06/01/2023

Introduction a la microbiologie.

La microbiologie est tout e qui est visible au microscope. La flore intestinale est constituée de
bactéries qui peuvent être ou non dangereux en fonction du milieu ou il se trouve.

La microbiologie est l’étude des microbes et de leurs spécificités.

Comme parasites on a aussi Les oxyures, les poux…

Le microorganisme a besoin d’un milieu favorable a son développement.

Les bactéries sont des procaryotes, ils ne possèdent pas de noyaux.

La spore permet aux bactéries de vivre dans les milieux agressifs. Toutes les bactéries n’ont
pas la capacite d’en former.

Pour classifier les bactéries on se base sur la forme et le besoin ou non en oxygène.

L’Escherichia colis est une bactérie du tube digestif.

La coloration de gram permet de savoir si la bactérie est gram+ (paroi plus épaisse) ou Gram-
(paroi moins épaisse)

Le mode de développement des bactéries permet aussi de différencier les microorganismes

Les fascias ce sont des membranes qui font la liaison entre le muscle et les organes. C’est
comme une forme de protection supplémentaire.

Le mode de division des bactéries est un mode asexué.

La germination est ma reconstruction d’une bactérie à partir d’une spore.

Biofilm ensemble de microorganismes qui tapissent une surface. Elles peuvent se développer
sur des surfaces biotiques (ave vie) ou abiotiques (sans vie).

Le virus est un parasite incapable de se développer toute seule, elle donc besoin de se
retrouver dans l’organisme (cellule) pour se développer.

Les spicules sont des parties du virus qui lui permettent de se fixer sur une cellule avant de la
pénétrer.

Les virus non enveloppés sont plus résistants (car les spicules sont fixés sur la capside) que
les virus enveloppé (spicules fixés sur l’enveloppe). Si l’enveloppe es détruite les spicules sont
détruits et le virus ne peut plus se développer.

Les bactériophages sont des bactéries qui détruisent d’autres bactéries.

PCR (Polymérase Chain Réaction) est une technique de recherche des virus.

Le liquide cephalo rachidien se trouve dans la colonne vertébrale.

 Le test immuno- chromatographique tes qui en fonction du remplissage de la bandelette et
de la présence ou non de microorganisme va colorer la substance réactive sur la bandelette.

Le traitement virostatique l’une des phases du dev du virus.

Le champignon commence par se fixer sur la paroi d’un organe et se développe jusqu’à
atteindre les vaisseaux sanguins.

Les antiseptiques empêchent les microorganismes présents sur la peau de pénétrer

l’organisme lors des piqures ou gestes invasifs.

Les parasites sont microorganismes qui tirent profit de leur hôte sans le détruire.

On parle de chaine transmission car tous les éléments qui interviennent dans la transmission
des microorganismes sont comme les maillons d’une chaine car elles jouent un rôle bien précis dans
la transmission.

- Exogène= transmission croisée par le biais d’un matériel, de l’eau l’air ou des matériels.
- Endogène= auto-infection par nos propres microorganismes

20/01/2023

Investigation et prévention des épidémies

Structure de lutte contre les IAS (infection associée aux soins)

- L’OMS. Son pouvoir règlementaire ‘exerce a travers des textes qui sont tenu d’être
respecté.
- La commission Européenne.
- Les CPias : centre de prévention des infections associé au soin. Elle met tout en œuvre
pour éviter les épidémies due aux soins de santé.
- Le haut conseil de sante public publie des recommandation de la santé qu’ils faut mettre
en pratique (administratif). Il sont généralement implanté dans un établissement de
santé et sont dirige par des experts en hygiène sanitaire ou des médecins. Il a trois
principales missions.
- La HAS (technique)
- Les PROPIAS
- En reva se sont des réseaux qui vont aider les ARS à gérer les soins.

Le GERES gère tous les matériaux de sécurité.

Le collecteur OPTC servent a jeter les objet piquant coupant tranchant.

Les excreta sont des substances liquide naturellement expulsé par la corp humaine.

Les protections complémentaires servent pour les microorganismes les plus sévère. On essaie de les
adapter au type de microorganisme c’est uniquement le médecin qui demande de prendre ces
mesures. Une personne colonise a des microorganisme des son organisme mais il vivent bien vac. Le
patient infecté possède des microorganismes et fait la maladie qui va avec.

L’érésipèle c’est une petite lésion au niveau cutané.

Le contact indirect se fait a travers un matériel intermédiaire.

L’antibiogramme est la liste des antibiotiques pouvant être efficace contre une maladie. Une
bactérie résistante au mois a 3 antibiotiques est une BMR.

La coproculture c’est la culture des selles pour diagnostiques une maladie.

Les ordures à risque infectieux sont collectées dans des sac ou matériels spécifique.

Les prévention complémentaire Goutelle est faite pour se protéger des maladies qui font
projeter des gouttelettes au patients.

Les types de masques chirurgicaux

-type 1 ; résistant aux projections légères

Type 2 : protection contre les projections lourdes

Le masque chirurgical ne peut être porté que 4 à 8 heures en continuent.

Pour la protection complémentaire air, les particules sont en suspension dans l’air et ne
sédimentent pas directement, mais peuvent être transporter par l’air. Elle vise donc a empêcher la
circulation de l’air contaminer. On porte un masque a effet fredeux pour s’en protéger il vise a se
protéger de l’inhalation. Ces masques doivent obligatoirement posséder une barrette.

On met don une pression négative a l’intérieur ce qui va permettre a l’air de passer de
l’extérieur a l’intérieur.

Les masques chirurgicaux et FFP2 ne sont pas des dispositifs médicaux et ne sont donc pas
soumis au RDM.

On considère une épidémie en BHRe à partir de deux patients contaminés.

Un patient contact est infecté par un microorganisme issue d’un patient porteur excréteur
par l’intermédiaire d’un personnel de santé qui s’est occupé d’un patient porteur excréteur.

Cours du 03/03/2023

Septisemie : passage des microdes dans le sang pour une infection generalisée.

La surveillance des ISO se fait par

- L’experience des réseaux de surveillance

- Les méthodes de surveilllance
- Les indicateurs
- La retro information
 - La coordination à l’echelle nationale. (cette surveillance vise a améliorer la qualite des
soins)

Le registre de surveillance es ISO en France regroupe le taux d’incidence par specialité (qui
est plus eleve en chirurgie colorectale et de l’intestin, le plus faible est l’ophtalmologie la chirurgie
endocrinieene, l’orl et l’orthopedie

La duree de survie permet d’inciter les chirurgiens a revoir chaque patient ou a obtenir des
info de ce dernier 30 jours après la sortie. Plus de 40% des ISO sont peut être identifié a la sortie.

Parmi les risque multifactoriel des ISO on a

En preoperatoire on a des facteurs tels que le sevrage du tabac si possible, l’equilibre du

diabète, prise en charge de l’obésité, prise en charge de l’obésité, la préparation cutanée et
antisepsie, (tondre et non raser), l’antibioprophylaxie, limiter la durée d’hospitalisation pré
opératoire.

En per-opératoire port de la tenue complète avec masque et charlotte, l’hygiène des mains.
Durée courte du geste chirurgical (60% des contamination sont endogènes et 40% sont exogènes).
Parmi les autres problèmes à considérer on a les problèmes hémostatiques, les drain chirurgicaux, la
technique chirurgicale, les traumatismes tissulaires, ou la nécrose, la mise en place de corps
étranger, la ventilation de B.O, la mauvaise stérilisation du matériel, la gravité de l’intervention.

- L’acte chirurgical
- Le patient opéré (âge, facteurs de risque, la maladie sous-jacente
- L’environnement organisation de l’espace…)

La contamination peut se faire par le patient lui-même, le professionnel de santé et

l’environnement

Les niveaux d’infection sont :

- Les infections superficielles qui survient dans les 30 jours suivant l’intervention, affecte la
peau, et les tissus sous cutanés, ( sous cutanée).
- L’infection profonde de l’incision qui survient dans les 30 jours suivant l’intervention ou
dans l’année suivant l’intervention. Elle affecte les tissus ou espaces situe au niveau ou
en dessous de l’aponévrose. (Fascia ou muscle)
- Infection de l’organe ou site de l’espace survient dans les 30 jours ou l’année suivant
l’interventions mise en place d’un implant ou d’une prothèse. Il implique les organes ou
espace manipule (organe)

En post opératoire : les risques ISO sont le service de soin post-opératoire (lieu a risque,
pas de recommandation pour des patients BMR, seulement pour les patients bacillifères)  ; le
service de chirurgie (les pansement stérile, l’éducation a la surveillance de la cicatrice,
l’isolement des BMR) ; le risque est aussi lié au patient (colonisé a s. aerus, la dénutrition …)

Les indice de risque qui sont de score calculé avant l’intervention chirurgicale :
 - La classification d’altemeier : classe 1 chirurgie propre ; classe deux chirurgie propre
contaminée ; classe 3 chirurgie contaminée ; classe 4 chirurgie sale.
- Le score ASA : 1(patient en bonne santé), 2 (paient avec maladie générale modérée), ,3
patient avec maladie générale invalident mettant en jeu le pronostic vital), 5 (patient
moribond qui ne survivrai pas 24h avec ou sans opération) 6 (patient en mort cérébrale
dont les organes sont destinées au don.
- Le score de NNIS/ qui se compose du score ASA, la durée d’intervention, le score
d’altemeier

Pour les risques liés a l’environnement en per opératoire il faut limiter les entrées de
particules, éviter les entrées et sorties dans le bloc, augmenter le renouvèlement de l’air,
traiter les DM.
L’asepsie progressive est un ensemble de barrière successive qui servent la limiter la
contamination des plaie opératoires.
L’architecture doit s’organiser selon le type d’activité, la part ambulatoire, les
différentes activités, s’il ya ou non un accueil des urgences, le niveau d’activité et le
nombre de salles. Le bloc opératoire est une enceinte protéger, une zone a risque qui
nécessité un environnement maitrise. Le matériel y utiliser doit être lisse.
Le principe de la marche en avant doit être respecté (on nettoie du plus propre au
plus sale.)
Le circuit a double circulation permet d’isoler le sale (déchets, le matériel, le linge)
mais il occasionne une perte de place.
Le circuit a simple couloir permet un gain de place mais nécessité cependant
d’emballer le sale dans un flacon afin d’éviter des contaminations dans le couloir.

L’Endoscopie

L’endoscope est un appareil constituer d’un tube optique muni d’un dispositif
d’éclairage destine a être introduit dans une cavité du corps humain pour l’examiner.
- Les endoscopes rigides ou tube metalique pour explorer l’abdomen, le thorax, les
articulations
- Les endoscopes souples ou fibroscopes très maniable.les constituant de l’endoscope :

Parmi les risque lies a l’endoscope on peut citer : le nombre de canaux, la longueur et
diametre variable, les jonctions multiples les risque lies a l’etat de l’endoscope et l’operateur.

Les risques lies a la zonne d’exploration. La nature sterile ou non des cavites et leur acces

Les risques lies au type d’acte/ la nature ou non invasive du geste chirurgical, les gestes
combinées a d’autres actes plus invasifs, les risques liés a l’erosion des perforation ou des
hemoragies, et les risques liés a l’eau d’irrigationsi non sterilet.
 Les risques liés au traitement (nettoyage des infections) l’acces delicat pour nettoyage, la
necesite de proprités multiples du D/d, necessite de la connaisance du materiel, le respect de la
procedure de sterilisation du materiel.

Les types d’infections :

- Les risques infectieux endogènes

- Les risques infectieux exogènes
- Les risques infectieux de TC (transmission croisée)

La prévention des RI se fait a plusieurs niveaux : du patient, du personnel en salle d’examen

et du matériel.

La classification de spaulding permet de choisir le type de traitement a adopter

Traitement de l’endoscope selon le risque opératoire.

La maitrise du risque exogène se fait par : le respect des étapes d’entretien, la salle de traitement
manuel pour l’endoscopie on va du plus salle au plus propre.

Pour maitriser le risque exogène lié à l’environnement on effectue des opérations de

nettoyage entre les deux actes, en fin de journée, immédiatement, régulièrement. Il faut également
protéger l’opérateur selon l’acte (traitement manuel, traitement du Laveur Desinfecteur de
l’Endoscope)

Le choix du traitement selon la tolérance du DM

- Le prétraitement et le premier nettoyage se font manuellement

- Stérilisation plus efficace que la désinfection par bain
- Stérilisation par vapeur d’eau saturée…

Le traitement manuel de l’endoscope se fait par du matériel d’entretien spécifique ( jeu

d’écouvillon unique, adapte au diamètre des canaux, correctement utilisé, brosses irrigateur
tout conduit et tubulure.

Les BHRe (bactéries hautement résistantes) ce sont des bactéries du tube digestif
résistantes aux antibiotiques. Le nettoyage requiert des mesures spécifiques : mise en action
du canal érecteur durant la phase, pas de brosse ou d’écouvillon standard…

On stocke les endoscopes selon deux méthodes ESSET et dans les bacs

La stérilisation
Elle permet de lutter contre les transmission lie aux soins . ce processus effectué sur le
matériel afin d’éviter qu’ils ne jouent un triple rôle : réservoir, transporteur et inoculateur de
microorganismes.

DMR (dispositifs médicaux reutilisables)

 Un DM sterile est un DM qui a subit une sterilisation. C’est un etat ephemere a partir du
moment on ne protege pas le materiel.

Le seuil de sterilite est une norme qui permet de savoir la probabilite de trouver un germe
viable est inferieur a 1 million sur un DM.

La destruction en fonction du temps (Loi d’activation des MO)

Destruction en fonction de la température. (Loi d’Arrhenius)

Les types de stérilisation :

- Par la chaleur : vapeur d’eau saturée (134 degrés 18mins)(125 degrés 15mins 121 degrés
20mins) ou autoclave et chaleur sèche (Poupinel = interdit en France car il ne détruit pas
les prions). L’unite de mesure est le nombre de panniers la taille des panniers étant
normés de 1 à 18
- Stérilisation basse température (formaldéhyde et propylène=interdit en France et enfin
H2O2)
- Par des rayons ionisants (beta ou gamma)

La sterilisation se fait par de l’eau osmosée pour le générateur (20à 30L par cycle) et de l’eau
adoucie pour la pompe a vide pour eviter le calcaire (40L par cycle)

Parmi les actions favorables à une bonne sterilisation : ne pas trop charger, instruments
creux a l’envers ou sur la trache, ne pas empiler les panier, choisir le programme, ne pas toucher le
materiel a la sortie du sterilisateur, surveiller le cycle.

Le control du sterilisateur se ait de manière régulière, chaque matin test de Bowie Dick, toute les
semaines test a vide ou de Helix.

IBODE : infirmiere du bloc opératoire diplomé d’etat.

La sterilisation est de la responsabilité de pharmacien. Pour la sterilisation on doit respecter

le principe de la marche en avant.

Risque viral d’exposition au sang. (Précautions standards)

Un AES est tout contact avec du sang ou un liquide biologique contenant du sang et
comportant soit une effraction cutanée soit une projection sur une muqueuse ou sur une peau lésée.

Risque d’infection au VIH ; 0.3%, VHC :3%, VHB : 30%.

17/03/2023

Contaminant : toute particule, molécule ou entité biologique qui peut affecter de manière négative
un processus ou un produit. Il y en a 3 types a savoir : Microbiologique, chimique et particulaire. Les
particules se comportent de différentes manières dans l’air : elles sédimentent, restent en
suspension ou se regroupe pour former des agglomérations.

L’air est responsable de la propagation de micro-organismes. Ces miro organismes sont l’eau,
l’air, les aliments, les surfaces, le linge, déchets fluides.

Il faut filtrer l’air pour éviter qu’il ne soit contaminé. Les prises d’air neuf sont la porte d’entrer de
l’air contaminé en milieu hospitalier. En cas de défaut d’aération ou de filtration des particules
risquent de sédimenter, constituer un biofilm ou se multiplier

La zone propre selon la norme 14644-1 espace définie dans lequel la concentration en
nombre de particules en suspension dans l’air est maitrise et classé.

Les éléments constitutifs d’un système de maitrise de la qualité de l’air  : la souffleuse, la

reprise (la souffleuse et la reprise sont à la même pression), des filtres à air, limiter l’émission des
particules, renouveler l’air, maitriser les flux, nettoyages.

La classe sont définie par un nombre et une dimension de particules acceptables au mètre
cube.

Les particules de >5mirometre sont lourdes et sédimentent

Centrale de traitement d’air : l’air passe par le registre et est ensuite préfiltré, (grosses particules)
ensuite l’air est préchauffé, puis humidifier, ensuite ventilée. Piège à son (maitrise le bruit) le
charbon actif filtre les particules chimiques.et la filtration finale protège des graines.

L’objectif de la filtration est de bloques les particules. Pour ce faire on utilise des filtres
normé ISO dont la taille des pores dépend de la dimension des particules à filtrer.

- Filtres ISO grossiers(coarse)

- Filtres ISO ePM2.5
- Filtres ISO ePM2.5
- Filtres ISO ePM1
- Filtres Normés en EPM

Risques lies au changement de filtre :

- s’assurer de l’intégrité du filtre

- S’assurera du centrage et de l’étanchéité

- attention au relargage

- changer le filtre après arrêt complet

- nettoyage de la CTA et des canalisations

- changer tous les filtres simultanément pour éviter les flux

Classes Microbiologiques de propreté microbiologique.

L’air est introduit dans les salles par des bouches de ventilation.
 Les grilles de reprise sont le constituant le plus contaminé de la chaine de maitrise de
la qualité de L’air car elles retiennent de l’air contaminé.

Le taux de brassage est le taux de renouvèlement de l’air/épuration.

Les essaies et surveillance servent a maintenir l’efficacité des systèmes an place,

détecter les dysfonctionnement , maitriser les comportements contaminants. Cette
surveillance se fait par des comptages particulaires bactériologique de pression et
l’observation des comportements.

Traitement de l’eau
L’eau présent 3 principaux risque ; infectieux, toxique (présence de substance
chimique, risque lié a l’ingestion, risque à l’hémodialyse) et un risque de brulure( 7s a
60°gravité en fonction de la température, 1 s a 70°, 8 min à 50°).

Le risque infectieux : lié à la nature du microorganisme, (virus et parasite<10) bactéries et

champignons(<1000). Les voies d’exposition sont l’ingestion le contact…

On distingue en milieu hospitalier de l’eau non traité, traitée (ne peuvent pas être
utilisé tel quel à cause du risque qu’elle représente : eau bactériologique maitrisé eau chaude
sanitaire), stériles et technique.

- -L’adoucissement de l’eau est fait pour enlever le tartre et éviter la formation de calcaire.
- La déminéralisation sert à la production d’eau pure pour dilution des produits concentrés
de dyalise rénale.
- L’osmose inverse. On doit adoucir l’eau et filtrer au préalable.
- La distillation pour obtenir de l’eau pure
- La filtration par piégeage et tamisage.
- Traitement par ultraviolet irradiation de l’eau par ultraviolet. C’est un traitement biocide
qui vise l’ADN

Mesures préventives

Purges quotidiennes (lutte contre l’l’entartrage et la corrosion, la surveillance par les

prélèvements).

En cas de mesure correctives a prendre pour respecter les normes bactériologiques ;

traitement thermique (choc a 70°pendant 30 mins) traitement chimique (chlore 50mg/L pendant
12h).

La qualité de l’eau repose sur la prévention, la protection des patients à risques, la virgilence.

Traitement des déchets

 La règlementation des déchets est assuré par le Code de l’environnement.

On distingue les déchets ménagers non recyclable et les déchets recyclables par filière.

Les DAS (déchets d’activité de soin) déchets issu de l’activité de diagnostic de suivi et de
traitement dans le domaine de la médecine humaine et vétérinaire.

DASRI (déchets d’activité de soin à risque infectieux.) déchets contenant des microorganisme
viables ou leur toxines dont on sait ou dont on de bonnes raison de croire qu’ils cause la maladie
chez l’homme ou chez lzs autres organismes vivants.