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MICROBIOLOGIE

GENERALE
Cours proposé par
José Edmundo NAVA SAUCEDO
aux étudiants de L3S5

Partie 3
Evolution du métabolisme
METABOLISME

CATABOLISME ANABOLISME
Dégradation de (macro)molécules Synthèse de (macro)molécules

REACTIONS ANAPLEROTIQUES
Molécules de remplissage
ENERGIE DES ELECTRONS
liaisons covalentes / ioniques

HAUT NIVEAU D’ENERGIE Molécules Organiques

BAS NIVEAU D’ENERGIE Molécules Minérales


condensation

H Monomère OH + H Monomère OH

H 2O

H Monomère Monomère OH + H Monomère OH

H 2O

H Monomère Monomère Monomère OH


hydrolyse

H Monomère Monomère Monomère OH

H 2O

H Monomère OH + H Monomère Monomère OH

H 2O

H Monomère OH H Monomère OH + H Monomère OH


oxydoréduction

Molécule oxydée Molécule réduite

A B
COUPLE REDOX COUPLE REDOX

X-H2 X

Cofacteur réduit Cofacteur oxydé


Agitation moléculaire (désordre)
Nutriments
Chaleur Source d’énergie
ENTROPIE

Structures
ENERGIE Cellule
dissipatives

NEGUENTROPIE
Maintien
structurel Produits
excrétés
Structuration de la matière (ordre)
fermentation

Haut niveau d’énergie

ATP

Bas niveau d’énergie

CH3 CH3
C=O H-C -OH
(+ 2H+)
COOH COOH
Pyruvate Lactate
respiration anaérobie

Haut niveau d’énergie

ATP

Bas niveau d’énergie

S H 2S
(+ 2H+)

Soufre Acide sulfhydrique


Photosynthèse anoxygènique
sulfureuse
NADH + H+ ATP
Haut niveau d’énergie

Bas niveau d’énergie

CO2 + 2H2S (CH2O) + H2O + 2S


(+ 2H+)

Dioxyde de Acide sulfhydrique Glucide Eau Soufre


carbone
Photosynthèse anoxygènique
non sulfureuse
NADH + H+ ATP
Haut niveau d’énergie

Bas niveau d’énergie

HOOC-CH2-CH2-COOH HOOC-CH=CH-COOH
(+ 2H+)

Acide succinique Acide fumarique


photosynthèse

Haut niveau d’énergie

photon
ATP

γ Bas niveau d’énergie

(+ 2H+)
H 2O 1/2O2 1/2O2 H 2O
(+ 2H+)

Eau Oxygène Oxygène Eau


respiration aérobie

Haut niveau d’énergie

ATP

Bas niveau d’énergie

1/2O2 H 2O
(+ 2H+)

Oxygène Eau
évolution du métabolisme
FERMENTATION

RESPIRATION ANAEROBIE

PHOTOSYNTHESE
Anoxygénique non sulfureuse

PHOTOSYNTHESE
Anoxygénique sulfureuse

PHOTOSYNTHESE
Oxygénique

RESPIRATION AEROBIE
Groupes trophiques
synergie trophique
Groupes
trophiques

(CO2)
H2O)
Fermentation
ou Respiration ?

O2
EVOLUTION DU METABOLISME
Les Procaryotes
Origines de la vie Propriétés développées
Bactéries anaérobies 1 au cours de l’évolution
1 Voie du fructose (glycolyse)
avec fermentation Voie des pentoses phosphate
Bacteroides Ruminococcus Phosphorylation du substrat
2 Bactéries anaérobies
avec respiration 2 Fe-Porphyrines (Cytochromes) comme
composants d ’une chaîne de transport
Desulfovibrio Methanobacterium d ’électrons (Pompe de protons) utilisant des
accepteurs d ’électrons externes (CO2,
Bactéries 3 sulphate)
hétérophotoorganotrophes
Rhodospirillum 3 Utilisation de l ’énergie lumineuse par les
Mg-Porphyrines (Chlorophylle et
4 Bactéries Photosystème I)
autophotolithotrophes 4 Fixation du CO2 par la voie de la Ribulose
Chromatium Biphosphate Carboxylase (RuBisCo)
6
5
Cyanobactéries Bactéries aérobies 5 Photosystème II
Oscillatoria avec respiration 6 Cytochromes comme oxydases terminales
Pseudomonas
Chloroplastes Mitochondries dans le transport d’électrons aérobies
Endosymbiose en série

Origine des eucaryotes


endosymbiose en série
Enveloppe nucléaire
Reticulum
endoplasmique Noyau
Invagination de Mitochondrie
Eukaryote
la membrane Cellule avec photosynthétique
plasmique noyau et ancestral
système Plaste
membranaire

Capture d’un
procaryote
ADN photosynthétique

Cytoplasme Capture d’un


procaryote
Te hétérotrophe
m
ps Prokaryote aérobie
ancestral
Membrane Mitochondrie
plasmique Eukaryote
hétérotrophe
ancestral
endosymbiose en série
Prochloron
Cyanobactérie
(cyanobactérie)
ancestrale
Rickettsia
(protéobactérie α)
Bactérie ancestrale
Eukatyotes
hétérotrophes
Bactérie pourpre aérobies
ancestrael

LUCA Eukatyotes
Eukaryote ancestral autotrophes
(anaérobie) aérobies

Archée ancestrale Thermoplasma


(archée)
Identification du virus Acanthamoeba
polyphaga mimivirus et différentiation
par rapport au mycoplasme Ureaplasma
urealyticum grâce à l’utilisation des
microscopes électroniques à balayage
et à transmission.
Mycoplasmes
• Ce sont de petits microorganismes ressemblant à
des bactéries, qui mènent une existence de
parasites, en étroite association avec des cellules
eucaryotes.

• Ils ont un diamètre de l'ordre de 0,3 µm.

• Ils contiennent suffisamment d'acides nucléiques


pour biosynthétiser environ 750 protéines
(nombre minimal pour la survie d'une cellule).
Ureaplasma urealyticum (mycoplasme)
&
Acanthamoeba polyphaga mimivirus (APMV)

(left)
(right)
Ureaplasma urealyticum (mycoplasme) & APMV

• Acanthamoeba polyphaga mimivirus
Position des mimivirus dans les arbres
phylogénétiques du vivant.

Endosymbiose primaire et secondaire
*
endosymbiose en série primaire / secondaire
Endosymbiose
Euglène
Endosymbiose
Paramecium bursaria + Chlorella
Endosymbiose
Paulinella + cyanobactéries
L ’Endosymbiose en série
*
L ’Endosymbiose en série
*
Giardia lamblia

Ü Cycle, trophozoïte et kyste


Giardia lamblia

Ü Trophozoïte
Endosymbiose
Joenia et Devescovina
MICROBIOLOGIE GENERALE

À suivre …

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