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Epidémiologie

ISPITSA 1

Epidémiologie
- Généralités
- La démarche épidémiologique
- La classification en épidémiologie
- La surveillance épidémiologique
- Les mesures de fréquence en épidémiologie

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Définition de l’épidémiologie

• Épidémiologie :
– Epi : qui concerne (qui affecte)
– Demos : population Science qui étudie ce qui
– Logos : science affecte la population

Plusieurs définitions qui évoluent avec le développent des sciences.

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Définition retenue de l’épidémiologie


Définition de MacMahon & Pugh (1970) : la plus reconnue et la plus pratique :

« l’épidémiologie est l’étude de la DISTRIBUTION et des


DÉTERMINANTS de la FRÉQUENCE des phénomènes de santé chez
l’Homme »

• Fréquence : quantification de la survenue ou de l’existence d’un


phénomène de santé.
• Distribution : répartition des cas selon les caractéristiques de :
– Temps (Quand?)
– Lieu (Où?)
– Personne (Qui?)
• Déterminants : causes (facteurs de risque ou de protection)

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Développement des domaines de l’épidémiologie

Maladies Etude des


Epidémies infectieuses et phénomènes de
contagieuses santé

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Evolution d’un phénomène de santé dans le temps et


dans l’espace

• Endémie : c'est l'existence en permanence d'une maladie dans


une région donnée ou chez une population déterminée.

• Epidémie : c'est la survenue d'un nombre de cas en excès par


rapport à ce qui est habituellement attendu dans une région,
chez une population et à un moment déterminés.

• Pandémie : c'est une épidémie survenant dans une très grande


région, qui dépasse un continent, et touchant généralement une
grande partie de la population.

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Objectifs pratiques de l’épidémiologie


• Identifier l’ampleur des phénomènes de santé;
• Découvrir l’étiologie et les déterminants (FR/FP) d’une maladie
dans la communauté (prévention);
• Evaluer l’efficacité des actions;
• Surveillance épidémiologique.
• …

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Principes de l’épidémiologie

• « Hasard ».

• « Causalité ».

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Processus de la démarche en épidémiologie


1. Mesurer la fréquence d’un phénomène de santé.
2. Faire la distribution selon les caractéristiques PLT.
3. Emettre des hypothèses sur la distribution des déterminants
de cette fréquence.
4. Tester les hypothèses ainsi formulées.
5. Prise de décision (actions)

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Classification des études épidémiologiques d’observation

• Classification selon l’élément de départ.


• Classification selon le temps.
• Classification selon leurs objectifs.

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Classification selon le temps

Etude
Etude transversale Etude prospective
rétrospective (de prévalence)
X
t0 t1 Temps

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Classification selon l’élément de départ


Etude de
cohorte

E+/E- M?

Exposition Issue
(Facteur de Phénomène
risque ou de de santé
protection)

E? M+/M-
Etude cas-témoins

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• E. descriptive.

• E. analytique.
Branches (types) de • E. expérimentale.
l’épidémiologie
• E. opérationnelle.

• E. évaluative.

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E. Descriptive

• Distribution de la fréquence (personne, temps, lieu)

• Hypothèse (s) : association entre l’exposition et l’issue.

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• Analyse des déterminants et test des hypothèses.


• Déterminants (facteurs de risque ou de protection)
• Test des hypothèses :
– Mesure du risque
E. analytique – Mesure de l’association
– Validité de l’association (hasard, biais, facteurs
confondants)
– Critères de causalité
• Etudes fondamentales : études de cohorte et de cas-
témoins.

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• E. expérimentale :
– Expériences (essais cliniques) pour vérifier la valeur des
hypothèses

• E. opérationnelle
– Prise de décision et actions.

• E. évaluative
– Efficacité des actions.

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Application

Dans une localité de 50 000 personnes, 1 000 cas d’une maladie à transport
hydrique (MTH)

D’après les enquêtes entreprises, on a constaté que 20 000 personnes


consomment une eau non traitée, et parmi les 1 000 cas de MTH, 600
personnes consomment une eau non traitée.

On a donc suspecté que les cas de MTH peuvent être en relation avec l’origine de
l’eau de boisson (traitée ou non traitée) : la consommation d’eau non traitée
serait un facteur de risque pour avoir des épisodes de MTH.

Pour vérifier cette hypothèse, on va comparer les différentes mesures du risque


selon la nature de l’eau de boisson, pour cette raison on va dresser la table de
contingence.

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1) Table de contingence (étude de cohorte)
Issue (maladie) = MTH
Oui Non
Oui
600 19 400 20 000 Les exposés
Exposition Eau non traitée
Eau Non Non 400 29 600 30 000 Les non exposés
traitée Eau traitée
1 000 49 000 50 000 La population totale
Les malades Les non malades

2) Mesure du risque : 3.1 ) Le risque attribuable


• Re+= 600 / 20 000 = 3%. (différence de risque) RAt :
• Re-= 400 / 30 000 = 1,3%. C’est l’excès du risque qui
• Rt = 1 000 / 50 000 = 2%. serait dû au fait d’être exposé
3) Mesure de la force de l’association : au facteur de risque :
3.1) Risque relatif : RAt = Re+ - Re- = 3–1,3 = 1,7%
RR = Re+ / Re- = 3 / 1,3 = 2,3 :
→ il y a association entre la consommation de l’eau
non traitée et l’apparition des cas de MTH,
→ l’eau non traitée = FR.
→ les personnes qui consomment de l’eau non
traitée ont un risque 2,3 fois plus élevé de faire une
GEA que celles qui consomment de l’eau traitée.
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4) Validité de l’association :
RR = 2,3 : Eau non traité ↔ MTH
4.1) Vérification que l’association Chi2 > 3,84 : → p < 0,05 (e < 5%)
n’est pas due au hasard par le test
Chi2 > 6,63 : → p < 0,01 (e < 1%)
statistique Chi2.
CHi2 = probabilité (erreur) pour que Chi2 > 10,83 : → p < 0,001 (e < 1 0/00)
l’association entre l’exposition et
l’issue soit due au hasard.

ou

Oi : Valeurs observées = a, b, c et d
Ai : Valeurs attendues = a’, b ‘, c’ et d’?

= 400
Chi2 = 170,06 >>> 10,83
p < 0,001 (e < 1 0/00)
= 19 600 la probabilité que l’association entre les
cas de MTH et la consommation de l’eau
= 600 non traitée soit due au hasard est
inférieure à 1 0/00
= 29 400 → Degré de confiance > 99%
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Intervalle de confiance du RR :

z est la valeur de distribution normale standard associée au degré de


confiance désiré :
Pour 90%, z = 1,645.
Pour 95%, z = 1,96.
Pour 99%, z = 2,575

RR= 2,3, Chi2 = 170,06, degré de confiance = 99% et z = 2,575


La limite supérieure = 2,65
La limite inférieure = 1,92
IC = [1,92 – 2,65] : dans 99% des cas le RR réel se situera entre 1,92 et
2,65.

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Mesures de risque pour étude cas-témoins

Maladie
Oui Non
Oui a b
Exposition Non c d

Les cas Les témoins

* La cote de l’exposition chez les CAS = CEC = P (exposition) / P (non exposition)


= [a / (a+c)] / [c /(a+c)] = a/c

* La cote de l’exposition chez les TEMOINS = CET = P (exposition) / P (non exposition)


= [b / (b+d)] / [d /(b+d)] = b/d

* Le rapport des cotes = Odds-ratio = OR = CEC / CET = ad/bc

* IC de OR (même formule et interprétation que IC du RR)

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• Notions de base : Ratio, Proportion, Taux, Indice


• Les mesures de fréquences :
- Les mesures de fréquences de morbidité :
✓Les mesures de prévalence.
Les mesures de ✓Les mesures d’incidence.
fréquence - Les mesures de fréquences de mortalité :
✓Taux de létalité.
✓Taux de mortalité.

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La Proportion
Proportion = X / (X + Y)
•(X, Y) : même nature.
• N (=X) est inclus dans le D (=X+Y)
• Expression :
– Chiffre compris entre 0 et 1.
– %, pour 1000, pour 10000, pour 100000, …
• Ex :
– Lieu = Maroc.
– Temps = 31/12/2006.
– Personne = cas de tuberculose = 26 099 :
- M : 15 271.
- F : 10 828.
• La proportion des cas de tuberculose de sexe masculin
= 15 271 / 26 099 = 0,5851 = 58,5%

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Le Ratio

Ratio = X / Y ou X : Y
•(X, Y) : fréquences de 2 classes d’une même variable.
• X n’est pas inclus dans Y.
• (X, Y) : même nature, exclusifs.
• Expression : sans unité.
• Ex :
– Lieu = Maroc.
– Temps = 31/12/2006.
– Personne = cas de tuberculose = 26 099 :
- M : 15 271.
- F : 10 828.
• Le sexe-ratio M : F = 15 271 : 10 828 ou 1,41 : 1

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La Cote

Cote = Ratio P(+) : P(-)


•Utilisation : études de cas-témoins
→ cote des E(+) sur les E(-)
•Expression : nombre d’unités de N pour une unité de D.
•Ex :
– TIAC de 75 cas
– 53 cas ayant consommé un aliment X = E(+)
– et 22 cas n’en ayant pas consommé = E(-)
•La cote d’exposition chez les cas :
= cote des E(+) sur les E(-) =

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L’indice

Indice = X / Y
•Type de ratio : (X, Y) sont de nature différentes
•Utilisation : cas où le D nécessaire pour une proportion ou un taux
ne peut pas être correctement mesuré (indicateurs de
fonctionnement ou en économie de santé)

Indicateurs Urbain Rural Total


ISF 2,15 3,20 2,59
Habitant par lit (Public) 1438
Habitant par médecin (public) 2 725
Habitant par infirmier (public) 1 109
Lits par infirmier (public) 0,9
Habitant par médecin (RSSB) 8 111 11 345 9 209
Lits par médecin (REH) 3,7

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(Source : santé en chiffre 2011)
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Le taux

•Taux :
= probabilité de survenue d’un événement au cours du temps.
= vitesse de changement d’un phénomène de santé dans le temps.
= proportion qui renferme la notion du temps.

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Exs

Santé en
Objectifs de Objectifs de
chiffres
Indicateur ENPSF, 2004 la stratégie la stratégie
2011, édition
2008-2012 2012-2016
2012

112
TMM/100 000 NV 227 U : 73 50 50
R : 148
28,8
TMI/1000 NV 40 U : 23,6 15 19
R : 33,5

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Ex : évolution des cas de GP (A / H1N1)
Maroc
du 1 mai au 12 mai 2009

t1 = 1 mai 2009 à 23h30 GMT t2 = 12 mai 2009 à 06h00 GMT


156 cas dont 9 décès. 2059 cas dont 56 décès
X X Temps

Tx de mortalité à t1 Tx de mortalité à t2
= 9 / 156 = 5,8% = 56 / 2 059 = 2,7%

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Mesure en épidémiologie
= Rapport = N / D = CAS / POPULATION ETUDIEE

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Les indicateurs épidémiologiques

Phénomène de santé

Cas (maladie) I. de morbidité


Décès I. de mortalité
I. Statiques :
Prévalence, mortalité
proportionnelle, FREQUENCE (t)?
létalité

I. Dynamiques :
Tx d’incidence, TM VITESSE (∆t)?

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La prévalence

•Expression :
– Chiffre compris entre 0 et 1.
– %, pour 1000, pour 10000, pour 100000, …
• P = { cas} = { anciens + nouveaux cas}
• Instant t = moment précis ou intervalle de temps.
• Ex :
– Maroc , 1 mai 2009 à 23h30 GMT
– GP (A/H1N1) : 156 cas.

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Incidence

•Expression :
– Chiffre compris entre 0 et 1.
– % : x cas pour 100, 1000, 10000, … personnes pendant la période ∆t.
– IC / an, mois, semaine, jour.
• Ex :
– Maroc , du 1 au 12 mai 2009.
– GP (A/H1N1) : 1093 nouveaux cas.
– Pop = 30 853 000

IC = 1093 x 1 000 000 / 30 853 000 = 35,43 pour 1 million.

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Le taux d’attaque
• Utilisation : cas des épidémies.
• TA = IC de la maladie pendant la durée de l’épidémie.
• Ex :
– Commune Itzez (Khénifra), 6006 habitants.
– 183 cas de fièvre typhoïde entre le 04/6 et le 13/8/2005.
• TA de la fièvre typhoïde = 183 / 6006 = 3%

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Mortalité globale

• MG = IC des décès.
• MG dépend de la structure par âge.
• Les données de mortalité sont le plus souvent stratifiées par
classe d’âge.

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ex : MS pour une classe d’âge


(calculs pour 1000 NV)

naissance 1 mois 1 an 4 ans 5 ans

11 mois
TM.
néonatale
18,8 TM.
Post
néonatale
10,0

TM. TM.
Infantile Juvénile
28,8 1,7

TM.
Infanto-Juvénile
30,5
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(Source : santé en chiffre 2011)
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Mortalité spécifique
• MS pour une cause :

• MS pour une classe d’âge :

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Mortalité proportionnelle liée à une cause

Létalité

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Les biais dans l’Epi. Analytique

• Biais de sélection : • Biais d’observation


– Échantillonnage. (information) :
– Non-réponse ou non- – Techniques de mesure.
participation.
– Suivie ou de perte de vue. – Enregistrement.
– Déclarations des sujets.
– Rappel ou mémorisation.

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Les facteurs confondants

• F. confondant = variable liée à la fois à l’exposition et à l’issue,


qui peut produire des fausses associations.
• Moyens de neutraliser l’effet des FC :
✓ Restriction.
✓ Stratification.
✓ Appariement.
✓ Standardisation.
✓ Analyse multi variée (modélisation)

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Critères de causalité
1) La séquence temporelle.
2) La force de l’association.
3) La reproductibilité de l’association.
4) La relation dose-effet (gradient biologique)
5) La spécificité de l’association.
6) La cohérence avec les connaissances.
7) La plausibilité biologique.
8) La preuve expérimentale.

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•SE?
•Étapes de la SE.
•Finalité de la SE.
•Objectifs de la SE.
La surveillance •Types de la SE.
épidémiologique (SE) •Déclaration obligatoire des maladies.
•Maladies sous surveillance au Maroc
•Circuit de la SE au Maroc.

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SE?

• Définition (Languir, 1963)


Thématique 5
« la surveillance est le processus de collecte, de compilation et
d’analyse des données, ainsi que la diffusion à l’ensemble de
ceux qui ont besoin d’être informés »

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Etapes de la SE

Collecte systématique des données


épidémiologiques Informations
sanitaires
Compilation & analyse

Diffusion
SE
Rétro-information
Gestion du
Système National
de Santé

➢ Prise de décision et action


➢ Alerte et riposte

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Finalité de la SE

« la SE, c’est de l’information appelant l’action »


(J. Kostrzewski )

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Objectifs de la SE

• Décrire

• Alerter

• Evaluer

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Décrire
Evolution annuelle des cas de Sida,
Maroc, 1986-2005
350
289
300

271
250
Nombre de cas

205
200

165
150 150
129
92
100 93 112
77
66
50 28 30
44
57
14 20 26
9
1
0

Années

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Décrire
Distribution des nouveaux cas de Distribution des nouveaux
SIDA selon le mode de cas de SIDA par région,
transmission, Maroc, 2006 (n=291) Maroc, 2006

Marrakech-Tensift-
29%
Alhaouz
18%
Souss Massa Draa
Périnatal Bisexuel;
13%
3% Doukala Abda
; 7%
12%
Grand Casa
8%
Homosex Autres régions
uel; 3% 6%
Oriental
Drogue; Meknés Tafilalat
3%
3% Rabat Salé Zemmor
3%
Zaër
Inconnu;
Héterose 3% Guelmim-Esmara
3%

xuel; Laayoune-Boujdour
3%
80% Transfusi 1%
Etranger
on; 1%
1%
Origine inconnue
0% 20% 40%

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Alerter
• Objectif :
– Selon les caractéristiques de TLP, détection d’une
augmentation des cas d’une maladie.

• Principe :
– Selon les caractéristiques de TLP, comparer le nombre
de cas survenus pendant un intervalle de temps, au
nombre de cas habituellement enregistrés pendant la
même période.
– Calcul de l’indice épidémiologique et du ratio
épidémiologique.

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Alerter
• Indice épidémiologique :
– IE = Observation / Moy_5
– Observation : Nombre de cas observés dans une Observation = n (S50)
semaine. Moy_5 = (N1+N2+N3+N4+N5)/5

– Moy_5 : Moyenne de 5 ans pour la semaine en


question.
– IE ≥ 1,5 : alerte épidémiologique.
CAS
N5 A-5
N4 A-4

N3 A-3

N2 A-2

N1 A-1

N (S50) A

ANNEE
S
S S S
5 S53
1 2 4
0
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Alerter
• Ratio épidémiologique :
– RE = Observation / Moy_5
– Moy_5 : Moyenne de 5 ans des semaines d’avant et Observation = n (S50)
celles d’après de l’observation. Moy_5 = (N1+N2+N3+N4+N5)/5
→ A-1 : N1 = [N(S49) + N(S51)] / 2
– Limite Supérieure du RE : LS = 1 + (δ / Moy_5)
– Limite Inférieure du RE : LI = 1 – (δ / Moy_5)

CAS
N5 A-5
N4 A-4

N3 A-3

N2 A-2

N1 A-1

N (S50) A

ANNEE
S S S
S S S
4 5 5 S53
1 2 4
9 0 1

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Alerter
• Interprétation du RE :
– Si RE > 1 : augmentation de survenue des cas

– Si RE > LS : augmentation significative :

• → Epidémie (à confirmer par des investigations et attention aux


artefacts)

– Si RE < LI : diminution significative :

• → Efficacité d’un programme de prévention, mais attention aux


artefacts.

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Alerter
Evolution hebdomadaire du RE, Méningite
3,5 méningococcique, Maroc, année 2006
3,0

2,5
RE
2,0

1,5
LS
1,0
LI
0,5

0,0
1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 53
Sem
R.E Lim sup Lim inf

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Evaluer
Evolution des cas de rougeole, Maroc, 1975 - 2005
180000

160000
PEV
140000

120000

100000

80000
PNI
60000

40000

20000

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Evaluer
Evolution annuelle des cas de Paralysies Flasques Aigües,
Maroc, 1982-2005
Formation

200 198
180

160 164

140 144

120 121

100 116

80 82 81
76 79 78
74 73
60

40

20
12
3 5
0

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Types de la SE

• Surveillance passive

• Surveillance active

• Surveillance sentinelle
– Surveillance sentinelle par réseau (Grippe, PFA, méningite)

– Surveillance sentinelle par site (VIH/SIDA)

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Déclaration obligatoire des maladies

• Acte médical qui consiste à signaler à l’autorité sanitaire (MS)


une ou plusieurs maladies fixées par voie réglementaire.

• Permet la surveillance de l’état de santé de la population.

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Déclaration obligatoire des maladies

Base légale

• Décret Royal N° 554-65 du 26/06/1967 portant loi rendant la


DMO et prescrivant les mesures prophylactiques propres à
enrayer ces maladies (compléments en 1997, 2000 et 2003)

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Déclaration obligatoire des maladies

• Destinataire des déclarations


«La déclaration des cas de maladies doivent être faites
exclusivement à l’autorité sanitaire provinciale ou préfectorale
qui doit les acheminer au Ministère de la Santé»

• Circulaire du Ministère de la Santé, N° 755/292/201 du 24/3/76.


• Circulaire du Ministre de l’Intérieure, N° 17 DLA/I du 17/1/78.

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Déclaration obligatoire des maladies


• Liste des MDO
– Maladies soumises au règlement sanitaire international (Choléra, peste et
fièvre jaune)

– Maladies pouvant donner lieu à des poussés épidémiques.

– Autres maladies à déclaration obligatoire.

Bouchriti, Y.,
ISPITS - Agadir
Epidémiologie
60
Maladies sous surveillance épidémiologique au
Maroc
Maladies Code
1- Maladies à transport hydriques et/ou - Choléra 001
alimentaire - Typhoïde 002
- Toxi-infections Alimentaires Collectives
- Hépatites Virales Epidémiques 070

2- Méningites - Méningites à méningocoques 036


- Autres méningites bactérienne
- Méningites virales
3- Zoonoses - Rage humaine
- Charbon humain
- Leptospirose
- Brucellose
4- Maladies cibles de la vaccination - Rougeole 055
- Coqueluche 033
- Diphtérie
- Tétanos 037
- Poliomyélite et PFA
5- Rhumatisme articulaire aigu (RAA) 320

6- Maladies oculaires - Conjonctivites 077


- Trachome 076
7- Infections sexuellement - IST curables 091, 098
transmissibles (IST) - VIH/SIDA B20

8- Tuberculose - TTF & TPM+ A15-19


9- Maladies parasitaires - Schistosomiase 120
- Paludisme 084
- Leishmanioses (LCT, LCM, LV) B55.1-2,B55.0

10- Lèpre A30


Bouchriti, Y.,
ISPITS - Agadir
Epidémiologie
61

Circuit de la SE au Maroc

SSE
(MS-DELM)

SSP
(Région)

REH
Laboratoires
CPE Secteur privé
(Délégation médicale)

: circuit des données


RSSP
: rétro-information

Bouchriti, Y.,
ISPITS - Agadir

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