BIOCHIMIE

PASS – LAS 2023-2024

Option Santé
3 octobre 2023 – Cours d’introduction
DE LA CHIMIE À LA BIOCHIMIE
D. MASSON
 Enseignement de Biochimie
• De Chimie à la Biochimie – Cours d’introduction D. Masson
• Acides aminés et protéines 1 CM M. Denis
• Glucides 1 CM G. Herbreteau
• Acides aminés et protéines CM M. Denis
• Enzymes et coenzymes CM D. Masson
• Glucides 2 CM D. Masson
• Lipides et lipoprotéines CM F. Nazih & K. Bach
• Applications médicales ED D. Masson & M. Duflot

• 15h
Plan du cours
• Biochimie : Définition & Généralité
• Biochimie & Métabolisme
• Organisation et orientation
• Régulation
• Altérations
• Apports de la Biochimie
• Outil de compréhension de mécanismes de physiologie
• Outil de compréhension de mécanismes de physiopathologie
• Outil d’exploration
• Outil de compréhension des mécanismes d’action des médicaments
 De la chimie à la Biochimie
• Biochimie
• Etude des réactions chimiques ayant lieu dans la cellule et dans l'organisme vivant
• Aspects moléculaires de la vie cellulaire.

• Molécules étudiées
• Biomolécules qui régissent les fonctions physiologiques de base de la cellule
• Molécules organiques composées de Carbone, Hydrogène, Oxygène, Azote, Soufre, Phosphore
• Propriétés directement liées à leurs fonctions biologiques, dépendent des interactions
moléculaires et de la réactivité chimique des groupes d’atomes
• 3 catégories principales : Glucides (sucres) ; Lipides (graisses) ; acides aminés, peptides et
protéines …

• Réactions étudiées : Toutes les réactions de la chimie organique

• Oxydo-réduction : hydrogénation, déshydrogénation, hydroxylation …
• Addition : hydratation …
• Elimination : déshydratation, décarboxylation …
• Substitution : transfert …
• Transposition : isomérisation …
 Biochimie & Métabolisme (1)
• Métabolisme : Réseau hautement intégré de réactions chimiques

• 2 grandes classes de réactions

• Les réactions de transformation de molécules en énergie cellulaire : catabolisme
• Les réactions de synthèse (protéines, Lipides …) qui nécessitent de l’énergie :
anabolisme
• Fonctions
• Apport permanent d’énergie : ATP
• Indispensable à la réalisation d’un travail mécanique (contraction musculaire)
• Indispensable au transport actif de molécules ou d’ions
• Indispensable à la synthèse de (macro)molécules
• Elimination de déchets toxiques
• Organisation …
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 Glucides
Acides aminés

Coenzymes
LE carrefour métabolique

Lipides

Lipides

Coenzymes
L’orientation métabolique du glucose
et la « réserve « en glucose
 Biochimie & Métabolisme (2)
• 3 Voies d’alimentation
• 1 carrefour métabolique
• 1 « combustible »
• 1 cycle fournissant un pouvoir
réducteur
• 1 chaîne respiratoire
• 1 voie d’élimination d’un toxique
• 2 orientations :
• 1 orientation vers la biosynthèse
de macromolécules
• 1 orientation vers la production
d’ATP
 Biochimie & Métabolisme (3)
• Le métabolisme est régulé par
contrôle :

• Du taux des enzymes

• De leur activité catalytique

• Intégrité structurale et
fonctionnelle de l’enzyme
• Cofacteurs

• De la disponibilité des substrats

et/ou cofacteurs
• Carence
• Défaut d’une voie métabolique
en amont
Biochimie & Métabolisme (4) – Organisation du cours
Métabolisme Métabolisme des Métabolisme
des ac. aminés sucres des lipides

PASS – LAS Protéines Polysaccharides Lipides

Biochimie
Hexoses
Acides aminés Acides gras
Pentoses

Pyruvate

Urée
Nutrition & Acétyl-CoA
Métabolisme Cycle de O2
l’urée
DFGSM3
Chaîne de transport
e- des électrons
Cycle de Phosphorylation Biologie
l’acide citrique oxydative
CO2 Cellulaire
catabolisme ATP
anabolisme
 Régulation du métabolisme
• Régulation par la disponibilité des substrats
• Régulation par les enzymes : Protéines qui jouent un rôle de catalyseurs dans
les réactions du métabolisme

Gène E3 E3
Gène E1 E1 E1 +-
 
A B C
Gène E2 E2
 Altérations du métabolisme
• Déficit de voies de catabolisme, d’anabolisme ou de détoxification

• Exemple : Défaut d’hydrolyse d’un disaccharide

Intolérance au Lactose
• Chez l’adulte : Inconfort
• Approche nutritionnelle

• Exemple : Défaut d’élimination de toxiques

• Hyperammoniémie NH4+

• Coma néonatal
Hyperammoniémique
 Apport de la Biochimie (1)
• Outil de compréhension de mécanismes de physiologie et physiopathologie

Exemple : La sécrétion de l’insuline par les cellules Bêta des îlots de Langerhans
- Les acteurs moléculaires Gloyn A.L. N Engl J Med 2004

- Transporteurs
- Canaux
- Enzymes
- Hormones
- …
- Les voies métaboliques impliquées
- Les cibles thérapeutiques :
- Canal potassique
- Pour l’ouvrir
- Pour le fermer
 Apport de la Biochimie (2)
• Outil de compréhension de mécanismes de physiologie et physiopathologie
• Maladies héréditaires du métabolisme
• Déficit partiel ou total concernant une enzyme
• Erreurs innées du métabolisme
• Déficit d'origine génétique
• Individuellement très rares (fréquence de 1/5 000 à 1/500 000)
• 500 actuellement identifiées sur 5 000 maladies potentielles

• Dépistage néonatal :
• Programme national - Tous les nouveau-nés
• Détection - Mise en place d’un traitement
• 13 maladies dépistées en France en 2023
• Protéine : Hémoglobine (Drépanocytose)
• Acide aminé : Phénylcétonurie
• Stéroïde : Hyperplasie congénitale des surrénales
• Lipide : Déficit du catabolisme des Ac. Gras
• …
Apport de la Biochimie (3)

• Outil d’exploration
• Mission des laboratoires de Biochimie
Médicale

• Dosage de substrats
• Dans un liquide biologique (plasma …)
• Glucose, Cholestérol, …
• Techniques enzymatiques : Spécificité
• Spectrophotométrie

• Mesure d’activités enzymatiques

• Dans un liquide biologique
• Dans un lysat ou extrait cellulaire
• Substrat spécifique et spectrophotométrie
Apport de la Biochimie (4)

• Outil d’exploration
• Voies métaboliques
• Glucides

• Lipides

• Outil d’évaluation de risques

• Ex : Risque cardio-vasculaire
• Approche nutritionnelle
• Approche thérapeutique
 Apport de la Biochimie (5)
• Un point commun entre ces technologies :
• Outil d’exploration – ex : Le dosage du Glucose
Une réaction de transformation du glucose catalysée
Capteur Freestyle Abbott
par une enzyme

• L’outil du patient

Glucose + O2 → Ac. Gluconique + H2O2

Ou
• L’outil des laboratoires
Glucose + ATP → Glucose-6-Phosphate + ADP

Suivie d’une seconde réaction produisant un

métabolique quantifiable par spectrophotométrie
ou 1 e-
 Apport de la Biochimie (6)
• Outil de compréhension des mécanismes d’action de médicaments
• Les inhibiteurs enzymatiques

• Nombreuses classes thérapeutiques Inhibition enzymatique :

• Hypocholestérolémiants
Applications non thérapeutiques
• Antibactériens
◼ Environnements
• Antiviraux
❑ Herbicides
• Antihypertenseurs ❑ Insecticides
• Anti inflammatoires ❑ Fongicides

• Anti-cancéreux ◼ Armes chimiques

• …
• De Chimie à la Biochimie – Cours d’introduction D. Masson
• Acides aminés et protéines 1 CM M. Denis
• Glucides 1 CM G. Herbreteau
• Acides aminés et protéines CM M. Denis
• Enzymes et coenzymes CM D. Masson
• Glucides 2 CM D. Masson
• Lipides et lipoprotéines CM F. Nazih & K. Bach
• Applications médicales ED D. Masson & M. Duflot