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Chapitre 4: les conformères-les

isomères- les stéréoisomères


D’après P.-Y. Bruice – Chimie organique – 2ème édition (Pearson) et Vollhardt
et Schore – Traité de chimie organique – 5ème édition (de Boeck)
Table des matières
1. Conformères
2. Isomères
2.1. Définitions et classification
2.2. Les isomères de constitution
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités
2.3.2. Les énantiomères : importance et origine de la
chiralité en biologie
2.3.3. Les énantiomères : activité optique
2.3.4. Les énantiomères : notation R et S
2.3.5. Composés possédant plusieurs centres chiraux
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E
2.3.7. Stéréoisomérie et réactivité

2
1. Conformères
« Une liaison carbone-carbone simple (liaison σ) se forme lorsqu’une orbitale
sp3 d’un carbone recouvre une orbitale sp3 d’un autre carbone. »

Rotation possible autour de la liaison

« On appelle conformations les différentes dispositions spatiales des atomes


générées par une rotation autour d’une liaison simple carbone-carbone. »

Le nombre de conformations possibles est infini

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1. Conformères
Il y a des deux extrêmes, la conformation décalée et la conformation éclipsée

Exemple : éthane
décalée éclipsée

Projection de Newman
Rotation de 60o de l’éthane

4
1. Conformères

Les projections de Newman


- On se focalise sur une liaison σ
donnée
- On regarde la liaison C-C en
question selon un axe longitudinal
- Le carbone à l’avant est un simple
point à l’intersection des trois
traits
- La carbone à l’arrière est un cercle
d’où sorte trois traits
- Les substituants les plus lourds
sont placés verticalement

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1. Conformères
Une conformation décalée a une plus grande stabilité
Moins stable, car
encombrement
entre les H

Ce sont des
conformères

« À la température ambiante, une molécule passe des millions de fois par


seconde d’une forme décalée à une forme éclipsée. »
Les différents conformères ne peuvent pas être séparés les uns des autres.
6
1. Conformères
Conformation du butane entre C-2 et C-3

Il y a six rotations de 60o (360o) possibles, donc six conformères

A est la forme la moins stable, car les deux gros groupements (CH3) sont éclipsés
(encombrement ou tension stérique)

D est la forme la plus stable, car les deux gros groupements (CH3) sont décalés

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1. Conformères
« Plus une conformation est stable, plus la fraction de molécules qui adoptent
cette conformation est importante. »
« La plupart des molécules existent dans des conformations décalées. »

« Comme une conformation décalée a moins d’énergie, les chaînes carbonées ont
tendance à adopter des dispositions en zigzag. »

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1. Conformères
Composés cycliques

« Les composés cycliques


naturels ont, en général, des
cycles de cinq ou de six
membres », car les angles des
liaisons des carbones sp3
s’approchent de 109o
Si les angles sont très petits
(cycles à trois et quatre
membres), la tension rend ces
cycles instables (tension d’angle)

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1. Conformères
Les cycles à plus de trois carbones peuvent diminuer leur encombrement par
torsion

Dans le cycle à cinq


carbones, quatre atomes de
carbone se situent dans un
même plan

« Le cinquième carbone
oscille de part et d’autre par
rapport au plan »

Les hydrogènes sont complètement éclipsés dans les cycles à trois carbones et
sont de plus en plus décalés dans les cycles à quatre ou cinq carbones
10
1. Conformères
« Les cycles à six membres sont les plus répandus dans les composés cycliques
naturels. »

« Ils peuvent prendre une forme, appelée conformère chaise, qui est presque
totalement exempte de tension. »

Configuration chaise plus stable

Configuration bateau
moins stable
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1. Conformères
Pour dessiner une conformation chaise :
1. « Tracez deux traits parallèles inclinés vers le haut, qui commencent à la
même hauteur et sont de même longueur. »

« Les liaisons axiales sont verticales


et sont situées en alternance au-dessus
et au-dessous du cycle. »
« Les liaisons équatoriales s’éloignent
latéralement du cycle. »

2. Reliez les traits par un V et un V inversé légèrement plus long d’un côté
que de l’autre.
3. « Chaque carbone a un lien C—H axial et un lien C—H équatorial. »
12
1. Conformères
La rotation autour des liaisons C—C permet une interconversion rapide entre deux
conformères chaise stables

« Lorsque les deux conformères chaise s’interconvertissent, les liaisons


équatoriales dans l’un des conformères deviennent axiales dans l’autre, et vice
versa »
13
1. Conformères
Pendant le processus d’interconversion, le cyclohexane doit prendre les
conformations suivantes :
On ne trouve pratiquement
pas de conformation bateau,
car elle est moins stable.

Encombrement des deux hydrogènes


tête de pont aux carbones 1 et 4
Fortes interactions exercées par les formes
éclipsées des carbones 2, 3, 5 et 6
14
1. Conformères
Cyclohexane monosubstitué

« Contrairement aux deux conformères chaise du cyclohexane, les conformères


d’un cyclohexane monosubstitué tel le méthylcyclohexane ne sont pas
équivalents. »
« Le groupe méthyle est en position équatoriale dans un conformère et en
position axiale dans l’autre. »

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1. Conformères
Le groupement méthyle en position équatoriale est plus stable, car il y a moins
d’encombrement stérique.
Le groupement méthyle en position axiale possède des interactions diaxiales
avec deux hydrogènes du cycle.

hydrogènes axiaux méthyle axial

On retrouve beaucoup plus de conformères chaise possédant des


substituants en position équatoriale, car ils sont plus stables. 16
2. Isomères
2.1. Définitions et classification

Les isomères sont des composés possédant une formule moléculaire


identique, mais dont les atomes sont arrangés différemment

Il y a deux grandes classes : les isomères de constitution et les stéréoisomères.

Diastéréoisomères Enantiomères

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2. Isomères
2.2. Les isomères de constitution
« Les isomères de constitution (ou de structure) se caractérisent par des
enchaînements différents de leurs atomes » pour une même formule brute.
« Ils n’ont pas les mêmes structures développées ou semi-développées
condensées. »

« Ils comprennent les isomères de fonction et les isomères de position. »

Les isomères de fonction possèdent des groupements fonctionnels différents:


même formule brute mais connectivité des atomes différente

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2. Isomères
2.2. Les isomères de constitution

Exemple : (C4H10O)

Seul point commun : formule brute


Isomère de fonction/constitution (plus
petite forme de similarité)

Butan-1-ol (C4H10O) Ethoxyéthane (éther diéthylique)

Les isomères de position: même formule brute, mêmes fonctions chimiques,


connectivité différente
OH
OH
Exemple : C3H8O

propan-2-ol propan-1-ol 19
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères

20
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités

Les atomes des stéréoisomères sont liés les uns aux autres de la même façon,
mais sont disposés différemment dans l’espace.

Diastéréoisomères Enantiomères

Molécules en tt points identiques sauf dans leur répartition dans


l'espace 21
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités

La thalidomide (Softénon) forme R anti-nauséeux, forme S tératogène. Se transforme


(racémise) dans le plasma sanguin.

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités

On distingue les énantiomères dont les images spéculaires ne sont pas


superposables et les diastéréoisomères qui n’ont pas de relation d’image à
image spéculaire

Enantiomères

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités
Non
Même formule brute ? Pas isomères

Oui
Isomères

Oui
Même connectivité ? Stéréoisomères
Non

Isomères de Images spéculaires non superposables ?


constitution
Oui Autre
Non Mêmes fonctions ? Oui Enantiomères Diastéréoisomères

Isomères de Isomères de
fonction position 24
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités

Enantiomères

Diastéréoisomères Diastéréisomères

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités
Un objet chiral a une image miroir non superposable.

L’image de l’objet comme tel n’est pas identique à l’image observée dans un
miroir.
Un objet achiral a une image miroir superposable.

achiral
Exemple : chiral

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités

Un carbone asymétrique ou « centre asymétrique, soit un atome lié à 4 groupes


différents, est habituellement à l’origine de la chiralité des molécules. »

Exemple : L’astérisque représente le centre asymétrique


ou chiral.

Ce carbone est lié à quatre groupes


différents.
1- OH
2- CH2CH3
3- CH3
4- H 27
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités

Un composé possédant un centre asymétrique peut avoir deux


stéréoisomères
« Si nous imaginons qu’un miroir les sépare, nous constatons qu’ils sont des
images miroir l’un de l’autre, et que ces images ne sont pas superposables. »

Ce sont des
énantiomères.
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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.1. Définitions et généralités

Un mélange 1:1 de deux énantiomères est appelé un mélange racémique.


Comment les distinguer ? Plan de symétrie ou pas.

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mélange racémique
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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.2. Les énantiomères : importance et origine de la chiralité en biologie

(R) (S)

Mentha spicata L. var. crispa (Lamiaceae) Carum carvi L. (Apiaceae) 30


2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.2. Les énantiomères : importance et origine de la chiralité en biologie

(4R,8R)-diméthyldécanal (4S,8S)-diméthyldécanal
Tribolium confusum

Karrikines

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Anthocercis littorea (Solanaceae)
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.2. Les énantiomères : importance et origine de la chiralité en biologie

Pourquoi les systèmes biologiques perçoivent-ils ces différences de


configuration spatiale (pharmacocinétique, toxicité, …) ?
Récepteurs spécifiques

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.2. Les énantiomères : importance et origine de la chiralité en biologie

Enzyme
Substrat (saccharose)

Produit

Site actif

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.3. Les énantiomères : activité optique

Comment distinguer des énantiomères ?


Mêmes propriétés physiques mais propriétés optiques différentes
Molécule chirale = pas
de déviation

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.3. Les énantiomères : activité optique
=> Si rotation vers la droite: dextrogyre (+)
=> Si rotation vers la gauche : lévogyre (-)
=> [α]= pouvoir rotatoire spécifique: constante physique


[α] = α /l.c (dm-1.ml.g-1)
λ

Avec T° en degrés Celsius, λ = 595 nm, α = rotation optique observée en


degrés (angle),
l= longueur cellule (dm), c= concentration en g/ml

Que vaut le [α] d’un mélange racémique ?


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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.3. Les énantiomères : activité optique

% de pureté optique: ([α] observé/[α]spécifique ) X 100

Soit le mélange suivant :

+ + + -

Quelle est sa pureté optique ?

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.3. Les énantiomères : activité optique

% de pureté optique: ([α] observé/[α]spécifique ) X 100

Soit le mélange suivant :


+ + + - + + + +

+ 25 % α + 25 % α + 25 % α - 25 % α

Pureté optique : 50 % Pureté optique 100 %


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Déviation optique de 50 % de [α]
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.3. Les énantiomères : activité optique

On peut représenter une molécule en 3D sur base de la notation L et D ?

=> Non car pas de corrélation entre le signe de [α] et la structure de


l’énantiomère (déterminé par analyse cristallographique à l’aide de rayons
X ou analogie de structure)

Mais toujours utilisée pour les acides aminés (naturels forme L) et les
glucides (naturels forme D)

Notation R et S (Cahn, Ingold, Prelog)

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.4. Les énantiomères : notation R et S

Pour distinguer deux énantiomères, les chimistes utilisent un système de


nomenclature basé sur les lettres R et S, qui précise la disposition des atomes
ou groupes autour du centre asymétrique

1. Classez par ordre de priorité les groupes (ou atomes) liés au centre
asymétrique

La priorité relative dépend du numéro atomique des atomes directement liés


au centre asymétrique.

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.4. Les énantiomères : notation R et S

1 120 o 4
Br H 1- Br Ordre de priorité selon l’atome
2- OH Br > O > C > H
3- CH3
H 3C OH Le H doit être vers l’arrière,
2 4- H donc sur le trait hachuré.
3
2. Orientez la molécule de manière à faire pointer dans la direction opposée à la
vôtre le groupe (ou l’atome) de plus faible priorité (4).

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.4. Les énantiomères : notation R et S

Tracez une flèche imaginaire reliant le groupe (ou l’atome) de priorité 1 et le


groupe de priorité 2 puis du groupe 2 à 3.

S Si la flèche tourne dans le sens horaire, le centre


asymétrique a la configuration R.

Si le sens de la flèche est antihoraire, le centre


asymétrique reçoit la configuration S.

Capsule html
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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.5. Composés possédant plusieurs centres chiraux

« Un composé peut avoir un nombre maximal de 2n stéréoisomères, n étant


le nombre de centres asymétriques. »

Exemple : 2,3-dibromohexane

2 centres asymétriques

4 stéréoisomères possibles

(R,R), (S,S), (R,S), (S,R)

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.5. Composés possédant plusieurs centres chiraux

2.
1.

3. 4.

Images miroir et non superposables = énantiomères : 1 et 2, 3 et 4


Pas images miroir et non superposables = diastéréoisomères : 1 et 3, 1 et 4, 2 et 3, 2 et 4
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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.5. Composés possédant plusieurs centres chiraux

« Il est à noter que dans une paire de diastéréoisomères, la configuration des


deux membres est la même pour l’un des centres asymétriques, mais
différente pour l’autre. »

« Les diastéréoisomères ont des propriétés physiques différentes (point de


fusion, point d’ébullition, solubilité, pouvoir rotatoire, etc.) et des propriétés
chimiques différentes. »

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.5. Composés possédant plusieurs centres chiraux

La représentation de Fischer: « le centre asymétrique devient le point


d’intersection de deux lignes perpendiculaires. »

Les lignes horizontales = les liaisons devant le plan


Les lignes verticales = les liaisons dans le plan ou se projetant vers l’arrière du
plan
COH COH

Projection HO C H HO C H Projection
conventionnelle de Fischer
H C OH H C OH

CH2OH CH2OH 45
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.5. Composés possédant plusieurs centres chiraux

La représentation de Fischer: la chaîne carbonée est constituée d’une ligne


verticale. On ne représente pas les C. « Les lignes horizontales représentent
les liaisons qui se projettent devant le plan et les lignes verticales celles qui
sont dans le plan ou à l’arrière du plan. » Cette notation est très utilisée pour
les sucres.

D-glucose

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.5. Composés possédant plusieurs centres chiraux

Certains composés à deux centres asymétriques n’ont que trois stéréoisomères

Le stéréoisomère « manquant » est l’image miroir qui correspond à la même


molécule qu’un autre stéréoisomère

« Un composé méso est un type


de composé défini par la
présence de centres
asymétriques et d’un plan
de symétrie. »

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.5. Composés possédant plusieurs centres chiraux

« Un composé méso est achiral, bien qu’il ait deux centres asymétriques. »

« Une molécule ayant un plan de symétrie n’a pas d’énantiomère ; elle est
achirale. »
Comment savoir si une molécule à
deux centres asymétriques a un
composé méso parmi ses
stéréoisomères ?
Plan de symétrie Cela arrive si les quatre atomes ou
groupes liés à un centre asymétrique
sont identiques aux quatre atomes ou
groupes liés à l’autre centre
48
asymétrique.
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

La notion d’isomère cis-trans désigne deux diastéréoisomères pour lesquels


les substituants sont positionnés respectivement du même côté ou à l’opposé
d’une structure « rigide » telle qu’un cycle ou une double liaison

Isomère cis : les deux groupes sont situés du même côté du cycle / de la double
liaison
Isomère trans : les deux groupes se trouvent sur des côtés opposés du cycle /
de la double liaison

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

Il existe deux conformères


pour la forme cis et deux
conformères pour la forme
trans (chaise et bateau)

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

cis-1,4-
diméthylcyclohexane

trans-1,4-
diméthylcyclohexane

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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

Si les hydrogènes liés aux carbones sp2 sont sur le même


côté, on dit que l’alcène est cis
cis-but-2-ène
Si les hydrogènes liés aux carbones sp2 sont sur des
côtés opposés, on dit que l’alcène est trans

trans-but-2-ène

« Si l’un des carbones sp2 a des substituants H3C CH3


identiques, une seule structure est possible », donc pas C C
d’isomères cis / trans possibles
H CH3
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2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

« Les isomères cis et trans sont interconvertibles seulement lorsque la


molécule absorbe une quantité de chaleur ou d’énergie lumineuse suffisante
pour briser la liaison π. »

cis-pent-2-ène trans-pent-2-ène

Ce phénomène se nomme isomérisation


53
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

Le système de nomenclature cis-trans ne s’applique pas à des composés qui


ont des carbones sp2 liés à quatre groupes différents mais uniquement s’il y a
deux H et deux autres substituants.

Système de nomenclature E-Z (toujours applicable)


Il faut déterminer les priorités relatives des deux groupes liés aux carbones sp2

Plus le numéro atomique est élevé plus la priorité est haute.

« Si les deux groupes à haute priorité (l’un sur chaque carbone) se trouvent du
même côté de la liaison double, il s’agit de l’isomère Z , sinon c’est l’isomère E »

Z = zusammen signifie « ensemble » E = entgegen qui signifie « opposé » 54


2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

Le brome est Le chlore est


prioritaire sur prioritaire sur le
le carbone sp2 carbone sp2 de
de gauche. droite.

Même côté
Isomère Z
de la liaison double

« Si les deux groupes liés à un carbone sp2 commencent par le même atome
(égalité), il faut aller au-delà de cet atome et vérifier le numéro atomique
des autres atomes auxquels il est lié. »
55
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

Tous les premiers atomes sont des C


On passe à l’atome prioritaire suivant

C lié à 1 C et 2 H C lié à 2 C et 1 H
C lié à 1 Cl et 2 H C lié à 1 O et 2 H
Cl > C O>C

Isomère Z

« Il ne faut pas additionner les numéros atomiques ; il faut considérer chaque


atome séparément et trouver lequel a le numéro atomique le plus élevé. »
« Si un atome est uni à un autre atome par une liaison double, il est traité
comme s’il formait des liaisons simples avec deux de ces atomes. » 56
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.6. Stéréoisomérie cis/trans et Z/E

« Un alcène est stabilisé par des substituants alkyles liés à ses carbones sp2. »

« Si les substituants volumineux


se trouvent sur le même côté de
la molécule, le nuage
électronique de chacun repousse
celui de l’autre, créant une
tension stérique qui réduit la
stabilité de la molécule. » 57
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.7. Stéréoisomérie et réactivité

En fonction du mécanisme incriminé, différents scénarios peuvent se produire

Une molécule ne possédant pas de centre asymétrique peut donner un


produit comportant un centre asymétrique (il s’agira alors d’un mélange
racémique)

+ Br -

Attaque possible des 2 côtés

Énantiomère S Énantiomère R 58
2. Isomères
2.3. Les stéréoisomères
2.3.7. Stéréoisomérie et réactivité

« Si le réactif contient déjà un ou plusieurs centres asymétriques et que ceux-ci ne


sont pas modifiés par la réaction effectuée, les produits obtenus ne sont pas des
énantiomères, mais des diastéréoisomères. »

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