Biologie Moléculaire

Chapitre I :Les Acides

nucléiques

saifi.ensb@gmail.com
PLAN

 Structure de l’ADN (Acide DésoxyriboNucléique)

 Structure de l’ARN
 Structure du génome
- Le nucléosome
- Structure chromatinienne d’ordre supérieur
STRUCTURE DE L’ADN
Structure en Hélice de l’ADN

- Une double hélice.

- Présente un squelette sucre
phosphate
- Des bases parallèles liées

1 tour d’hélice =10,5 paires de base

entre elles
- Distance entre deux base Squelette
sucre- phosphate
0,34nm
- 1 tour d’hélice= 10,5 pb
STRUCTURE DE L’ADN
Bases Sucre

Phosphate
 STRUCTURE DE L’ADN
Les bases Pyrimidique

ARN

ADN
 Les bases pyrimidiques sont : la cytosine, et la thymine pour l’ADN
et uracile pour l’ARN.
 Les pyrimidines ont un noyau aromatique hexagonal de 4 carbones et 2 azotes.
STRUCTURE DE L’ADN
Les bases Puriques

Les bases puriques sont : l’adénine et la guanine.

Les purines ont un double noyau aromatique comportant à gauche un cycle hexagonal
de 4 carbones et 2 azotes et à droite un cycle pentagonal de 3 carbones (dont 2
communs avec le précédent) et 2 azotes.
STRUCTURE DE L’ADN
Nucléoside et Nucléotides
 STRUCTURE DE L’ADN

Liaison ester

Liaison N-
osidique

Les sucres se lient aux bases azotées par des liaisons impliquant un des azotes de la
base (azote n°1 des pyrimidines ou azote n°9 des purines) et le carbone n°1 de l’ose.
Ce sont des liaisons N-osidiques.
STRUCTURE DE L’ADN
 Des liaisons
phosphodiesters permette
la formation du squelette
sucre phosphate.
 Les brins de la molécule
d’ADN sont toujours
orientés (5’ et 3’)
 A pH physiologique
l’ADN est chargé
négativement
STRUCTURE DE L’ADN
Les liaisons hydrogène sont essentielle pour l’appariement des bases

Incompatibilité entre A et C

 Appariement entre G:C et A:T

 Il y a 3 liaisons hydrogène pour G:C et 2 liaisons hydrogène pour
A:T
STRUCTURE DE L’ADN
Structure détaillée du polymère polynucléotidique

 Les deux brins de la double

hélice sont appariés l’un à
l’autre de façon
complémentaire dans une
orientation antiparallèle

 Si on a A sur un brin, en face on

a T et réciproquement.
Si on a G sur un brin, en face on
aura un C et réciproquement :
A / T = C / G = 1, c'est la loi de
Chargaff.
STRUCTURE DE L’ADN
Dénaturation de l’ADN

ADN double brins

 Dénaturation de l’ADN : C’est la Dénaturation renaturation

séparation des deux brins d’ADN.

 La séparation se fait par augmentation de
la température ou de pH
ADN partiellement
dénaturé

Association des brins

Séparation complète des par appariement des
deux brin bases
STRUCTURE DE L’ADN
Dénaturation de l’ADN

 Chauffage de l’ADN conduit à sa dénaturation et une augmentation

de l’absorbance à 260nm.

 Tm : température pour la quelle on à 50% d’ADN double brin

et 50% d’ADN dénaturé.
STRUCTURE DE L’ADN
Dénaturation de l’ADN
%GC

L’augmentation de concentration en GC conduit à augmentation

de la Tm
STRUCTURE DE L’ADN
Dénaturation de l’ADN

Faible
concentration
en sel Forte
concentration
en sel

L’augmentation de concentration en sel conduit à une

augmentation de la Tm
STRUCTURE DE L’ADN
Calcul de la Tm
Oligonucléotide inferieur à 20 nt:

- (A+T)X2 + (G+C)X4= Tm en °C

Oligonucléotide supérieur à 20 nt:

- [ (A+T)X2 + (G+C)X4] X (1+ [(N-20)/20 ])= Tm en °C

Pour être plus précis il faut tenir compte aussi de la concentration en sodium du
tampon d’hybridation. Lorsque cette concentration n’excède pas 1M, on utilise la
formule :

- Tm = 81,5 + 16,6(log10[Na+]) + 0,41[(G+C)/N] - (600/N)

- Des algorithmes plus complexe existe sur internet:

www.thermofisher.com
https://tmcalculator.neb.com/#!/
STRUCTURE DE L’ARN
STRUCTURE DE L’ARN

Trois différences entre

l’ARN et l’ADN

1) l’ARN contient un (1) (2)

ribose au lieu d’un
désoxyribose
2) L’ARN contient
l’uracile à la place de
la thymine
3) Les ARN sont
généralement isolés à (3)
l’état monocaténaire
(un seul brin)
STRUCTURE DE L’ARN
Caractère hélicoïdale de l’ARN Boucle

La chaine d’ARN se replie en partie sur Région

d’appariement
elle-même pour former localement des
doubles hélices.
Structure en épingle à cheveux

Structure en hernie

Structure en boucle
STRUCTURE DE L’ARN
L’ARN peut se replier et former des structures tertiaires complexes

Les structures tertiaires sont facilités par des liaisons non conventionnelles, tel
que: G:U ou bien U:A:U
STRUCTURE DE L’ARN

Appariement G:U
STRUCTURE DE L’ARN

Appariement U:A:U
STRUCTURE DE L’ARN
La vie a-t-elle évolué à partir d’un monde à ARN??????

Pourquoi ADN est un désoxyribose????????

STRUCTURE DE L’ARN

Pourquoi ADN est un désoxyribose????????

STRUCTURE DU GÉNOME
STRUCTURE DU GÉNOME

2 mètres d’ADN
compactés dans une
cellule a 10 μM de
diamètre
STRUCTURE DU GÉNOME
Nucléosome
Le nucléosome est un complexe Histones de ADN de
l’octamère
comportant un segment d’ADN l’octamère
(147pb)
d'environ 147 nucléotides, enroulé
autour d'un cœur formé de
protéines (les histones) ADN
internucléosomique
(20-60pb)
STRUCTURE DU GÉNOME
Histones
Il existe 5 histones
 H2A, H2B H3 et H4 : ces histones forment l’octamère du
nucléosome.
 H1 c’est une histone internucléosomique, elle se fixe au niveau
de l’ADN internucléosomique.
Les histones sont des protéines chargées positivement
Queue N-terminale Domaine de repliement de l’histone
STRUCTURE DU GÉNOME
Structure chromatinienne d’ordre supérieur

Histone H1 induit un plus grand resserrement de l’ADN entre

des nucléosome

ADN octamère
ADN internucléosomique
STRUCTURE DU GÉNOME
Structure chromatinienne d’ordre supérieur

La fixation de H1 conduit a la formation de la fibre 30nm.

STRUCTURE DU GÉNOME
La fibre 30nm forme des boucle ADN

Boucle
ADN

Charpente du
chromosome
STRUCTURE DU GÉNOME