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Bactriophages

CES BactriologieBactriologie-Virologie Professeur Moussa Fafa Ciss Mdecin Biologiste Facult de Mdecine de Dakar
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Introduction

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Dfinition
Virus spcifiques des Bactries Synonyme : phages

  

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Dcouverte

Auteurs  Twort en 1915  DHrelle en 1917 Nombre > 5.000 phages diffrents

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Critres de classification

  

Nature acide nuclique Morphologie de la particule Enveloppe virale

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Classification des phages

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Phages gnome ADN

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Phages ADN bicatnaire

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Trois groupes


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Phages nus symtrie binaire  Siphoviridae  Myoviridae  Podoviridae Phages nus symtrie cubique  Corticoviridae  Tectiviridae Phages envelopps  Plasmaviridae

Phages nus symtrie binaire

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Phages nus symtrie binaire




Sont les plus nombreux  95% des phages dcrits  Sont dits cauds Morphologie  Tte cubique (renferme ADN)  Queue hlicodale  Contractile ou non  Taille: 20 190 nm
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Principaux phages cauds




Siphoviridae (60%)  Enterobacteria phage P, T1, T5  Mycobactries, Lactococcus Myoviridae (25%)  Enterobacteria phage T4,  Enterobacteria P1, P2 Podoviridae (15%)  EB phage T7  Bacillus phage J 29
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Deux autres groupes

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Phages nus symtrie cubique




Corticoviridae  Alteromonas phage PM2 Tectiviridae  Enterobacteria phage PRD1  Bacillus phage

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Phages envelopps


Plasmaviridae  Acholeplasma phage L2 Constitution  Enveloppe  Nucloprotine  Absence de capside


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Phages ADN monocatnaire

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Deux groupes
Phages nus symtrie hlicodale  Inoviridae Phages nus symtrie cubique  Microviridae

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Microviridae


Morphologie  Capside cubique  ADN simple brin Diffrents phages  Enterobacteria phage J x 174  Bdellovibrio phage MACI  Chlamydia phage 1
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Inoviridae

Morphologie  Long filaments  Flexibles Enterobacteria phage fd

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Phages nus gnomes ARN

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Leviviridae

Morphologie  Capside cubique  ARN monocatnaire Enterobacteria phage MS2

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Cystoviridae

Morphologie  Capside cubique  ARN bicatnaire, segment Pseudomonas phage J 6

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Multiplication des phages

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Cycle lytique des phages

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Phage ADN

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Exemple des Myoviridae T


   

Adsorption et injection du gnome Rplication et synthse des constituants Assemblage des virus Libration des virus Dure cycle = 22 minutes

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Adsorption et injection du gnome

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Sites de fixation bactriens


    

Lipopolysaccharide Protines de paroi Acides teichoques Flagelles Fimbriae

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Sites de fixation phagiques


  

Plaque terminale de la queue Fibres caudales Capside

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Fixation du phage


Contact alatoire phage-bactrie phage Par une fibre de la queue  Reste des fibres se fixe rapidement Phage bien arrim sur bactrie

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Injection de lADN phagique




Enzymes prsentes au n plaque n  Perforent paroi bactrienne  Contraction de la queue  Canal central pntre dans bactrie Gnome phagique est inject

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Aprs injection du gnome




Colmatage brche dinjection  Par des composants  Synthtiss par enzymes virales Devenir phage dpourvu de son gnome  Soit reste fix sur la bactrie  Soit est dcroch
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Rplication et synthse constituants

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Phase prcoce


Synthse des enzymes virales prcoces  Certains gnes sont transcrits en ARNm  ARNm sont traduits en enzymes virales vnement cellulaires  ADN bactrien dgrad en nuclotides  Inhibition synthse macromolcules  Synthse hydroxymthylcytosine qui remplace la cytosine dans le phage
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Phase tardive


Rplication ADN phagique  Commence ds phase prcoce  Formation copies gnomes du phage Gnes tardifs sont transcrits et traduits  Protines virales constitutives  Protines virales non structurales  Protines de la lyse cellulaire
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Assemblage des virus

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Quatre phases
Construction de la tte Construction de la queue Construction des fibres Assemblage final du phage complet

   

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Droulement
 

 

Encapsidation de lADN dans la tte Tte associe la queue  Dj porteuse de la plaque terminale  Grce au collier Fibres se fixent enfin la queue Accumulation phages dans cytoplasme
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Libration des phages

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Lyse brutale de la bactrie




Intervention de 2 gnes phagiques  Lun code le lysozyme  Lautre code une protine entranant le lysozyme vers la paroi Libration de 300 phages environ

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Phage ARN

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Exemple des Leviviridae




Petits phages  ARN (+), monocatnaire  Sans queue  Capside cubique Site fixation = pilus F et fimbriae Similitudes avec Enterovirus, HAV
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tapes


FixationFixation-pntration  Reconnaissance/fixation sur pilus F  Pntration : modalit mal dfinie ARN phagique est directement traduit  Protine A fixation  Protine de capside  Rplicase  Protine de lyse bactrienne
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Rplication
 

Formation intermdiaire de rplication Brin (-) sert de matrice ( ARNm protines virales  ARNv (+) gnomes phages fils Dure du cycle 20 30 minutes

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Cycle lysognique des phages

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Phages temprs


Phages  Phage P  Phages P2 P22  Phage Mu-1 MuADNv intgr dans gnome bactrie  Directement de faon covalente  Ou comme plasmide On obtient un prophage
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tapes


FixationFixation-pntration  Injection ADN phagique  Circularisation de lADN phagique  Transcription des ARNm 2 voies selon expression du rpresseur CI  Cycle lytique  Cycle lysognique
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Modalits de la lysognie


Synthse de protines prcoces  CII et CIII  CII se fixe sur promoteur PRE  Activation synthse du rpresseur CI Rpresseur CI : est auto-activable auto Inhibe transcription des ARNm  Stimule un autre promoteur qui augmente la synthse de CI
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Intgration du gnome phage




Mcanisme  CII active expression dun intgrase int  CI rprime transcription Enzyme int  Intgre gnome du phage  Dans un site prcis du gnome bactrie  Grce au site att du gnome du phage
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Induction du cycle lytique




Agents inducteurs  Ultras violets  Agents chimiques mutagnes Mcanisme de linduction  Diminution quantit rpresseur CI  CI dgrad par enzymes bactriennes  Gne xis excisionase qui sassocie int dont elle inverse le processus
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Rle et utilisation des phages

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Outils gntique molculaire

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Phages usuels


Phages filamenteux (Inoviridae)  Phage M13  Phage fl  Phage fd Phage P

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Utilisation des phages




Modalits dutilisation  Vecteurs de gnes  Amplificateurs de gnes Buts  Thrapie gnique  Vaccination  Production de protines
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Prparation des phages


 

Insertion simple de lADN tranger DltionDltion-remplacement Il faut conserver  Squences cos  Gnes de structure du phage

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Autres vecteurs drivs




Vecteurs drivs  Cosmide: plasmide + squences cos  Phagemide: plasmide + phage filamenteux Intrt  Encapsids in vitro  Capacit dinsertion gnomique +++

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Rle dans lenvironnement

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Rles bnfiques


Contrle densit bactries et biomasse  1010 UFP litre deau propre  108 UFP litre deau use Tmoins de contamination fcale

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Problmes pour industrie

 

Phages dtruisent bactries fermentaires Utilises pour production lait, protines

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Utilisation en bactriologie

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Facteurs de virulence


Production de toxines bactriennes  Corynebacterium diphtheriae  Streptococcus pyogenes Acquisition rsistance aux antibiotiques  Staphylococcus aureus  Streptococcus spp.
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Lysotypie bactrienne


Bactries souvent types  Listeria monocytogenes  Salmonella  Staphylococcus aureus Indications de la lysotypie  tudes pidmiologiques (pidmies)  Dtection de Listeria dans aliments
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Autres organismes virus like

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Virodes

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Classification


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Critres de classification  Homologie de squences  Rgion centrale conserve ou non Deux familles  Avsunviridae  Virode brlure de lavocatier  Rgion centrale non conserve  Pospiviridae  Rgion centrale conserve

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Structure des virodes




ARN (+)  Monocatnaire  Circulaire  Sans rgion codant pour des protines  240 400 nuclotides Absence de capside

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Infectent les plantes




Agents pathognes parasites des plantes  Tubercules  Pomme de terre Mcanisme daction  Parasitent appareil transcription hte  Utilisent ARN pol II nuclaire de lhte
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Virusodes ou ARN satellites

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Composition
ARN satellites Encapsids avec des virus des plantes Ont besoin de virus auxiliaire Car ne peuvent pas se rpliquer seuls

   

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Merci
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