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I. Pseudomonas aeruginosa
a) Caractéristiques
Pseudomonas aeruginosa est une bactérie appelé bacille pyocyanique, car elle produit une substance du nom de
pyoverdine qui peut colorer une plaie ou ses colonies de culture en vert-bleu/vert-gris (pyo = pus et cyanique = bleu).
La bactérie est de couleur vert-de-gris.
Elle est surtout responsable de surinfections des plaies. Elle a beaucoup été observé au cours de la Première Guerre
Mondiale. C’est l’exemple-type des bactéries nosocomiales opportunistes. On parle de bactéries pathogènes
opportunistes (BPO).
b) Taxonomie
• Genre Pseudomonas :
Correspond à :
c) Epidémiologie
Selon l’Enquête nationale de prévalence des infections nosocomiales en 2012, P. aeruginosas est la troisième cause
d’infection chez l’Homme. Elle est loin derrière E. coli qui est la première bactérie responsable d’infections
nosocomiales (26%), suivie de S. aureus (15%) et ensuite de P. aeruginosas (8,4%). Et contrairement à E.Coli qui est
aussi un pathogène communautaire, P. aeruginosas uniquement un pathogène hospitalier.
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d) Habitat
• C’est une bactérie ubiquitaire, saprophyte de l’environnement. On la retrouve partout où il y a de
l’eau : eaux de surface, sol, végétaux, fruits, légumes (salade, tomates, carottes…), océans… Elle s’accommode des
milieux humides, pauvres en nutriments (survie 300 jours dans un état de dormance dans l’eau à 37°C).
• Elle peut aussi être commensale du tube digestif, c’est pour cela qu’on la recherche par écouvillonnage
rectal.
• Pour finir, elle est commune dans l’environnement hospitalier : fleurs, plantes en pots, fruits et
légumes, siphons d’évier, robinets, douches, siphons, humidificateurs, respirateurs, nébuliseurs, antiseptiques auxquels
elle résiste (ammonium quaternaires), même sur le savon…
e) Physiopathologie
La physiopathologie est liée à la production de mucus qu’elles colonisent facilement. (Elles peuvent aussi coloniser les
plaies via des facteurs d’adhésion, des adhésines de la membrane externe).
• De nombreux facteurs de virulence permettent la colonisation de l’hôte (uniquement des patients immuno-
déprimés) :
- Toxines : hémolysines, phospholipase C, exotoxine A, exoenzyme S, LPS, cytotoxines, entérotoxine…
- Protéases : élastase, neuraminidase…
- Alginate (du sucre) des souches muqueuses (très important pour la colonisation des patients atteint de
mucoviscidose)
- Pigmentations : Pyocyanine : pigment bleu, spécifique du pyo, cytostatique ou Pyoverdine : pigment jaune-vert
fluo, produite par d’autres espèces de Pseudomonas (P. fluorescens, P. putida), sidérophores.
• Il est d’autant plus important que le patient est immunodéprimé. L’immunodépression étant liées à
l’âge (nouveaux nés, personnes âgées), aux surinfections, aux maladies chroniques, au diabète, aux cancers, aux aplasies,
et aux corticothérapies au long cours, aux immunosuppresseurs, grands brûlés et patients atteints de mucoviscidose.
• Un patient qui reçoit un traitement d’ATB à large spectre aura tendance à sélectionner au sein de ses
flores commensales le Pseudomonas car + résistant que les entérobactéries classiques…
• Chez l’immunocompétent (notamment les fleuristes, professions en contact avec l’eau) : infections
cutanées, oculaires et ORL.
Les types d’infections :
• Les infections sont très variables comme toute BPO. On les retrouve partout : surtout au niveau
pulmonaire (patient sous ventilation mécanique sujet à des infections, patient mucoviscidose), urinaire,
ostéoarticulaire, oculaire …
• Cutanées : onyxis, infections interdigitales, surinfections d’ulcères, Risque : brûlés+++,
• Bactériémies : nosocomiales ++ : > 50% de mortalité, Endocardites, Entérites (rare)
g) Caractère mucoïde de P. aeruginosa :
Ces bactéries fabriquent une substance qui est un mucus appelé alginate (sucre). La production d’alginate, a un « coût »
important pour la bactérie, cela arrive en général dans un temps avancé de la mucoviscidose.
L’alginate permet une agglutination des bactéries (elles sont engluées dans ces sucres), de mieux adhérer aux cellules et
de résister aux sécrétions pulmonaires et à la phagocytose.
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On observe la formation de micro-colonies engluées au sein d’un biofilm. L’augmentation de la viscosité des sécrétions
empêche une clairance ciliaire efficace et les bactéries ne sont donc pas éliminées. Le biofilm permet l’échappement
du germe à la réponse immunitaire (phagocytose).
Cela permet également de résister aux antibiotiques, car dans le mucus les bactéries ne se multiplient plus, ce qui les
rend insensible à l’action des bêta-lactamines.
h) Diagnostic
i) Antibiothérapie
P. aeruginosas est une bactérie peu virulente mais assez résistante aux antibiotiques :
• Nombreuses résistances naturelles :
– AMX, Augmentin, AMC, Céphalosporinase naturelle, C1G, C2G, et certaines C3G (cefotaxime,
ceftriaxone),ertapénème (= Carbapénème)
– Quinolones, SXT, cyclines, chloramphénicol, kanamycine, macrolides, glycopeptides….
• ATB actif :
– C3G : Ceftazidime (Fortum®) +++, céfépime qui la molécule anti-pyocyanique par excellence
– Pénicillines hautes : TIC, TCC, PIP, TZP
– Carbapénèmes : toutes sauf Ertapénème (imperméable à cette molécule)
– Ciprofloxacine (Ciflox®)
– Aminosides : tobramycine, gentamicine, amikacine…
– Fosfomycine
– Colistine
• Pourcentage de résistances :
La proportion de résistance à la Ceftazidime est assez stable dans tous les pays mais varie en fonction du pays. En France,
on est autour de 12% des souches. La résistance à la Ceftazidime est causée par l’hyperproduction de céphalosporinase.
Idem pour la résistance aux carbapénèmes (13%) qui reste stable. Ce qui est en train de changer est le pourcentage de résistance
enzymatique liées à la présence de carbapénèmases.
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a) Epidémiologie
Acinetobacter baumannii (AB) est une bactérie très rare et très peu virulente. En France, elle représente moins de 1%
des infections nosocomiales. Elle n’infecte que des patients dans un état déjà grave, très immunodéprimés comme des
patients en réa, sous ventilation mécanique.
b) Taxonomie
C’est une bactérie proche de la famille des Neisseriaceae mais appartient à la famille des Moraxellaceae.
• Genre : Acinetobacter
- Grande hétérogénéité phénotypique et génétique
- Actuellement : 34 groupes génomiques (25 espèces)
(Pour rappel : genre génomique = classification basée sur de la séquence ou des caractères biochimiques et
enzymatiques)
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c) Habitat
• Acinetobacter :
- Bactéries ubiquitaires, saprophytes de l’environnement : eau, sol, animal, alimentation (produits laitiers,
viande…)
- Bactéries commensales de la flore cutanée humaine (plis humides du corps, espaces interdigitaux)
• Baumannii :
• Très faible pouvoir pathogène car très peu de facteurs de virulence donc opportuniste +++
• La bactérie s’attaque aux malades fragilisés +++ et hospitalisés et notamment les patients en réa.
• Elle représente 1% des pathogènes hospitaliers mais 10% des pneumonies nosocomiales en Réa avec 17-50% de
mortalité pour des bactériémies selon les études à A. baumannii surtout si elles sont BMR voire ABRI (Acinetobacter
baumannii résistant à l’imipénème) avec risque d’impasse thérapeutique.
Cette bactérie évolue sous forme épidémique (il faut donc appliquer des mesures d’hygiène importante pour contenir
l’épidémie) :
- Bactériémies à point de départ KT (de cathéter)
- Infections pulmonaires
- Infection Site Opératoire, urinaires +++
e) Diagnostic
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- Coccobacilles à Gram négatif
- Immobile
- Oxydase –
• Identification : spectre de masse (MALDI TOF) b qui donne au moins le complexe mais dans 90% des
cas c’est Acinetobacter
f) ATBthérapie
• Quelques résistances naturelles :
- Céphalosporinase naturelle produite : AMX, AMC, C1G, C2G, cefotaxime, ceftriaxone, ertapénème
- Fosfomycine, triméthoprime
• ATB actif :
- TIC, TCC, PIP, TZP, Ceftazidime (Fortum®), céfépime, imipénem ++, méropénem, doripénem
- Quinolones et Fluoroquinolone (FQ)
- Aminosides : tobramycine, gentamicine, amikacine…
- Colistine si souche résistance à tous
- Cyclines
- SXT
• MAIS les souches hospitalières sont très souvent multirésistantes : elles résistent à presque tout, même
auxcarbapénèmes !
À Bicêtre pour parler de multirésistance, on regarde 4 marqueurs, si 2 de ces 4 marqueurs présents ont dit que la souche
est résistante. Il y a peu de résistances isolées à partir de souches à Bicêtre (environ une trentaine)
La résistance aux carbapénèmes arrive en France et est souvent liée à des patients qui ont été rapatriés en France après
un séjour à en réa en Grèce ou en Italie. Il faut donc mettre en place des bonnes mesures d’hygiène
Exemple de la Grèce :
En 1997, la résistance aux carbapénèmes était très faible et en l’espace de 4 ans, on est passé à 30% de résistance, puis
2006, 91% et aujourd’hui presque 100% de résistance à tous les ATB sauf la Colistine.
30% des Acinetobacter sont résistants aussi à la Colistine, ce qui entraine les soignants et patients dans une impasse
thérapeutique.
I. Introduction à la résistance
Depuis la découverte des antibiotiques par Flemming, leurs utilisations dans le milieu médicale depuis 20 ans est
massive.
Or à chaque fois que l’on utilise un antibiotique on crée inéluctablement de la résistance, et ce d’autant plus vite
que l’on utilise mal l’antibiotique.
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II. Les 2 types de résistances
• Il existe 2 types de résistance des bactéries aux antibiotiques :
- La résistance naturelle : Les caractéristiques phénotypiques d’une espèce bactérienne
- La résistance acquise : Nouvelle résistance obtenue après sélection.
On ne peut pas arrêter la résistance car nous continuons à utiliser les antibiotiques
III. La multirésistance
• Résistance acquise à plus d’une classe d’ATB par accumulation de résistances naturelles et acquises. Les bactéries ne
sont plus sensibles qu’à un petit nombre d’ATB habituellement actifs en thérapeutique.
• Les critères sont différents et évolutifs selon l’établissement, la région, le pays.
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En France on utilise 3 fois plus d’antibiotique qu’en Suède pourtant on n'a pas des malades 3 fois plus grave. Cela reste
un choix des politiques de santé, mais quoi qu’il en soit, diminuer la consommation d’antibiotique amène à diminuer la
résistance.
Si on a besoin d’antibiotiques, il faut veiller à bien les utiliser : choisir des molécules à bon escient sur des pathogènes
bien documentés.
L’un des principaux convoyeurs de BMR (bactérie multi résistantes) est le tourisme, en effet lors d’une étude sur 600,
51% d’entre eux sont revenus avec un BMR car ces bactéries sont partout dans l’environnement.
Heureusement 90% d’entre eux se sont décolonisés de ces BMR en 3 mois par rétablissement de la flore commensale
local/normal.
Cependant pendant ces 3 mois 12% d’entre eux ont contaminés leurs familles avec les BMR
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- Mise en place du dépistage systématique des BMR pour les patients en réanimation.
- Search and Isolate
- Lavage des mains au savons
-
En 2000 : On a la mise en place de l’utilisation du SHA : solution de gel hydroalcoolique qui as une meilleure compliance
que le lavage aux savons.
I. Infections nosocomiales = IN
a) Hygiène
• Définition (Robert) : « ensemble des principes et des pratiques tendant à préserver et à améliorer la santé».
• Objectifs :
Améliorer la qualité et la sécurité des soins
Prévenir le risque infectieux
En 1992, on définit les infections nosocomiales. Il s’agit d’une infection contractée dans un établissement de soins,
que les symptômes apparaissent lors du séjour à l’hôpital ou après. Lorsque l’état infectieux du patient n’est pas
connu, l’infection est classiquement considérée comme nosocomiale si elle apparaît après un délai de 48 heures
d’hospitalisation. Cette infection peut être liée aux soins (infection iatrogène) ou simplement survenir lors de
l’hospitalisation indépendamment de tout acte médical (exemple : épidémie de grippe).
La plupart du temps, le patient s’auto-infecte (par exemple avec un micro-organisme dans son tube digestif). Il n’y a
pas forcément d’erreur commise ou d’acte de transmission d’une bactérie d’un patient A à un patient B.
En 2007, on change donc cette définition. On ne parle plus d’infection nosocomiale, mais d’infection dite associée aux
soins :
- Une infection est dite associée aux soins si elle survient au cours ou au décours d’une prise en charge (diagnostique,
thérapeutique, palliative, préventive ou éducative) d’un patient, et si elle n’était ni présente ni en incubation au début
de la prise en charge.
- Lorsque que l’état infectieux au début de la prise en charge n’est pas connu précisément, un délai d’au moins 48h ou
un délai supérieur à la période d’incubation est couramment accepté pour définir une IAS. Toutefois, il est
recommandé d’apprécier dans chaque cas la plausibilité de l’association entre la prise en charge et l’infection.
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- Pour les ISO, on considère habituellement comme associées aux soins les infections survenant dans les 30 j suivant
l’intervention ou, si mise en place d’un implant, d'une prothèse ou d’un matériel prothétique, dans l’année qui suit
l’intervention. Toutefois, et quel que soit le délai de survenue, il est recommandé d’apprécier dans chaque cas la
plausibilité de l’association entre l’intervention et l’infection, notamment en prenant en compte le type de germe en
cause. En effet, suivant l’intervention chirurgicale, on peut étendre ce délai à 1 an.
On différencie les IAES (Infections associées à l’environnement des soins), des IAAS (Infections associées aux actes
de soins)
Les infections associées à l’environnement des soins (IAES) concernent :
- Les résidents des structures,
- Les soignants,
- Les visiteurs
Par exemple : infections d’origine environnementale (légionellose dans l’eau des douches, aspergillose de la poussière) ;
infections dues à des micro-organismes à transmission interhumaine (grippe, gale, certaines BMR)
On parle d’infections associées aux actes de soins (IAAS) :
- Quel que soit le lieu où l’acte de soins est réalisé : en établissement de santé ou en dehors donc même à domicile
- Quelle que soit la finalité du geste : diagnostique, thérapeutique, dépistage, ou prévention primaire
- Elles dépendent de l’état pathologique sous-jacent du patient.
On peut mesurer :
- La prévalence : fréquence des infections (à un temps t)
- L’incidence : vitesse de propagation de l’infection
Le résultat est exprimé en pourcentage : taux de prévalence, taux d’incidence... En règle générale, on fait surtout des
études de prévalence.
En France, tous les 4-5 ans, Santé Publique France encadre l’enquête nationale de prévalence. Presque 90 % des
hôpitaux participent. Elle a pour objectif :
• Décrire :
- Les infections nosocomiales par type d’ES (= établissement de santé), service, site infectieux, micro-organisme,
- Les traitements anti-infectieux par molécule, famille et indication.
• Connaître le niveau de résistance dans chaque ES (résultats locaux), au niveau régional et national (et international).
• Sensibiliser et former
- Au risque infectieux,
- A ses méthodes de surveillance.
• Comparer :
- Dans le temps (par rapport à ENP précédente),
- Aux autres pays européens (protocole ECDC).
• Enquête ponctuelle : un jour donné tous les 5 ans.
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- L’évolution de la résistance :
o S. aureus : 13,8 % en 2017 / 15,9 % en 2012 / 18,9 % en 2006 / 19,8 % en 2001 => R diminue (lié en grande partie à
l’utilisation de SHA, aux dépistages)
o SARM %/S. aureus isolés : 26,5 % en 2017 / 38,1 % en 2012 / 52,4 % en 2006 / 64,0 % en 2001 => R diminue
o Entérobactéries : C3G-R : 22,52 % / BLSE : 15,33 %
- Consommation d’ATB :
1. Augmentin, mais diminue de 9,7% entre 2006 et 2012
2. Pipéracilline tazobactam a augmenté de presque 100%
3. Les carbapénèmes ont augmenté de 40% entre 2006 et 2012 car les BMR émergent, notamment les BLSE.
Chaque établissement de santé est censé mettre en place un CLIN, Comité de Lutte contre les Infections
Nosocomiales. Dans ces comités, on trouve :
- Le ROLLIN : C’est un comité de médecins (infectiologues, chirurgiens…) et de personnel soignant qui siègent et qui
décident d’un certain nombre de mesures à mettre en place.
- L’Équipe Opérationnelle d’Hygiène = EOH : C’est un groupe d’exécutants, il comporte un médecin hygiéniste, des
infirmières hygiénistes et un laboratoire qui s’occupe des prélèvements d’hygiène. Ils se déplacent aussi de services en
services pour faire de la prévention. Ce sont eux qui sont chargés de déclarer les infections nosocomiales. Ils sont chargés
de la maitrise du risque infectieux.
L’objectif est de protéger les patients et le personnel vis-à-vis du risque de transmission des agents infectieux lors de
contact avec le sang, les liquides biologiques et tout autre produit d’origine humaine.
La transmission croisée des agents pathogènes par les mains du personnel soignant est la cause principale :
- Des infections associées aux soins (IAS)
- De la propagation de germes résistants aux antibiotiques
Lorsqu’un patient est hospitalisé, on met en place 7 précautions standards : ce sont les précautions universelles. Elles
s’appliquent à tout type de patient.
La première des recommandations est la plus évidente et la plus importante, c'est le lavage des mains avec du savon
antiseptique ou du SHA (solution hydro alcoolique) :
- Avec du savon antiseptique : en se lavant les mains pendant 1min 30 mais (il restera plus de bactéries que si on utilise
du SHA).
- Avec les solutions hydro-alcooliques : plus pratiques car plus rapides (30 secondes au total face à 1min30 pour le
lavage simple des mains, elles sont aussi plus efficaces que le lavage au savon pour supprimer les bactéries (voir photo
ci-dessus). Il est donc recommandé de privilégier la friction au SHA que le lavage des mains standard au lavabo pour
une meilleure décontamination des mains et donc une réduction de transmission de germes.
Prérequis au lavage des mains :
- Ne porter ni montre, ni bijou, bague ou alliance qui sont de grands
porteurs de germes,
- On préconise d’avoir les avant-bras découverts,
- Utiliser le SHA,
- Ongles courts sans vernis,
- SHA doit être appliqué sur des mains sèches et propres,
- Utiliser un volume de SHA suffisant pour permettre une friction d’une durée suffisante (soit 30sec).
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Précautions complémentaires
Ces précautions sont mises en place dans certaines situations pour maitriser la transmission croisée de bactéries
multirésistantes.
Dans un premier temps, il faut respecter les précautions standard, en particulier l’hygiène des mains.
Les précautions complémentaires sont généralement associées au dépistage, à de la signalisation, de l’information. Si
une BMR est mise en évidence, l’infirmière hygiéniste vérifiera que le patient est bien isolé, qu’il y a un personnel dédié,
que les normes d’hygiène sont bien respectées.
Précautions Complémentaires Air gouttelette (PCA) :
Précaution AIR « A » gouttelettes < 5µ (exemple : tuberculose, rougeole, varicelle) : risque de diffusion dans un grand
volume, lors d’un éternuement par exemple.
• BK , syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS)…
• Masque « FFP2 » avant d’entrer et à retirer hors de la chambre.
• Le patient doit porter un masque de soin lorsqu’il sort de sa chambre.
• Porte fermée.
• Chambre à pression négative à renouvellement d’air > 6 vol/h. Si les gouttelettes (grippe, coqueluche) sont > 5µ, les
précautions seront allégées.
Isolement protecteur : pour protéger le patient par exemple un patient neutropénique
- Hygiène des mains avant d’entrer : SHA
- Masque, gants, surblouse, charlotte à mettre avant d’entrer et à retirer hors de la chambre.
- + /- chambre à pression positive.
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Signalisation précautions devant les chambres des patients :
- C : transmission par contact.
- G : transmission par gouttelettes provenant des voies aériennes (>5µ)
- A : transmission par gouttelettes provenant des voies aériennes (<5µ)
- P : protecteur
Les BMR = bactéries multi-résistantes :
On retrouve deux catégories de BHREs (bactéries hautement résistantes épidémiques) :
- EPC : entérobactéries productrices de carbapénèmases.
- ERG : entérocoques résistants aux glycopeptides.
Annales :
2020/2021
Réponses : A, D, E
2019/2020
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Réponse : Colistine
Réponse : A, B, D
Réponse : A, C
2018/2019
Réponses : A, C, D
2017/2018
Question 6 : Les précautions standards :
A. Sont des précautions universelles d’hygiène.
B. Recommandent le confinement du patient porteur dans sa chambre.
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C. Elles visent à protéger patients et personnels vis à vis du risque de transmission des agents infectieux.
D. L’hygiène des mains en est la plus importante.
E. Recommandent la fermeture de la porte de la chambre.
Réponses : a,c et d
2016/2017
Question rédactionnelle :
Pseudomonas aeruginosa : Habitat, physiopathologie, diagnostic bactériologique, sensibilité aux antibiotiques
Réponses : b,c et d
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