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E
Exemple
l : butadiène
b t diè 1-3
13 C=C–C=C
La longueur de la simple liaison est différente
Formules de Kéculé
6C sp2
En réalité les 6 liaisons C – C sont équivalentes
(l = 1,39A°)
N
naphtalène
p
I d l
Indole
(tryptophane)
1) Déplacement des e- des liaisons = effet inductif Halogènes : F > Cl > Br > I
OH
X est un atome ayant une électronégativité > C
Effets inductifs donneurs
C :X X a un effet inductif attracteur
K, Na, Li
Groupements hydrocarbonés
Y est un atome ayant une électronégativité < C CH3 CH3
CH3 C- CH- CH CH2- CH3-
3
CH3 CH3
C: Y Y a un effet inductif donneur
Tertiobutyl isopropyl éthyl méthyl
S’atténuent(( le long
g d’une chaine))
C=O C-O
Cl CH2 CH 2 CH2
0
CH2
–
–
N = C–C
CH2 = CH - CH = CH2 CH2 - CH = CH - CH2
–
HO – C = C HO = C – C - Molécule plus stable
- Système plan
V) Composés de coordination ou
- Effets inductifs et mésomères s’ajoutent, l’effet
complexes
global = résultante algébrique
1) Liaisons datives
–
HO – C = C HO = C – C 2) Complexes, ex : ferrocyanure de K
..
1) Liaisons datives Exemple : NH3 + H+ NH4+
- l. covalente = mise en commun d’un doublet e-, donneur
N (Z=7) 1s2 2s2 2p3
chaque atome apporte 1 e-
4 OH sp3
H
- l.
l dative
d ti = misei en commun d’un d bl t e-,
d’ doublet
-
1 atome apporte 2 e , il est « donneur »,
l’autre est « accepteur » H+ accepteur
H NH
4
-O
H2SO4
2s2 2p4 O O- O
O S S
O- O-
O O
H S O H
O 2 liaisons datives
Atome de S avec 8 e- formes limites de résonance
O
Ferrocyanure de K [Fe(CN)6]4-
Complexes des métaux de la 1ère série de transition
Fe Z =26
Ces éléments utilisent leurs orbitales de valence (Ar 18e- + 8e-) 3d6 4s2 4p0
3d, 4s et 4p pour former des orbitales avec
différents ligands.
Fe2+ (24e-)
Dans le complexe, le métal possède la
En présence de CN- ligand à champ fort, les 6e- de la 3d
configuration électronique du gaz rare de la sont regroupés en 3 paires
4ème période qui est le krypton (Z=36)
4s2 3d10 4 p6 (18 électrons)
électrons).
2 O d vides
- OOC
CH2 . Ion citrate chelate soluble avec Ca2+
(Formule : ne pas apprendre) anticoagulant
CH2
COO-
N OH
CH2
COO- – CH2 – C – CH2 – COO-
Mg 2+
CH2
COO-
+
. Oxalate mixte d’NH4 et K COOH – COOH
CH2 N
COO- acide oxalique
-OOC CH2
O O-
En enzymologie : C
EDTA élimine
é les cations métalliques
é du milieu réactionnel
é
pouvant inhiber la réaction enzymatique C Ca2+
ou il inhibe une enzyme nécessitant un ion métallique
O O-
Anticoagulant : EDTA (sel de Na) complexe le Ca2+
indispensable à la coagulation. Oxalate de Ca insoluble (dans les calculs urinaires)
Pas de recouvrement des O.A. ou O.M. des 3) Liaison hydrogène (liaison électrostatiq
électrostatiquee
molécules concernées. particulière)
4) Interactions hydrophobes.
1 )Interactions électrostatiques
a) charge - charge Energie d’attraction :
L’énergie d’attraction entre l’ion carboxylate et l’ion ammonium
entre 2 charges q1, q2 de signes opposés
séparées par une distance d CO2- ……….NH4+
dans un milieu de constante diélectrique est : d=0.3 nm
q1 q2
W =
d = constante diélectrique du vide = 1 milieu W kJ.mol-1
Vide 1 - 550
solvants apolaires solvants polaires Eau 78 -4
Benzène 2.3 Acétone 20.7 Poche hydrophobe Zone hydrophobe 2 - 230
Hexane 1.9 éthanol 24 macromolécule #2 macromolécule
DMF 37
Eau 78
ex : H2O
Eau liquide = réseau tridimentionnel
dans la glace : structure tétraédrique
Diminution du nombre de liaisons hydrogènes,
Chaque molécule d’eau lie 4 molécules d’eau voisines
molécules plus proches que dans la glace = densité eau liquide
H est supérieure à celle de la glace, la glace flotte dans l’eau.
O
H O H H
H H O
H
O O
H O H
H H
H O H H O H
O H
H O H
H H
Propriétés physiques particulières : t° ébullition élevée.
R H
3) Interactions hydrophobes
Rôle important des L.H. en Biologie
Molécules formées par : 1 partie hydrophile
- double hélice ADN 1 partie hydrophobe.
Exemple le nonanol 1
((Appariement
pp des bases p
puriques
q et py
pyrimidiques)
q )
CH3–CH
CH2–CH
CH2–CH
CH2–CH
CH2–CH
CH2–CH
CH2–CH
CH2–CH
CH2 – OH
- Structures secondaire, tertiaire et quaternaire Dans l’eau, la partie hydrophobe est repoussée par
des protéines (hélice feuillet les molécules d’eau.
- pas attraction entre molécules
- Reconnaissance : Enzyme – Substrat, - réaction de rejet
j : les molécules d’eau repoussent
p les
Récepteur - Hormone parties apolaires des molécules et les forcent à se
regrouper.
G0 = -1 à – 6 kJ.mol-1
Ex : membrane plasmique d’une cellule (PL). f
Chimie fondamentale
J.C. Chottard
J.C. Depezay
J.P. Leroux
Ed. Hermann