverte
d’anticorps, détectée par les récepteurs, qui est l’endocytose par récepteurs interposé. Une cel ne
mange pas n’importe quoi, elle récupère spécifiquement les récepteurs a l’int. Les vésicules sont
transportés d’une cellule vers une autre, ou bien vers une autre vésicule.

On ne peut pas filmer une cel. On peut reconstruire le processus par les images de microscopie
électronique. Ici suite d’image, permet de reconstruire le processus de gauche a droite. De haut en
bas c la mb cellulaire, 10 nm d’épaisseur a peu près, des structures grises que sont les protéines,
mince couche de protéine atour de la vésicule naissante. La mb va s’invaginer, on aura une bulle qui
se forme. Finalement la vésicule va se détacher, on constate la coloration régulière qui entoure cette
vésicule formée, on a une structure de 100 nm, on parle d’endosome.
On se trouve sur la mb, on a constaté sur la partie extérieur que y a des récepteurs qui vont se
regrouper, qui vont réceptionner une protéine cargo, et finalement ce puit qui se forme conduit a un
détachement de cette vésicule.

Si on zoom encore, qu’on utilise des colorations avec anticorps et protéine couplées à l’or, on peut
utiliser des mutations conduisant a un dysfonctionnement des récepteurs, et donc obs un phénotype
qui nous intéresse. Il y a des maladies héréditaires, basées sur des mutations dans certains gènes qui
affectent les protéines, ne sont pas létales mais la maladie est détectable. Par ex l’abolition du
fonctionnement des récepteurs LDL, contenus dans des vésicules qui transportent le cholestérol. Il
existe des maladies avec pb du récepteur LDL qui se trouve dans la mb, le récepteur a deux partie :
une s’attachant au LDL circulant dans le sang, et une autre capable de se fixer sur la structure noire,
permettant de former cette vésicules, et donc à cette LDL d’être endocyter dans la cel. Si ce
récepteur fonctionne bien il récupére le LDL et on a un puit recouvert de protéine. Si ce recepteur est
muté sur la partie intérieur, il peut attacher les LDL, mais n’interagit plus avec ce puit recouvert, on
peut avoir formation de vésicule, mais ne contiennent pas de LDL. En anglais on parle de coated pit =
manteau creux. A droite, on voit les protéine/récepteur LDL en gris comme un nuage.

Structure de type micelle, on a une couche lipidique autour, comme quand on regarde dans le
microscope, la boule de graisse qui se forme quand on fait la vaisselle est ce micelle.

Si la cel a besoin de cholestérol pour former des mb, elle fabrique ces récepteurs qui s’intègrent dans
la mb, ensuite, une fois que les endosomes sont formées ils deviennent lysosome primaire, puis
secondaire, le lysosome est libéré et est utilisé dans la formation de mb.

Si ce récepteur est défectueux, le LDL est tjrs circulant dans le sang, mais n’entre pas dans la cel. On a
un risque d’attaque cardiaque qui augmente.

Ce qui nous intéresse est la partie noire.

On zoom dessus, on y trouve des protéines appelées les clathrines. Il y a trois bras qui ont une forme
en 3D. ils font en sorte qu’on peut couvrir la vésicule qui se forme. On a comme un ballon de foot, sa
mb est très mince, et on a du cuir qui l’entoure. Ca permet de stabiliser la forme.

Ces clathrines en vert vont donner la forme a cette vésicule qui se forme, mais ils interagissent pas
eux meme avec les récepteurs nécessaires pour récupérer les cargo. Entre les deux on a des
protéines appelés adaptateur. Les récepteur + les clathrines qui sont toutes pareilles, et pour
interagir correctement on a un adaptateur. Comme les adaptateur des prises. On a donc le cargo +
récepteurs + adaptateur + clathrine.

Fonctionnement de la formation d’une vésicule, reconstruction. On peut voir la clathrine sous

microscope électronique, font un trisquelium, structure tres simple et tres sophistiqué, car avec cette
meme structure on peut entourer quelque chose de circulaire. La clathrine entoure la vésicule qui se
forme. Plusieurs molécules de clathrine pour une vésicule, tjrs le meme type de protéine.

QCM : la clathrine contribue au processus de détachement, car préparent bien le détachement en

enrobant les microcavités, qui forment presque des vésicules. Ca prépare a l’étape suivante pour
comprendre comment les mols sont détachés.

L’endocytose c le transport de macromolécules vers la cellule, mais aussi le transport a travers des
cels, car chez les métazoaire, on a la particularité d’avoir plusieurs cels, parfois ils sont situées en
profondeur mais n’ont pas accès a l’env, donc ont besoin de récupérer des mols par un transport a
travers une feuille endothéliale, on parle de diacytose. Besoin pour le stockage également de
macromolécules.

Pour étudier ces processus dans une cel, il faut le perturber : il faut introduire un changement dans
ces processus pour voir quelles sont les bases de fonctionnement de ce processus. La meilleure façon
est d’attendre que y ait des mutations ou de les provoquer, donc on détruit partiellement une
protéine pour voir ce qui se passe, a quel moment ca détruit ce processus. On a aussi la possibilité
d’utiliser l’interférence pharmacologique, donc une toxine pour bloquer le processus. Souvent pour
utiliser l’endocytose, on utilise la concanavaline A, c’est produit dans les haricots. Permet
d’empêcher les prédateurs de manger le fruit du haricot. La concanavaline A fait partie de la famille
de lectines, celle-ci se fixe sur des monosaccharides, on les retrouve aussi sur les surface des
protéines ces monosaccharides, car les protéines sont glycosylées. Les lectines s’y fixent, et
spécifiquement sa fonction est d’empêcher la fusion entre endosome et lysosome. Ca empêche la
bonne digestion des fruits par les prédateurs. Sous leur forme purifiée on les utilise pour étudier les
glycoprotéines. La fusion entre endosome et lysosome est empêchée, on va voir en quoi c important
pour la digestion.

On revient sur la cel caricaturale, on a la vésicule qui se détache et se forme a l’int, on parle
d’endocytose.

On voit tjrs la clathrine, la clathrine est réutilisé pour former d’autres vésicules. Certains de ces
vésicules (endosomes) se transforment en lysosome, ils sont destinées à digérer les molécules cargo.
Pour cela deux choses sont nécessaires : baisser le pH, et intégrer des enzymes capables de digérer
ce cargo. Soit des protéases, ou lipases, pour digérer les protéines ou lipides.

Les lysosomes ont un pH très faible et continent des enz capable de

digérer leur contenu. Pour baisser le pH il y a une pompe a proton
intégrée dans la vésicule, en effet le pH est la concentration de H+,
plus on a de h+ dans notre solution plus le pH est faible (acide). La
pompe a proton est importante, on a découvert son existence en
1990.
La pompe a proton : on a la mb et une protéine qui, avec la consommation d’ATP, va transporter le
proton du cytoplasme vers l’int de l’endosome. Cette pompe a proton est transportée dans une
vésicule, et la vésicule fusionne avec l’endosome.

Les clathrines sont autour du coted pit, font une vésicule, puis intégration avec la pompe a proton.
Initialement la pompe a proton était connu car cetait une protéine qui consomme l’ATP. La vésicule
de transport va avoir une ATPase, qui est la pompe a proton. La vésicule change son nom, elle
s’appelle early sorting endosome (endosome précoce). On peut mesurer avec des indicateurs de pH
que son pH commence a baisser. Il y a des vésicules qui se détachent et les clathrines sont relâchées
pour aller au niveau de la mb, on appelle ces vésicules de transport recycling compartment. La
pompe a proton fait baisser le pH de 6 à 5, il y a donc 10 fois plus de protons. 10^1 (10^6-5). Sur les
vesicule late endosome, on trouve comme des étiquettes : on a des glycoprotéines appelées lamp et
m6pr. Donc si on arrive à détecter ces deux + le bon pH on parle de late endosome. Un lysosome se
caractérise par un pH faible, existence de lamp+ mais abs de M6PR.

Y a aussi une relation avec d’autres sys membranaire a droite. Tjrs dans les lysosome on retrouve des
cargo. Il faut apprendre les caractéristiques de ces 3 vésicules.

Soit le late endosome s’engage vers l’app de golgi, ou devient un lysosome pour détruire les
protéines cargo a l’int.

Lysosome : tous ceux qui ont un pH faible, et abs de M6PR.

Le lysosome contient une pompe a proton qui s’intègre, recyclage. Et ensuite l’endosome arrive, il
fusionne souvent avec un grand lysosome. Ce grand mangeur a la particularité d’être fusionné a des
vésicules de transport qui sont des hydrolases, se sont des enz a activité hydrolytiques, donc utilisent
l’eau pour fragmenter des biomol. Ces enz sont actifs seulement a un pH faible, ce sont des
hydrolases acides. Ils viennent de l’appareil de golgi, c’est une station d’empaquetage des molécules,
sous le microscope ca ressemble a des endosomes, ce sont des bulles qui vident leur contenu a l’int
du lysosome. Tjrs une pompe a proton qui baisse le pH, les hydrolases sont actives a ce pH faible,
ensuite les protéines cargo vont etre fragmentée, digérées. Ces structures peuvent digérer des
matériaux endogènes comme les mitochondries. Donc on a un pH faible et des hydrolases activées
par ce pH faible dans ce lysosome. Comment cette vésicule ne se digère pas elle-même ? la protéine
LAMP entre en jeu, dans le late endosome, c’est une couche de protection. Elle protège déjà les
endosomes tardifs, lamp entoure la mb des lysosomes donc protège contre l’action active des
hydrolases. La concanavaline A empêche la fusion des endosome avec les lysosome, donc les cargo
n’arrivent pas a destination, il n’y a donc pas de digestion cellulaire. Cette fusion membranaire est
mystérieuse.

Il faut encore la découvrir. On sait que les endosomes et lysosome vont fusionner c’est sûr, on peut
empêcher avec la toxine cette fusion. Les deux mb sont séparées, ce sont les bicouche de
phospholipides. On a un modèle construit du fonctionnement. Mais si on essaye de fusionner deux
bulles de savon ca éclate, donc on n’arrive pas à reproduire ce processus. Bcp des organismes
ennemies comme les bactéries pathogènes, les substances qu’on aimerait digérer, empêchent cette
fusion. Donc la phagocytose ne fonctionne pas, c’est une endocytose. Les bactéries sont dans cet
endosome, empêchent la fusion avec le lysosome. Donc sont a l’abri du sys immunitaire et ne sont
pas attaqué par les hydrolases. On commence a mieux connaitre cette fusion, il faut une force. Mais il
y a bcp de détails inconnus.

Les mb de lysosomes ont une particularité. Comme tt membrane, ils sont impénétrables pour des
macromolécules, les mb biologiques sont étanches, meme pour les électrons. Elles représentent des
barrières pur les mols. Les enz a l’int peuvent les attaquer, mais les mb sont protégés par la couche
glucidique formée par les lamp. Ce sont des lysosome associated membrane protein.

Leur particularité est la pompe a proton, qui transporte les H+ a l’int. Consomme en permanence de
l’ATP.

La fonction du lysosome est la digestion intracel. En effet, endosome va fusionner avec lysosome
pour digestion intracelr. La digestion extracel, on les trouve pas chez tt les cels, que chez certaines.
Par ex le lysosome fusionne avec la mb cellulaire, il va vider a l’ext des hydrolases actives, donc
s’attaquent aux autres cels, ce qui est dangereux. Donc c qq chose de très contrôlé. Les ostéoclastes
(cels régulant croissance osseuse, les plastes se divisent, alors que cytes sont des cels différenciées)
et chondroclaste (régulent croissance du cartilage). Nos os sont des tissus vivants, meme si on a
l’impression que c’est mort. Si on se casse une jambe on se rend compte que c’est vivant. Leur
croissance est longue. Parfois il peut y avoir des excroissances osseuses, qui sont douloureuses au
niveau des articulations. Sinon c bien contrôlé. Il y a donc ces deux types celR.

Quand une cel se divise de manière incontrôlée, on parle de cancer. Pour le cancer osseux, on a un
équilibre perturbé entre ostéoclaste et ostéoblaste. Les ostéoblastes se divisent, et les ostéoclastes
les détruisent. Les ostéoclastes pour détruire les cels, ils vident leur contenu cellulaire de leur
lysosome a l’ext. On a des récepteurs RANK qui fixent un ligand appelé RANKL (rank ligand). RANK
est sur la surface osseuse, il attire les ostéoblastes vers le tissus osseux. Les ostéoclastes détruisent le
tissu, ils sont également contrôlés. On a des cels tumorales qui prolifèrent. Ils sont sorti du tissus
osseux et prolifèrent. Ils produisent RANKL, qui font que les ostéoblastes ne sont plus disponible
pour réparer les tissus. Ils vont alors détruire le tissus osseux de l’int, simplement par l’équilibre de
ces ostéoblastes qui n’arrivent plus à réparer les dégâts causés par les ostéoclastes. On parle de
ostéolyse, qui est la lyse des cels osseuses.

Si on ne le traite pas, il détruit l’ens des os dans un corps. Pour le moment y a pas de traitement
adapté. On peut faire une amputation, en coupant le membre touché, dans le cas où il n’y a pas de
métastase. Un marathonien a eu cet ostéosarcome, il a réussi a courir des marathons avec
l’amputation. C’est assez fréquent chez les chiens, on ne sait pas pour quelle raison. Seule
l’amputation va sauver l’animal.

On a le lysosome, ce sont des structures de destination de plusieurs endosome tardifs. Caractérisées

par baisse pH, présence d’hydrolases, et protection par lipoprotéines a l’int de la mb.
Dans ce lysosome on a les hydrolases, on parle aussi d’hydrolases lysosomales. pH très faible. Y en a
à peu près une 50aine. On retrouve tout types d’hydrolases, on a les peptidases, les glycosylases qui
gèrent les sucres et glycoprotéines, les lipases, les nucléases. Souvent les enz utilisées sont optimum
a pH faible, dont il faut utiliser des tampons spécifiques pour les faire fonctionner. On a donc une 50
aine d’enz, mais si une de ces enz ne fonctionne pas, on est très malade. Le pb est tellement grand
que la mutation est létale.

Dans certains cas les personnes peuvent survivre, mais ce sont des phénotypes très graves. Pour
certaines de ces maladies on reconnait l’origine. On connait les gènes responsables des
dysfonctionnement de ces protéines. Ce sont des maladies héréditaires, qui ont été découvert chez
certaines familles, on leur a donné le nom de la famille dans laquelle ca a été découvert. On a
souvent ca dans des communautés avec fort taux de consanguinité.

Les biomolécules on a des enz qui les digèrent, mais dans l’évolution on a l’amiante et les particules
de silices, ce sont des maladies de cumul de ces molécules, que l’on n’arrive pas à digérer. Un
phénotype pouvant etre tres grave est tay sach.

Locus sur le chr 15. On a la digestion d’un glycolipide, notamment le GM2. On le retrouve dans les
cels nerveuses. Si ce GM2 n’est pas digéré, sa concentration augmente, et les cels nerveuses
montrent un disfonctionnement. Si cette GM2 n’est jamais digérée, elle va dysfonctionner. Les
enfants sont nés en parfaite santé, mais apres qq semaine, mois, 2/3 ans apres la naissance, ils ont
des dysfonctionnement nerveux tellement grv qu’ils vont décéder.

Les hydrolases viennent de l’app de golgi, elle viennent de vésicules de transport ou la digestion n’a
pas lieu car le pH n’est pas assez bas. Ces petites vésicules de transport sont appelées aussi
lysosome. On parle de vésicules primaires, ce sont des vésicules de transport, ils sont plus petits que
les lysosomes. Les lysosomes ou la digestion a lieu sont les lysosomes secondaires, donc ou le pH est
faible et où il y a les hydrolases.

Enfin il y a les lysosomes tertiaires ou corps résiduels, ce sont des déchets, ce n’est pas fonctionnel,
cad pas de digestion, ça ne fonctionne plus.

Ces lysosomes tertiaires appelés aussi corpuscules résiduels ou residual body, et ou granule
lipofuscine.

On a 1 endocytose, formation d’endosome, pH baisse, lysosome se forme, corps résiduel (déchets

qui reste dans nos cels)

On sait cela grâce au ME

Les bulles sont l’app de golgi, et les petites taches rondes plus petites que 100 nm, sont densement
colorés car bcp de protéine dedans, ce sont les lysosomes primaire avec les hydrolases, servant au
transport.
200/300 nm les lysosomes secondaires, les coloration est assez homogènes mais pas aussi noire, on a
des area densa, surement des concentrations d’hydrolases ou protéines cargo.

Le lysosome tertiaire apparait, on a des invagination de la mb qui se forme, donc le lysosome se

replie sur lui-même, on a donc ce déchet qui se forme dans nos cels. Parfois il peut etre irrégulier. Il
se débarrasse des déchets vers l’ext, y a un grand risque de blesser la MEC. Sinon y a une
constipation. Ca arrive dans nos cels, la formation de ce granule lipofuscine. Il contribue
certainement a un dysfonctionnement avec un âge avancé.

Lipofuscine est un pigment qu’on peut voir chez les personnes fragiles par ex sur la peau, ce sont des
taches, ce sont des cumul visible a l’œil nu de ce pigment.

Notamment les neurones et la peau en contient des qté importante. Ca fait parti du processus de
vieillissement mais si ca arrive trop précocement, on parle de maladie neurodégénératives, on
connait 8 maladies du a ce dysfonctionnement d’accumulation de cette lipofuscine précoce. On a le
nom du médecin qui l’a découvert.