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Intervenants :
F. Bennis, F. Chegdani, M. El Messal
Responsable module:
M. El Messal
Responsable TP:
F. Chegdani
Objectifs
- Donner à l’étudiant les notions fondamentales de la génétique
- Développer chez lui la maitrise des connaissances nécessaires
pour entreprendre des études en différentes disciplines de la
biologie
Compétences
Maitriser les bases fondamentales de l’hérédité et les grands
principes qui règlent la transmission
Autoévaluation
- Généralités
- Transmission des caractères génétiques chez les eucaryotes
- Génétique des haploïdes
- Mutations
Chapitre 1
GENERALITES
I- Introduction
II- Définitions
Chapitre 1
GENERALITES
I- Introduction
II- Définitions
Chapitre 1: GENERALITES
I- Introduction
HEREDITE VARIATION
Chapitre 1: GENERALITES
I- Introduction
Chromosomes
Un chromosome = une molécule d'ADN et les
protéines sur lesquelles elle s'enroule
ADN
L'ensemble des
chromosomes forme la
chromatine
Histones
Chapitre 1: GENERALITES
I- Introduction
1ère propriété de l’ADN:
REPLICATION
Chapitre 1: GENERALITES
I- Introduction
Rappels
Chapitre 1: GENERALITES
I- Introduction
Code génétique (1960 et 1964)
AAA Phénylalanine AGA Sérine ATA Tyrosine ACA Cystéine
AAG Phénylalanine AGG Sérine ATG Tyrosine ACG Cystéine
AAT Leucine AGT Sérine ATT STOP ACT STOP
AAC Leucine AGC Sérine ATC STOP ACC Tryptophane
GAA Leucine GCA Proline GTA Histidine GCA Arginine
GAG Leucine GCG Proline GTG Histidine GCG Arginine
GAT Leucine GCT Proline GTT Glutamine GCT Arginine
GAC Leucine GCC Proline GTC Glutamine GCC Arginine
TAA Isoleucine TGA Thréonine TTA Asparagine TCA Sérine
TAT Isoleucine TGG Thréonine TTG Asparagine TCG Sérine
TAG Isoleucine TGT Thréonine TTT Lysine TCT Arginine
TAC Méthionine TGC Thréonine TTC Lysine TCC Arginine
CAA Valine CGA Alanine CTA Asparagine CCA Glycine
CAT Valine CGG Alanine CTG Asparagine CCG Glycine
CAG Valine CGT Alanine CTT Ac. glutamique CCT Glycine
CAC Valine CGC Alanine CTC Ac. glutamique CCC Glycine
A
T
Tyr
Gène muté à protéine mutée Tyr-Arg-Leu-Phé-Leu
Chapitre 1
GENERALITES
I- Introduction
II- Définitions
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
1- SOMA/GERMA
- Germinales (germen)
2- CARYOTYPE
Observation des chromosomes d’une espèce 2n:
un certain nombre de chromosomes de
différents types représentés 2x (chromosomes
homologues)
Caryotype
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Caryotype drosophile
(drosophila melanogaster)
2n=8 à 4 paires de chromosomes homologues:
I-I, II-II, III-III, IV-IV I-Y, II-II, III-III, IV-IV
(I=X)
II III II III
IV IV
Y
X
X
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Caryotype Homme
2n= 46
A B
D E
F G
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
3- Divisions cellulaires
INTERPHASE
PROPHASE
PROMETAPHASE
§ Finalité:
- Transmission de l'information génétique d'une génération à la
suivante
- Réduction du nombre de chromosome pour la reconstitution du
capital génétique au cours de la fécondation
- Brassage de l'information génétique qui aboutit à la
diversification maximale des membres de l'espèce
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Mots clés:
Division I Méiose I et méiose II, Diploïde, Haploïde; Chromosomes
Homologues, Appariement des chromosomes homologues,
Crossing-over et recombinaison génétique
A- leptotène
B- zygotène
Prophase I C- pachytène
D- diplotène
E- diacinèse
A- Stade leptotène
Les filaments de la chromatine s'individualisent et se
déroulent au maximum
Fin de la réplication, et formation pour chaque filament de
son double (I chromosome: 2 chromatides)
Les deux extrémités de chaque chromosome se rattachent
sur la face interne de l'enveloppe nucléaire à chaque
chromosome forme une boucle
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Prophase I
B- Stade zygotène
Appariement des chromosomes homologues à formation du
complexe synaptonémal (comme une "fermeture éclair" qui
réunie les chromosomes homologues sur toute leur longueur)
à chromosomes font synapses
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Prophase I
C- Stade pachytène
Quand l'appariement est terminé, les chromosomes se
condensent à Le complexe formé par l'appariement de
deux chromosomes : bivalent
Les échanges de morceaux d'ADN entre les chromatides
homologues ou recombinaison (crossing over) peuvent avoir
lieu
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Prophase I
D- stade diplotène
Les chromosomes se séparent et le complexe synaptonémal
disparaît. Quant il y a CO, les chromosomes homologues
restent reliés entre eux en plusieurs points à chiasmas
(zones d’entrecroisement des chromatides). Les chiasmas se
déplacent jusqu'aux extrémités du chromosome pour
disparaître. C'est à ce stade que l'on observe les
chromosomes en écouvillons typiques des cellules en méiose
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Prophase I
E- Stade diacinèse
La condensation des chromosomes est au maximum
Les bivalents se détachent de l'enveloppe nucléaire qui se
désagrège totalement
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Métaphase I
Anaphase I
Télophase I et prophase II
MEIOSE MITOSE
Prophase I Prophase I
début début
Prophase I Prophase
fin fin
Métaphase I Métaphase
Anaphase I Anaphase
Télophase I Télophase
Prophase II
Métaphase II
Anaphase II
Télophase II
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Disparition du nucléole et de la
membrane nucléaire
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
4- PHENOTYPE / GENOTYPE
* Traits morphologiques
* Syndromes cliniques
* Variation qualitative ou quantitative d’une protéine
*…
Chez diploïdes
1 gèneà 1 couple d’allèle
Exemples
- Groupe sanguin ABO: Io, IA, IB
- Couleur fourrure chez lapin:
C: complètement coloré
cch: gris clair, ch: albinos aux extrémités noires, c: albinos
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
Symboles utilisés (drosophile)
- Phénotype: [ ]
- Souche sauvage de référence: + à [+]
a- Recombinaison Méiotique
- Réduction du nombre
chromosomique
- Echange de matériel
au stade prophase I
1 paire de 1
chromosomes 2
homologues 3
apparié 4
Chapitre 1: GENERALITES
II- Définitions
b- Recombinaison Mitotique
- Très rare
- Division mitotique à cellules somatiques
- Exemple: travaux de Stern sur drosophila melanogaster
2 phénotypes : Couleur des poils et forme des poils
Chapitre 1: GENERALITES
Objectifs de maîtrise
V. Liaison au sexe
V. Liaison au sexe
GENIE/LOGIQUE MENDEL
MENDEL
LOIS DE
* Caractères qualitatifs bien contrastés
expression n'est pas soumise à l'environnement
2- Exemples
Exemple 1 :
F0 ou P : [R] X [r]
gamètes gamètes
gamètes
et
F1 : 100% [R]
♀
♂
F2 : 75 [R] et 25 [r]
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Exemple 2 :
Soient, chez la drosophile, 2 parents de race pure: l’un à corps gris et yeux
rouges et l’autre à corps ébène et yeux bruns. Le croisement entre eux
donne une F1 à phénotype corps gris et yeux rouges. L’autofécondation de
la F1 donne une F2 suivante: 56 individus à corps gris et yeux rouges, 19 à
corps gris et yeux bruns, 19 à corps ébène et yeux rouges et 6 à corps
ébène et yeux bruns. Interprétez les différents résultats.
- Hypothèse : 2 gène autosomaux indépendants à * (e+, e) avec allèle gris : e+ ; allèle ebony : e
* (br+, br) avec allèle rouge : br+ ; allèle brun : br
[gris] : [e+] ; [ebony] : [e] et [rouge] [br+] ; [brun] : [br]
Avec : * Pour chaque gène une interaction interallélique dominance – récessivité
* Et un rapport phénotypique de 9/16 [e+, br+], 3/16 [e+, br], 3/16 [e, br+], 1/16 [e, br]
- Vérification : T= 100
Valeurs observées (VO) à 56 [e+, br+] ; 19 [e+, br] ; 19 [e, br+] ; 6 [e, br]
Valeurs attendues (VA) à 9/16 T= 56,25 ; 3/16 T=18,75 ; 1/16 T= 6,25 VA=VO à hypothèse vraie
- Conclusion : Chaque caractère est gouverné par 1 seul couple d’allèle avec interaction interallélique
de type dominance – récessivité. Les 2 gènes en question sont indépendants et autosomaux
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
gamètes gamètes
F1
F2
Gamètes
56 [e+,br+]
19 [e+,br]
19 [e,br+]
6 [e,br]
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Remarque
- Tableau des gamètes : Phénotypes et génotypes
V. Liaison au sexe
Ségrégation monogénique
F1
Pr
Rapport:
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Dihybridisme
g Htz
g Hmz
Objectifs de maîtrise
Autofécondation
dihybridisme
Autofécondation : 3/4 – 1/4 Autofécondation : 9/16 – 3/16 – 3/16 – 1/16
TC: 1/2 – 1/2 TC: 1/4 – 1/4 – 1/4 – 1/4
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
V. Liaison au sexe
b- Létalité
Génotype homozygote
létal Mutation létale
hétérozygote
3- [ j ] X [ j ] 2 [ j ] , 1 [ j-]
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
3- [ j ] X [ j ] à2 [ j ], 1 [ j-]
j j- j j-
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Létalité du génotype j j
Vérification: dissection de femelles [ j ] fécondées par des mâles [ j ] à
Létalité embryonnaire intra-utérine
2 caractères indissociables:
- Couleur du pelage 1 seul gène: rapport phénotypique
Gène pléiotrope
Pléiotropie: production d’effets multiples et indissociables par 1 même gène
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Létalité
twi twi+
Remarque
Une descendance homogène veut dire automatiquement que les parents
sont de race pure?
F2
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
b- Interaction intergénique
Rapport 9: 6: 1
Rapport 9: 3: 3: 1
F2
P [rosace] X [pois] 1 AABB 1 AAbb 1 aaBB 1 aabb
2 AaBB 2 Aabb 2 aaBb
F1 [coussin] 2 AABb
4 AaBb
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Epistasie
hypostatique
F2 1 AABB F2 1 AABB
2 AaBB 2 AaBB
2 AABb 2 AABb
4 AaBb 4 AaBb
2 Aabb 2 Aabb
1 AAbb 1 AAbb
1 aaBB 1 aaBB
2 aaBb 2 aaBb
1 aabb 1 aabb
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
F2 1 AABB F2 1 AABB
2 AaBB 2 AaBB
2 AABb 2 AABb
4 AaBb 4 AaBb
2 Aabb 2 Aabb
1 AAbb 1 AAbb
1 aaBB 1 aaBB
2 aaBb 2 aaBb
1 aabb 1 aabb
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
F2 1 AABB
2 AaBB
2 AABb
4 AaBb
2 Aabb
1 AAbb
1 aaBB
2 aaBb
1 aabb
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
I. Rappels
Approche Différences
analytique c2 significatives ou pas ?
Procédure
Calcul du c 2
Degrees of
Probability, p
Freedom
0.99 0.95 0.05 0.01 0.001
1 0.000 0.004 3.84 6.64 10.83
2 0.020 0.103 5.99 9.21 13.82
3 0.115 0.352 7.82 11.35 16.27
4 0.297 0.711 9.49 13.28 18.47
5 0.554 1.145 11.07 15.09 20.52
6 0.872 1.635 12.59 16.81 22.46
7 1.239 2.167 14.07 18.48 24.32
8 1.646 2.733 15.51 20.09 26.13
9 2.088 3.325 16.92 21.67 27.88
10 2.558 3.940 18.31 23.21 29.59
11 3.05 4.58 19.68 24.73 31.26
12 3.57 5.23 21.03 26.22 32.91
13 4.11 5.89 22.36 27.69 34.53
14 4.66 6.57 23.69 29.14 36.12
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Exemple
Croisement mendélien de deux variétés, l’une à graine ronde et couleur jaune et
l’autre à graine ratatinée et couleur verte. Le croisement entre ces 2 individus
donne une F1 à graine ronde et couleur jaune. L’autofécondation de la F1 donne
la F2 suivante: 315 [ronde, jaune]
101 [ratatinée,jaune] Valeurs
108 [ronde,verte] observées
32 [ratatinée,verte]
2 caractères :
- 1er caractère: Aspect de la graine avec 2 phénotypes : rond et ratatiné
- 2ème caractère: Couleur de la graine avec 2 phénotypes : jaune et vert
[ronde,jaune] :
[ratatinée,jaune] : Valeurs théoriques
[ronde,verte] :
[ratatinée,verte] :
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Vérification
c 2 total = 0,523
ddl = 3 à c2 table = 7,815
Conclusion
I. Rappels
Notation génotypique
XX ♀ XY♂ ou
♀ ♂
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Mutation récessive
Mutation dominante
♀ [H] x ♂ [h]
♀ [h]
♂ [H]
3 ♀ [h], 1 ♀ [H]
3 ♂ [H], 1 ♂ [h]
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
2ème division
1ère division
1ère division
w
w
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
♀ [w] x ♂ [+]
♀
♂
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
♀ [w] x ♂ [+]
♀ [w+], ♂ [w]
Rares ♀ [w], ♂ [+]
2ème division
2ème division
1ère division
1ère division
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
♀ [w] x ♂ [+]
♀
♂
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
Remarque
Détermination génétique du sexe Chez la drosophile
§ Hérédité à l’X
§ Hérédité à l’Y
§ Hérédité incomplètement liée à l’X et à l’Y
§ Hérédité contrôlée par le sexe*
I. Rappels
A b a B
A B
a b
A B
A B A b
1
2
A B
AB Ab
a b
3
4 ab aB
a b a B
a b
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
F1 [eb+,se+]
Hypothèse : Chaque mutation est gouvernée par 1 seul gène : (eb,eb+) et (se,se+)
Rapport : 1/2:1/2 pour chaque couple d’allèle
Test-cross
♀ F1 [eb+,se+] x ♂ F0 [eb,se] [se+] = 60+15 : 75 [eb+] = 60+15 : 75
[se] = 15+60 : 75 [eb] = 15+60 : 75 Chaque mutation est
gouvernée par 1 seul
[eb+,se+] 60 T = 150 individus gène autosomal
[eb,se+] 15 1/2 de 150 : 75
F2
[eb+,se] 15
[eb,se] 60 Les 2 gènes sont-ils liés ?
Rapport F2 différent de 1/4:1/4:1/4:1/4
-> Les 2 génes sont liés
Ecriture génotypique
Noter le couple d’allèles (se,se+) et (eb,eb+)
♀ [eb,se] x ♂ [eb+,se+] Vous devez passer par l’échiquier de croisement
eb se eb+ se+
F1 eb se eb+ se+
Phénotype parental [eb+ se+] 60
100% [eb+ se+] eb se
eb+ se+ Phénotype parental [eb se] 60
b- Test 3 points
3 caractères :
- Couleur des yeux à[v] et [v+] 3 mutations sont
- Forme des veines à [cv] et [cv+] liées é l’X (donnée)
- Forme des ailes à[ct] et [ct+]
Exemple: ♀ [v+, ct+, cv+] X ♂ [v, ct, cv] 3 couples d’allèles ??:
(v+, v) (cv+, cv) (ct+, ct)
v+: 731 / v: 717 cv+: 717 / cv: 731 ct+: 724 / ct: 724
Les plus fréquentes 580 [v, ct+, cv+] 1/2: 1/2 1/2: 1/2 1/2: 1/2
CP 592 [v+, ct, cv] Rapport test cross différent 1:1:1:1:1:1:1:1
45 [v, ct+, cv] CP >> CR à Gènes liés
40 [v+, ct, cv+]
Les moins fréquentes 89 [v, ct, cv] Gène médian:
CR 94 [v+, ct+, cv+] CP: [v, ct+, cv+] et [v+, ct, cv]
3 [v, ct, cv+] D C.O: [v, ct, cv+] et [v+, ct+, cv]
5 [v+, ct+, cv]
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
v ct+ cv+ v+ ct cv ♂
♀ v ct cv Y
X
v ct+ cv+
v ct+ cv+ v ct cv
X
v+ ct cv
v ct+ cv+ v+ ct cv ♂
♀ v ct cv Y
X v ct+ cv+ [v ct+ cv+] [v ct+ cv+]
v ct+ cv+
v+ ct cv [v+, ct, cv] [v+, ct, cv]
v ct + cv + v ct cv
♀ [v+, ct+, cv+] X ♂ [v, ct, cv] v+ ct+ cv+ [v+, ct+, cv+] [v+, ct+, cv+]
580 [v, ct+, cv+]
CP 592 [v+, ct, cv]
45 [v, ct+, cv]
40 [v+, ct, cv+]
89 [v, ct, cv]
CO v-ct 94 [v+, ct+, cv+]
3 [v, ct, cv+]
5 [v+, ct+, cv]
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
v ct+ cv+ v+ ct cv ♂
♀ v ct cv Y
X v ct+ cv+ [v ct+ cv+] [v ct+ cv+]
v ct+ cv+
v+ ct cv [v+, ct, cv] [v+, ct, cv]
v ct + cv + v ct cv
♀ [v+, ct+, cv+] X ♂ [v, ct, cv] v+ ct+ cv+ [v+, ct+, cv+] [v+, ct+, cv+]
580 [v, ct+, cv+]
CP 592 [v+, ct, cv] v, ct+, cv [v, ct+, cv] [v, ct+, cv]
45 [v, ct+, cv]
CO ct-cv 40 [v+, ct, cv+] v+, ct, cv+ [v+, ct, cv+] [v+, ct, cv+]
89 [v, ct, cv]
CO v-ct 94 [v+, ct+, cv+]
3 [v, ct, cv+]
D CO 5 [v+, ct+, cv]
Chapitre 2: ANALYSE GENETIQUE CHEZ LES DIPLOIDES
v ct+ cv+ v+ ct cv
X
v ct+ cv+
v ct + cv + v ct cv
X
v+ ct cv v ct cv
Remarque
c- Interférence
Si pas d’interférence:
v+ ct cv
♀
v ct+ cv+
DCO observé
Les 2 régions adjacentes ne
sont pas indépendantes DCO attendu
% DCO observés
cc = avec I= 1 – cc
% DCO attendus 0≤I≤1
cc = 0 cc = 1
I=1à I=0à
interférence totale interférence absente
d- Conclusion
Calcul fréquence de recombinaison
Abdomen
Recombinaison
mitotique
Single spot
[y]
Single spot
[sn]
Twin spots
[sn+, y+]
[sn] et [y]
Dédoublement mais
pas appariement
Mitose normale
sn+ y sn y+
sn+ y sn y+
sn+ y sn y+
[sn+, y+]
sn+ y sn y+
sn+ y sn y+
[sn+, y+]
Appariement anormal
sn+ y sn+ y
sn y+ sn y+
sn+ y sn+ y sn y+ sn y+
Appariement anormal
sn+ y sn+ y
chromosomes
sn+ y sn+ y+
sn y+ sn y
sn y+ sn y+
sn+ y sn y
sn+ y+ sn y+
sn+ y sn y sn+ y+ sn y+
Single spots
[sn+, y]
3- Double CO som.
sn+ y sn+ y+ sn y sn y+
Single spots
[sn, y+]
sn+ y sn y+
sn+ y sn y+
sn+ y sn y+
ou
Appariement anormal
ou
chromosomes
Twin spots
[sn] et [y]
> Single spots
[sn+, y]
> Single spots
[sn, y+]
mA mB mA mB+ mA+ mB
mA mA mB+
[m] [+]
mB mA+ mB
Ø Savoir que la liaison génique peut être analysée suite à un test cross ou à
une F2 mendélienne
Ø Savoir que l’objectif de l’étude de gènes liés est le calcul de la distance qui
les séparent et par conséquent la carte génique
Ø Savoir que les recombinaisons dans des régions adjacentes ne se font pas
toujours indépendamment les unes des autres et qu’une interférence, qui est
mesurable, peut avoir lieu
Objectifs de maîtrise
Chapitre 2
Ø Déduire le déterminisme génétique du ou des caractères étudiés, en
passant par les étapes suivantes: