L’ADN

L'ADN, une macromolécule informative

Description la plus simple :

L’ADN est un polymère linéaire de désoxyribonucléotides reliés par des liaisons
phosphodiesters
C’est une molécule composée de 2 brins linéaires qui forment une double hélice.

Un désoxyribonucléotide correspond à une Base + pentose + groupe phosphate

Nucléoside : Base + pentose

Nucléotide : Base + pentose + groupe phosphate
 Les bases de l’ADN
L’ADN est composé de 4 nucléotides différents avec les bases azotées suivantes :

Bases puriques

Adénine Guanine

Bases pyrimidiques

Cytosine Thymine
Le sucre présent dans l’ADN

Glucide de l’ADN

b-D-désoxyribose
 Structure de l’ADN
Polymère linéaire de désoxyribonucléotides reliés par des liaisons phosphodiesters

Extrémité 5’ Phosphate

Extrémité 3’ OH

Les atomes de carbone de la molécule de sucre sont numérotés comme 1' (lire "un
prime"), 2', 3 ', 4' et 5 '. Le résidu phosphate est attaché au groupe hydroxyle de
l'atome de carbone 5' d'un sucre et au groupe hydroxyle de l'atome de carbone 3' du
sucre du nucléotide suivant, qui forme une liaison phosphodiester 5'-3 '.
 Appariement des bases
Les bases A d'un brin sont toujours appariées des T de l'autre brin, alors que les bases G sont
toujours en face de C : c'est la complémentarité des bases. Les deux brins d’ADN sont liés par
des liaisons hydrogènes antre une base purine et une base pyrimidique.

H
-
3 liaisons hydrogène

H
-
2 liaisons hydrogène

-
H
Appariement des bases
 Appariement des brins est antiparallèle
L’ADN est formé de 2 brins Les deux brins de l'hélice courent dans des directions opposées,
ce qui signifie que l'extrémité carbone 5' d'un brin fera face à l'extrémité carbone 3' de son
brin correspondant. Ceci est appelé orientation antiparallèle. Cette orientation est
importante pour la réplication de l'ADN et dans de nombreuses interactions avec les acides
nucléiques.

Extrémité
Extrémité 3’OH
5’ Phosphate

Extrémité
Extrémité 3’OH 5’ Phosphate
Fragment ADN = double hélice
Entre les deux brins d’ADN, le
liaisons hydrogènes apportent
une contrainte physique ce qui
nécessite l’adoption de la
structure en double hélice.

Hélice avec 2 périodicités : une

de 0,34nm = distance entre
deux bases successives et
l’autre 3,54 correspondant au
pas de l’hélice
Un sillon majeur et un sillon
mineur.

Au niveau du sillon majeur :

intération de l’ADN avec des
protéines jouant un rôle dans la
régulation de l’expression de
l’information génétique
ADN procaryotes vs eucaryotes ?

Procaryotes Eucaryotes
cellule haploïde cellule diploïde (2n)
pas de noyau noyau
ADN chromosomique circulaire ADN chromosomique linéaire
ADN surenroulé, associé à des ADN condensé, associé à des
protéines non-histone protéines de type histone

Topoisomérases
 ADN procaryotes vs eucaryotes ?
Procaryote :

- Pas de noyau
- ADN dans cytosol
- Molécule d’ADN bicaténaire et circulaire
- Présence possible de plasmides (ADN circulaire)
- ADN ne présente pas d’introns et présente des régions régulatrices.

Eucaryote :

- ADN linéaire dans le noyau

- Compaction d’une partie de l’ADN grâce aux histones qui forme l’hétérochromatine
qui permet d’empêcher ces morceaux d’ADN de s’exprimer
- Euchromatine = morceaux d’ADN s’exprimant dans la cellule
- Présence d’exons et d’introns et de régions régulatrices, les introns seront éliminés
lors de la transcription.
Compaction de l’ADN eucaryote
L’ADN des eucaryotes est
compacté grâce au histones.
Cet ensemble (ADN + histones)
forme le nucléosome
Cet assemblage est la première
étape d’empaquetage de l’ADN
pour réduire volume de l’ADN
dans le noyau.
Les histone sont des protéines
riches en acides aminés
chargés positivement (lysine et
arginine), charge opposée à
l’ADN qui est chargé
négativement.
4 types d’histones forme
l’octamère qui correspond au
cœur protéique autour duquel
s’entoure l’ADN
 Compaction de l’ADN eucaryote
L’histone H1 ne fait pas partie du
cœur protéique mais est attaché à
l’ADN situé entre les nucléosome
(ADN de liaison) et l’ADN nucléosomal
(ADN autour de l’octamère). Il permet
la solidification de l’ensemble.
Les histones ont des extrémités N
terminale libres nécessaire pour la
formation des surenroulement des
nucléosomes pour avoir le structure
finale de la chromatine.
Dans le cas des gamètes mâles, les
histones sont remplacés par des
protéines permettant une compaction
encore plus importante : les
protamines. Cette compaction est
nécessaire pour protéger le matériel
génétique avant la fécondation.
Résumé :
Schéma bilan :
• L'adénine et la guanine sont des
purines. La structure primaire
d'une purine est constituée de
deux cycles carbone-azote.

• La cytosine, la thymine sont des

pyrimidines qui ont un seul
cycle carbone-azote comme
structure principale.
• La liaison phosphodiester n'est pas
formée par une simple réaction: sa
formation implique l'élimination de
deux groupes phosphate. Un
polynucléotide peut avoir des
milliers de telles liaisons
phosphodiester.