Mission d’enseignement online à l’EISMV / Abidjan du 01 au 06 mars 2021

La compartimentation
de la Cellule Eucaryote
Prof. BAKOU Niangoran Serge, Msc., DVM, PhD

Ecole Inter-Etats des Sciences

et Médecine Vétérinaires de Dakar
 INTRODUCTION
F Contrairement à une bactérie, qui est généralement
formée d’un compartiment unique entouré d’une
membrane plasmique, une cellule eucaryote est
subdivisée de manière élaborée en compartiments
limités par une membrane et fonctionnellement
distincts.
F Chaque compartiment, ou organite, contient son propre
groupe d’enzymes et d’autres molécules spécialisées,
et des systèmes de distribution complexes qui
transportent des produits spécifiques d’un
compartiment à l’autre.
 INTRODUCTION
F Ainsi pour comprendre une cellule eucaryote, il est
essentiel de savoir ce qui se passe dans chacun de ces
compartiments à savoir :
Ø Comment les molécules circulent entre eux ?

Ø Comment les compartiments eux-mêmes sont créés et

conservés ?
 INTRODUCTION
F Les protéines jouent un rôle essentiel dans la
compartimentation d’une cellule eucaryote :
Ø Elles catalysent les réactions qui se produisent dans
chaque organite et font sélectivement pénétrer et sortir
de petites molécules de sa région interne ou lumière.

Ø Elles servent également de marqueurs de surface

spécifiques de l’organite, qui adressent de nouvelles
livraisons de protéines et de lipides vers l’organite
approprié.
 INTRODUCTION
F Les protéines jouent un rôle essentiel dans la
compartimentation d’une cellule eucaryote :
Ø Une cellule de mammifère contient environ 10 milliards
(1010) de molécules protéiques de 10.000 sortes.

Ø La synthèse de la majorité de ces molécules commence

dans le Cytosol (espace commun qui entoure les
organites).

Ø Chaque protéine néo-synthétisée est ensuite transmise

spécifiquement au compartiment cellulaire qui en a
besoin.
 INTRODUCTION
F Objectifs :
Ø A travers la circulation (trafic) intracellulaire des
protéines nous étudierons presque tous les
compartiments cellulaires.
Ø A l’issue de cette leçon l’étudiant devra être capable de :
ü Décrire les compartiments cellulaires ;

ü Décrire les relations qui existent entre les différents

compartiments cellulaires ;

ü Décrire la circulation protéique intracellulaire ;

ü Décrire la biogenèse des organites cellulaires limités par

une membrane.
 INTRODUCTION
FPlan
1. Compartiments des cellules eucaryotes
2. Relations topologiques des organites limités par
une membrane
3. Compartiments cellulaire et circulation protéique
intracellulaire :
ü Méthodes d’étude
ü Voies de circulation protéique
ü Déplacement des protéines entre les compartiments
ü Destin des protéines et peptides et régions « signal »

4. Biogenèse des organites cellulaires limités par une

membrane
 1.
Compartiments des cellules eucaryotes
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Toutes les cellules eucaryotes on un ensemble
fondamental d’organites limités par une
membrane :
Ø Ces membranes jouent de nombreux rôles :
ü processus vitaux tels que la phosphorylation
oxydative et la photosynthèse qui ont besoin d’une
membrane semi-perméable organisée pour coupler le
transport des ions H+ à la synthèse d’ATP.

ü cadre pour la synthèse de nouveaux composants

membranaires.
 1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Noyau :
ü contient l’essentiel du
génome et est le site principal
de la synthèse de l’ADN et
l’ARN.

Ø Cytoplasme :
ü il entoure le noyau est
composé du cytosol et des
organites cytoplasmiques qui
y sont en suspension.

ü le cytosol représente un peu

plus de la moitié du volume
total de la cellule.
 1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
ü le cytosol est non seulement
le site de la synthèse protéique,
mais aussi celui de la plus
grande partie du métabolisme
cellulaire intermédiaire.

ü environ la moitié de la
surface totale de la membrane
d’une cellule est utilisée pour
entourer les espaces
labyrinthiques du Réticulum
endoplasmique (RE)
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
ü les membranes du RE (6 nm
d’épaisseur) délimitent un
ensemble de cavités ou
citernes qui communiquent
entre elles et forment un
réseau spongieux à l’intérieur
du cytoplasme.

ü une portion du RE entoure le

noyau, c’est l’ENVELOPPE
NUCLEAIRE, qui marque la
frontière entre le compartiment
nucléaire et le compartiment
cytoplasmique.
 1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments intracellulaires
principaux :
Ø Cytoplasme :
ü cette frontière n’est pas
continue car fenêtrée de place en
place par des perforations de 50
nm de diamètre : les PORES.

üde nombreux ribosomes sont

attachés aux membranes du
réticulum de cette cellule et leur
donnent un aspect grenu d’où le
nom de RETICULUM
ENDOPLASMIQUE GRANULAIRE
ou ERGASTOPLASME attribué à
ce type de RE.
 1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üles chaînes polypeptides qui
sont synthétisée par ces
ribosomes sont transférées
dans les cavités du réticulum
ou (destinées à la sécrétion)
insérées dans les membranes
(protéines intrinsèques).
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üainsi les cavités du
réticulum forment des
compartiments où
s’accumulent des molécules
destinées à être exportées
dans le milieu extracellulaire
ou à être stockées dans
d’autres compartiments
intra-cytoplasmiques.
 1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments intracellulaires
principaux :
Ø Cytoplasme :
üles portions du RE dont les
membranes sont dépourvues
de ribosomes constituent le
RETICULUM ENDOPLASMIQUE
LISSE (REL) ;

üce type de RE est très peu

abondant dans le fibroblaste
mais très abondant dans les
cellules interstitielles (LEYDIG)
par exemple et est impliquée
dans le métabolisme des
lipides.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
ü les membranes de
l’Appareil de Golgi (7 nm
d’épaisseur et toujours
dépourvues de ribosomes)
isolent des cavités dont
l’arrangement est beaucoup
plus ordonné que le réseau
polymorphe du RE.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üil s’agit de disques aplatis
ou saccules qui sont
empilés les uns sur les
autres.

üchaque pile constitue un

DICTYOSOME et compte 3 à
4 saccules de 1 nm de
diamètre environ.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üau nombre d’une dizaine, les
dictyosomes sont groupés
près du noyau.
üune des faces des
dictyosomes est en regard de
certaines régions du RE, c’est
la FACE EXTERNE.

ü la face opposée étant la

FACE INTERNE.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üde part et d’autre des
dictyosomes existent 2
populations de vésicules de
20 nm de diamètre : les
VESICULES DE TRANSITION
situées entre les
dictyosomes et des citernes
du RE.

üdes VESICULES DE
SECRETION sont situées au
voisinage de l’autre face des
dictyosomes.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :

ü les dictyosomes sont des

structures DYNAMIQUES.

ü en effet, de nouveaux
saccules se forment à la face
externe par fusion de
vésicules de transition qui
ont bourgeonnées à partir du
RE, en même temps que des
saccules disparaissent à la
face externe en se
fragmentant en vésicules de
sécrétion.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
ü les vésicules de sécrétion
sont emportées vers la
périphérie de la cellule et leur
contenu est alors déchargé
dans le milieu extracellulaire
par fusion de leur membrane
avec celle de la membrane
plasmique (EXOCYTOSE).

üdans le cytoplasme des

cellules eucaryotes, il existe
également d’autres organites
qui sont en fait des
productions du RE ou de l’AG.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
ü il s’agit de vésicules de 0,1
micron de diamètre limitées
par une membrane de 6 nm
d’épaisseur qui isole une
matrice.

ü dispersées dans le
cytosol, ces vésicules
renferment des enzymes qui
catalysent la production et la
décomposition de l’eau
oxygénée (peroxyde
d’hydrogène) : les
PEROXYSOMES.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üd’autres vésicules de
diamètre varié (0,2 à 3
microns) limitées par une
membrane de 7 nm
d’épaisseur contiennent un
mélange d’hydrolases,
enzymes qui catalysent à pH
acide le clivage de molécules
variées avec intervention de
molécules d’eau. ce sont les
LYSOSOMES.
1. Compartiments des cellules eucaryotes

F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üsur leur trajet vers les
lysosomes, les
macromolécules et les
particules endocytées
doivent traverser une série
de compartiments appelé :
ENDOSOMES.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üLes MITOCHONDRIES
représentent un dernier type
d’organite cytoplasmique à
structure membranaire.

üau nombre d’un millier

environ par cellule
dispersées dans le cytosol,
elles ont la forme de
bâtonnets cylindriques aux
extrémités arrondies dont le
diamètre est de 0,5 micron et
la longueur de 2 à quelques
microns.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
ü chaque mitochondrie est
séparée du cytosol par
une membrane de 6 nm
d’épaisseur qui est la
membrane mitochondriale
externe.
ü la membrane
mitochnondriale interne
forme des replis appelés
CRETES
MITOCHONDRIALES.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
ü les 2 membranes
mitochondriales isolent 2
compartiments l’un situé
entre les 2 membranes
externe et interne :
l’ESPACE
INTERMEMBRANAIRE.

ü un autre limité par la

membrane interne qui est
la MATRICE
MITOCHONDRIALE.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üles mitochondries régénèrent
le fournisseur universel
d’énergie pour la cellule :
l’Adénosine Tri-Phosphate
(ATP).

ül’hydrolyse de l’ATP donne

l’ADP, de l’Acide phosphorique
et de l’Energie qui est utilisée
pour des travaux cellulaires tels
que : synthèse de molécules,
production du mouvement ;
transport des d’ions d’un
compartiment à l’autre.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
ü la régénération de l’ATP se
fait par phosphorylation de
l’ADP en ATP.

ü cette réaction nécessite de

l’énergie qui est fournie par
l’oxydation des combustibles
organiques (glucides ou
lipides).
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø Cytoplasme :
üen plus des organites
limités par une membrane et
décrits précédemment, les
cellules contiennent de
nombreuses petites
vésicules qui agissent
comme transporteurs entre
les organites, ainsi que
d’autres vésicules qui
communiquent avec la MP.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø en général, chaque organite
entouré d’une membrane,
possède une série de
propriétés communes à tous
les types cellulaires, ainsi que
des propriétés qui varient d’un
type cellulaire à l’autre et qui
contribuent aux fonctions
spécialisées des cellules
différenciées.

Ø l’ensemble de ces organites

occupe près de la moitié du
volume cellulaire.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments intracellulaires principaux :
Ø Volumes relatifs occupés par les principaux compartiments
intracellulaires dans une cellule du foie (hépatocyte)

Compartiment intracellulaire % du volume Nombre approximatif

total de la par cellule
cellule
Cytosol 54 1
Mitochondrie 22 1700
Réticulum endoplasmique granulaire (REG) 9 1
RE lisse plus citerne et saccules de Golgi 6 ND
Noyau 6 1 (sauf cellule géante
/ cellule plurinucléée)

Peroxysomes 1 400
Lysosomes 1 300
Endosomes 1 200
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments intracellulaires principaux :
Ø Quantité des types membranaires dans 2 cellules eucaryotes pour
former des organites intracellulaires

Type de membrane % de membrane cellulaire totale

Foie (Hépatocyte) Pancréas (cellule
exocrine)
Membrane plasmique 2 5

Membrane du REG 35 60
Membrane du REL 16 <1

Membrane de l’appareil de Golgi 7 10

Membrane externe des mitochondries 7 4

Membrane interne des mitochondries 32 17

Membrane nucléaire interne 0,2 0,7

Membrane des vésicules de sécrétion ND 3

Membrane lysosomale 0,4 ND

Membrane du peroxysome 0,4 ND

Membrane de l’endosome 0,4 ND

1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø les organites entourés par une
membrane ont souvent des
localisations caractéristiques
dans le cytosol.

Ø ainsi, dans la plupart des

cellules par exemple, l’Appareil
de Golgi est à proximité du
noyau (supra ou juxta-
nucléaire).

Ø le réseau des tubules et des

cavités du RE s’étend du noyau
à travers le cytosol
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiments
intracellulaires principaux :
Ø cette distribution
caractéristique dépend des
interactions entre les organites
et le cytosquelette.

Ø ainsi, la localisation aussi bien

du RE que de l’Appareil de
Golgi est sous la dépendance
d’un parfait arrangement
microtubulaire.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiment cytosolique :
Ø le cytosol représente
généralement environ la moitié
du volume cellulaire total.

Ø il est constitué de milliers

d’enzymes impliquées dans le
métabolisme intermédiaire et il
est plein de ribosomes qui
fabriquent des protéines.

Ø environ la moitié des protéines

synthétisées sur ces
ribosomes sont destinées à
rester en permanence dans le
cytosol.
1. Compartiments des cellules eucaryotes
F Compartiment cytosolique :
Ø Le cytosol contient des
structures filamenteuses
(filaments protéiques) arrangés
en un cytosquelette fibreux qui
interviennent dans :
üle maintien de la forme ;
üdans les mouvements de la
cellule.
Ø ces structures forment le
cytosquelette intracellulaire
comprenant :
üles microtubules (25 nm) ;
üles microfilaments (5 nm) ;
üet les filaments intermédiaires
(10 nm).
 2.
Relations topologiques des organites
limités par une membrane
 2. Relations topologiques des organites
entourés par une membrane
F Les relations topologiques des organites limités par une
membrane peuvent s’expliquer par leurs origines
évolutives :
Ø les précurseurs des premières cellules ont été des
organismes ressemblant aux bactéries, qui ont
généralement une MP mais aucune membrane interne.

Ø La MP dans de telles cellules assure toutes les fonctions

dépendantes de la membrane (pompage des ions,
synthèse d’ATP, synthèse des lipides).

Ø Les eucaryotes actuels sont 10 à 30 fois plus grands

qu’une bactérie du type E. coli.

Ø Aussi la profusion de membranes internes peut être en

partie considérée comme une adaptation à cette
augmentation de taille.
 2. Relations topologiques des organites
entourés par une membrane
F Les relations topologiques des organites limités par une
membrane peuvent s’expliquer par leurs origines
évolutives :
Ø l’évolution des membranes internes est allée de pair avec
la spécialisation de la fonction membranaire.

Ø chez certaines bactéries actuelles, il existe des régions

spécialisées de la MP dans lesquelles une catégories
particulières de protéines membranaires se rassemble
pour effectuer un groupe de fonctions voisines.

Ø Ces régions membranaires spécialisées, telles que la

« membrane pourpre » qui contient la bactériorhodopsine
chez Halobacterium, et les chomatophores chez les
bactéries photosynthétiques, représentent des organites
primitifs.
 2. Relations topologiques des organites
entourés par une membrane
F Les relations topologiques des organites limités par une
membrane peuvent s’expliquer par leurs origines
évolutives :
Ø Dans certaines bactéries photosynthétiques, ces régions
se sont transformées en vastes invaginations de la MP,
alors que dans d’autres, les invaginations semblent s’être
complètement détachées par pincement, formant des
vésicules scellées limitées par une membrane et
spécialisées dans la photosynthèse.

Ø La surface interne de ces vésicules est topologiquement

équivalente à la surface externe de la cellule.
 2. Relations topologiques des organites
entourés par une membrane
F Les relations topologiques des organites limités par une
membrane peuvent s’expliquer par leurs origines
évolutives :
Ø Endosymbiose des mitochondries et des chloroplastes.
 2. Relations topologiques des organites
entourés par une membrane
F Les relations topologiques des organites limités par une
membrane peuvent s’expliquer par leurs origines évolutives :
Ø La MP des mitochondries et des chloroplastes correspond à la
MP originelle de la bactérie, alors que la lumière de ces
organites s’est développée à partir du cytoplasme bactérien.

Ø En conséquence, ces deux organites restent à l’écart de

l’importante circulation vésiculaire qui fait communiquer la
plupart des autres organites les uns avec les autres et avec
l’extérieur de la cellule.

Ø L’origine du noyau cellulaire qui possède une double

membrane est plus mystérieuse.

Ø Une des hypothèses est basée sur le fait que le chromosome

bactérien est fixé à l’intérieur de la MP dans la cellule
procaryote au niveau de sites particuliers. Dans la même veine,
la double membrane de l’enveloppe nucléaire pourrait être
originaire d’une profonde invagination de la MP.
 CONCLUSION
F Les cellules eucaryotes contiennent des membranes
intracellulaires qui enferment presque la moitié de leur
volume total dans des compartiments intracellulaires séparés.

F Les principaux types d’organites limités par une membrane,

présents dans toutes les cellules eucaryotes, sont :

Ø le réticulum endoplasmique ;
Ø l’appareil de Golgi ;
Ø le noyau ;
Ø les mitochondries ;
Ø les lysosomes ;
Ø les endosomes ;
Ø les peroxysomes ;
Ø Les chloroplastes (cellules végétales)
 CONCLUSION
F Chaque organite contient des protéines distinctes qui servent
d’intermédiaires dans ses fonctions uniques.

F Chaque protéine néo-synthétisée de l’organite trouve son

chemin du ribosome vers l’organite en suivant une voie
spécifique guidée par un signal contenu dans sa séquence
d’AA qui fonctionne soit comme peptide signal, soit comme
région signal.

F Le tri protéique commence par un premier événement de

séparation au cours duquel la protéine reste dans le cytosol
ou bien est transmise à un autre compartiment (tel que le
noyau, une mitochondrie, ou le RE)
 CONCLUSION
F Les protéines qui pénètrent dans le RE subissent d’autres
processus de tri au cours de leur transport vers l’appareil de
Golgi, puis de l’appareil de Golgi vers les lysosomes, les
vésicules de sécrétion ou la membrane plasmique.

F Certaines protéines résidentes sont retenues

spécifiquement dans le RE et dans les différents saccules
de l’appareil de Golgi.

F Celles qui sont destinées à d’autres compartiments

pénètrent, pense-t-on, dans des vésicules de transport, qui
bourgeonnent à partir d’un compartiment et fusionnent avec
un autre.