Clara Decarrière et Hippolyte Herman

TP2 : Etude de la structure d’un anticorps (Ac)

Chaîne L

Chaîne M

Molécule d’anticorps

Chaîne H

Chaîne I

MISE EN EVIDENCE DES DIFFERENTES CHAINES D’UN ANTICORPS (RASTOP)

Nous observons une comparaison simple des séquences d’acides aminés nous avons ici les
chaînes lourdes : la chaîne H et la chaîne I. La chaîne de référence H comprend 447 acides
aminés et la chaîne I comprend également 447 acides aminés. Alors il n’y a aucune
différence entre ces deux chaînes lourdes puisqu’elles sont identiques et donc il n’y a pas de
mutation.

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Clara Decarrière et Hippolyte Herman

Pour cette deuxième comparaison simple des séquences d’acides aminés, nous avons ici les
chaînes légères : la chaîne L et la chaîne M. La chaîne de référence L comprend 208 acides
aminés et la chaîne M comprend également 208 acides aminés. Alors il n’y a aucune
différence entre ces deux chaînes lourdes puisqu’elles sont identiques et donc il n’y a pas de
mutation.

COMPARAISON DES SEQUENCES PEPTIDIQUES DES DIFFERENTES CHAINES D’UN ANTICORPS

(ANAGENE)

Nous observons une comparaison alignement avec discontinuité qui comprend 458 acides
aminés, nous avons ici les chaînes lourdes : la chaîne H et la chaîne H2. La chaîne de
référence H comprend 447 acides aminés sans compter les discontinuités et la chaîne H2
comprend 457 acides aminés sans compter les discontinuités également. La chaîne H2
comprend 418 acides aminés à l’identique. Il y a plusieurs types de mutations dans cette

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Clara Decarrière et Hippolyte Herman

comparaison en effet par rapport à la chaîne de référence H il y a 28 substitutions. Voici

deux exemples où nous observons une substitution : aux 2èmes acides aminés nous
retrouvons, l’acide aminé Méthionine qui remplace la Valine ainsi qu’au 95èmes acide aminé
il y a une autre substitution, l’acide aminé Tyrosine remplace la Phénylalanine. Mais nous
retrouvons également une délétion aux 119èmes acide aminé, la tyrosine se retrouve avec la
perte d’un acide aminé. Et enfin, il y a 11 insertions, voici deux exemples où nous observons
ces insertions : aux 100èmes acides aminés, il y a l’ajout d’une Arginine et aux 109èmes
acides aminés, il y a l’ajout d’une Alanine.

Nous observons une comparaison alignement avec discontinuité qui comprend 216 acides
aminés, nous avons ici les chaînes légères : la chaîne L et la chaîne L2. La chaîne de
référence L comprend 208 acides aminés sans compter les discontinuités et la chaîne L2
comprend 216 acides aminés sans compter les discontinuités également. La chaîne L2
comprend 169 acides aminés à l’identique. Il y a plusieurs types de mutations dans cette
comparaison en effet par rapport à la chaîne de référence L il y a 39 substitutions. Voici
deux exemples où nous observons une substitution : au 1er acide aminé nous retrouvons,
l’acide aminé Glutamine qui remplace l’Alanine ainsi qu’aux 156èmes acide aminé il y a une
autre substitution, l’acide aminé Sérine remplace la Glycine. Enfin, il y a 8 insertions, voici
deux exemples où nous observons ces insertions : aux 55èmes acides aminés, il y a l’ajout
d’une Lysine et aux 99èmes acides aminés, il y a l’ajout d’une Valine.

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Clara Decarrière et Hippolyte Herman

COMPARAISON DE LA SEQUENCE PEPTIDIQUE DE 2 ANTICORPS DIFFERENTS (ANAGENE)

120 acides aminés de la chaîne lourde I

120 acides aminés de la chaîne lourde H

110 acides aminés de la chaîne légère L
110 acides aminés de la chaîne légère M

ETUDE DE LA POSITION DES REGIONS VARIABLES (RASTOP)

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Chaîne Y

Chaîne H

Chaîne L

Fragment d’anticorps lié à un antigène

OBSERVATION D’UN COMPLEX IMMUN (RASTOP)

Les anticorps ont la capacité de neutraliser les antigènes selon une réaction spécifique
durant laquelle l’anticorps se lie à l’antigène alors nous cherchons à connaître l’organisation
de la molécule d’anticorps pour comprendre cette liaison antigène-anticorps.
A l’aide de Rastop nous observons qu’un anticorps est une molécule en forme de « Y »
constitué de 4 chaînes d'acides aminés : la chaîne H, I, L et M. Avec anagène, nous avons
observé que les séquences d'acides aminés des chaînes d'un anticorps sont deux à deux
identiques : un anticorps est constitué de deux chaînes lourdes identiques (H et I) et deux
chaînes légères identiques (L et M). Avec la comparaison des chaînes de 2 anticorps
différents il y a pour les chaines lourdes, 39 acides aminés différents sur 457 sur les 123
premiers acides aminés et pour les chaines légères, 47 acides aminés différents sur 216 sur
les 111 premiers acides aminés.
Les chaînes des différents anticorps possèdent une région constante des régions variables.
La région variable est constituée par les acides aminés situés en position 1 à 110 dans les
chaînes légères (L et M) et par les acides aminés situés en position 1 à 120 dans les chaînes
lourdes (H et I).
Et enfin, pour le complexe immun, nous observons un "contact" entre la région variable de la
chaîne légère et la région variable de la chaîne lourde. Nous observons également que la
liaison d'un anticorps à son antigène spécifique s'effectue à l'extrémité des branches du "Y".
Nous pouvons dire qu’il y a un déterminant antigénique.
Cette liaison antigène-anticorps est due à la partie variable des chaines lourdes et. • Le
contact s'établit avec une partie seulement de l'antigène : c’est le déterminant antigénique.

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• Il y a deux sites identiques de reconnaissance d'un déterminant antigénique dans une

molécule d'anticorps.
Pour conclure, l’anticorps est donc une molécule en forme de « Y » composée de 4 chaînes.
Les deux chaines lourdes d’acides aminés sont identiques entre elles ainsi que pour les
chaines légères. Cependant, lorsque nous comparons les chaînes de 2 anticorps différents, la
chaîne H et la chaîne H2 pour les chaînes lourdes puis la chaîne L et la chaîne L2 pour les
chaines légères, le nombre d’acide aminés change dans l’extrémité de la chaîne donc dans la
partie variable. Il y a donc une partie constante et une partie variable pour chaque chaîne. Le
contact s'établit avec une partie seulement de l'antigène : c’est le déterminant antigénique
et qui sont donc différentes suivant le type d’antigène. Il y a donc spécificité de la réaction
antigène-anticorps.