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Chapitre II:
Méthodes d'obtention des
molécules optiquement actives
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Chapitre 2: Méthodes d'obtention des molécules optiquement actives
Une bonne part de molécules organiques naturelles sont chirales ainsi que la
plupart des composés dont sont constitués les organismes vivantes.
Lorsqu’un composé biologiquement actif tel qu'un médicament interagit avec son site
récepteur chiral, la nature de l’interaction dépendra de la forme énantiomérique du
médicament.
Toutefois, dans certains cas l'un des énantiomères d'une espèce médicamenteuse a
l'effet de bloquer le site récepteur biochimique, ce qui diminue l'activité thérapeutique
de l'autre énantiomère. Il arrive aussi que l'un des énantiomère présente un spectre
d'activité tout à fais différent ou même toxique.
C'est la raison pour laquelle les recherches se sont focalisé pour identifier l’énantiomère
responsable de l'activité désirée et aussi pour trouver des méthodes d'accès moins
couteuses à cet énantiomère.
La thalidomine prescrite pour diminuer les nausée chez les femmes enceintes était
administré sous forme d'un mélange racémique.
La (R)-thalidomide avait l'effet sédatif souhaité alors que l'énantiomère S avait un effet
tératogène et fût responsable des malformations observées chez les enfants issus des
patients ayant utilisé ce médicament.
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La L-Dopa est active dans la lutte contre la maladie de Parkinson, elle restaure la
fonction nerveuse tandis que la D-Dopa est toxique.
Le (R)-limonène a une odeur d’orange, le (S) a une odeur de citron. De même, la menthe
verte et les graines de carvi ont des odeurs très différentes dus aux deux formes
énantiomères de la carvone.
a) Le Pool chiral:
Le pool chiral est la collection des produits naturels disponibles et bon marché pour être
utilisés comme produits de départ pour la synthèse organique. La stratégie de synthèse
des molécules optiquement actives à partir de pool chiral consiste à incorporer une
partie ou bien la totalité de l’un de ces composés dans la molécule cible.
- Abondants
- Peu couteux.
- Leurs structures doivent être assez proches de celle de l'un des produits naturels
disponibles, sinon la synthèse devient plus complexe.
Ces restrictions limitent l'éventail des molécules asymétriques que l'on peut synthétiser
par cette méthode mais elle demeure malgré tout largement employée.
Parmi ces composés, peut citer les acides aminés, les hydroxyacides , les aminoalcools,
les sucres, les terpènes et les alcaloïdes.
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Les hydroxyacides:
Les aminoalcools:
Les terpènes:
Les sucres:
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Les alcaloïdes:
La plupart des synthèses asymétrique nécessitent plus d'une ou deux étapes à partir
d'éléments du pool chiral.
Les scrabées mâles du genre Ips produisent une phéromone qui est un mélange de
plusieurs composés énantiomériquement purs. L'un est un simple diénol, le (S)-(-)-
ipsénol. Les chimistes japonais ont remarqué dans les années 1970 la similitude d'une
partie de la structure de l'ipsénol avec celle d'un aminoacide très disponible, la (S)-
leucine et ont décidé d'exploiter cela dans une synthèse du pool chiral , en utilisant le
centre chiral de la leucine pour fournir le centre chiral de l'ipsénol.
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2°/ L'alcool est protégé sous forme d'un dérivé de THP. La réduction de l'acide, en
passant par l'ester permet ensuite l'introduction du groupement partant tosyle, qui est
déplacé pour faire l'époxyde.
3°/ L'époxyde réagit avec un réactif de Grignard portant la partie dièique de la molécule
cible.
Pour imiter l'effet de la phéromone, le chimiste doit synthétiser les deux énantiomères
séparément et les mélanger ensuite dans les bonnes proportions.
La solution consiste à utiliser le lactate d'éthyle qui est largement disponible sous la
forme de son énantiomère (S), mais qui peut être facilement transformé en l'un ou
l'autre énantiomère d'un époxyde intermédiaire.
Ces époxydes réagissent avec le réactif de Grignard convenable pour donner l'un ou
l'autre énantiomère du substrat.
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La première résolution d'un racémique a été réalisé par Louis Pasteur en 1848 qui est
arrivé à séparer par tri manuel, les sels d'ammonium et de sodium des acides tartriques
(+) et (-). Ce racémique est constitué d'un conglomérat de cristaux dissymétriques non
superposables. Un tel dédoublement par tri manuel est assez exceptionnel car les
racémiques cristallisant sous la forme de conglomérats sont très peu nombreux (moins
de 10 %).
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Exemple:
L’acide (R)-(-)tartrique peut servir comme agent de résolution chiral d'un mélange
racémique de la 1-phényléthylamine en la transformant par réaction acido-basique en
un mélange de diastéréoisomères.
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Exemple:
Lorsque les deux énantiomères sont dans le mélange, le pouvoir rotatoire du mélange
est égale à:
On peut dire ainsi que l'excès énantiomérique e.e d'un mélange représente sa pureté
optique.
La pureté optique:
où [*] est le pouvoir rotatoire du mélange ou du produit brute non purifié. [] est le
pouvoir rotatoire de l'échantillon pur.
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basée sur la différence des intéractions entre la phase stationnaire chirale et les deux
énantiomères donnant des complexes diastéréoisomères (interactions par liaisons
hydrogène, électrostatiques ou par transfert de charges (donneur-π/accepteur-π). Un
exemple important est le 3,5-dinitrobenzoyl (3,5-DNB) dérivé de la R-phénylglycine, qui
est lié à la silice par un espaceur aminopropyliques
Une autre méthode qui a été adaptée à la séparation des énantiomères est
l’électrophorèse capillaire. Le principe de séparation électrophorétique repose sur la
différence de mobilité d’une molécule chargée dans une matrice polymère sous
l’influence d’un champ électrique.
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L'appareillage est constitué d'un tube capillaire ouvert à ses extrémités , en verre se
silice de très faible diamètre (15 à 150 m) et d'une longueur L variant entre 20 et 80
cm qui est rempli d'un électrolyte tampon.
La différence de potentiel appliquée peut atteindre 600 V/cm, mais l’intensité ne doit
pas dépasser une centaine de microampères, afin que la puissance dissipée reste
inférieure à 3 W.
Un détecteur est placé à la distance _ de l’extrémité amont du capillaire près du
compartiment cathodique. Le signal obtenu est à la base de l’obtention de
l’électrophorégramme qui donne des renseignements sur la composition de l’échantillon.
L’électrophorèse sur gel, une technique bioanalytique très importante, Le capillaire est
rempli avec un électrolyte contenant un gel de polyacrylamide. Celui-ci produit un effet
de filtration qui ralentit les grosses molécules et qui minimise les phénomènes de
convection ou de diffusion. Cette méthode est principalement appliquée aux
macromolécules, comme les polypeptides et les oligonucléotides.
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La pureté optique de l'échantillon est son excès énantiomérique e.e calculée à partie de
la relation suivante où SR et SS désigne sont les aires des pics des deux énantiomères:
PURETE OPTIQUE
La séparation spectroscopique des énantiomères repose sur le fait de les placer dans un
environnement chiral. Si le composé est un alcool ou une amine on peut le transformer
en un dérivé d'ester ou d'amide avec un chlorure d'acyle énantiomériquement pur
appelé chlorure d'acyle de Mosher, d'après son inventeur Harry Mosher. Les deux
énantiomères de l'alcool ou de l'amine deviennent des diastéréoisomères et donnent des
pics différents dans le spectres RMN. On peut déterminer l'e.e en intégrant les spectres
RMN 1H et 19F.
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Dans le passé des sels de lanthanides d'acides faibles énantiomériquement purs (appelé
réactifs de déplacement chimique chiral) qui formaient des complexes acide-base de
lewis avec les atomes d'oxygéne du composé étudié.
Ces réactifs ont une grande affinité pour les groupes fonctionnels oxygène et azoté.
Pour les petites molécules organiques, les réactifs de déplacement les plus fréquemment
utilisés sont Eu[tfc]3 et Eu[hfc]3.
Typiquement, ces composés ont au moins un substituant aryle, ce qui conduit à de forts
changements de signaux en raison du blindage anisotrope des cycles aromatiques.
Une autre approche appelée résolution cinétique repose sur de la différence des
vitesses de réaction de deux énantiomères avec un réactif ou un catalyseur
énantiomériquement pur.
Les états de transition correspondants sont des diastéréoisomères qui possèdent des
énergies différentes.
Si on fait réagir un mélange racémique de composé A avec un composé
énantiomériquement pur (R)-B on aura:
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A partir de là, il est possible de tracer la courbe donnant l'excès énantiomérique dans le
mélange de départ, en fonction du degrés de conversion" " pour différentes valeurs de
"s". .
L'excès énantiomérique de l'énantiomère n'ayant pas réagi est d'autant meilleur que la
conversion est importante:
La situation idéale est obtenue lorsque un seule énantiomère réagit, par exemple (R)- A
(kR >> kS). Ainsi, la réaction s’arrête à 50% de conversion et le mélange est composé de
50% de produit P1 et de 50% de substrat (S)- A qui sont séparables par des techniques
classiques de purification. Il faut néanmoins noter que ce cas est très rare et qu’il faut
généralement mettre 0.5 équivalent de réactif pour 1 équivalent de mélange racémique
afin d’arrêter la réaction à 50% de conversion.
Une forme très efficace de résolution cinétique appelée résolution enzymatique utilise
des enzymes comme biocatalyseurs chiraux pour faire réagir sélectivement un seul des
deux énantiomères d’un mélange racémique. L'autre forme d'énantiomère reste
inchangée.
Parmi les enzymes les plus disponibles on peut citer les estérases et les lipases qui
catalysent les réactions d'hydrolyse des esters:
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c) Synthèse asymétrique:
Si on veut créer un centre chirale sur une molécule achirale en utilisant un réactif
achirale, on obtient un mélange racémique puisque les états de transition qui conduisent
aux deux énantiomères sont eux-mêmes énantiomères qui ont la même énergie.
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Chapitre 2: Méthodes d'obtention des molécules optiquement actives
Il faut donc disposé d'une molécule énantiomériquement pur ou bien d'une partie de la
molécule qui reste en place pendant la réaction et qui entre en interaction avec l'état de
transition de la réaction pour contrôler la formation du nouveau centre chirale.
Cette transformation nécessite l'aide d'un auxiliaire chiral qui est provisoirement lié au
substrat, à un réactif ou à un catalyseur.
Auxiliaire chiral: C'est un groupe qui est fixé momentanément à proximité du centre
réactif et qui provoque une induction asymétrique. C'est un élément qui peut être dans
un catalyseur ou un solvant.
4. Il doit fournir une grande induction asymétrique. Les effets stérique jouent un
rôle très important dans la différenciation faciale.
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Exemple:
d) Induction asymétrique:
1- Concept de prochiralité:
Un atome de carbone triangulaire qui n'est pas un centre chiral mais qui peut le devenir
est appelé prochiral.
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Un atome ce carbone tétraédrique (qui n'est pas chiral) peut être également prochiral,
s'il porte deux substituants différents et si le remplacement de l'un des deux
substituants conduits à un nouveau centre chiral.
On attribue les noms pro-R et pro-S aux groupements énantiotopiques d'un atome de
carbone tétraédrique prochiral en utilisant les mêmes règles d'attribution de R et S au
centre chiral qui se crée si on donne au groupement en question une priorité supérieure
à celle de l'autre énantiomère.
Exemple:
Les deux groupement acide sont énantiotopique car la substitution de l'un d'eux par un
autre groupe donne un énantiomère.
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Exemple:
Il s'agit de tout pair de substituants identiques portés par un carbone hybridé sp3 dans
une molécule possédant un plan de symétrie.
Exemple:
La prochiralité concerne aussi les doubles liaisons des alcènes. Une double liaison est
prochirale lorsque dans une réaction d'addition elle est convertie en un ou deux centres
chiraux.
Exemple:
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2) Induction asymétrique:
Felkin- Anh a fait l'hypothèse que l'attaque nucléophile s'effectue sur la face opposée au
groupe le plus volumineux ou le plus polaire selon l'angle de Burgi- Denitz à environ
107° de la fonction carbonyle. Le substituant le plus volumineux est placé
perpendiculaire au plan de la fonction carbonyle.
.
Exemples:
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En faisant une rotation de 60° autour de la liaison centrale de l'aldéhyde nous obtenant
une série de six conformations (présentées en projection de Newman) dont deux d'entre
elles, celles qui placent le substituant le plus gros perpendiculairement au groupement
carbonyle, sont les conformations les plus faibles en énergie.
Tout nucléophile qui attaque la fonction carbonyle le fait selon l'angle de Bürgi -Dunitz à
environ 107° de la liaison C=O. L'attaque peut se faire des deux coté de la fonction C=O.
Les schémas ci-dessous montrent les trajectoires possibles sur les deux conformations
les plus stables:
Les quatre trajectoires ne sont pas également favorisées. Pour celles en rouge, le
nucléophile passe à 30° d'un autre substituant tandis que la trajectoire en noir ne
présente aucune gène stérique: Elle corresponde à la conformation la plus réactive qui
réagit pour donner le diastéréoisomère le plus stable.
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On doit d'abord dessiner les conformères les plus importants de la cétones. Ceux où le
groupement Ph est perpendiculaire à la fonction C=O.
Pour prédire la stéréosélectivité des réactions d'addition sur un groupement carbonyle ayant un
centre chiral voisin, utilisez le modèle de Felkin-Ahn.
Alors que le modèle de Felkin- Ahn prédit l'orientation de l'attaque, il ne donne aucune
information dur le degrés de sélectivité de la réaction.
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La diastéréosélectivité très supérieure suggère qu'un autre facteur est mis en œuvre ici.
C'est l'électronégativité de l'atome d'azote N.
Les groupement carbonyles augmentent la réactivité des groupes partant voisins vis à
vis de la substitution nucléophile.
La même chose de produit même avec des atomes électronégatifs qui ne sont pas des
groupes partant de la réaction SN2 (X=OR, NR2, SR,..etc). Les orbitales anti- liants * et la
liaison C=O et * de la liaison C-X se recouvrent pour former une nouvelle orbitale de
plus faible énergie, plus susceptible d'une attaque nucléophile.
Mais si X n'est pas un groupe partant l'attaque sur cette orbitale ne donnera pas une
substitution nucléophile mais une addition sur la fonction carbonyle. Cet effet ne se
produira que si les liaisons C-X et C=O sont perpendiculaires afin que les orbitales soient
correctement alignés.
En termes d'énergie:
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Effet de la chélation:
Le soufre est un atome électronégatif. L'attaque la moins gênée se fait sur la seconde
conformation de la cétone et donne le diastéréoisomère indiqué.
- Un ion métallique qui préfère se coordiner à plus d'un hétéroatome à la fois (Li+, Mg2+,
Zn2+, Cu2+, Ti2+, Ce3+, Mn2+). Na+ et K+ ne sont pas impliqués dans la chélation.
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