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Faculté de Médecine d’Alger-Département de pharmacie- 4 ème année de Pharmacie 2021-2022-

Pr Korichi-Ouar. M

Structure et anatomie fonctionnelle des bactéries

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Introduction
Une bactérie est un être unicellulaire (procaryote) de petite taille, de morphologie variable
qui présente des caractéristiques propres, douée d’un mode de vie autonome.

La taille d’une bactérie varie entre 1 à 10 µm (0,3 – 2,5 µm), elle contient 70% d’eau.

Lorsque qu’on rapporte au poids sec, une bactérie est constituée de : 55 % de protéines ,10%
de lipide, 3 % de lipopolysaccharide, 3 % peptidoglycane ,40% de ribosomes ,20 % ARN
(20%) et 3 % ADN.

I- Structure bactérienne
La bactérie est constituée d’éléments structuraux obligatoires et d’éléments structuraux
facultatifs

 Parmi les éléments structuraux obligatoires nous citerons : la paroi bactérienne, la


membrane cytoplasmique, le cytoplasme, les ribosomes et l’ADN chromosomique.

 Parmi les éléments structuraux facultatifs nous citerons : la capsule, le glycocalyx, le


plasmide, les transposons, les intégrons, les flagelles, les pili /fimbriae, spore.

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I-1-les éléments obligatoires

I-1-1 La paroi bactérienne


La paroi est une structure rigide, de nature polymérique. Les polymères et leurs modes de
liaison varient selon les espèces bactériennes. Elle est retrouvée uniquement chez les
bactéries. C’est un élément obligatoire dans la structure des bactéries.
Il existe 3 types de paroi dans le monde microbien
o la paroi des bactéries à Gram positif
o La paroi des bactéries à Gram négatif
o La paroi particulière des Mycobactéries

Remarque : le monde microbien présente une seule bactérie dépourvue de paroi appelée
Mycoplasme (bactérie intracellulaire obligatoire).

Constituants de la paroi

Le constituant de base de la paroi est dit :


Peptidoglycane ou mureine : c’est un héteropolymère dont la chaine principale est faite
d’une alternance de deux sucres N- acetyl glucosamine (NAG) et acide N- acetyl
muramique (ANAM ou NAM) relier par des ponts penta-peptide ou pentaglycine.

Un ensemble de chaînes latérales peptidiques identiques, composées de 4 acides aminés et


attachées à l'acide N-acétyl muramique .

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Remarque :
La chaine NAM-NAG est la même pour toutes les espèces bactériennes tandis que les
chaînes latérales de tétrapeptides et les ponts interpeptidiques varient d'une espèce à
l'autre.

Synthèse du peptidoglycane
La synthèse du peptidoglycane se fait en trois étapes et en trois lieux différents :

 Au niveau du cytoplasme :il y aura la synthèse des précurseurs dont le N acétyl


glucosamine , le N acétyl muramyl, les pentapéptides (L-alanine, D- glutamine, L-
lysine, D-alanine, et la D-alanine).
 Au niveau de la membrane cytoplasmique : on retrouve un transporteur de nature
lipidique l’undécaprényl phosphate qui prend en charge les précurseurs.
 Extérieur de la membrane cytoplasmique : Il y’aura la formation de liaison osidique
entre le N acétyl glucosamine et le N acétyl muramique grâce à une transglycosylase
, puis la formation des liaisons peptidiques entre le troisième acide aminé du premier
penta peptide et le quatrième acide aminé du deuxième penta peptide grâce à une
transpeptidase. Cette liaison se fait directement ou par un pont de glycine. Le
cinquième acide aminé du deuxième penta peptide est éliminé par une
décarboxylase.

Les différents types de paroi

Paroi des bactérie à Gram positif :


Elle est constituée de :
 Peptidoglycane représente 90% de la paroi avec une épaisseur de 20-80 nm
 Acides teichoiques reliés au peptidoglycane
 Acides lipoteichoique reliés aux lipides de la membrane plasmique
On retrouve aussi : le polyoside C des Streptococcus sp et les protéines M et A

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Paroi des Bactérie à Gram Négatif


Elle est constituée de :
• Peptidoglycane représente 5 à 20 %
• Membrane externe membrane trilamellaire avec deux couches de phospholipides
présentant un pôle hydrophobe et un pôle hydrophile, à sa face externe certains
phospholipides sont remplacés par:
- Les lipopolysacharides (LPS) : est une Endotoxine
- La lipoprotéine de Braun
- Protéines de la membrane externe (OMP)

 Les lipopolysacharides : est une Endotoxine formée de 03 parties


- Lipide A : enfoui dans le membrane externe est souvent toxique
- Polysaccharide central lié au lipide A avec 10 sucres.
- La chaîne latérale O ou antigène O, constitué de quelques sucres dont la
composition varie selon les souches bactériennes, responsable de la spécificité
antigénique.

 La lipoprotéine de Braun relie la membrane externe au peptidoglycane.


 Protéines de la membrane externe (OMP) sont de deux types : Les OMP non
structurales et les OMP porines.

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Paroi des Mycobacteries est constituée d’une petite couche de Muréine , une couche
d’arabino-galactane et une grande couches d’acides mycolique rendant la paroi résistante à
l’acide et à l’alcool on parle alors de BAAR(Bacille Acido-alcolo –résistante).

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Fonctions de la paroi
• Forme et rigidité de la bactérie
• Protège contre la lyse osmotique (maintient une pression osmotique intracellulaire
généralement très élevée)
• Spécificité antigénique
• Permet la différenciation entre bactérie Gram+/- (rôle dans l’identification)
• Lieu d’action de certains antibiotiques aui inhibent la synthèse de la paroi (les β
lactamines, Glycopeptides), et des autolysines et des lysozymes.
• Les lipopolysaccharides et le peptidoglycane sont capables d’activer le complément
par voie alterne libérant les fractions C3a et C5a ( effet chimiotactique) et C3b
(effet opsonisant).

Remarque :
- Protoplastes sont observés chez les bactéries à Gram positif après destruction de la
paroi (bactérie non viable)
- Sphéroplastes sont observés chez les bactéries à Gram négatif après destruction de la
paroi (bactérie non viable)

Coloration de GRAM

• intérêt : Elle permet de distinguer la paroi des bactéries à ayant : plus du


peptidoglycane (Gram+ ) de celles ayant moins de PG ( Gram-).

• Coloration en 4 étapes :
1. coloration par le violet de gentiane ;
2. mordançage avec du lugol (solution d’iode iodo-iodurée) ;
3. décoloration par l’alcool
4. coloration par la Fuschine

• Etapes 1 et 2 = coloration en violet du contenu de la bactérie et fixation par le lugol


des structures internes.
• Etape 3 = décoloration du cytoplasme des bactéries ayant une paroi pauvre en
peptidoglycane qui laisse passer l’alcool pour éliminer le violet de gentiane = bactérie
à Gram négatif
• Etape 4 = contre-coloration par la Fuschine teintant en rose les bactéries
précédemment décolorées.
• Les bactéries à Gram positif restent colorées en violet (pas de passage à travers la
couche de peptidoglycane.
• Les bactéries à Gram négatif seront colorées en rose ( car la paroi est pauvre en
PG).

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I-1-2-La membrane cytoplasmique


• Bicouches phospholipidique, les parties hydrophobes se font face et son protégé dans
les milieux aqueux, tandis que les têtes hydrophiles externe y sont immergées. ( 5-10
nm d’épaisseur)
C’est une Mosaïque fluide, avec déplacement et rotation des groupements lipidiques

• Elle limite le cytoplasme de la bactérie, c’est une membrane trilamellaire


formée deux couches de phospholipides (30-40 %) dont les pôles hydrophobes
sont face à face.
• Dans la membrane cytoplasmique sont insérés à la surface externe des
protéines (60-70 %).

Elles sont :
• Des perméases permettant des échanges
• Des protéines ayant un rôle dans la synthèse du PG
• Des Protéines liant les pénicillines (PLP ou PBP)
• Des enzymes respiratoires
• Des protéines impliquées dans la production d’énergie

Fonctions :
1- Barrière perméable et sélective et transport de substances solubles
Semi-perméable contrôle l'entrée de différentes substances grâce aux perméase et
l’exception de substance. Elle a un rôle de barrière osmotique.

2- La respiration : la membrane cytoplasmique, contient les enzymes et les co-enzymes de


la chaîne respiratoire permettant la phosphorylation oxydative (poumon de la bactérie).

3- Productrice d’énergie pour la bactérie grâce aux réactions d’oxydoréduction et de


phosphorylation oxydative sous forme d’ATP (centrale électrique).

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4-Supporte les enzymes et les transporteurs nécessaires à la synthèse d’ADN et des


constituants de la paroi.

5- les flagelles bactériens y est fixés.

Remarque :
Les polypeptides (Colistine) est un antibiotiques qui détruit la membrane cytoplasmique

Mésosome
• Le mésosome est une invagination de la membrane plasmique et est en contact
avec l’ADN, elle Jouerait peut être un rôle dans la synthèse de la paroi.
• Il a un rôle dans la réplication du chromosome et sa distribution aux bactéries filles

I-1-3 Cytoplasme
Le Cytoplasme est un Hydrogel colloïdal (70 % d’eau) dépourvue d’organite
comprenant :
Une solution de sels minéraux, des lipoprotéines, des lipides, des inclusions de matière
organique ( substances carbonés, glycogène , poly-β hydroxybutyrate) ou inorganiques
(granules de polyphosphate) ,des ribosomes, et de l’ ARN solubles : ARNt et ARNm.

Remarque : il existe un cytosquelette similaire au cellules Eucaryote (2010) constitué de


protéine ( tubuline , actine et crescentine) .

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I-1-4 Appareils nucléaires : nucléoïde

L’appareil nucléaire ou nucléoïde est non entouré par une membrane (différence avec les
cellules eucaryotes).
Le chromosome bactérien (le plus souvent unique) est constitué d’un filament unique
continu et circulaire bicaténaire super enroulée d’ADN constituant le nucléoïde.
Il est composé de 60 % d’ADN, 30% ARN et 10% de protéines.

C’est un ADN double brins constitué de nucléotides :


• Bases azotées (Adénine, Cytosine, Guanine, Thymine)
• Un sucre
• Phosphate
Rôle :
1- ADN va donner des ARN m permettant la synthèse de protéines de structures et des
enzymes.
2- La réplication de l‘ADN est semi conservative et se transmit aux bactéries filles avec
tous les caractères héréditaires.

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I-1-5-Ribosome

Le cytoplasme est souvent rempli de ribosomes ( E.coli:15 000 ribosomes)


Le ribosome est une granulation sphérique qui peut être libre dans le cytoplasme
entrainant la synthétise de protéine intracellulaire ou liés à la membrane cytoplasmique
provoquant la synthétise de protéine exportable.

Composition: c’est un complexe de protéines (1/3) et d’Acides ribonucléique (ARN) 2/3 ( 16


S, 23S ,5S) sui est divisé en sous unités 30 S ( ARN 16 S et 31 protéines ) et la sous unité 50
S (ARN 23 S et 5 S avec 21 protéines).

L'ARN messager passe à travers la petite sous unité (30S) qui contient les sites de fixation des
ARNt.
La grande sous unité (50S) contient la partie catalytique qui effectue la synthèse de la liaison
peptidique entre les acides aminés consécutifs de la protéine. Elle contient également un
tunnel par lequel sort la chaîne protéique en cours de synthèse.

Remarque
Macrolides et apparentés agissent sur l’unité 50S
Aminosides et les Cyclines agissent sur l’unité 30 S

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II-2- Eléments facultatifs

II-2-1-Capsule
La capsule est une structure de nature polysaccharidique (S.pneumoniae) et quelquefois
polypeptidique (Bacillus anthracis), située à l’extérieur de la paroi
Rôle :
 Adhésion
 Empêche la phagocytose.
 Support de la virulence
 Support d’antigénique
 Elle empêche la pénétration des antibiotiques
Intérêt:
Elle peut se trouver à l'état soluble dans les liquides de l’organisme, dans le diagnostic(
recherche d'antigène soluble).
Ce typage par le gonflement de la capsule
Les polymères capsulaires purifiés sont la base de certains vaccins (Streptococcus
pneumoniae, Haemophilus influenzae).

II-2-2 Glycocalyx

Ce sont des fibres polysaccharidiques ou polymères extrêmement fréquents entourant la


bactérie. Ce feutrage est dit glycocalyx : biofilm parfois Slime

Il est responsable de l'attachement des bactéries aux cellules (cellules buccales,


respiratoires..) ou à des supports inertes (plaque dentaire, biofilms sur les cathéters, les
prothèses.
Il protège les bactéries à l’intérieur du biofilm de la dessiccation, des antiseptiques,
désinfectants et antibiotiques et enfin, il concentre les éléments nutritifs exogènes et pro

II-2-3-Plasmide
Les plasmides sont des molécules d’ADN circulaire double brin exta-chromosomique
(cytoplasmique), non indispensable, de taille variable (0,5-500 Kb) doué de réplication
indépendamment du chromosome, transmissible de façon stable à la descendance
La transmission du plasmide d'une cellule bactérienne à une autre se fait grâce au pili sexuel
(Conjugaison).

Fonction :
• Non indispensable au métabolisme normal de la bactérie
• Apporte des informations génétiques importantes à la bactérie
• Permet une meilleure adaptation de la bactérie

Rôle :
Il existe des plasmides porteurs de gènes de résistance aux antibiotiques d’autres portes des
gènes de certaines caractéristiques métaboliques.

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II-2-4 Transposon
Les Transposons sont des séquences d'ADN linéaires de taille limitées capables de changer
de localisation dans le génome sans jamais apparaitre à l'état libre. Ils s’intègrent
directement dans le génome (chromosome ou plasmide). Ils sont incapables de se répliquer
seul.

II-2-5- Flagelle :

Les flagelles : structure mince de 20 nm de Ø et 15-20 µm de long rigide, constitué de


d’une protéine appelée Flagelline.

Le flagelle se compose en 3 parties:


• filament
• Le crochet : plus large et est fait de différentes sous unités protéiques.
• Le corps basal est enfoui dans la membrane cytoplasmique

Le flagelle est mobile par rotation, comme une hélice, grâce à un mécanisme similaire à un
« rotor » fonctionnant grâce à l’énergie fournie par un gradient de protons.

Il existe 4 types de flagelles

• A : Monotriche ( Vibrio) ,B : Lophotriche (Pseudomonas),C : Amphitriche, D :


Péritriche (E.coli)

Rôle:
 La locomotion
 Rôle antigénique (Les antigènes flagellaires (Ag H) déterminent différents
sérotypes (exemple : sérotypage des Salmonella).

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II-2-6- Pili ou fimbriae


Ce sont des appendices filiformes plus fins que les flagelles, il existe environ 1000 pilis
Ce sont de minces tubes de sous unités protéiques appelée Piline.

• Il existe deux types de pili:


• Les pilis communs ayant un rôle dans l’adhésion donc fixation de la bactérie sur la
cellule cible.
• Les pilis sexuels sont plus long, ils sont codés par un plasmide permettant le
transfert d’un plasmide conjugatif d’une bactérie à une autre.

II-2-7-Spore
Certaines bactéries ont le pouvoir de se transformées en petites unités ovale ou
sphériques douées d’une résistance très élevée lorsque les conditions deviennent
défavorables (carence en éléments nutritifs par exemple…).

Elles peuvent déformer ou non le corps bactérien. Leur position dans la cellule est
variable : centrale, terminale, sub-terminale
Ex: endospores : Bacillus, Clostridium.

Rôle : permet l’identification de certaines bactéries ( Bacillus) et surtout de survie de


certaines espèce bactériennes.

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