TD Médecine Préventive S8 - 1 2021

Médecine Préventive
(S8)
BEDEKELABOU P. Andre, DMV, Msc.
PhD Student
ATER MIPI-EISMV
Ecole Inter-Etats des Sciences et Médecine

Vétérinaires
Département de Santé Publique et
Environnement
Service de Microbiologie Immunologie
Pathologie Infectieuse
PROGRAMME
Les indicateurs épidémiologiques
Les formes d'évolution des maladies
Valeurs des tests épidémiologiques

2
Les indicateurs
épidémiologiques

3
Définition:
 Indicateurs de santé
 Mesures quantitative qui évaluent le niveau de divers aspects

de la santé dans une communauté

4
Définition:
 Variables qui peuvent être mesurées directement ou calculées

et qui permettent de décrire l’état de santé d’une population
 Servent a mesurer et suivre la santé d’une population.

5
Les mesures s’expriment en fraction :
 Proportion
 Ratio
 Indice
 Taux

6
Les mesures:
 Proportion: a/(a+b) ; numérateur inclus dans le dénominateur;
s’exprime en % ou en chiffre entre 0 et 1
 Ratio : rapport des effectifs des deux modalités d’une même

variable. Ex: variable sexe avec deux modalités.
 100 animaux dont 51 mâles et 49 femelles entraine un ratio
F/M=0,96. 1 MALE POUR 0,96 FEMELLES
 Pas d’unité

7
Les mesures:
 Indice: rapport des effectifs de deux variables. Exemple : 1000

troupeaux pour 10 vétérinaires
 Taux: notion de temps et de risque; Probabilité de survenue

d’un événement au cours d’une période

8
Les mesures:
 Nombre d’infestation cutanés / nombre d’infestés : c'est une
proportion
 Nombre de coliques / consommation de concentré par animal :
c'est un indice
 Nombre de décès de la période / effectif à risque pendant la
période : c'est un taux

9
10
Sous populations dans une maladie (iceberg)

11
La prévalence
 La prévalence (P) d’une maladie est le nombre de cas

rapporté a la population à risque.
Nbre de cas
 Ainsi P= X 100
Pop à risque
 IL existe deux types de prévalences: la prévalence réelle

(PR) et apparente (PA)

12
La prévalence (exemple)
Nbre de cas
X 100
Pop à risque

13
L’incidence
 Nombre nouveau cas rapporté à la population a risque

pendant une période déterminée.
 Un des critères les plus importants pour évaluer la fréquence

et la vitesse d’apparition d’une maladie.
Nbre de nveaux cas
 Ainsi I= X 100
Pop à risque

14
Exemple: Donnez la valeur du taux d’incidence annuelle pour une maladie
présentant au premier janvier de l’année une prévalence instantanée de 45
troupeaux dans une population de 225 troupeaux et pour laquelle 18 nouveaux
foyers sont mis en évidence au cours de l’année. (réponse en pourcentage)
I= Nbre de nveaux cas

X 100
Pop à risque

15
Mortalité
 Rapport entre le nombre de morts et la population à risque.
Nbre de mort
 M=
X 100
Pop à risque

16
Mortalité (exemple)
On a observé une certaine année, 500 000 décès de
chevaux pour une population de chevaux estimé à 50
millions de tête
Nbre de mort
M= X 100
Pop à risque

17
La morbidité
 Nombre de malades rapporté à la population à risque
Nbre de malades
 Ainsi Mb= X 100
Pop à risque

18
Morbidité (exemple)
L’influenza aviaire de type H7N7 touche un élevage de 2500
dindes dont 450 vont tomber malades et 272 vont mourir. Quel
est le taux de morbidité de la maladie ? (réponse en
pourcentage)
Nbre de malades
M= 100
X
Pop à risque

19
La létalité
 Nombre de morts rapporté au nombre de malades.
Nbre de morts
X 100
 Létalité = Nbre de malades

20
Létalité (exemple)
On a dénombré une année, 500 000 chevaux malades lors d’une
épidémie de la peste équine dont 50 000 décès. La population
de chevaux était estimé à 50 millions de tête dans la région.
Calculer le taux de létalité.
Nbre de mort
 L= X 100
Nbre de malades

21
Forme épidémiologique des
maladies

22
EPIZOOTIE
 Maladie qui atteint simultanément un grand nombre

d’animaux de même espèce ou d’espèces différentes.
 Evolution rapide avec nombre important de malades mais

limité dans le temps et dans l’espace.
 Ex: Grippe aviaire; peste bovine, …

23
EPIZOOTIE
Un individu infecte plusieurs autres individus

24
EPIZOOTIE

25
ENZOOTIE
 Maladie qui sévit de façon régulière dans une région donnée.

 Ex: Rage , Tuberculose,…

26
ENZOOTIE
Un individu infecté infecte un nombre réduis d’individus; variations

faibles de l’incidence
27
ENZOOTIE
NB1: l’évolution exponentiel de l’épizootie fini par décroitre faute

d’individus et donner une forme en cloche.
NB2: C’est une erreur de penser qu’une enzootie se caractérise toujours
par des incidences faibles; il peut y avoir de fortes incidences mais
stables dans le temps
28
PANZOOTIE
 Maladie qui se propage sur de grandes distances, à travers

plusieurs continents et qui affecte une importante partie de la
population animale

29
ANAZOOTIE
 Maladie contagieuse ou non, d’allure épidémique , sporadique

ou endémique dont tous les cas ont une seule et même origine
commune.
 Ex : Anthrax

30
ANAZOOTIE
Source commune
31
MALADIE SPORADIQUE
 Maladie survenant de façon irrégulière ( dans le temps et dans

l’espace) et en général peu fréquente (quelques cas isolés).
 Ex: hydrocéphalie acquise chez les petits ruminants

32
MALADIE COSMOPOLITE/UBIQUITAIRE
 Maladie présente partout.
 Ex: mammites à colibacillose

33
Résumé

34
La valeur des tests de
dépistage

35
tests de dépistage
Définition
 Recherche systématique à l’aide d’examens, des individus

atteints dans une population par un trouble de santé jusqu’à la
passé inaperçu.
 Différant du diagnostic qui se fait à échelle individuel.

36
Définition
 Au cours d’ un dépistage, il peut y avoir des erreurs:

 Erreurs par défaut: résultat négatif chez un sujet réellement
malade= faux négatif;
 Erreurs par excès: résultat positif chez un sujet indemne de la
maladie= faux positif.

37
Tableau de contingence
Malade (M) Non Malade Total

(Ṁ)
Test positif Vrais positifs Faux positifs VP+FP

(VP) (FP)
Test négatif Faux négatifs Vrais négatifs FN+VN
(FN) (VN)
Total VP + FN FP + VN Effectif N

38
Les valeurs intrinsèques du test
La sensibilité du test
 La sensibilité du test est la probabilité d’obtenir un résultat
positif pour un individu appartenant au groupe des malades.
 Se =
VP X 100
VP+FN

39
Les valeurs intrinsèques du test
La spécificité du test
 Probabilité d’obtenir un résultat négatif pour un individu
appartenant au groupe de sujets indemnes.
VN
 Sp = X 100
VN+FP

40
Les valeurs opérationnelles du test
La valeur prédictive positive
 Probabilité qu’ un individu qui fournit une réponse positive au
test appartienne au groupe de sujets malades.
 VPP =
VP
X 100
VP+FP

41
Les valeurs opérationnelles du test
La valeur prédictive négative
Probabilité qu’ un individu fournissant un résultat négatif
appartienne à la population de sujets non infectés.
VN
 VPN = X 100
VN+FN

42
Prévalence apparente et prévalence réelle
La prévalence apparente
Valeur de la prévalence dont le calcul résulte de
l’utilisation des moyens d’identification de la
maladie, c’est-à-dire du dépistage. Elle est le
rapport entre le nombre de sujets ayant répondu
positivement au test et la population totale (N).
VP + FP
 Pa = X 100
N
43
Prévalence apparente et prévalence réelle
La prévalence réelle
La prévalence réelle est celle qui prend en compte les
sujets réellement malades.
Elle est le rapport entre les sujets malades (VP+FN)
et la population totale.
VP + FN
 PR = X 100
N
44
EXERCICE
D’APPLICATION

45
En appliquant un test de dépistage sur une
population de 100000 individus, on a obtenu
les résultats suivants:
31800 ont répondu positivement au test;
68200 ont répondu négativement. Pour des valeurs prédictives
positive et négative de 93,4% et 99,56% respectivement,
remplir le tableau de contingence et calculer les valeurs
intrinsèques (sensibilité et spécificité) et la prévalence réelle de ce
test.

46
Sensibilité Troupeau
Elevage infecté = 1 positif
La ST augmente avec le nbre de test effectué
Pour un dépistage massale des maladies règlementé

(infectieuse) avec plusieurs animaux infecté, possible
d’utilisé des tests dont la sensibilité est moyenne
Capacité a détecté les troupeaux infectés sera bonne voir

excellente
47
Spécificité du Troupeau
La spécificité Troupeau diminue très fortement avec le
nombre de test réalisés
Ex : Troupeau 3 animaux négatifs et troupeau de 100
animaux négatifs (risque de trouver un faux positif
augmente dans le troupeau de 100 indemne)
Donc pour un troupeau indemne utilisé le test dont la

spécificité individuel est très bonne ;
Toujours choisir les tests de très bonne spécificité pour
les zones indemne ou les maladies rares
Alléger le nombre de test pour les troupeaux indemnes

48
Standardisation des taux
Une population est souvent hétérogène
Composé d’ensemble de sous-populations
Comment obtenir alors des observations comparables
entre elles malgré ces sous populations
=Standardisation des taux
Exemple de méthode de standardisation : La

standardisation directe

49
standardisation directe:
Région A Pondeuses Chaire Total
Nombre 4000 1000 5000
élevages
Nombre de 20 30 50
foyer
Taux 0,5% 3% 1%
d’atteintes
Région B Pondeuses Chaire Total

Nombre 1000 4000 5000
élevages
Nombre de 20 120 140
foyer
Taux 2% 3% 2,8%
d’atteintes
50
Etablissement de la population de référence
(=population standard)
Région A Pondeuses Chaire

Région A 4000 1000
Région B 1000 1000
Total 5000 5000
Population standard de 10000 avec 5000 pondeuses et

5000 chaire.
51
standardisation directe:
Région A Pondeuses Chaire Total
Nombre élevages 5000 5000 10 000
Taux d’atteintes 0,5% 3%
Nombre de foyers 25 150 175

standardisés
Région B Pondeuses Chaire Total
Nombre élevages 5000 5000 10 000
Taux d’atteintes 2% 3%
Nombre foyers 100 150 250

standardisés
52
Calcul des taux standardisés :
Région A : 175/10 000
Région B : 250/10 000

53
MERCI DE VOTRE
AIMABLE ATTENTION

54
EXERCICES SEANCE 3

55
Exercice 1: QCM
1- C’est la variation du taux d’incidence qui permet de faire la
différence entre les épizooties et les enzooties. Vrai/Faux
2-Choisi la bonne réponse :

a-Si l’on construit une courbe du nombre de cas dans une
anazootie, elle peut prendre la forme d’une maladie épizootique.
b-Si l’on construit une courbe du nombre de cas dans une
anazootie, elle peut prendre la forme d’une maladie enzootique.
3.Dans le cas des maladies infectieuses, la différence entre

épizootie et enzootie est la différence du nombre de nouveaux
individus contaminés par un individu infecté. V/F

56
Exercice 1: QCM
4. Le nombre de cas d’une maladie enzootique est forcément

modéré ou faible. V/F
5. Une maladie peut changer de forme au cours du temps, comme

être épizootique puis devenir enzootique puis redevenir
épizootique. V/F
6-Pour dépister des troupeaux infectés d’une maladie contagieuse

dans une région on peut se contenter d’un test de sensibilité
individuelle moyenne si l’on étudie tous les animaux de chaque
troupeau. Vrai/Faux
57
Exercice 2: QRC
1. Pour détecter tous les animaux infectés dans un troupeau il faut
que le test soit très ...
2. Les animaux infectés présentant une réponse négative à un test

s’appellent ...
3. Les animaux indemnes présentant une réponse négative à un

test s’appellent ...
4. La spécificité s’établie sur une population ...

58
Exercice 2: QRC
5. Sensibilité et spécificité sont également appelées

caractéristiques ...
6. La capacité d’un test de dépistage à identifier correctement les

sujets indemnes s’appelle : …
7.La confiance que l’on peut avoir dans les résultats positifs fournis
par un test de dépistage s’appelle ...
59
Exercice 3a
Calculez :
1-Prévalence au 1er janvier
2-Prévalence annuelle
3-Prévalence au 31
décembre
4-incidence annuelle

60
Exercice 3b
Calculez:
1-prévalence en janvier
2-prévalence au 1er février et au
premier trimestre
3-calculez le taux d’incidence
cumulé à chaque mois.
On donne : taux d’incidence

cumulé = nombre de nouveaux cas
durant une période sur le nombre
d’animaux sains au début de cette
période

61
Exercice4
Dans un élevage de 2000 porcs, une maladie contagieuse
est apparue il y a trois semaines. L’éleveur a noté le nombre
de mort par jour pendant cette période sur le calendrier ci
dessous
J J J J J J J J J J J J J J J J J J J J J J J J J
1 2 3 4 5 6 7 8 9 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 2 2 2 2 2 2
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 0 1 2 3 4 5
0 2 4 1 7 5 2 0 1 0 1 0 5 1 2 1 1 1 8 1 7 9 6 8 5
0 5 4 8 6 2 0
On vous demande:
-une représentation graphique des mortalités
-décrire la représentation graphique et déduire la forme
d’évolution épidémiologique correspondante

62
Exercice 5
Quelle est l’incidence annuelle d’une maladie

présentant une prévalence instantanée au 1er
janvier de 253 foyers et 198 foyers au 31
décembre avec 122 foyers assainis au cours de
l’année.

63
Exercice 6
Dans une région comportant 10 000 élevages, les
statistiques de dermatose nodulaire cutanée des
bovins pour 2008 sont les suivantes :
- Etat au 31/12/2008 : 300 élevages infectés
- Dans l’année 2008 : 200 élevages ont été
infectés
- Dans l’année 2008 : 250 élevages ont été
assainis.
a/- Quelle est l’incidence annuelle?
b/- Quelle est la prévalence annuelle?

64
Exercice 7
Pour dépister la brucellose dans une région, on a
utilisé un test dont les résultats sont positifs chez
50% des sujets indemnes de la maladie et négatif
chez 20% des sujets atteints
-quelle est la sensibilité et la spécificité du test
-pour une prévalence réelle de 10% quel sera la
prévalence apparente à l’issu du dépistage
-calculez les valeurs prédictives

65
Exercice 8
Chez 1845 vaches, le diagnostic de gestation a

été posé par examen échographique. L’état de
gestation a été confirmé plus tard par palpation.
1452 vaches ont été évaluées gestantes à l’écho.
L’examen par palpation a révélé 1324 vaches
gestantes. Parmi ces gestantes, 1281 étaient
gestantes à l’écho.
On demande :
-Sensibilité et Spécificité de l’échographie

66
MERCI A VOUS

67

TD Médecine Préventive S8 - 1 2021

Transféré par

Informations du document

Titre original

Copyright

Formats disponibles

Partager ce document

Partager ou intégrer le document

Options de partage

Avez-vous trouvé ce document utile ?

Ce contenu est-il inapproprié ?

Droits d'auteur :

Formats disponibles

TD Médecine Préventive S8 - 1 2021

Transféré par

Droits d'auteur :

Formats disponibles

Médecine Préventive

Ecole Inter-Etats des Sciences et Médecine

Les indicateurs épidémiologiques

Les formes d'évolution des maladies

Valeurs des tests épidémiologiques

Service de Microbiologie Immunologie

 Mesures quantitative qui évaluent le niveau de divers aspects

Service de Microbiologie Immunologie

 Variables qui peuvent être mesurées directement ou calculées

 Servent a mesurer et suivre la santé d’une population.

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

 Ratio : rapport des effectifs des deux modalités d’une même

Service de Microbiologie Immunologie

 Indice: rapport des effectifs de deux variables. Exemple : 1000

 Taux: notion de temps et de risque; Probabilité de survenue

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

 La prévalence (P) d’une maladie est le nombre de cas

 IL existe deux types de prévalences: la prévalence réelle

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

 Nombre nouveau cas rapporté à la population a risque

 Un des critères les plus importants pour évaluer la fréquence

Service de Microbiologie Immunologie

I= Nbre de nveaux cas

Service de Microbiologie Immunologie

 Rapport entre le nombre de morts et la population à risque.

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

 Nombre de malades rapporté à la population à risque

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

 Nombre de morts rapporté au nombre de malades.

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

 Maladie qui atteint simultanément un grand nombre

 Evolution rapide avec nombre important de malades mais

 Ex: Grippe aviaire; peste bovine, …

Service de Microbiologie Immunologie

Un individu infecte plusieurs autres individus

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

 Maladie qui sévit de façon régulière dans une région donnée.

Service de Microbiologie Immunologie

Un individu infecté infecte un nombre réduis d’individus; variations

NB1: l’évolution exponentiel de l’épizootie fini par décroitre faute

 Maladie qui se propage sur de grandes distances, à travers

Service de Microbiologie Immunologie

 Maladie contagieuse ou non, d’allure épidémique , sporadique

Service de Microbiologie Immunologie

 Maladie survenant de façon irrégulière ( dans le temps et dans

 Ex: hydrocéphalie acquise chez les petits ruminants

Service de Microbiologie Immunologie

 Maladie présente partout.

 Ex: mammites à colibacillose

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

Service de Microbiologie Immunologie

 Recherche systématique à l’aide d’examens, des individus

 Différant du diagnostic qui se fait à échelle individuel.