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CAMPYLOBACTER

Epidémiologie, antibiogramme et
mécanismes de résistance aux
antibiotiques

Prof Abdoul-Salam OUEDRAOGO


Service de Bactériologie-Virologie
CHU Souro Sanou
LNR-RAM Burkina2Faso
Introduction
• BGN = Campylobacteriaceae.
• forme plus ou moins allongée, incurvée, en
virgule, en forme de «S» ou hélicoïdale.
• mobilité en «vol de moucheron» par une
ciliature polaire monotriche.
• métabolisme respiratoire microaérophile
• Oxydase positive
• Responsables de gastro-entérites chez
l’homme et de zoonoses
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Historique
• En 1913, bacille mobile vibrio-like impliqué dans
des avortements chez les bovidés.

• En 1919, le nom de Vibrio fetus est donné à ce bacille

• En 1963, les études génétiques menées par Sébald et


Véron , bactérie différente des Vibrio (G+C% : 40-52)
et définissent le genre Campylobacter (30–38%)

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CARACTERES BACTERIOLOGIQUES

1-Taxonomie/classification
• Famille: Campylobacteriaceae
• Genre: Campylobacter
• Espèces: 17: (6 ss-espèces)
üC. jejuni (2 ss-esp. : jejuni et doylei)
üC. coli
üC. fetus (2 ss-esp: fetus et venerealis)

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Intérêts de la question
• Conditions de culture très exigeantes donc pas
recherchés en routine dans les laboratoires.

• Epidémiologique par le manque de données


dans la plupart des pays africains:

• Mesures d’hygiène alimentaires efficaces pour


limiter la transmission.

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Epidémiologie

Habitat
• Intestin de nombreux animaux
• Eaux souillées, produits laitiers
• Viandes contaminées
• Homme infecté

Incidence: Largement sous-estimé,

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Epidémiologie: 2-62% en Af.sub.

Gahamanyi et al, 2020 9


Epidémiologie
Incidence :5 à 14% de toutes les maladies diarrhéiques
Faible ou sous-estimée en Afrique Sub-saharienne?

Prévalence: 4,44%
dans la volaille, 0%
chez les éleveurs et
dans le sol.
Cipro et NAL
(37.5%),
ampi ( 50%),
tetra (87.5% )

Analyse préliminaire d’un étude locale* montre une circulation de quelques cas de Campylobacter sp(21% par
PCR vs 1% culture) Bobo-Dioulasso et Dano.
*(Andemia) 10
Physiopathologie

2 Mécanismes probables: Cytotoxique et


toxinique
• Adhère aux microvillosités
• Produit entérotoxines → diarrhée
• Certaines souches pourraient être invasives

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Physiopathologie: symptomatologie

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Physiopathologie: complications

• Complications post-infectieuses : syndrome


de Guillain Barré

• Polyradiculonévrite se manifestant par une


paralysie flasque, mortelle dans 2 à 3% des cas.

• relation causale forte établie avec les infections à


C.jejuni du sérogroupe O19 de Penner ou Lior 7,

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Diagnostic biologique
Prélèvement
• Selles fraichement émises
• Liquides ou mucopurulentes
• Sang pour hémoculture.

Transport et conservation
• Transport rapide
• Récipient hermétiquement
• Conservation à 4°C pendant 24h

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Examen direct: Microscopie

• Etat frais: bacilles très mobiles (mobilité en « vol de


moucheron »).
• frottis de selles coloré au gram ou au bleu de
méthylène,
• Mise en évidence de polynucléaires(témoin de
l’invasion des cellules intestinales)
• Population monomorphe de bacilles incurvés à gram
négatif.

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Examen direct: Microscopie

Observation microscopique de Campylobacter à l’état frais x40)

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Observation microscopique de Campylobacter coloration de Gram x100)
CULTURE
vMilieux Sélectifs: géloses de base variables +
suppléments antibiotiques

• Butzler, inhibiteurs (bacitracine, colistine, cefazoline,


novobiocine, cycloheximide ou amphotericine B)

• Skirrow: inhibiteurs :vancomycine, polymyxine,


trimethoprime

• gélose Karmali: pyruvate de sodium, cefoperazone,


vancomycine, cycloheximide

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CULTURE

18
CULTURE
qAspects des colonies

• Bouillon sémi-gélosé: en forme cylindrique « coup d’ongle », à


la surface du milieu

• Sur gélose: plates, grisâtre, translucides(S),

• Parfois opaques, muqueuses(M)

• Colonies rugueuses(R) Culture de Campylobacter – 48h


à 37°C en microaérobie sur GS

petites colonies luisantes (1 à 2 mm


de diamètre), non hémolytiques,
grisâtres ou translucides selon les
espèces, rondes, lisses, bombées ou
plates, ayant tendance à
l’envahissement.

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Identification
Caractères:
• morphologique,
• culture,
• biochimie,
• Antigénique
• Spectrométrie de masse MALDI-TOF
• Galérie API Campy (BioMérieux) en pratique

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Identification:
Coloration de Gram après culture

BGN fins, en
forme de
virgule ou « S »
ou en forme
hélicoïdale

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Indentification:
Caractères biochimiques
• Oxydase+, nitrates+, catalase Catalase+
varie
• H2S inconstant: distingue ss-esp
• Sucres Neg ≠ Vibrio
• C. jejuni hydrolyse l’hippurate.

apparition d’une
coloration violette

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Hippurate+ Oxydase +
Caractères différentiels de quelques
Campylobacter
Espèces Oxyd Catala Croissance à H2 Sensibilité à Hydroly
ase se 25°C 42°C S Acide Céfalot se de
nalidixi ine l’hippur
que ate
C. fetus fetus + + + - - S R -
C. fetus + + + - - S R +
venerealis
C. jejuni + + - + - R S
C. coli + + - + - R S -
C. sputorum + - - + + R S
sputorum

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Antibiogramme des Campylobacters

qMéthode par diffusion:

• selon les recommandations du CA-SFM

• Milieu MH-F incubé dans une atmosphère microaérophile


35°±2ºC , 24 h ou 40-48 h d’incubation

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Antibiogramme des Campylobacters
Antibiotique à tester
Liste standard Liste complémentaire
• Ampicilline • Ertapénème
• Amoxicilline-acide • Gentamicine
clavulanique
• Erythromycine
• Ciprofloxacine
• Tétracycline

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Résistance naturelle
qBeta-lactamines:

v Naturellement peu sensibles (en particulier aux carboxy,


uréido-pénicillines et céphalosporines),

vMécanisme de résistance:

-manque de perméabilité à ces molécules

-et/ouexpression de protéines liant les pénicillines (PLP) de


moindre affinité.

q Sulfamides et les glycopeptides : inactifs.


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Résistances acquises

Gahamanyi et al, 2020 27


Résistances acquises
qRésistance à l’amoxicilline

• taux de résistance de 47%

• résistance liée à la présence de bêta-lactamase


chromosomique sur le gène bla

• acide clavulanique restaure la sensibilité dans


presque la totalité des cas

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Résistances acquises
qRésistance aux macrolides

• résistance croisée entre macrolides de 3,7 %.

• Mécanisme : mutations (ponctuelles) au niveau


du gène codant pour l’ARNr 23S entraînant une
diminution de l’affinité du ribosome pour les
macrolides

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Résistances acquises
qRésistance aux tétracyclines

• Tétracyclines sont une alternative thérapeutique aux


macrolides

• taux de résistance limité (12,6 %).

• Mécanisme: résistance enzymatique par acquisition


du gène plasmidique tetO

• Lecture: tétracycline peut être utilisée pour


déterminer la sensibilité à la doxycycline.
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Résistances acquises
qRésistance aux aminosides

• résistance rare (1 % pour la kanamycine)

• Mécanisme: nature plasmidique avec enzyme


inactivatrice de nature aminoglycoside
phosphotransférase 3’ de type III

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Résistances acquises
qRésistance aux quinolones

• taux de résistance aux quinolones en 2004: 27%pour C.


jejuni, 42% pour C. coli.

• résistance due à des mutations dans la région dite «


Quinolone Resistance Determining Region » ou QRDR
du gène de la gyrase A (gyrA), en particulier, une mutation
d’une thréonine en position 86.

• D’autres mutations peuvent être en jeu au niveau de gyrA

• Résistances par efflux existent également


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CONCLUSION
qImportance majeure des campylobacter dans les infections
intestinales

qPrévention efficace:
• Hygiène individuelle et collective
• Bonne cuisson des aliments , pasteurisation du lait,

qImportant de définir l’épidémiologie dans PED

qRecherche non systématique en coproculture d’où


incidence sous-évaluée
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MERCI!

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