Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 1 Examen : 60% Bactriologie 1 seul examen (plusieurs questions) 40% Eucaryotes + virologie 2 examens (1 cours

Eucaryote + 1 TD Virologie) Livres : * Physiologie de la cellule bactrienne une approche molculaire Neidhardt FC, Ingraham JL and Schaechter M (1995) MASSON, Paris * Microbiologie Prescott L M, Harley JP, Klein DA 2me edition franaise De Boeck

Chapitre 1 : Introduction.
I. Prambule. 1. Prsentation de lenseignement. Le monde bactrien est extrmement vaste et vari : diversit. Ces bactries sont prsentes partout sur toute la plante. Phnomne dadaptabilit du monde bactrien. Les bactries ont volu pour rsister aux divers types denvironnements. 2. Dfinitions. Microbiologie : * cest la science qui tudie les microbes (= organisme invisible lil nu, microbe < 1mm). Exemples de microbes : bactries, arches, virus, eucaryotes infrieurs, champignons unicellulaires (Fungi), levures, protistes. * Mthodologies communes : travail disolement en culture pure. II. Historique. 1. Mise en vidence. * Les prcurseurs. Lucrece en 50 et Frascatoro en 150 sont les premiers avoir crit quil existe des organismes invisibles lil nu. Ils nont jamais russi le dmontrer. Au 17me sicle, linvention du microscope. 1625 : Stelluti, scientifique disciple de Galile, a dvelopp les lunettes astronomiques et sen est servi lenvers pour regarder linfiniment petit. 1665 : Robert Hooke : Anglais passionn de microscopie, il a lide que ce quil regarde sont des cellules et sont donc des organismes vivants. Il fait partie de la socit royale de Londres qui la particularit dtre la 1re socit stre intresse la microbiologie. Il va lire et reconnatre les critures dun autre scientifique : Antonie Van Leewenhoek.
1

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 1 Celui-ci, dveloppe ses propres outils microscopiques. Il observe les 1 res bactries observes par un tre humain et en fait de trs bons dessins. Il nomme ces organismes vivants : animalcules. Ces travaux vont permettre de sintresser la gnration spontane. 2. Gnration spontane. Depuis longtemps, on pense que la vie provient de la matire organique cd de gnration spontane. 1650 : Redi prend 3 pots o il met de la viande, o il dpose sur un de la ouate, sur lautre du papier, et un sans rien. Sur celui lair libre se dveloppe des mouches. Il dcouvre des ufs de mouches, il dit quun insecte est venu pondre ces ufs. Cette dcouverte met un terme lide de gnration spontane. * Controverse. Cette controverse se fait entre les pros et les antis gnration spontane. 1748 : Needhan, il fait bouillir un liquide puis le laisse poser et il se retrouve contamin il dit que cest la gnration spontane. 1780 : Spallenzani, lui, fait la mme exprience mais scelle le pot contenant le liquide et rien ne se dveloppe. On dit que le fait de sceller, latmosphre nest pas possible la vie. Schroder et Dutch eux refont lexprience en arant le pot et toujours pas de contamination donc pas de gnration spontane. 19me : Pasteur 1856 : Felix Pouchet. Pasteur veut prouver que cette gnration spontane nexiste pas. Il a lide de dvelopper une exprience grce des flacons bol de signe. Dans le flacon, il fait bouillir le liquide et il attend. Il ne se passe rien et ne sont toujours pas contamin, pourtant ils sont lair libre. Cest cause de la forme du tube, les poussires etc ne peuvent pas remonter le tube. Il met donc un terme la gnration spontane en dmontrant que la poussire est la base de la contamination. 1877 : Tyndall dmontre galement que la poussire est responsable de la contamination. 3. Relation maladie/microorganismes. Jusquau 18me sicle, on tait persuad que la maladie provenait des miasmes ou des 4 humeurs. 1835 : Bassi travaille sur un pathogne du ver Soie. Il dissque le Ver soie et observe la prsence dune moisissure sur les Vers malade. Il montre quun microorganisme provoque une maladie. 1845 : Berkeley montre quun champignon est responsable dune maladie. 1876 : Robert Koch publie des travaux sur la maladie du charbon. Il dmontre que le pathogne responsable de cette maladie est une bactrie : Bacillus Anthracis. Il dmontre galement que la bactrie isole et purifie introduite dans un animal non malade est
2

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 1 responsable de sa maladie. Il reoit le prix Nobel en 1905 pour Mycobacterium Tubercolis, lagent responsable de la Tuberculose. Le postulat de Robert Koch : 1. Le micro-organisme doit tre prsent dans chaque cas de maladie mais pas dans les organismes sains. 2. Le micro-organisme doit pouvoir tre isol et cultiv en culture pure. 3. La maladie doit se dvelopper lorsque le micro-organisme est inocul un organisme sain. 4. Ce mme micro-organisme doit encore pouvoir tre isol partir de cet autre malade. * Les inventions techniques. Comment isoler des organismes en culture pure ? Les bactries, en culture solide, font des colonies. Koch est le premier faire des essais de culture solide. Il fait des essais sur la pomme de terre. Il dpose des agents sur une pomme de terre cuite mais le rsultat nest pas terrible. Il met alors de la glatine sur la pomme de terre mais elle fond 28C. Une de ses collaboratrices lide de mettre de lAgar-Agar qui fond 60C, il gel en refroidissant. Il peut donc glifier. Richard Petri est le premier glifier des organismes afin de faire se dvelopper des colonies. Il invente la boite de Petri. III. Les domaines de la Microbiologie. 1. Lindustrie : Pasteur. La production dthanol par la levure. 1856 : Bigo, Lillois, est un spcialiste de la production dthanol par la levure. Schwann dmontre quil y a de la levure dans la mlasse mais ce nest pas encore totalement sr. Pasteur analyse la fermentation (la bire) et dcouvre une levure : Saccharomyces cerevisiae. Cest cette levure qui fait de lthanol. Si lthanol dcroit cest quil y a des bactries lactiques. La fermentation lactique produit du Lactate qui acidifie la culture. Le saccharose est capable de produire de lthanol et de lacide. Effet Pasteur : Pour la production dthanol partir de saccharose, si on are bien le systme, la production dthanol diminue et la consommation de saccharose diminue. 2. Lagroalimentaire : Lister. Il tudie le yaourt et dcouvre une des bactries responsable de ce yaourt : Lactobacillus bulgarius. Les 2 bactries responsables du yaourt sont : Lactobacillus bulgarius et Streptococcus thermophilus.
3

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 1

3. Les autres apports de la microbiologie. Fleming a dcouvert que la Pnicilline est un antibactrien puissant et quelle peut tre administre des malades pour les soigner. Mullis a dcouvert la PCR. ADN polymrase : Taq (= Thermus aquaticus). 4. Les diffrents domaines. * La microbiologie mdicale (clinique). * Microbiologie industrielle et agroalimentaire. Fabrication de micro-organismes. Utilisation de starter. Mise au point de souches. Ex : le biothanol, bioplastiques (PHA= plastiques hypoallergniques). * Microbiologie fondamentale. Ex : utilisation des bactries psychrophile : optimum de croissance temprature trs basse. Permet de respecter une chaine de froid dans lagroalimentaire. Lessive : permet de laver froid.

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 2

Chapitre 2 : La cellule bactrienne.

Une cellule eucaryote a une taille variable ~100 m de diamtre. Bactrie ~ 1 3 m de diamtre. I. Les structures obligatoires. 1. Lenveloppe. a. Lenveloppe cellulaire. Elle est compose dun cytoplasme dlimit par une membrane cellulaire. Cette membrane cellulaire est compose dune bicouche de phospholipides ce qui permet de dfinir la structuration suivante : 2 ttes apolaires qui se font face (hydrophobe) et loppos 2 ttes polaires. Au travers de cette bicouche, ce nest pas rigide car on y trouve des protines enchsses ou ancres notion de mosaque fluide (permet le dplacement des protines). On trouve exclusivement des phospholipides dans cette membrane (pas de cholestrol). Fonction : - barrire physique qui compartimente la cellule, permet une diffusion slective (permabilit slective) - limite physique de la cellule - transport (flux mtaboliques) Coloration Gram : Principe : rsistance des Gram positives la dcoloration par lalcool. Protocole : - coloration au violet Crystal (+ fixation au lugol) du cytoplasme des Gram positive et Gram ngative - dcoloration courte et brutale lpaisse paroi de peptidoglycane (voir TD2) Toutes les bactries subissent cette coloration de Gram pour savoir si elles sont Gram+ ou Gram-. Les Gram ngatifs : (Se dcolore + vite) Chez ces Gram-, on a vu lexistence dune 2me membrane : la membrane externe. Compose dune bicouche phospholipidique mais un peu particulire : - feuillet externe compos du LPS = lipopolysaccharide - feuillet interne : phospholipide (normal) La LPS est une molcule bipolaire. La LPS est compose de : - La fraction lipidique = va constituer le feuillet externe de la membrane externe. - La fraction oligosaccharidique. Voir schma bactrie Gram1

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 2 Molcule extrmement ractive et un rle trs immunoactif. ??? Il y a beaucoup de porines dans la membrane externe. Porine : pore dentre de la molcule, facilite les changes entre lespace entre les 2 membranes et lintrieur de la bactrie. Cette porine est une protine. Priplasme : - zone entre la membrane externe et la membrane cellulaire - SAS dentre - Zone de concentration et denzyme divers entre lintrieur et lextrieur de la bactrie. Dans ce priplasme, on trouve le peptidoglycane = polymre constitu dosamines + peptines. Ce peptidoglycane est un exosquelette : - structure qui permet la bactrie davoir une certaine rigidit. - structure protectrice de la cellule. Si on met de leau dans la cellule, leau entre lintrieur et lenveloppe cellulaire va venir se coller au peptidoglycane ce qui empche le gonflement et la lyse de la cellule. La lipoprotine de Braum : - se trouve entre le peptidoglycane et la membrane externe - un partie de cette protine permet un encrage - 1/3 de ces protines sont lies au peptidoglycane Les bactries Gram positif : (Se dcolore moins vite) Il ny a pas de 2me mb contrairement au Gram-! Le peptidoglycane nest pas fin, cest une vritable croute lextrieur de la membrane cellulaire. Ce peptidoglycane assure une rigidit. On trouve des LTA = acide lipotichoique et TA = acide tichoique. Ces LTA ne sont pas un constituant majeur. - encrage dans la membrane cellulaire - charges moins TA : ancr de faon covalente au peptidoglycane. 2. Le cytoplasme. Dans le cytoplasme dune bactrie, on ne trouve pas dorganites cellulaires (pas de mitochondries, dappareil de Golgi). * Nuclotide, chromosome et rplication. Les bactries :
2

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 2 - ne possdent quun chromosome appel : chromonme. - sont donc haplodes - nont pas de noyau, lADN est diffus dans la cellule bactrienne - lADN diffus en permanence au contact des ribosomes - donc pas de compartimentation des activits gntiques : transcription et traduction sont simultanes - la rplication se fait directement dans un chromosome, pas de faisceau de division, de microtubules - pas dintrons : lintgralit du gnome est codante, un gne donne une protine - ribosome : mlange de protines + ARN chromosomique. Le ribosome a un coefficient de sdimentation de : - chez les eucaryotes : 80S 60S + 40S - chez les bactries : 70S 50S + 30S II. Les structures facultatives. 1. Les structures externes. a. La couche S. - structure se trouvant lextrieur de lenveloppe bactrienne. - se trouve chez Gram- et Gram+ - polymre gnralement protique (et parfois glycoprotiques) - forme autour de la cellule bactrienne une vritable cuirasse (cotte de maille) - rle de protection mais qui ne limite pas compltement la diffusion molculaire b. La capsule ou Exopolysaccharides (=EPS). - polymre majoritairement polysaccharidique - se trouve lextrieur de la cellule bactrienne. - nest pas trs bien organis - rle : rtention deau = capacit de retenir leau en se gorgeant deau - rsistance aux phages - camouflage Diffrence entre capsule et Exopolysaccharides : - la capsule est lie de faon covalente la cellule bactrienne. - lEPS est li de faon ionique la cellules bactrienne. c. Les fimbriae (ou pili) - structure filamenteuse se trouvant lextrieur de la cellule bactrienne : donne une certaine pilosit la bactrie - polymre protique filamenteux - piline : protine de petit poids molculaire, ont une association filamenteuse avec la cellule - se trouve chez Gram+ et Gram- position 2 possibilits :
3

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 2 - simplement associ la membrane externe de la cellule bactrienne - ancr la membrane cellulaire et traverse la membrane externe = ancrage usher - sont rigides type I ou souples = curli - rle dadhsion ( des cellules, la matrice extracellulaire, support abiotiques, agrgation) Voir schma fimbriae - pour quun mle F+ rencontre une femelle F-, se forme un pili-sexuel d. Les flagelles. - Flagelle = antigne H - motilit = grce au flagelle, les bactries sont capables de se mouvoir - polymre filamenteux (beaucoup + gros quun pili) dune sous unit protique = la flagelline (agencement hlicodale) - capable de se diriger vers quelque chose ou de fuir 2. Les Structures internes. a. Les plasmides. Un plasmide est un fragment dADN gnralement circulaire rplication autonome. La bactrie peut donc moduler sa quantit de plasmide en fonction du besoin. Transfert de gnes de virulence, de gne de rsistance antibiotique. III. Diffrences avec les Eucaryotes et les Arches. 1. Les Eucaryotes. Les eucaryotes possdent beaucoup dorganites tels que les mitochondries qui permettent de respirer Les bactries, elles, nont aucun organisme. Tout le matriel ncessaire leur vie se trouve dans la membrane cellulaire. 2. Les Arches. Woese a fait une classification et a dmontr que les arches ne sont pas des bactries. Arches hyperthermophile possde une structure : - ther lipide qui permet de rsister une haute temprature

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 3

Chapitre 3 : Influence de lenvironnement.

I. La morphologie des bactries. (pour la culture gnrale, pas savoir) 1. La taille. Moyenne globale de 1 3m : - la plus petite : Mycoplasma pneumonae fait 0,3 m de diamtre. Elle est tellement petite et dformable quelle passe travers du filtre absolu pose des problmes. - la plus grande : Thiomargarita namibiensis fait 400 m de diamtre. Elle est visible lil nu. 2. Formes cellulaires. 2 formes : - les bactries rondes : les coques - les bactries + allonges : les Bacilles * Les coques. Sils sont isols = Sils sont par 2 = diplocoques. Ex : Neisseria gonorhoeae. Ttracoques : ex : Deinococcus radiodurans (resistante de fortes radiations) Streptocoques : B coque en chanette Staphylocoques : aureus = bactrie de la peau en amas, en grappe * Les bacilles (btonnets). Forme plutt allonge. Isoles ou par 2 : Ex : clostridium tetani ou clostridium botulinum En chanette : Ex Bacillus enthracis ou Bacillus thuringiensis (crystal) Virgule ou incurvs : Ex Vibrio cholerae Bifides : bifidobactrium longum Structure micellaires : Streptomyces griseus : bactries extrmement importantes car elles font parties de lhumus rle dans le recyclage de la MO. Elles ont d dvelopper des antibiotiques pour combattre dautres bactries. Elles permettent de fabriquer la Pnicilline. * Les spirales. Il existe 2 types de spirales : - Les spirilles qui sont rigides. - Les spirochtes qui sont souples. Ex : Treponema pellidum : bactrie responsable de la Syphilis.

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 3 * Bourgeon, Pdoncules. Circulobacter Crescensus : bactrie pdoncule, 2 formes de vie : une attache un support (grce que pdoncule). Lorsque la bactrie se divise, elle le fait toujours en tant attach un support. * Carr. Haloquadratum Walsby : cest une arche. Arche intressante car elle est carre. * Plomorphes. Bifidobacterum bifidum. Bactrie qui prsente une forme bifide ou bacille ou micille selon lenvironnement. 3. Les formes coloniales. La diffrence de structure dpend de la faon de se dvelopper en colonie par rapport au support, au substrat. Les colonies peuvent avoir des aspects trs diffrents. Laspect tridimensionnel de la bactrie participe ces variations de formes coloniales. II. Les paramtres physicochimiques. Ces diffrents paramtres vont produire des conditions optimales de croissance ou non pour un micro-organisme. Dans les conditions optimales de croissance, la vitesse des divisions est maximale. Dans les conditions minimales et maximales de croissance, il ny a pas de division. 1. La temprature. Les bactries sont seuls ou isoles, elles sont indpendante des conditions environnementales pour leur croissance. Une augmentation de 10C de la temprature multiplie par 2 la vitesse de division des bactries. Une temprature trop leve mne rapidement la mort cellulaire. Voir schma 1. Tous les organismes ont + ou 30C autour de la temprature optimale. Les bactries qui ont une fourchette plus faibles sont appeles Stenotherme. Ex : N gonorhoeae qui une fourchette de [30C 38C]. Elle est obligatoirement pathogne. Au contraire, un organisme Eurytherme est capable de se diviser sur une large fourchette de temprature. Ex : Enterococcus faecalis qui a une fourchette de [0C - 44C] Il existe 5 grands groupes : - Les Psychrophiles.
2

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 3 - Les Psychrotrophes. - Les Msophiles. - Les Thermophiles. - Les Hyperthermophiles. * Les psychrophiles : T Optimale : 15C T Minimale : -5C T Maximale : 20C Elles sont capables de garder une activit dans des milieux cristallins. La membrane est constitue dacides gras polyinsatures souplesse. Ce sont des bactries essentiellement marines. * Les Psychrotrophes. Elles prfrent se multiplier faible temprature. T Optimale = 25C T Minimale = OC T Maximale = 35C Temprature optimale plutt leve. On y trouve beaucoup de bactries lies la chane du froid car mme faible temprature, elles gardent une vitesse de division plutt rapide. Ex : Listeria monocytogenes. * Les Msophiles : T Optimale = 35 - 37C T minimale = 15C T Maximale = 45C On y trouve tous les pathognes des animaux sang chaud. Leur optimum de temprature se trouve environ la temprature du corps humain. La pousse de fivre limite la prolifration de ces bacctries. * Les Thermophiles : T Optimale = 65C T Minimale = 45C T Maximale = 80C On les trouve dans les environnements extrmes chauds. Elles prsentent un problme conomique important car se trouvent dans toutes les sources deau chaude. Elles jouent un rle dans le compost. On y trouve des protines chaperonnes en plus grand nombre. Elles servent lenzyme de garder une activit dans un environnement instable. Les lipides sont majoritairement saturs donne une rigidit plus importantes aux membranes. * Les Hyperthermophiles. T Optimale = 95C T Minimale = 65C
3

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 3 T Maximale = 105C Elles vivent dans des sources deau extrmement chaudes. Elles sont proches ou dans les volcans. A 90% elles ne sont pas des bactries mais des arches. La prsence dther lipide permet de garder une grande cohsion la membrane. 2. La pression. Lenvironnement qui nous entoure est de lordre de 1 atm. La pression augmente avec la profondeur. La limite de la pression aquatique est de 250 atm. On y a trouv des bactries capables de rsister une telle pression. On les appelle les Barophiles. Une augmentation de la temprature de leau, augmente galement la pression. 3. Loxygne. Les seuls organismes terrestres capables de vivre sans oxygne sont les bactries. On distingue 5 types respiratoires : - Les arobies stricts. - Les anarobies facultatifs. - Les anarobies arotolrantes. - Les anarobies stricts. - Les microarophiles. * Les arobies stricts. LO2 est ncessaire leur vie car lO 2 est laccepteur final dlectrons qui conduit la formation deau. * Les anarobies facultatifs. Elles peuvent utiliser lO2 mais nen ont pas ncessairement besoin. Si lO2 est prsent, elles sen servent comme accepteur final dlectrons. Elles ont alors une croissance + rapide. Sinon elles utilisent le SO42- ou NO3-. Certaines sont capables de faire de la respiration anarobie. La majorit est capable de faire la fermentation. * Les anarobies arotolrantes. Elles nutilisent jamais dO2. Elles font quasi exclusivement de la fermentation. La prsence dO2 dans lenvironnement nest pas toxique pour la bactrie. * Les anarobies stricts. Elles ne font que la fermentation. La prsence dO2 est toxique. Ex : Bacteroides qui reprsentent 30% de la flore intestinale.
4

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 3

* Les microarophiles. Lair ambiant est constitu 21% dO 2. Cette concentration atmosphrique dO2 est toxique pour ces bactries. Elles se divisent bien lorsque la concentration en O2 est de lordre de 10%. Elles utilisent lO2 comme accepteur dlectrons. On les trouve dans les environnements aqueux car il y a moins d0 2 dans leau. Elles ne sont pas proches de la surface car il y reste une grande prsence dO2. * Toxicit de loxygne. Cette toxicit est li sa capacit ractive et donc arracher des lectrons des molcules organiques ce qui donne lieu des formes actives de lO2. Formes actives de lO2 : - Radical superoxyde : O2 + e- O2- * - le peroxyde dhydrogne : O2- * + e- + 2 H+ H2O2 - Radical hydroxyde : H2O2 + e- + H+ H2O + OH- * Tous les organismes vivants fabriquent des enzymes de dtoxification pour combattre ces formes actives de lO2 qui nous sont toxiques. Enzymes de dtoxification : - SOD : superoxyde dismutase 2 O2- * + 2 H+ O2 + H2O2 - Catalase : 2 H2O2 2 H2O + O2 - Peroxydase : H2O2 + NADH + H+ 2 H2O + NAD Contenu enzymatique : AO : + SOD + catalase AF : + SOD + catalase AA : + SOD Catalase AS : - SOD Catalase Microarophiles : + SOD +/- Catalase 4. Le pH. Il y a un optimum de pH auquel la croissance bactrienne est maximale. On distingue 3 types diffrents : - Les Acidophiles : [1 5,5] - Les Neutrophiles : [5,5 8] - Les Alcalinophiles : [8 10] Leffet du pH sur la croissance bactrienne. Ces capacits de rsister tel ou tel pH permettent la lutte contre le gradient de H+. SI pH acide lextrieur de la cellule, les protons H+ vont entrer dans la cellule o le pH est moins lev. Les bactries acidophiles sont capables dexporter les protons H+ hors de la cellule. Cest le contraire pour les bactries Alcalinophiles.
5

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 3

5. Lactivit de leau (aw). Toute solution contenant des soluts contient : - une partie de leau lie au solut. - une partie de leau libre. P mil = pression de la vapeur deau lie dans un milieu donne P eau pure = Pression de la vapeur deau libre aw = ( P mil ) / ( P eau pure) aw eau pure = 1 aw = produit dshydrat aw eau de mer = O,98 Les bactries ne se dveloppent pas dans une activit de leau infrieure 0,91. On distingue 2 types dorganisme : - Les Halophiles : elles sont capables de prolifrer dans des concentrations salines hautes [2,8 6M en NaCl]. (ne prolifre pas dans leau de mer car pas assez sal). - Les Halotolrantes : Bactries capables de rsister de hautes concentrations en sel mais elles ne sont pas capables de prolifrer dans un tel environnement. III. La nutrition. 1. La varit des sources nutritives. Pour dterminer les sources nutritives dune bactrie, il faut dterminer ses besoins cad ce qui constitue sa MO. Les bactries sont composes essentiellement de C, H, O et N. Tous les organismes vivants contiennent des molcules organiques. Llment de base dune molcule organique est la prsence dun squelette carbon. Autres lments moins importants : P, S, oligolments (Mg2+, Ca2+, Fe2+, Cu2+, Ni2+) Organismes autotrophes : Organismes qui savent tout produire delle-mme partir de la MO de base. 1975 : Ven Djiken a tablit cette formule : CH2 O0,5 N0,25 2. Les sources de carbone, dnergie et donneur dlectrons. a. La source de carbone. On a 2 types dorganismes - Les organismes autotrophes : Ensemble des organismes qui sont capables dutiliser le CO2 comme seul source de carbone. - Les bactries htrotrophes : Ensemble des organismes qui utilisent des molcules organiques rduites comme source de carbone

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 3 b. Lnergie. On a 2 types dnergie : - Phototrophes : capablent dutiliser lnergie lumineuse comme source dnergie - Chimiotrophes : ont besoin doxyder des m organiques ou minrale pr produire de lnergie. c. Les donneurs dlectrons. On dfinit 2 grands groupes : - Lithotrophes : la molcule dorigine est une molcule minrale rduite - Organotrophes : utilise des molcules organiques rduites comme donneur dlectrons. Lintgralit des espces vivantes peuvent sorganiser 4 groupes par rapport cette nutrition. 3. Les 4 types nutritionnels. a. Autotrophes photolithotrophes. Ils ont tous la possibilit dutiliser le CO2 comme source de base de carbone. Lnergie provient de la lumire. La source de donneur dlectrons sont des molcules minrales rduites. (H20, H2, H2S) On y trouve tous les vgtaux. b. Les autotrophes chimiolithotrophes. Toute la matire organique est produite partie du CO2. Oxydation dune molcule minrale rduite produit lnergie. Donneur dlectron : Molcule minrale. La source de lnergie et de donneur dlectrons sont li. c. Les htrotrophes photoorganotrophes. Source de carbone : molcule organique. Cette mme molcule organique sert de source dlectrons. Utilise lnergie lumineuse pour arracher les lectrons la molcule organique la base des ractions doxydo rduction. On y trouve lHomme. d. Les htrotrophes chimioorganotrophes. Source de carbone, dnergie et dlectron est une molcule organique rduite. e. Les mixotrohpes.
7

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 3

Il a la cappis dtre la fois dans 2 catgories. Il est capable dtre par exemple : Htrotrophe photoorganotrophes le jour et htrotrophes chimioorganotrophes la nuit.

Moyens mnmotechniques pour retenir les divers groupes : SI on est autotrophes, on est forcment lithotrophe. photo ou chimio. Si on est Htrotrophe, on est forcment ogranotrophe. Photo ou chimio.

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 4

Chapitre 4 : Adaptation au stress et formes de vie.

I. Rsistance au stress. Stress : Variation brutale dune condition environnementale et physique. Organisme : Syndrome gnral dadaptation. Dfinition du stress : Selon les biologistes, cest une rponse de lorganisme une variation brusque de paramtre glycochimique pour maintenir lquilibre biologique dans un tat fonctionnel. 1. Le stress oxydatif. Il est li aux formes actives de loxygne : O2*-, H2O2, OH* Ces formes actives de lO2 peuvent avoir plusieurs origines : - endogne : lO2 atmosphrique est en contact avec la cellule bactrienne O2*- exogne : H2O2 (peroxyde dhydrogne) intervient dans la dfense cellulaire pour protger les bactries. a. Les cibles biologiques. * Si la cible est une protine : Cystine : lextrmit SH libre forme un SOH : sufonyle. Elle se stabilise en formant un pont disulfure. Cest toxique pour la bactrie qui va dvelopper tout un systme de dfense qui dtecte la prsence de cellule mal conform qui va vite aller les liminer (Protase). * Si la cible est lADN : Le radical OH* subit une hydroxylation des bases puriques et pyrimidiques. Cela cause des erreurs dappariement. Ex : La base T devient une 5-hydroxymethyluracile. La base G devient une 8-hydroxypurine. Le systme de dfense excise ces bases non conforme et les remplace par dautres bases transversion, transition. * Si la cible est un lipide : Un acide gras insatur en prsence de O2*-, il y a la formation dun peroxyde. Cela est extrmement ractif et instable. Cela dur qq secondes et va attaquer un autre pond disulfure. Donc il y a ouverture des ponts disulfures ddstabilisation des phospholipides (membrane). SOD = super oxyde dismutase. Elle dbarasse la cellule de O2*-. Catalase et / ou peroxydase dbarasse des autres formes actives de lO2.
1

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 4

2. Losmorgulation. Dfinitions : Osmolarit (ou pression osmotique) : La somme des soluts osmotiquement actifs dune solution. Permet de dfinir lunit de base : osmole. Ex : Si on prend une solution de saccharose 0,5 molaire est 0,5 osmol. Une solution de NaCl 0,5 molaire et 1 osmol (0,5 osmol de Na+ et 0,5 osmol de Cl-). Relation entre osmolarit et AW : Augmentation de osmolarit = diminution de AW. Osmorgulation : Lensemble des processus homostatiques qui maintiennent losmolarit dun tre vivant son niveau (ou quilibre) normal. Ce sont tous les systmes dont la bactrie dispose pour lutter contre le phnomne naturel de losmose. Osmose : Leau se dplace dun milieu hypotonique faible en solut vers un milieu hypertonique fort en solut. a. Rle de losmolarit. En permanence des soluts en solutions entrent dans la cellule bactrienne augmentation constante de losmolarit de la cellule qui mne une augmentation de pression = pression de turgescence. De 3 10 atm de pression contre la paroi. Cette pression de turgescence est le moteur de la division cellulaire. b. Variation de losmolarit. Divers cas de figure : - Augmentation brutale de losmolarit de lenvironnement leau tendance naturellement sortir de la cellule bactrienne. Phnomne de plasmolyse. Ceci est toxique pr la bactrie : arrt de tous les mtabolismes et division. - Si le stress est faible (<0,5M NaCl), la bactrie compense en faisant entrer des sels en particulier des K+ et en mme temps entre de glutamate (COO -). Le glutamate est produit par la bactrie elle-mme. - Si le stress est faible, il y a synthse ou entre dosmoprotecteurs (aa, sucres, drivs daa). La glycine btane (trimethylamine glycine) est un des osmoprotecteurs. Ces osmoprotecteurs sont stocks en grande quantit car ils sont extrmement soluble (600g/L). - Une diminution brutale de losmolarit de lenvironnement leau tendance naturellement entrer dans la cellule bactrienne. Phnomne de turgescence. Ceci est
2

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 4 toxique pour la bactrie : arrt de tous les mtabolismes et division. Elle essai de compenser de divers faons : - Ouverture des aquaporines : canaux qui permettent la sortie deau. - Les canaux mcanosensibles : lorsque la pression de turgescence augmente, ces canaux souvrent pour laisser sortir les soluts de la cellule bactrienne. - Les canaux spcifiques Ex : Le canal MscM chez E. Coli, suite un choc osmotique louverture en 200msec fait sortir 1M de glycine btane. II. Formes de vie. 1. Notion dcologie microbienne. a. Planctonique. Une cellule planctonique est une cellule individualise en milieu liquide. A la base de la microbiologie, on tudi toutes les bactries dans un environnement planctonique. Les bactries ne sont pas prsente en majorit dans un environnement planctonique. En effet, elle est souvent en colonie et non individualise. b. Colonies. Biofilm bactrien. Une bactrie en colonie sur une bote de ptri est rparti de manire htrogne. Les bactries en colonies forment une boule. Les bactries en surface en contact avec lO 2 nauront pas la mme structure quune bactrie situe au centre de cette boule . Les bactries ne supportant pas lO2 se retrouveront donc, en tant au centre de cette boule, protgs par les autres bactries. 2. Le biofilm bactrien. La forme planctonique est une forme de dissmination pour passer dun biofilm un autre. La forme naturelle de vie normale dune bactrie est la colonie. a. Dfinition. Ecosystmes constitus de populations de micro-organismes associ les uns aux autres, inclus dans une matrice dexopolymres et gnralement associs des tissus, des matriaux abiotiques ou des interfaces. Cette dfinition inclus : - les structures de types agrgats et floculats - les colonies sur milieux gloss (bote de Petri) - les bactries fixes dans des interstices de milieux poreux - les pellicules bactriennes contaminant les biomatriaux implants dans lorganisme ou colonisant la surface des tissus eucaryotes htes - les fleurs deau (bloom)
3

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 4

b. Cintique de colonisation. Lordre de colonisation des supports pas la bactrie. On a une surface libre immerge dans un milieu aqueux. * Notion de film conditionnant : immersion dun support dans un milieu aqueux le support se recouvre immdiatement des molcules situes dans le milieu aqueux. Il y a + de matire organique au niveau du support que dans le milieu aqueux cest pourquoi les bactries viennent se coller au support. * Colonisation premire : Elle est rversible, certaines bactries saccrochent/dcrochent. * Rgime laminaire ou turbulent : Une bactrie nest pas forcment dans un milieu aqueux trs stable. Ex : Rgime laminaire = verre deau Rgime turbulent = leau dun torrent Interaction de lenveloppe bactrienne avec la surface. Ce contact peut tre voulu ou non. Si la bactrie trouve un environnement favorable sur le support, elle va sy fixer dfinitivement. * Colonisation secondaire : Irrversible, changement complet du mtabolisme. Elle se fixe dfinitivement au support. Elle produit des Adhsines indispensables la fixation au support. Lorsque les bactries se fixent dfinitivement au support, elles commencent se multiplier. Les cellules filles restent en contact de la cellule mre. * Synthse dExopolymres : Il y a synthse dune gangue qui entoure la colonie de bactries. Micro-colonies : bactries entoures dune gangue. Biofilm = association des micro-colonies. voir poly : cintique de dveloppement c. Structure tridimensionnelle. * Formes des biofilms : Des flux viennent apports de la matire organique qui se colle en contacte de la gangue dexopolymres. La gangue dexopolymre une forme de champignon . Lassociation des micro-colonies en champignon cre une vritable vascularisation qui permet le passage deau. Le biofilm filtre la diffusion. Les bactries en biofilms sont plus rsistantes aux antibiotiques que les bactries planctoniques car la diffusion des antibiotiques lintrieur du film est ralentit.
4

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 4 Schma 1. * Evolution des biofilms : La carence en lments nutritifs mne la mort des bactries. Ainsi les biofilms disparaissent. Des contraintes physiques peuvent bloquer lvolution des biofilms. Comme la prsence dun environnement turbulent. La colonie va devoir adapter une forme adapte lenvironnement. Ex : Adapter une forme pyramidale au lieu dune forme de btonnet qui serrait moins solide face au courant. Contrainte physique de lenvironnement. Schma 2. Evolution naturelle : En permanence le biofilm peut voluer en librant et en internant des bactries individualises.

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5

Chapitre 5 : Les mtabolismes.

I. La fourniture dnergie. 1. Rappel. a. Source dnergie. La lumire est la source dnergie. Elle permet la cascade de raction doxydorduction. Loxydation de molcules organiques ou de molcules minrales est lorigine de la production dnergie. b. Donneur dlectrons. Ce sont soit : - des molcules organiques rduites (sucres, lipides, protines) - des molcules minrales rduites (H2O, H2, H2S) c. Accepteurs dlectrons. On part dun donneur de- et par une cascade de raction doxydorduction on arrive laccepteur final de-. Cest laccepteur final de- qui tablit la voie mtabolique. Les diffrentes voies mtaboliques sont : - respiration : - arobie accepteur final de- = O2 - anarobie accepteur final de- = autre molcule que lO2 (Fe3+, NO3-, SO42-, TMAO). Ces molcules sont dans tous les cas exognes. - fermentation : La molcule acceptrice dlectrons est forcment endogne. Cette molcule est un intermdiaire mtabolique. - photosynthse : Laccepteur final de- est une molcule endogne. Accepteur final de- = NADH. Lobjectif final est de transfr les protons de cet NADH entre autre pour former de la matire organique. CO2 + H+ [CH2O]n d. Source de carbone. Autotrophe : CO2 (ne peut pas faire la fermentation) Htrotrophe : molcule organique e. Les types nutritionnels.
1

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 - Autotrophes : photolithotrophes. CO2, lumire minrale NADH - Autotrophes chimilithotrophes : Source de C : CO2. Va devoir oxyder des m minrales. Le transfert de- de ces m minrales se fait par oxydation. La seules voie mtabolique utilisable est la respiration. - Htrotrophes photoorganotrophes : Source de C et donneur de- = molcule organique. Utilise lnergie lumineuse pour produire la cascade doxydorduction. Ex : Rhodospirillum sp. Est capable de faire la photosynthse, la respiration et la fermentation. - Htrotrophes chimioorganotrophes : Source de C, dnergie et donneur de- = molcule organique rduite. Voie mtabolique : respiration ou fermentation pour utiliser ces molcules organiques dans les voies doxydorduction. f. Oxydorduction. Une raction doxydorduction se dcoupe en 2 demi-ractions : - une raction doxydation dune m rduite qui va donc cder ces e- et H+. Ex : H2 2 H+ + 2 e- une raction de rduction, gain de- et de H+. Ex : O2 + 2 H+ + 2 e- H2O. Bilan : H2 + O2 H2O. Couples redox : 2 H+ / H2 : - 0,421 V O2 / H2O : + 0,816 On peut dfinir un potentiel rdox pour chacun des couples : Eo Un bon donneur de- a un potentiel rdox ngatif. Ex : H2 Un bon accepteur de- a un potentiel rdox positif. Ex : O2 Voir poly page 1. Eo = Go = nergie libre DH2 + A D + AH2 + nergie (ATP) Comme on passe dun donneur fort et un accepteur fort un donneur faible et un accepteur faible, il y a une libration dnergie. Plus la diffrence entre la force des donneurs et accepteurs est forte, plus la libration dnergie est importante. Remarque 1 : La photosynthse.
2

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 Dans la photosynthse oxygnique, le point de dpart de la cascade doxydorduction est H2O. H2O est un donneur faible, lnergie lumineuse casse cette m dH2O pour donner de lO2 qui est un accepteur fort. Remarque 2 : La fermentation. La fermentation a pour point de dpart une m organique et laccepteur final de- est une autre m organique = un intermdiaire mtabolique. Par dfinition ces m vont tre proche du point de vu potentiel rdox. Cest pourquoi la fermentation libre peu dnergie. Remarque 3 : Catabolisme. Catabolisme = cmt on dgrade une m pour produire de lNRJ. Anabolisme = fabrication de m organique Mtabolisme = Catabolisme + Anabolisme 2. Production dnergie : les diffrents cas. Schma 1. Le point commun de ces 3 voies, cest que lon va utiliser du NADH. a. Rle du NAD+ / NADH, H+. NADH = Nicotinamide adnine dinuclotide. (ou NADP/NAPH). Que lon parle de = quivalent NADH Potentiel rducteur intracellulaire : Pour le couple NAD+/NADH, H+, NAD+ est prsent en toute petite quantit dans la cellule. Schma 2. Cette tape sassocie obligatoirement par la rduction du NAD+ en NADH, H+. [NAD+] est limit donc il faut recycler ce potentiel rducteur au fur et mesure des mtabolismes. 3. Oxydation de molcules organiques rduites. Il y en a plein de possibles. Mais on ne voit que le cas gnral : Assimilation dun sucre : le glucose. a. Les voies doxydation. Lassimilation du sucre par les bactries se fait par 3 voies possibles : - voie de la glycolyse - voie des pentoses phosphate
3

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 - voie des KDPG * La glycolyse : Poly page 2. La voie de la glycolyse peut tre dcoupe en 2 parties : - La voie haute : Dans cette voie, il ny a pas de raction doxydorduction. Pas de production de NADH Elle est commune aux procaryotes et eucaryotes. 1re tape : Phosphorylation du sucre. Glc (C6) Glc-6P Pour rentrer dans la c un sucre doit etre systmatiquement phosporyl car qd il est phosphoryl il ne peut plu sortir de la c. schma 3. On consomme de lATP : -1 ATP. On fait une 2me phosphorylation. C6P 2 C3P Il y a donc eu au total 2 m dATP consomm et 0 produite. - La voie basse On part de : 2 G3P 2 x G3P 2 pyruvate C3P C 3 On a produit un NADH multipli par 2 car il y a 2 m. R-CH3 > R-CHOH > RCHO > R-COOH Rduit oxyd Libration au final de 2 M dATP pr arriver au final au pyrivate multiplier par 2 car tjr 2 m. Bilan : - 2 ATP + 2 NADH + 4 ATP 2 ATP + 2 NADH produit par molcule de glucose. * La voie des pentoses phosphates : Cette voie peut tre dcoupe en 2 parties : - voie haute : C6P Ribulose 5P
4

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 Le ribuulose 5 P est un mtabolique intermdiaire central dans la voie de la synthse de tous les acides nucliques. On part -1 ATP car la molcule de Glc est dj phosphoryle. 2 ractions doxydation vont se produire : - transformation du glc 6 P en 6 phosphoglucono ? lactone. (NADPH) - oxydation qui saccompagne dune dcarboxylation Libration de NADPH + CO2. Bilan : - 1 ATP et + 2 NADH - voie basse Point de dpart : 3 C5P On prend 2 m : schma 4. Bilan : +1 NADH + 2 ATP Bilan global : + 1 ATP + 3 NADH (donc consommation de 3 NAD+)

* La voie du KDPG : On dcoupe en 2 parties : - Voie haute : La partie haute est confondue avec les pentoses P cd jusqau 6 phospho gluconate. - 1 ATP + 1 NADH - Voie basse : C6P KDPG 2 C3 1 C3P : G3P 1 C3 : pyruvate + 2 ATP + 1 NADH Bilan global : + 1 ATP + 2 NADH Bilan compar par molcule de glucose : Glycolyse : 2 ATP Pentose P : 1 ATP KDPG : 1 ATP 2 NADH 3 NADH 2 NADH

b. Les fermentations. La stratgie est de vite rgnr du NAD+ (qui a t transform en NADH) partir du pyruvate pour pouvoir refaire les voies mtaboliques qui se font partir du NAD+. A partir du pyruvate. Pyruvate rduction molcule rduite
5

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 NADH oxydation NAD+ Cest une stratgie commune. Les fermentations essentielles sont : homo, htro et mixte. * La fermentation homolactique. Loxygne nest jamais utilis dans la fermentation ! Glc Glc 6 P (- 1 ATP) 2G3P 2 Pyruvate Consommation de 2 ATP Produit 4ATP + 2 NADH Bilan : 2 ATP + 2 NADH Pour rgnrer le NAD+, rduction du pyruvate : LDH 2 Pyruvate 2 Lactate 2NADH 2 NAD+ (pdt cette raction) LDH = Lactate deshydrognase Streptococcus thermophilus Certains lactobacilles : Lactobacillus delbrueckii ssp bulgaricus Fermentation homolactique : on peut calculer le lactate produit. * Fermentation htrolactique : On part du Xylulose 5 P. Avant il y a eu : C6P Xylulose 5 P Avec production de 1 C02 et 2 NADH. La phosphoctolase transforme le xylulose 5 P en : ActylP et Glycraldhyde 3P. LDH G3P Pyruvate lactate 2 ATP 1 NADH NAD+ Bilan : 1 ATP produit. Actyl P Actate Bilan + 1 ATP Actyl P Actyl CoA A voir poly
6

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5

Bilan gnral : Lactate + Actate : + CO2 + 2 ATP + 2 NADH Lactate + Ethanol : + CO2 + 1 ATP Les bactries utilisant cette fermentation sont : - la plupart des lactobacilles - leuconostoc sp * La fermentation acide mixte. Glc 2G3P 2 pyruvate Bilan nergtique : 2 ATP + 2 NADH A partir dune M de pyruvate, 2 m diffrentes peuvent tre produites. 2 pyruvate 2 Lactate Production de NAD+ La production de H2 par dcarboxylation du pyruvate est un indicateur de cette fermentation. A partir de lactyl CoA, il y a 2 possibilits. Si la cellule possde une actokinase, lactylP peut tre transform en actate. Bilan : Lactate, Acide formique, CO2, H2 Puis au choix on fait de lactate ou de lthanol. Si on favorise la formation de lactate, on a bon un bilan nergtique mais peu de NADH : Production de 3 ATP + 1 NADH. Si on favorise la formation de lthanol, il y a production : 2 ATP 2 NADH 3 NAD+ = - NAD+ Les bactries qui font la fermentation acide mixte sont majoritairement les enterobactries (E. coli). La raison quune bactrie fait telle ou telle fermentation est selon les enzymes quelles possdent. * La fermentation butanediolique. Glc 2G3P 2 pyruvates Production : 2 ATP + 2 NADH
7

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 Ces bactries ont une enzyme trs interessante : lactolactate synthase. La fonction ctone de lactone va tre remplac par une fonction alcool. Le passage dun ctone un alcool = rduction. Bilan : 2 ATP + 1 NADH Les bactries faisant cette fermentation font galement une autre fermentation en mme temps (gnralement fermentation acide mixte). Les bactries faisant cette fermentation sont certaines enterobactries : Serratia, Erwinia, enterobacter. * La fermentation de Stickland. Au dpart ce nest pas un sucre mais un aa. AA = source de C. On a un couplage de ractions. Le potentiel redox de la c reste un intact grce ce couplage : Oxydation dun AA et en mme temps rduction dun autre AA. Alanine : dsamination et oxydation se font en mme temps. La dcarboxylation mne une liaison forte avec le Pour contrebalancer ces ractions doxydation, il se fait en parallle des ractions de rduction. 1 Alanine + 2 Glycine 3 NH3 + 3 actate + 1 CO2 1 ATP produit Bactries : Clostridium sp * La fermentation buthyrique. Bactries : C. buthyricum. Se retrouve dans les boites de conserves males strilises. * La fermentation Actonobutylique. Bactries : C. Actonobutylicum. Formation dun actone et de butanol. * La fermentation propionique. Succinate Propionate Avec libration de CO2.
8

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 * La rtrogradation malolactique. Cest un cas particulier car ce nest pas une fermentation. Cest un des lments capital de la fabrication dun vin. Levure (Saccharomyces cerevisiae). Elle fermente les sucres en thanol. En mme temps il y a production de phnol (arme). Il y a libration dacide dans le vin, notamment du malate qui est un diacide. Mais le phnol ne supporte pas lacide. Donc il faut limiter cet acide sinon pas darme. On passe donc du malate au lactate diminution de lacidit du vin en transformant un diacide en un monoacide. LATPase membranaire permet de faire un gradient de proton H+. Cest ce gradient de protons H+ qui permet la transformation du diacide en monoacide. c. La respiration. Les bactries utilisant la respiration peuvent rgnrer le NAD+. Elles oxydent le pyruvate. * Le cycle des acides tricarboxyliques = cycle de Krebs. Oxydation du pyruvate en ActylCoA = dcarboxylation qui saccompagne de la transformation du NAD+ en NADH. Schma 5 4 oxydations : 3 NADH et 1 FADH2 A chaque tour de cycle : 2 dcarboxylations succssives et 4 oxydations successives. Bilan : 1 GTP produit. Le pyruvate a totalement t oxyd en CO2 qui ets dgag. Pyruvate 3 CO2 5 NADH (= FADH2) (les 4 du cycle + 1 du pyruvate) 1 ATP (= GTP) * Chane de transporteurs dlectrons et/ou H+. Les bactries capables de pratiquer la respiration disposent au niveau de la mb CR une chaine dlectron et/ou protons. schma 6 Comment transporter les protons du NADH vers les autres molcules ?

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 Chaine de transporteurs de- et de protons partir de loxydation du NADH. Cette chaine mne un accepteur final : O2. Mais cette chane ne mne pas la production de beaucoup dnergie. thorie chimiohosmotique dde Mitchell. Il faut une chaine de transporteur de- seul et une chaine de transporteur de- et de H+. On passe dun donneur fort (trs lectro ngativement charg) un accepteur fort (lectropositivement charg). Il va y avoir une forte concentration en H+ lext de la c ce qui va crer un gradient de H+. Les H+ vont alors rentrer ds la c via lATPase mbR qui produit bcp dNRJ. La force proton-motrice va donc permettre de produire de lnergie. * La respiration arobie : voir schma de bioch 1. (avec les 4 complexes). Ou poly. Cest le systme de transporteur que lon trouve dans la mitochondrie. Laccepteur final est lO2. La phosphorylation oxydative (ATP). Complexe I = NADH deshydrognase Le complexe o le NAdH va soxyder en NAD+. Le FMN va transporter les H+ et e- et va devenir FMNH2. FMN FMNH2 FMN = flavine mononuclotide. Puis le complexe est transfrr un complexe fer/soufre. Seul les e- con transfrer ce complexe Fe/S. Q = quinone : ont la capacit de Q QH2. Le 2me complexe associe est le complexe II = succinate deshydrognase. FAD FADH2 FAD = Flavine adnine dinuclotide. FAD FADH2

Succinate

Fumarate

O2 + 2e- + 2H+ H2O NADH + H+ NAD+ + 2H+ + 2eNADH + H+ + H2O2 NAD+ + H2O + ATP 2 types de m interviennent dans la chaine de transporteurs de e- et H+ : - donneur/accepteur : e-

10

Microbiologie 1 : Bactriologie : Chapitre 5 Cytochromes : a, b, c, d, o. Au centre de ces molcules, il y a une association avec un mtal associ (svt Fe2+ ou Fe3+). Cest le noyau porphyrine qui contient ce mtal. Il y a un voyage de- Fe2+ Fe3+ + 1eComplexe Fe/S : Fe2/S2 ou Fe4/S4. Le fer est le cofacteur central des transfert de-. - Donneur / accepteur de protons H+ et e- : Flavine (Fp) (riboflavine) FMN : Flavine mononuclotide / FMNH2 FAD : Flavine Adnine dinuclotide : FAD + 2H+ + 2e- FADH2 Coenzyme Q 10 : Ubiquinone (drive de vitamine) UQ + 2e- + 2H+ UQH2 Il y a une succession de 4 complexes successifs : - complexe I : NADH dshydrognase : - 1 complexe FMN - 22 25 complexes Fe/S NADH + H+ NAD+ + 2e- + 2H+ FMN FMNH2 voir feuille de cours.

11