Structure et anatomie

fonctionnelle des bactéries

Pr Korichi-Ouar . M
Pr Bachtarzi .M

4 ème année de Pharmacie – Année universitaire 2021-2022

 Plan
• Introduction
I- Composants obligatoire d’une bactérie

I-1- Paroi
- Le peptidoglycane
- La paroi des bactéries à GRAM + / La paroi des bactéries à GRAM –

I-2-Membrane cytoplasmique
- Mésosome

I-3- Cytoplasme
I-4-Appareil nucléaire
I-5-Ribosomes
II-Composants facultatifs d’une bactérie

II-1-Capsule
II-2- Glycocalyx
II-3- Plasmide
II-4-Transposon
II-5- Flagelles
II-4- Fimbriae/Pili
II-5-Spore
 Objectifs du cours

 Acquérir les connaissances sur la structure bactérienne.

 Identifier les composants obligatoire de la bactérie et leurs

fonctions.

 Identifier les composant facultatif d’une bactérie et leurs

fonctions.

 Acquérir des connaissances portant sur les différences de

structure de la paroi entre les bactéries à GRAM positif et à
GRAM négatif.
 Introduction
• Une bactérie est un être unicellulaire (procaryote) de
petite taille, de morphologie variable qui présente des
caractéristiques propres.
• doué d’un mode de vie autonome.
• La taille d’une bactérie varie entre 1 à 10 µm (0,3 – 2,5 µm)
• Elle contient 70% d’eau.
Rapporté au poids sec, une bactérie est constituée de :
• Protéines (55%), lipides (10%), lipopolysaccharides (3%)
• Peptidoglycane (3%)
• ribosomes (40%)
• ARN (20%)
• ADN (3%).
 Introduction

• Nous allons voir ensemble l’organisation

structurale d’une bactérie
 Structure bactérienne

Eléments obligatoire Eléments facultatifs

• Paroi bactérienne • Capsule

• Glycocalyx
• Membrane cytoplasmique • Plasmide
• Cytoplasme • Transposon
• Ribosome • Flagelle
• Pili/Fimbriae
• ADN chromosomique
• Spore
I- Eléments obligatoires
I-1-Paroi :
Définition de la paroi: est une structure rigide, de nature polymérique.
Les polymères et leur mode de liaison varient selon les espèces
bactériennes.
 Retrouvé uniquement chez les bactéries,
 est un élément obligatoire dans la structure des bactéries.

Il existe
- la paroi des bactéries à Gram positif
- La paroi des bactérie à Gram négatif
- des parois particulières : les Mycobactéries

les Mycoplasmes sont dépourvus de paroi

Le constituant de base de la paroi est dit :

• Peptidoglycane ou mureine : c’est un héteropolymère dont la

chaine principale est faite d’une alternance de deux sucres
 N- acetyl glucosamine (NAG)
 l’acide N- acetyl muramique (ANAM ou NAM)
 relier par des ponts penta-peptide
 Un ensemble de chaînes latérales peptidiques
identiques, composées de 4 acides aminés et attachées à
l'acide N-acétyl muramique .
La chaine NAM-NAG est la même pour toutes les espèces bactériennes tandis que les chaînes
latérales de tétrapeptides et les ponts interpeptidiques varient d'une espèce à l'autre.
Synthèse du peptidoglycane se fait en trois étapes et en trois
lieux différents :

1. Le cytoplasme : synthèse des précurseurs dont le N acétyl

glucosamine , le N acétyl muramyl ,pentapéptide (L-alanine,
D- glutamine, L-lysine, D-alanine, et la D-alanine)

2. La membrane cytoplasmique : on retrouve un transporteur

de nature lipidique l’undécaprényl phosphate qui prend en
charge les précurseurs .
 3. Extérieur de la membrane cytoplasmique :

 Formation de liaison osidique entre le N acétyl glucosamine et

le N acétyl muramique grâce à une trans-glycosylase.

 Formation des liaisons peptidiques entre le troisième acide

aminé du premier penta peptide et le quatrième acide aminé du
deuxième penta peptide grâce à une transpeptidase .
Cette liaison se fait directement ou par un pont de glycine.

 Le cinquième acide aminé du deuxième penta peptide est

éliminé par une décarboxylase.
La chaine NAM-NAG est la même pour toutes les espèces bactériennes tandis que les chaînes
latérales de tétrapeptides et les ponts interpeptidiques varient d'une espèce à l'autre.
Les différents type de paroi
 Paroi des Bactéries à Gram - Paroi des Bactéries à Gram +
• Plus fine
-Membrane externe ( deux feuillets • épaisse
dense limitant un feuillet transparent • PG (20-80 nm) associé à
de nature LPS, de phospholipides et de
protéines l’acide Teichoȉque (
- Une couche de PG ( 5 nm) carbohydrates)
• Division sous forme d’ étranglement • Existence d’un septum de
• Les bactériophages se fixent sur les LPS division ( cloison
transversale
Paroi des bactérie à Gram Positif

• Peptidoglycane représente 90% de la paroi avec une

épaisseur de 20-80 nm

• Acides teichoiques reliés au peptidoglycane

• Acides lipoteichoique reliés aux lipides de la membrane

plasmique

On retrouve aussi :Polyosides C

Paroi des Bactérie à Gram Négatif

• Peptidoglycane représente 5 à 20 % de la paroi

• Membrane externe membrane trilamellaire avec deux

couches de phospholipides présentant un pôle hydrophobe
et un pôle hydrophile, à sa face externe certains
phospholipides sont remplaces par:

Les lipopolysacharides (LPS) : est une Endotoxine

La lipoprotéine de Braun
Protéines de la membrane externe (OMP)
 Les lipopolysacharides ou LPS est une Endotoxine formée de 03
parties :
• Lipide A : enfoui dans le membrane
externe est souvent toxique Ag O
Polysac
• Polysaccharide central lié au lipide A charide
avec 10 sucres. Lipide A

• La chaîne latérale O ou antigène O,

constitué de quelques sucres dont la
composition varie selon les souches
bactériennes, responsable de la
spécificité antigénique.
 La lipoprotéine de Braun relie la membrane externe au
peptidoglycane.
 Protéines de la membrane externe (OMP) sont de deux types : Les
OMP non structurales et les OMP porines.
Porines: structure de transport des composés hydrophiles
essentielles à la vie et à l’action de certains antibiotiques
Tableau comparatif entre la paroi des Bactérie Gram+ et des Bactéries Gram-

Bactérie Gram+ Bactéries Gram-

Constituants

Peptidoglycane + 90% + 5 à 20%

Lipopolysaccharides - +

Acides teichoiques + -

Acides lipoteichoique + -

Protéines +/- +

Lipides 01% 20%

Lipoprotéines - +
Fonctions de la paroi

• Forme et rigidité de la bactérie

• Protège contre la lyse osmotique ( maintient une pression osmotique
intracellulaire généralement très élevée)
• Spécificité antigénique
• Permet la différenciation entre bactérie Gram+/- (rôle dans
l’identification)
• Lieu d’action de certains antibiotiques qui inhibent la synthèse de la
paroi (les β lactamines, Glycopeptides), et des autolysines et des
lysozymes.
• Les lipopolysaccharides et le peptidoglycane sont capables d’activer le
complément par voie alterne libérant les fractions C3a et C5a ( effet
chimiotactique) et C3b (effet opsonisant).
Remarque :
- Protoplastes sont observés chez les bactéries à Gram positif.
- Sphéroplastes sont observés chez les bactéries à Gram négatif.
Coloration GRAM

• Christian Gram (1853-1938) a été l’inventeur de la

coloration en 1884.

• Son intérêt :Elle permet de distinguer la paroi des bactéries

à ayant : plus du peptidoglycane (Gram+ ) de celles ayant
moins de PG ( Gram-).
• Coloration en 4 étapes :
1. coloration par le violet de gentiane ;
2. mordançage avec du lugol (solution d’iode iodo-iodurée) ;
3. décoloration par l’alcool
4. coloration par la Fuschine

• Etapes 1 et 2 = coloration en violet du contenu de la bactérie et

fixation par le lugol des structures internes.
• Etape 3 = décoloration du cytoplasme des bactéries ayant une paroi
pauvre en peptidoglycane qui laisse passer l’alcool pour éliminer le
violet de gentiane = bactérie à Gram négatif
• Etape 4 = contre-coloration par la Fuschine teintant en rose les
bactéries précédemment décolorées.
• Les bactéries à Gram positif restent colorées en violet (pas de
passage à travers la couche de peptidoglycane. De l'alcool
• Les bactéries à Gram négatif seront colorées en rose ( car la paroi
est pauvre en PG)
Bactérie Bactérie
GRAM+ GRAM-
I-2-La membrane cytoplasmique
• Bicouches phospholipidique, les parties hydrophobes se font
face et son protégé dans les milieux aqueux, tandis que les têtes
hydrophiles externe y sont immergées. ( 5-10 nm d’épaisseur)
Pôles
hydrophiles

Pôles
hydrophobes

C’est une Mosaïque fluide, avec déplacement et rotation des

groupements lipidiques
• Elle limite le cytoplasme de la bactérie, c’est une membrane
trilamellaire formée deux couches de phospholipides ( 30-40
%) dont les pôles hydrophobes sont face à face.

• Dans la membranes cytoplasmique sont incérées à la surface

externes des protéines (60-70 %).

Elles sont :

• Des perméases permettant des échanges

• Des protéines ayant un rôle dans la synthèse du PG
• Des Protéines liant les pénicilline (PLP ou PBP )
• Des enzymes respiratoires
• Des protéines impliquées dans la production d’énergie
Fonctions :

1- Barrière perméable et sélective et transport de substances solubles

semi-perméable contrôle l'entrée de différentes substances grâce aux
perméase et l’excretion de substance. Elle a un rôle de barrière osmotique.

2- La respiration : la membrane cytoplasmique, contient les enzymes et les co-

enzymes de la chaîne respiratoire permettant la phosphorylation oxydative
(poumon de la bactérie)

3- Productrice d’énergie pour la bactérie grâce aux réactions d’oxydoréduction

et de phosphorylation oxydative sous forme d’ATP ( centrale électrique )

4-Supporte les enzymes et les transporteurs nécessaires à la synthèse d’ADN

et des constituants de la paroi
5- le flagelles bactériens y est fixés.

Remarque :
Les polypeptides (Colistine) est un antibiotiques qui détruit la membrane
cytoplasmique
I-2- Membrane cytoplasmique : a/Le mésosome

Mésosomes :
• Invagination de la membrane plasmique
• Contact avec l’ADN
• Jouerait peut être un rôle dans la synthèse de la paroi
• A un rôle dans la réplication du chromosome et sa distribution aux
bactéries filles
I-3 Cytoplasme

C’est un Hydrogel
colloïdal ( 70 % d’eau)
dépourvue d’organite

Existence d’un cytosquelette similaire au cellules Eucaryote (2010)

Constituer de protéine ( tubuline , actine et crescentine) donnant la forme
à la bactérie
 Cytoplasme comprend:

• Une solution de sels minéraux

• Des lipoprotéines et des lipides ,
• Des Inclusions :
Granule de matière organique ou inorganique : ce sont des réserves (
substances carbonés , Glycogène, le poly-β hydroxybutyrate et
substances inorganiques ( granules de polyphosphate)
• Ribosomes

• ARN solubles : ARNt et ARNm

I-4 Appareils nucléaires :nucléoïde

• L’appareil nucléaire ou nucléoïde est non entouré par une

membrane (différence avec les cellules eucaryotes)

• Le chromosome bactérien ( le plus souvent unique) est

constitué d’un filament d’ADN unique continu , circulaire
bicaténaire super enroulée constituant le nucléoïde. C’est le
support du matériel génétique.

• Déplié le chromosome bactérien a près de 1 mm de long

(1000 X la taille de la bactérie et 3-5 nanomètres de large.

• Il est composé de 60 % d’ADN, 30% ARN et 10% de protéines

Rôles

1- ADN ------ARN m ------- synthèse

de protéines de structures et
des enzymes

2- La réplication de l‘ADN est semi

conservative, et se transmit aux
bactéries filles avec tous les
caractères héréditaires.
Structure de l’ADN
I-5- Ribosomes
Le cytoplasme est souvent rempli de ribosomes ( E.coli:15 000 ribosomes)

Le ribosome : granulations sphériques qui peuvent être libres dans le

cytoplasme ( synthétisent de protéines intracellulaire) ou liés à la membrane
cytoplasmique ( synthétisent les protéines qui sont exportées).

Composition: c’est un complexe de protéines (1/3) et d’Acides ribonucléique

(ARN) 2/3 ( 16 S, 23S ,5S)

divisés en :
 sous unités 30 S ( ARN 16 S et 31 protéines )
 sous unité 50 S (ARN 23 S et 5 S avec 21 protéines.

Macrolides et apparentés agissent sur l’unité 50S

Aminosides et les Cyclines agissent sur l’unité 30 S
 Ribosomes
Plus petit 70 S que ceux des
cellule Eucaryotes appelé
Ribosome 80 S

L'ARN messager passe à travers la petite sous unité (30S) qui contient les sites
de fixation des ARNt.
La grande sous unité (50S) contient la partie catalytique qui effectue la
synthèse de la liaison peptidique entre les acides aminés consécutifs de la
protéine. Elle contient également un tunnel par lequel sort la chaîne protéique
en cours de synthèse.

ADN ------ARN m ------- synthèse de protéines de structures et des enzymes.

II- Eléments facultatifs :
 II-1-Capsule
• Capsule : structure de nature polysaccharidique (S.pneumoniae) et
quelquefois polypeptidique (Bacillus anthracis)
Situé à l’extérieur de la paroi

Rôle :
 Adhésion
 Empêche la phagocytose.
 Support de la virulence
 Support d’antigénique
 -Elle empêche la pénétration des antibiotiques

Intérêt:
Elle peut se trouver à l'état soluble dans les liquides de l'organisme
,dans le diagnostic = recherche d'antigène soluble).
• Ce typage par le gonflement de la capsule
Les polymères capsulaires purifiés sont la base de certains
vaccins (Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae).
II-2-Glycocalyx
•- Fibres polysaccharidiques ou polymères extrêmement fréquents
entourant la bactérie.

• Le feutrage des fibres du glycocalyx : biofilm parfois Slime

• Il est responsable de l'attachement des bactéries aux cellules

(cellules buccales, respiratoires......) ou à des supports inertes
(plaque dentaire , biofilms sur les cathéters, les prothèses .

• Il protège les bactéries à l’intérieur du biofilm de :

 la dessiccation,
 concentre les éléments nutritifs exogènes
 Des antiseptiques, désinfectants, antibiotiques.
 II-3-Plasmide

Définition
Les plasmides sont des molécules d’ADN circulaire double brin exta-
chromosomique (cytoplasmique)
- Non indispensable
-de taille variable (0,5-500 Kb)
-réplication indépendamment du chromosome
- transmissible de façon stable à la descendance
--Leur transmission d'une cellule bactérienne à une autre grâce au pili sexuel
(conjugaison ).

En.wikipedia.org
Fonction d’un plasmide
• Non indispensable au métabolisme normal de la bactérie
• Apporte des informations génétiques importante à la bactérie
• Permet une meilleure adaptation de la bactérie

Les facteurs sexuels qui interviennent dans le transfert du matériel génétique

par conjugaison

Microbes-edu.org
II-4-transposon
• Transposons : séquences d'ADN linéaires de taille limitée capables de
changer de localisation dans le génome sans jamais apparaitre à l'état
libre.
• Ils s’ intégre directement dans le génome (chromosome ou plasmide)
• Incapable de se répliquer.

Edu.upmc.fr
II-5- Flagelle
• Les flagelles : structure mince de 20 nm de Ø et 15-20 µm de
long rigide, constitué de d’une protéine appelée Flagelline
 Le flagelle se compose en 3
parties:
• filament
• Le crochet : + large et est
fait de différentes sous
unités protéiques.
• Le corps basal est enfoui
dans la membrane
cytoplasmique

fr wikipedia.org

Mobiles par rotation, comme une hélice, grâce à un mécanisme similaire à un « rotor »
fonctionnant grâce à l’énergie fournie par un gradient de protons.
•
• A : Monotriche ( Vibrio)
• B : Lophotriche
(Pseudomonas)
• C : Amphitriche
• D : Péritriche (E.coli)

Rôle:
 La locomotion
 Rôle antigénique (Les antigènes flagellaires (Ag H) déterminent différents
fr.wikipedia.org
sérotypes (exemple : sérotypage des Salmonella).
 II-6- Pili ou fimbriae
Appendices filiformes plus fins
que les flagelles
• Il existe : 1000 pilis
• Minces tubes de s/u
protéiques (Piline)
• Il existe:
Les pilis communs ( adhésine
donc fixation de la bactérie sur la
cellule cible )

Les pilis sexuels : plus long , codé

par un plasmide ) :transfert d’un
plasmide conjugatif d’une
bactérie à une autre). Rehydrate.org/gopixpic.com/microbiologybytes.wordpress.com
 Microbiologie-medicale.fr/ futura-science.com

II-7-Spore
• Spore : certaines bactéries ont le
pouvoir de se transformées en
petites unités ovale ou sphériques
douées d’une résistance très
élevée lorsque les conditions
deviennent défavorables ( (carence
en éléments nutritifs …).

Ex: endospores : Bacillus, Clostridium.

 • Les spores sont de petites unités
ovales ou sphériques.
• Elles peuvent déformer ou non
le corps bactérien. Leur
position dans la cellule est
variable : centrale, terminale,
subterminale

Rôle : permet l’identification de certaines

bactéries ( Bacillus)
Intérêt dans la pathologie humaine:
- Conserve et cachir Botulisme ( Clostridium
botulinum)
-Tetanos plaie souillée par de la terre (
Clostridium tetani)
Bacillus anthracis responsable du charbon

Web.expasy.org/microbes-edu.org