FACULTE DE MEDECINE DE TUNIS SESSION DE JANVIER 2018

PCEM2
THEME XIII
Durée : 120mn

Nombre de pages : 20 avec Code génétique et table χ 2 P P

Nombre de questions : 39

Instructions aux étudiants

-
Veuillez identifier et signer votre copie
- Vérifiez le nombre de pages et de questions
- Répondez aux questions dans les espaces prévus
- Ne pas écrire dans les cases réservées à la notation

TOUTE COPIE ANONYME SERA CONSIDEREE COMME NULLE.

MATIERE BAREME NOTE Total/38

ANATOMIE 6 points

GENETIQUE 16 points

HISTOLOGIE 5 points

PHYSIOLOGIE 7 points

PSYCHOLOGIE 4 points

1
Question N°26 : (1,5 points)

Le séquençage d’une partie de l’exon 3 du gène BRCA2 chez une

femme jeune ayant développé un cancer du sein a permis d’identifier
une mutation pathogène à l’état hétérozygote. Voici la séquence
retrouvée :

5’ ACT CTG CCG CTG TAC CAA TCT CCT GTA AAA TAA TTA GAT AAA
1T 1T

TTC AAA TTA GAC 3’

Avant le séquençage, une étape d’amplification par PCR nécessitant

un couple d’amorces (sens et antisens) a été faite.

26-1- Donnez la séquence des amorces (5’3’) utilisées sachant que

leur taille est de 12 pb. (1point)

26-2- : (0,25 point) De quel type de mutation s’agit-il, sachant que la

séquence de référence est comme suit :

5’ ACT CTG CCG CTG TAC CAA TCT CCT GTA AAA GAA TTA GAT AAA
1T 1T

TTC AAA TTA GAC 3’

2
Réponse 26-1 :

Amorce sens (Gauche): ACT CTG CCG CTG

1T

Amorce antisens (Droite) : GTC TAA TTT GAA

Réponse 26-2 :
Substitution de G en T 1 er nucléotide au niveau du 11 ème codon
P P P P

(G purine T pyrimidine = transversion)

26-3- : (0,25 point) Quelle est la conséquence de cette mutation sur

la protéine ?

Réponse : Faux sens  Changement de l’AA par un autre

Question N°27 : (2 points)

L'otospongiose est une maladie qui se manifeste par une surdité de

sévérité variable. L'étude de la transmission de cette maladie dans
une famille a permis de construire l'arbre généalogique suivant:

27-1-Quel est le mode de transmission de cette pathologie. Justifier

3
Réponse :

Lié à Y , influencé par le sexe et limité au sexe à rejeter fille et

garçons atteints de la même manière

DLX à rejeter II5 père atteint a une fille II8 saine

RLX à rejeter mère atteinte II2 soit Xm/Xm a un garçon sain III4

Mode Autosomal Récessif probable avec conditions : sujets sains

ayant enfants atteints hétérozygotes (I1, II1, II6)

Mode Autosomal Dominant probable

Transmission verticale
Filles et garçons atteints
Filles et garçons sains
Un individu atteint a au moins un de ses parents atteints
Une seule condition un des parents de I2 doit être atteint

Donc Mode Autosomal Dominant le plus probable

27-2- Le couple III 9 et III l0 attend un enfant. Cet enfant peut-il être
R R R R

sain ? Justifiez votre réponse.

Réponse :

oui si la mère hétérozygote et le père aussi

et le père l’est forcément sa mère est saine

4
Question N°28 : (2 points)

Une étude moléculaire, après amplification de la région d’intérêt

avec deux amorces spécifiques et la digestion des produits amplifiés
avec une enzyme de restriction RsaI, a été réalisée dans une famille
ou ségrége une maladie autosomique récessive.

Sachant qu’il existe dans cette région un polymorphisme modifiant la

séquence de restriction de RsaI:

Allèle normal T Allèle muté C

5’ -----------GTAC------------3’ 5’------------GCAC-------------3’

28-1- Précisez l’effet de la mutation sur le site de restriction.

(0,5point)

28-2- Interpréter le profil électrophorétique suivant en précisant le

génotype pour chacun les individus suivants E1, E2, et parents de la
famille représentée ci-dessous.

5
Réponse 28-1: Abolition du site car séquence de restriction de
l’enzyme non reconnue suite à la substitution de T en C (Transition C
et T =bases puriques)

Réponse 28-2:

320pb

RsaI RsaI RsaI

------------------------------------------------------------

250 pb 70 pb

Taille globale du fragment 320pb

Présence du site de restriction  digestion  Coupure en 2

fragments

Absence du site de restriction  Fragment non digéré soit 320pb

Soit Allèle normal = allèle 1 et Allèle muté = allèle 2

Parents ou Sujets I1 et I2 : 1/2

Enfants : Garçon sain : 1/1 Fille et Garçon malades : 2/2

Question N°29 : (2 points)

Les anomalies de l’empreinte génomique sont responsables de

pathologies dont le phénotype est différent selon que le locus
malade soit d’origine paternelle (P) ou maternelle (M).

6
 Compléter le schéma ci-dessous :

Mécanisme …………………. …………………. ………………………… Mutation

moléculaire séquence

Syndrome
……………………….

Chromosome impliqué : …………………………

Syndrome
…………………………

7
Réponse :

Mécanisme Microdélétion Disomie inactivation/mutation Mutation de

moléculaire centre d’empreinte séquence

Syndrome
Prader Willi

Chromosome impliqué : 15
Syndrome
D’Angelman

Question N° 30: (1point)

30-1- Le schéma suivant représente la formation d’un type de gène

particulier, lequel ? (0,5point)

carré en pointillé = Délétion

8
Réponse : Pseudogène

30-2- Quel(s) est (sont) le(s) mécanisme(s) moléculaire(s) impliqué(s)

dans ce processus, d’après le schéma. (0,5point)

Réponse : Duplication Délétion et autres Mutations

Question N°31 : (1 point)

Une jeune fille de 17 ans consulte en génétique pour aménorrhée

primaire.
Les explorations montrent une formule chromosomique 46, XY avec
anomalie de structure du chromosome X.
L’analyse moléculaire retrouve un gène SRY fonctionnel.

Donner un mécanisme moléculaire pouvant expliquer ce tableau

clinique.

Réponse :

Anomalie de structure de l’X  Duplication d’une région du

chromosome X où est localisé le gène DAX1 (gène du développement
ovarien) d’où un phénotype féminin malgré la présence du gène SRY.

Deux doses de DAX1 inhibent ou contrecarrent le gène SRY.

9
Question N°32 : (0,5point)

Les avancées de l’analyse du génome et de la bio-informatique ont

fait apparaitre de nouveaux termes : Génomique, Protéomique,
Transcriptomique,…

Citer une méthode ou technique permettant d’analyser le

transcriptome.

Réponse : Puces = Arrays= Chips

Question N°33 : (1,5 points) Compléter la figure suivante

Technique : ........................................

....................... ......................................

.......................................

.......................

........................................

10
 Technique : Southern Blot

Digestion Electrophorèse

Transfert sur filtre

Autoradiograhie

Hybridation

11
Question N°34 : (3 points)

L’étude de la descendance de sujets porteurs de la maladie de

U U

Charcot-Marie-Tooth (CMT) et ayant des antécédents familiaux

d’hypoplasie surrénalienne congénitale (HSC) montre la répartition
suivante :
20 garçons atteints de CMT et HSC
12 garçons atteints de HSC
22 garçons atteints de CMT
8 garçons normaux
47 filles atteintes de CMT
19 filles normales
Interprétez ces résultats.

Etude de deux caractères voir TD méthodologie +++

HSC et CMT

Pas de filles atteintes de HSC  non autosomal

HSC récessif (ayant antécédants) mères hétérozygotes X N /X A
R R R

Pour CMT filles et garçons en même proportions autosomal

42 garçons atteints pour 47 filles
20 sains pour 19 filles

CMT dominant
Total 128 89 atteints et 39 sains
Parents hétérozygotes S/M
environ : 2/3 , 1/3 (85, 43) ou 3/4 , 1/4 (96,32)

Forme homozygote dominante léthale

Gènes indépendants un autosomal et l’autre lié à X

12
 FACULTE DE MEDECINE DE TUNIS
U

Deuxième année du PCEM

Examen du Thème XIII

Session de contrôle juin 2018

Durée: 120 min

PRENEZ LE TEMPS DE LIRE CE QUI VA SUIVRE

Une copie anonyme est considérée comme nulle

1. Commencez par identifier et signer votre copie

2. Vérifiez que vous avez à traiter 36 questions réparties
sur 16 pages numérotées de 1 à 16
(code génétique et table du χ 2 inclus)
4T P P4T

3. Répondez aux questions dans les espaces prévus

4. Ne pas écrire dans la case réservée à la correction

Cases réservées aux correcteurs

Discipline Note X4 Note

Anatomie (6 pts) /24 /6
Génétique (16 pts) /64 /16
Histologie (7 pts) /28 /7
Physiologie (7 pts) /28 /7
Psychologie (4pts) /16 /4

Total/40

13
 Note
Questions 27 et 28 :
Ne
Sur un arbre généalogique : rien
écrire
dans
Question 27 (1 point) : Quels critères permettent d’évoquer un Cette
Colon
mode de transmission cytoplasmique. ne

Réponse :
Seule la mère transmet le caractère
Ou Une mère transmet et un père non
Ou Transmission maternelle uniquement

Question 28 (2 points) :
S’il s’agit d’un mode cytoplasmique mitochondrial avec
hétéroplasmie, quel(s) critère(s) supplémentaire(s) faut-il avoir?
Réponse :
Une mère saine ayant des enfants atteints
Ou une mère atteinte ayant des enfants sains et atteints
Ou une mère saine ayant des enfants atteints et sains

14
Question 29 (2,5 points) : Note

Ci-joint l’arbre généalogique d’une famille dont certains membres

sont atteints d’une maladie héréditaire Figure A.
Une étude moléculaire du gène responsable de la maladie a été
réalisée chez les sujets II2 et III2.
Les résultats de l’électrophorèse de l’ADN sont représentés dans la
Figure B.

A partir de l’exploitation des Figures A et B, donnez le mode de

transmission le plus probable de cette maladie en justifiant votre
réponse.

15
Réponse :
Doc 1  plusieurs possibilités
Mais
Lié à Y à rejeter car filles atteintes
et LXR à rejeter I2 mère malade donc homozygote or son fils II3
est sain

AD probable si I2 HTZ
AR probable avec conditions notamment I1 et II1 HTZ
mais plus de filles !!

LXD ++ avec I2 HTZ car elle a un garçon sain II3

Mais Doc 2  LXD car père II2 ne peut donner que le A

si autosomal il doit être A/B car il est issu d’un père sain et d’une
mère malade

16
Questions 30 à 35

Dans le cadre d’un diagnostic génétique indirect, une étude a été réalisée
dans une famille ou ségrége une maladie autosomale dominante. Le père
et le fils sont atteints.

Les résultats obtenus sont représentés ci-dessous :

Question 30 (0,5 point) : De quel type d’analyse s’agit-il ?

Question 31 (1point) : Quel est le principe de cette technique ?

17
 Note
Réponse 30 : Technique du génotypage

Réponse 31:

* Diagnostic indirecte de maladies génétiques par analyse de la

liaison marqueur-maladie
ou
* Analyse de la coségragation d’un phénotype avec un allèle
particulier d’un marqueur dans une famille
ou
* Suivre indirectement la transmission d ‘une maladie ou d’un
allèle responsable de maladie à l’aide de marqueurs sans mise en
évidence directe de celle ci ou celui ci
Après amplification par PCR /Marqueurs à proximité ou dan locus
morbide (++)

Question 32 (1,5 point) :

Quel allèle serait associé à la maladie ? justifier.

Question 33 (2 points) :
Écrire le génotype de chacun des individus de cette famille.
Question 34 (1 point) :
Quel(s) type(s) de marqueur(s) génétique(s) pourrait-on utiliser
pour ce type d’étude.

18
Réponse 32: Allèle 113
Cet allèle est sur le même chromosome que la mutation
impliquée dans la maladie : Lorsque le père malade transmet le
chromosome avec la mutation il transmet l’allèle 113

Réponse 33:

Père : 105/113 Mère :105/115

Garçon atteint : 113/115 Garçon sain : 105/115

Réponse 34 : Marqueurs moléculaires polymorphes ex

microsatellites STR++ Minisatellites VNTR / RFLP non
U

Question 35 (1,5 points) :

Quelles sont les trois caractéristiques d’un bon marqueur

génétique ?

Réponse : polymorphe /polyallélique / informatif (non coûteux)

19
Question 36 (3 points) : Note

L'étude de la descendance des couples dont le mari est albinos et

à cheveux frisés et la conjointe ayant des cheveux raides et une
peau normale donne les résultats suivants:

92 enfants avec des cheveux frisés et une peau normale

34 enfants albinos avec des cheveux frisés
25 enfants avec des cheveux raides et une peau normale
9 enfants albinos avec des cheveux raides.

Interpréter ces résultats.

Réponse :

4 phénotypes
2 caractères albinisme (2 phénotypes N et A) et aspect cheveux (2
phénotypes F et R)
un dominant F>R et un récessif N>A
Pas de ségrégation selon le sexe Gènes autosomaux

Hypothèse : Les deux caractères sont contrôlés par 2 gènes

autosomaux indépendants à 2 allèles chacun (A,N) avec N>A et
(R,F) avec F>R

Proportions font penser à 9/16 3/16 3/16 1/16

20
 Parents : AF NR
A/A F/R N/A R/R

M/P AF AR

N/A R/R
NR N/A F/R

A/R A/A F/R A/A R/R

Parents doivent être hétérozygotes sinon il n’ y aura pas 4

phénotypes

Théoriquement ¼ de chaque or ce n’est pas le cas

Il faut changer les proportions pour avoir des proportions

compatibles avec les données

Ici il ne s’agit pas d’une F2 mais d’un équivalent de test cross

21
 Thème XV Janvier 2018
Des données expérimentales apportent des preuves de l’implication
de la protéine P53 dans la régulation de la longévité et par
conséquent du vieillissement.

Caractéristiques phénotypiques à l’âge de 24 mois

Souris p53+/+ Souris p53+/m

Durée de vie moyenne

U 118 semaines 96 semaines

Durée de vie maximale 164 semaines 136 semaines

U Incidence des tumeurs >45% <6%

Poids corporel Diminué à 30 mois Diminué à 18 mois

Poids du foie, de la rate des

Faible diminution 25 à 40% de diminution
reins

UOstéoporose Faible Marquée

Epaisseur du derme
U Faiblement réduite Fortement réduite

Cicatrisation Normale Retardée

Atrophie musculaire Faible Marquée

Biochimie sanguine Normale Normale

Question1 : (0,5 point ) Interpréter les résultats du tableau ci dessus

Question 2 : (0,5 point) En vous basant sur les résultats du tableaux
et sachant que les souris (p53+/m) ont une forme anormale de la
protéine P53 altération qui se traduit par une augmentation de
l’activité de la P53 naturelle quel serait le rôle de cette protéine P53
Question 3: (1 point)A quel groupe de gènes appartient le gène P53 ?

22
Réponses :

1- Les souris qui présentent cet allèle modifié (p53+/m) sont

résistantes au développement de tumeurs spontanées, cependant,
leur durée de vie moyenne est raccourcie d’environ 23% par rapport
aux souris témoins.
Les souris p53+/mprésentent ainsi certains phénotypes
caractéristiques du vieillissement

2- Les résultats de cette étude suggèrent que le gène p53 pourrait

jouer un rôle important dans les mécanismes du vieillissement,
impliquant l’existence d’une régulation fine de son activité afin
d’assurer un équilibre entre la sensibilité au développement tumoral
et le vieillissement prématuré

3- Gérontogènes

23
 Juillet 2018 th15 Note

Questions 1 et 2 :

La longévité d’un individu est attribuée en partie au métabolisme de

base, notamment au métabolisme des lipides.

Question 1 (1 point):

Expliquer le processus ou mécanisme à l’origine de cette constatation.

Réponse :
Existence d’allèles protecteurs empêchant pour certains de déclarer des
maladies ex maladies cardiovasculaire  Gènes APOAE POA1

Question 2 (0,5 point):

Citer deux allèles impliqués dans ce processus.

Réponse : Allèle ε 2 et Allèle milano fréquents chez les centenaires

R R

Question 3 (0,5 point):

Citer un autre métabolisme pouvant expliquer une longévité accrue.

Réponse : Métabolisme des glucides

24