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1ère Année Médecine Dentaire
COURS DE
CHIMIE ORGANIQUE
DR G. MERABET
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Cours Chimie Organique Dr Atmani-Merabet. G
1ère Année Médecine Dentaire
CHAPITRE I
DEFINITIONS ET CONCEPTS GENERAUX
Introduction
La chimie organique est le domaine de la chimie qui étudie les composés du carbone. Ces composés
sont constitués essentiellement de carbone d’hydrogène et très souvent d’oxygène, d’azote, de
soufre, d’halogènes, de métaux et de non métaux. Les atomes autres que le carbone et l’hydrogène
sont appelés : les hétéroatomes.
La chimie organique est la source de presque la moitié de l’activité industrielle mondiale.
- La synthèse de macromolécules qui sont utilisées dans la fabrication des plastiques, des
verres, des colles, des films…….
- Certaines familles organiques possèdent des propriétés qui permettent de fabriquer les
parfums, les colorants, les produits explosifs…….
- La chimie organique est la base de la fabrication des médicaments, elle est omni présente
dans le domaine de la pharmacie et de l’agroalimentaire.
B- La formule développée
Cette formule permet de donner les positions relatives des atomes dans la molécule, on
détaillera toutes les liaisons.
Exemple : C5H12
H H H H H H
H-C–C–C–C–C–C-H
H H H H H H
C- La formule semi-développée
On l’utilise quand la formule développée devient très grande.
Exemple: C5H12
CH3 – CH2 – CH2 – CH2 – CH3
D- la formule compacte
Elle simplifie les formules développées, les liaisons ne sont représentées, et les groupes
identiques sont mis entre parenthèses avec un indice qui indique leur multiplicité.
Exemple : Le pentane : C5H12
CH3 (CH2) 3CH3
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II- Classification des atomes de carbones
Un atome de carbone sera :
Primaire : s’il est lié à un seul atome de carbone
Secondaire : s’il est lié à un deux atomes de carbone
Tertiaire : s’il est lié à un trois atomes de carbone
Quaternaire : s’il est lié à un quatre atomes de carbone.
Il sera nullaire quand il n’est lié à aucun atome de carbone, c’est le cas de la molécule du méthane
CH4.
Exemple : I
CH3
IV III CH3
II
CH3 CH2 C CH
CH3
CH3
III- Les fonctions organiques
La fonction organique caractérise des composés chimiques qui ont des propriétés chimiques
identiques. Ces composés contiennent des groupements d’atomes identiques qui sont appelés : les
groupements fonctionnels ou les groupes fonctionnels.
Exemple : les acides carboxyliques : CH3 COOH
Les alcools : C2H5OH
On peut donc classer les composés organiques en famille de fonction on aura les familles des alcools,
des acides, des aldéhydes, des cétones, des amines………
Les hydrocarbures qui sont des composés ne contenant que des atomes de carbone et d’hydrogène
sont pris comme référence pour définir les fonctions principales. Ces fonctions sont formées en
remplaçant un ou plusieurs hydrogènes par des groupes fonctionnels.
Exemple : CH4 CH3 COOH
CH3 H CH3 NH2
CH3 OH
CH3 CHO
Il existe trois catégories d’hydrocarbures :
1-Les hydrocarbures aliphatiques
Ce sont des hydrocarbures à c haine ouverte et il existe trois groupes : les alcanes, les alcènes et les
alcynes.
a- les alcanes : formule générale CnH2n+2
Ce sont des hydrocarbures saturés (ils ne possèdent ni double ni triple liaisons), ils sont constitués de
carbones tous hybridés sp3, et ils peuvent être linéaire ou ramifiés.
Exemples :
CH3
CH3 – CH2 – CH2 – CH2 – CH2 – CH2 – CH3 CH3 – CH2 – CH2 – CH – CH2 – CH3
Alcane linéaire Alcane ramifié
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CHAPITRE II
LA NOMENCLATURE DES COMPOSES CHIMIQUES
Introduction
Jadis, les composés organiques portaient des noms qui ne suivaient aucune règle précise (des noms
triviaux). Actuellement, la nomenclature est établie par L’IUPAC (l’union internationale de la chimie
pure et appliquée). Ces règles permettent de nommer les composés organiques en prenant les
alcanes comme référence
I - La nomenclature des alcanes : CnH2n+2
1- Les alcanes linéaires (voir tableau -1-)
Les quatre premiers alcanes portent des noms simples, les suivants portent des noms formés d’un
préfixe qui indique le nombre de carbone de leur chaine suivi de la terminaison « ANE ».En enlevant
un hydrogène à l’alcane on obtient un radical alkyle noté « R » son nom est celui de l’alcane
correspondant remplaçant la terminaison « ane » par « yle ».
Exemple : CH4 le méthane CH3- le méthyle
Tableau-1- Nom des alcanes à chaine linéaires CnH2n+2
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Les termes : cyclo – iso – tertio – sec – néo…entrent dans l’ordre alphabétique. (Tableau 2)
6- S’il existe plusieurs chaines principales d’égales longueurs on choisit :
a) Celle qui porte le plus grand nombre de substituants.
b) S’il y a égalité, on prendra la chaine pour laquelle les substituants possèdent les indices les
plus petits.
c) Si la condition (b) est vérifiée par les deux chaines, on prendra la chaine pour laquelle les
indices les plus petits sont donnés aux substituants classés 1er par ordre alphabétique.
7- Les radicaux alkyles quand ils sont en préfixe s’écrivent sans « e ». On verra l’application de
ces règles dans les exemples.
Exemples :
1- les alcanes ramifiés : (les exemples sont traités sur feuilles en cour)
Cyclopropyle
Phényle Ph
CH2
Benzyle
Exemples alcanes avec des radicaux usuels : (les exemples sont traités sur feuilles en cour)
Principe :
1- On choisit la chaine la plus longue et qui contient la double liaison ou les doubles liaisons.
2- Le plus petit indice est donné à la double liaison ce qui indique le sens de la numérotation de
la chaine principale (CP).
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3- L’indice de la double liaison est placé avant la terminaison ENE donnant ainsi le numéro du
1er carbone non saturé. (Application avec les exemples)
III- La nomenclature des alcynes : CnH2n -2
Ce sont des composés qui possèdent une triple liaison, leur nom se forme à partir de l’alcane de
même squelette en remplaçant la terminaison (ANE) par (YNE). Les règles de nomenclature sont
identique à celles des alcènes et si on a plus d’une triple liaison on aura les terminaisons : diyne,
triyne………. (Voir exemples)
A- Exemples des alcènes : (les exemples sont traités sur feuilles en cour)
B- Exemples des alcynes : (les exemples sont traités sur feuilles en cour)
Exemples des composés à (=) et triples liaison : (les exemples sont traités sur feuilles en cour)
1 2 3 4 5
Absences de substituants CH2 = CH - CH2 – C CH pent-1-èn-4-yne
6 5 4 3 2 1
CH3 - CH = CH - CH2 – C CH Hex-4-èn-1-yne
OH
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VI- Nomenclature des fonctions organiques : (Tableau 3 )
Ils sont considérés comme des dérivés des alcools dans lesquels le proton hydroxylique du - OH est
remplacé par un groupe alkyle -R’.
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Les éthers ne sont pas un groupe prioritaire et ils sont toujours désignés par le préfixe : oxy-
Exemple : méthoxy : CH3O- éthoxy : CH3CH2O- ………….
Introduction : La stéréochimie est l’étude des molécules dans l’espace, elle indique que des
molécules peuvent avoir la même formule brute, la même formule développée plane mais une
géométrie différente. L’étude de ces molécules dans l’espace est : L’isomérie-stérique ou La stéréo-
isomérie. L’étude de la stéréochimie demande la représentation de ces molécules dans l’espace (en
trois dimensions). Les représentations suivantes nous aident à écrire des molécules spatiales dans le
plan.
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Br
60° Br H
H 2
Br rotation de C1de 180° 1
H
2 H
1 H
H
H H Br (b)
(a)
rotation de C2 de 180°
rotation de C1de 60°
Br H H
H
H 2
H Br 2 1
1 H
H
Br
Br
H
(b') (a')
Exemple :
CH4
H
H
H H
H
H H
H
Br H
Br 2
Br rotation de C1de 60° 1
H
2 H
1 H
H
H H H (b)
(a)
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3- La projection de Newman
On regarde la molécule selon l’axe de la liaison entre les carbones C1C2. Le premier carbone (atome)
rencontré est représenté par un point sur le plan, le 2ème carbone rencontré est représenté par un
cercle. Les liaisons du 1er carbone partent du centre du cercle et celles du 2ème carbone partent de la
circonférence du cercle. 1 2 3
Exemple : propane-1,3-diol HOCH2 - CH2 - CH2OH.
CH2OH
H H
2 3
CH2OH 3 H
OH H H
2 H OH
H H
CH2OH
H H 3
H
H
CH2OH 3 2
H H
2
H
OH
H
H
4- La projection de Fisher
On place la chaîne hydrocarbonée la plus longue à la verticale avec ses substituants dirigés vers
l’arrière. Le carbone qui est indicé (1) selon l’IUPAC est placé en haut et le bout de chaîne en bas.
L’axe de la liaison C1C2(ou bien C1C2C3…..) selon la molécule est dans le plan. Les substituants
horizontaux sont projetés en avant du plan. Pour faire une projection de Fisher la molécule doit être
éclipsée. 4 3 2 1
Exemple (1): Acide- 2,3-dihydroxy butanoique : CH3 – CH(OH) – CH(OH) - COOH
1 1
COOH COOH
2 2
HO H HO H
3 3
HO H HO H
4 4
CH3 CH3
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(2) Fisher à partir d’une perspective
1
CH2OH
4
CH3
2
1 H H
CH2OH 3
OH 3
2 H H OH
H H
4
CH3
4
CH3
H
H
1
CH2OH 3 1
CH2OH 3
rotation de C3de 180°
2 2
4
CH3 H H
H H
H H
Cram décalée
Cram éclipsée
1
CH2OH
2
H H
3
H H
4
CH3
Fisher
II- L’ISOMERIE
Définition : Les isomères sont des composés qui ont la même formule brute mais des formules semi
développées différentes. Il existe trois types d’isomérie :
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2- L’isomérie de position
Les isomères de position possèdent la même fonction mais le groupe fonctionnel occupe des
positions différentes.
Exemple : C5H12O
OH
CH3-CH2 –CH2- CH2 – CH2OH CH3-CH –CH2- CH2- CH3
Pentan-1-ol (pentanol) pentan-2-ol
3-L’isomérie de fonction
Les isomères possèdent des fonctions chimiques différentes.
Exemple : C4 H10O
Remarque (1)
Pour le composé CxHyNzX, le nombre d’insaturation (i) est calculé par la relation suivante :
i = NC - [ NH + NX –NN ] + 1 X : Halogène
2 N : Azote
Remarque(2) : Une double liaison = 1 insaturation
Une triple liaison = 2 insaturations
Un cycle = 1 insaturation
Exemple : C4H8O
I = 4 – 8/2 + 1
I = 1 donc on a soit une (=) ou bien un cycle.
4 3 2 1 4 3 2 1
CH2 = CH - CH2- CH2OH et CH3 - CH = CH- CH2OH (isomers de position)
But-3- ènol But-2- ènol
OH
Cyclobutanol
III- LA STEREOISOMERIE
Définition : Les stéréo-isomères sont des isomères qui ont les mêmes fonctions, les mêmes
enchaînements des atomes mais ils sont différents dans leur position dans l’espace (géométrie). Il
existe deux types de stéréo-isomères :
✓ Les stéréo-isomères conformationnels
✓ Les stéréo-isomères configurationnels.
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H
H
H H 2
H rotation de C1de 60°
1 H
2
H
1 H
H
H H H
(a) éclipsée (b)décalée
H
H
rotation de C1 de 60°
1 2 1
2
- Une rotation d’un angle α = π / 3 autour de l’axe (liaison) C1C2 permet de passer de (a) à (b).
- L’arrangement des atomes est différent dans (a) et (b) donc ce sont des stéréo-isomères.
- Pour passer de (a) à (b) aucune liaison n’a été rompue, il a suffit d’une simple rotation donc ce sont
des stéréo-isomères conformationnels (conformères).
- La conformation décalée est plus stable que la conformation éclipsée.
- L’angle de rotation α varie de 0……2π donc on aura pour chaque valeur de α un conformère.
Pour passer d’un stéréo-isomère configurationnel à un autre il faut rompre (casser) et former au
moins une liaison covalente. Il existe deux types :
✓ Les stéréo-isomères configurationnels géométriques.
✓ Les stéréo-isomères configurationnels optiques.
H H Cl H
C C C C
CH3 H CH3
Cl
Configuration Configuration
Cis Trans
les deux hydrogènes sont les deux hydrogènes ne sont
du même coté de la double pas du même coté de la double
liaison liaison
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B- Les stéréo-isomères configurationnels optiques
1- La chiralité
Lorsqu’un objet n’est pas superposable à son image dans un miroir plan on dit qu’il est chiral, dans le
cas contraire il sera achiral. Les composés chiraux ne possède aucun élément de symétrie, on
prendra comme exemple la main. L’image d’une main droite est une main gauche, la main est
chirale, ne possède aucun élément de symétrie et elle n’est pas superposable à son image dans un
miroir plan. Le ballon est achiral.
a- Le carbone asymétrique : Il est noté C* et c’est un carbone qui possède quatre substituant
différents. Une molécule qui possède un carbone asymétrique est chirale, elle aura deux
configurations qui sont image l’une de l’autre dans un miroir plan. La molécule et son image sont des
énantiomères elles forment un couple d’énantiomères.
Exemple :
CH3
CH3
* *
H H
HO OH
Cl Cl
c- Définition : Deux énantiomères possède les mêmes propriétés physico-chimiques, mais des
pouvoirs rotatoires différents. L’énantiomère qui fait tourner le plan de la lumière vers la droite est
dit : dextrogyre noté (+) et l’énantiomère qui fait tourner le plan de la lumière vers la gauche est dit :
lévogyre noté (-). On dira donc que cette molécule chirale qui a fait tourner le plan de la lumière d’un
angle α est optiquement active, elle possède un pouvoir rotatoire spécifique donné par la relation de
BIOT :
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[0] = / L C
Inversement, une molécule achirale (superposable à son image dans un miroir plan) est optiquement
inactive son pouvoir rotatoire [α0 ] = 0.
d - Le principe de PASTEUR 1850
« Pourqu’une molécule soit optiquement active, il faut et il suffit qu’elle soit chirale ».
-Une substance qui contient un mélange équimolaire de deux énantiomères est un « Racémique ».
Le racémique est optiquement inactif, son pouvoir rotatoire spécifique [α0] = 0.
* *
d d
b b
c c
configuration (S) configuration (R)
Les deux configurations R et S forment un couple d’énantiomère. L’image de (S) est (R).
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O
-COOH -C - CH2- OH
OH
Remarques
1- Quand le plus petit substituant est en arrière du plan, le sens de la rotation est celui même
effectué dans le plan.
2- Si le plus petit substituant est en avant du plan, on fait la rotation dans le plan puis on
inverse la configuration.
Exemples
(1) OCH3 OH CH2 CH3 H (plus petit sub en arrière)
OCH3
*
H
CH3 CH2
OH
(R)
O
C
H
H OH
CH3 (R)
CH3
OH
3
2
OH
H
CH3
H
(2S, 3R)
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Remarques : Cas ou le plus petit substituant est placé dans le plan :
1- On se met en face du plus petit substituant.
2- On met le substituant placé en avant en haut, et on place les substituants qui restent à droite et
à gauche.
Exemples (1) OH CH2CH3 CH3 H (plus petit sub dans le plan)
H
CH3
CH2 CH3
OH
CH3
OH
CH2CH3
Cl
CH3
CH2CH3
(S) Cl OH
COOH
2
H OH
3
OH H
CH3
(2R, 3S)
4-Les diastéréoisomères
Ce sont des stéréo-isomères configurationnels qui ne sont pas images les uns des autres dans un
miroir plan. On les rencontre à partir de C* = 2.
I- Cas des composés contenant deux C* qui possèdent des substituants non identiques deux à
deux : (zéro élément de symétrie)
a d
* *
b e
c f
RR SS RS SR
I II III IV
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Il existe donc quatre stéréo-isomères (I – II, III, IV) tous optiquement actifs, car il n’ya aucun élément
de symétrie. Les stéréo-isomères (I et II) comme (III et IV) sont image l’un de l’autre dans un miroir
plan, donc on a deux couples d’énantiomères. Par contre les couples (I et III), (I et IV), (II et III) et (II et
IV) sont quatre couples de diastéréoisomères.
D’une manière générale, pour n C* il existe 2n stéréo-isomères, des symétries peuvent diminuer ce
nombre.
Exemple : Déterminer les stéréo-isomères du composé : acide-2,3,4 - trihydroxy butanoique.
On donnera à chaque fois la configuration absolue des carbones asymétriques et on utilisera la
projection de Fisher. 1 2* 3* 4
HOOC – CH – CH – CH2OH
OH OH
COOH
H
2 OH
3
H OH
CH2OH
C2*: OH COOH C3* H C3*: OH C2* CH2OH H
(2R , 3R)
COOH COOH
COOH COOH
H
2 OH 2 H
HO 2 2
H OH HO H
3 3
H OH HO H 3 3 OH
HO H H
CH2OH CH2OH
CH2OH CH2OH
- Quatre stéréo-isomères tous optiquement actifs : I , II , III, ,IV ( zéro élément de symétrie)
-Deux couples d’énantiomères : (I , II) (III , IV)
-Quatre couples de diastéréoisomères : ( I, III) ( I , IV) ( II , III) ( II , IV)
II- Cas des composés contenant deux C* qui possèdent des substituants identiques deux à deux
On étudiera l’exemple de la molécule du : 2,3 – dichloro butane.
CH3 – CH – CH – CH3 ( plan de symétrie)
1 2
Cl 3 Cl 4
CH3
2 Cl
H
3
H Cl
CH 3
I (2S , 3R)
C2*: Cl C3* CH3 H C3*: OH C2* CH3 H
CH3
CH3 CH3
CH3
H
2 Cl
2 H
2 Cl 2
Cl H Cl H
3
H Cl
3 3 3 Cl
Cl Cl H H
H
CH3
CH3 CH3
CH3
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Les deux molécules III et IV sont images l’une de l’autre dans un miroir plan, elles forment un couple
d’énantiomère. Par contre les molécules I et II sont superposables, si on tourne la molécule I
verticalement on obtient la molécule II. Donc elles représentent la même molécule elle est achirale
et optiquement inactive à cause du plan de symétrie (P). Cette molécule sera appelée la forme méso
son pouvoir rotatoire spécifique est nul [ α0 ] = 0.
Finalement le 2,3 – dichloro butane possède trois stéréo-isomères deux sont optiquement actifs et le
3èm (forme méso) est optiquement inactif.
2- Les réactions de substitution : Un atome ou un groupe d’atomes est remplacé par un autre atome ou
groupe d’atomes.
H – CH3 + Cl - Cl Cl - CH3 + HCl
3- Les réactions d’élimination : Des atomes sont perdus par une molécule, et il apparaît une liaison multiple.
1-LE SOLVANT : Il permet la dissolution des produits ou réactifs et il peut favoriser certaines réactions, Il existe
deux types de solvants :
- Les solvants non polaires tels que : l’hexane, le benzène le tétrachlorure de méthyle………………………
- Les solvants polaires tels que : l’eau, les alcools…………………………
a- Rupture homolytique ou symétrique : les deux atomes emportent chacun un électron, il se forme alors deux
radicaux.
A–A A • • A A• + A• (A• : radical)
b- Rupture hétérolytique : Le doublet est emporté par un des deux atomes créant une lacune électronique sur
l’autre, deux ions de charges opposées sont formés.
+ -
A - B A + IB
Carbocation carbanion
4 – LES REACTIFS ELECTRPHILES ET NUCLEOPHILES :
Les réactifs électrophiles sont des accepteurs d’électrons, ils possèdent des lacunes ce sont les acides de Lewis :
+
H–C BF3 AlCl3
Les réactifs nucléophiles sont des donneurs d’électrons, ils ont des doublets non liants ce sont des bases de
Lewis : - NI , - O – , - S - , - XI (Halogènes).
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