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ISPITSA 1
Epidémiologie
- Généralités
- La démarche épidémiologique
- La classification en épidémiologie
- La surveillance épidémiologique
- Les mesures de fréquence en épidémiologie
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Epidémiologie
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Définition de l’épidémiologie
• Épidémiologie :
– Epi : qui concerne (qui affecte)
– Demos : population Science qui étudie ce qui
– Logos : science affecte la population
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Principes de l’épidémiologie
• « Hasard ».
• « Causalité ».
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Etude
Etude transversale Etude prospective
rétrospective (de prévalence)
X
t0 t1 Temps
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E+/E- M?
Exposition Issue
(Facteur de Phénomène
risque ou de de santé
protection)
E? M+/M-
Etude cas-témoins
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• E. descriptive.
• E. analytique.
Branches (types) de • E. expérimentale.
l’épidémiologie
• E. opérationnelle.
• E. évaluative.
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E. Descriptive
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• E. expérimentale :
– Expériences (essais cliniques) pour vérifier la valeur des
hypothèses
• E. opérationnelle
– Prise de décision et actions.
• E. évaluative
– Efficacité des actions.
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Application
Dans une localité de 50 000 personnes, 1 000 cas d’une maladie à transport
hydrique (MTH)
On a donc suspecté que les cas de MTH peuvent être en relation avec l’origine de
l’eau de boisson (traitée ou non traitée) : la consommation d’eau non traitée
serait un facteur de risque pour avoir des épisodes de MTH.
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1) Table de contingence (étude de cohorte)
Issue (maladie) = MTH
Oui Non
Oui
600 19 400 20 000 Les exposés
Exposition Eau non traitée
Eau Non Non 400 29 600 30 000 Les non exposés
traitée Eau traitée
1 000 49 000 50 000 La population totale
Les malades Les non malades
ou
Oi : Valeurs observées = a, b, c et d
Ai : Valeurs attendues = a’, b ‘, c’ et d’?
= 400
Chi2 = 170,06 >>> 10,83
p < 0,001 (e < 1 0/00)
= 19 600 la probabilité que l’association entre les
cas de MTH et la consommation de l’eau
= 600 non traitée soit due au hasard est
inférieure à 1 0/00
= 29 400 → Degré de confiance > 99%
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Intervalle de confiance du RR :
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Maladie
Oui Non
Oui a b
Exposition Non c d
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La Proportion
Proportion = X / (X + Y)
•(X, Y) : même nature.
• N (=X) est inclus dans le D (=X+Y)
• Expression :
– Chiffre compris entre 0 et 1.
– %, pour 1000, pour 10000, pour 100000, …
• Ex :
– Lieu = Maroc.
– Temps = 31/12/2006.
– Personne = cas de tuberculose = 26 099 :
- M : 15 271.
- F : 10 828.
• La proportion des cas de tuberculose de sexe masculin
= 15 271 / 26 099 = 0,5851 = 58,5%
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Epidémiologie
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Le Ratio
Ratio = X / Y ou X : Y
•(X, Y) : fréquences de 2 classes d’une même variable.
• X n’est pas inclus dans Y.
• (X, Y) : même nature, exclusifs.
• Expression : sans unité.
• Ex :
– Lieu = Maroc.
– Temps = 31/12/2006.
– Personne = cas de tuberculose = 26 099 :
- M : 15 271.
- F : 10 828.
• Le sexe-ratio M : F = 15 271 : 10 828 ou 1,41 : 1
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La Cote
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L’indice
Indice = X / Y
•Type de ratio : (X, Y) sont de nature différentes
•Utilisation : cas où le D nécessaire pour une proportion ou un taux
ne peut pas être correctement mesuré (indicateurs de
fonctionnement ou en économie de santé)
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(Source : santé en chiffre 2011)
Epidémiologie
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Le taux
•Taux :
= probabilité de survenue d’un événement au cours du temps.
= vitesse de changement d’un phénomène de santé dans le temps.
= proportion qui renferme la notion du temps.
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Exs
Santé en
Objectifs de Objectifs de
chiffres
Indicateur ENPSF, 2004 la stratégie la stratégie
2011, édition
2008-2012 2012-2016
2012
112
TMM/100 000 NV 227 U : 73 50 50
R : 148
28,8
TMI/1000 NV 40 U : 23,6 15 19
R : 33,5
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Epidémiologie
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Ex : évolution des cas de GP (A / H1N1)
Maroc
du 1 mai au 12 mai 2009
Tx de mortalité à t1 Tx de mortalité à t2
= 9 / 156 = 5,8% = 56 / 2 059 = 2,7%
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Epidémiologie
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Mesure en épidémiologie
= Rapport = N / D = CAS / POPULATION ETUDIEE
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Epidémiologie
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Phénomène de santé
I. Dynamiques :
Tx d’incidence, TM VITESSE (∆t)?
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La prévalence
•Expression :
– Chiffre compris entre 0 et 1.
– %, pour 1000, pour 10000, pour 100000, …
• P = { cas} = { anciens + nouveaux cas}
• Instant t = moment précis ou intervalle de temps.
• Ex :
– Maroc , 1 mai 2009 à 23h30 GMT
– GP (A/H1N1) : 156 cas.
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Incidence
•Expression :
– Chiffre compris entre 0 et 1.
– % : x cas pour 100, 1000, 10000, … personnes pendant la période ∆t.
– IC / an, mois, semaine, jour.
• Ex :
– Maroc , du 1 au 12 mai 2009.
– GP (A/H1N1) : 1093 nouveaux cas.
– Pop = 30 853 000
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Le taux d’attaque
• Utilisation : cas des épidémies.
• TA = IC de la maladie pendant la durée de l’épidémie.
• Ex :
– Commune Itzez (Khénifra), 6006 habitants.
– 183 cas de fièvre typhoïde entre le 04/6 et le 13/8/2005.
• TA de la fièvre typhoïde = 183 / 6006 = 3%
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Mortalité globale
• MG = IC des décès.
• MG dépend de la structure par âge.
• Les données de mortalité sont le plus souvent stratifiées par
classe d’âge.
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11 mois
TM.
néonatale
18,8 TM.
Post
néonatale
10,0
TM. TM.
Infantile Juvénile
28,8 1,7
TM.
Infanto-Juvénile
30,5
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(Source : santé en chiffre 2011)
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Mortalité spécifique
• MS pour une cause :
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Létalité
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Critères de causalité
1) La séquence temporelle.
2) La force de l’association.
3) La reproductibilité de l’association.
4) La relation dose-effet (gradient biologique)
5) La spécificité de l’association.
6) La cohérence avec les connaissances.
7) La plausibilité biologique.
8) La preuve expérimentale.
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Epidémiologie
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•SE?
•Étapes de la SE.
•Finalité de la SE.
•Objectifs de la SE.
La surveillance •Types de la SE.
épidémiologique (SE) •Déclaration obligatoire des maladies.
•Maladies sous surveillance au Maroc
•Circuit de la SE au Maroc.
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SE?
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Etapes de la SE
Diffusion
SE
Rétro-information
Gestion du
Système National
de Santé
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Finalité de la SE
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Objectifs de la SE
• Décrire
• Alerter
• Evaluer
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Décrire
Evolution annuelle des cas de Sida,
Maroc, 1986-2005
350
289
300
271
250
Nombre de cas
205
200
165
150 150
129
92
100 93 112
77
66
50 28 30
44
57
14 20 26
9
1
0
Années
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Décrire
Distribution des nouveaux cas de Distribution des nouveaux
SIDA selon le mode de cas de SIDA par région,
transmission, Maroc, 2006 (n=291) Maroc, 2006
Marrakech-Tensift-
29%
Alhaouz
18%
Souss Massa Draa
Périnatal Bisexuel;
13%
3% Doukala Abda
; 7%
12%
Grand Casa
8%
Homosex Autres régions
uel; 3% 6%
Oriental
Drogue; Meknés Tafilalat
3%
3% Rabat Salé Zemmor
3%
Zaër
Inconnu;
Héterose 3% Guelmim-Esmara
3%
xuel; Laayoune-Boujdour
3%
80% Transfusi 1%
Etranger
on; 1%
1%
Origine inconnue
0% 20% 40%
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Alerter
• Objectif :
– Selon les caractéristiques de TLP, détection d’une
augmentation des cas d’une maladie.
• Principe :
– Selon les caractéristiques de TLP, comparer le nombre
de cas survenus pendant un intervalle de temps, au
nombre de cas habituellement enregistrés pendant la
même période.
– Calcul de l’indice épidémiologique et du ratio
épidémiologique.
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Alerter
• Indice épidémiologique :
– IE = Observation / Moy_5
– Observation : Nombre de cas observés dans une Observation = n (S50)
semaine. Moy_5 = (N1+N2+N3+N4+N5)/5
N3 A-3
N2 A-2
N1 A-1
N (S50) A
ANNEE
S
S S S
5 S53
1 2 4
0
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Alerter
• Ratio épidémiologique :
– RE = Observation / Moy_5
– Moy_5 : Moyenne de 5 ans des semaines d’avant et Observation = n (S50)
celles d’après de l’observation. Moy_5 = (N1+N2+N3+N4+N5)/5
→ A-1 : N1 = [N(S49) + N(S51)] / 2
– Limite Supérieure du RE : LS = 1 + (δ / Moy_5)
– Limite Inférieure du RE : LI = 1 – (δ / Moy_5)
CAS
N5 A-5
N4 A-4
N3 A-3
N2 A-2
N1 A-1
N (S50) A
ANNEE
S S S
S S S
4 5 5 S53
1 2 4
9 0 1
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Alerter
• Interprétation du RE :
– Si RE > 1 : augmentation de survenue des cas
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Alerter
Evolution hebdomadaire du RE, Méningite
3,5 méningococcique, Maroc, année 2006
3,0
2,5
RE
2,0
1,5
LS
1,0
LI
0,5
0,0
1 3 5 7 9 11 13 15 17 19 21 23 25 27 29 31 33 35 37 39 41 43 45 47 49 51 53
Sem
R.E Lim sup Lim inf
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Evaluer
Evolution des cas de rougeole, Maroc, 1975 - 2005
180000
160000
PEV
140000
120000
100000
80000
PNI
60000
40000
20000
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Epidémiologie
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Evaluer
Evolution annuelle des cas de Paralysies Flasques Aigües,
Maroc, 1982-2005
Formation
200 198
180
160 164
140 144
120 121
100 116
80 82 81
76 79 78
74 73
60
40
20
12
3 5
0
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Types de la SE
• Surveillance passive
• Surveillance active
• Surveillance sentinelle
– Surveillance sentinelle par réseau (Grippe, PFA, méningite)
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Epidémiologie
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Base légale
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Epidémiologie
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Maladies sous surveillance épidémiologique au
Maroc
Maladies Code
1- Maladies à transport hydriques et/ou - Choléra 001
alimentaire - Typhoïde 002
- Toxi-infections Alimentaires Collectives
- Hépatites Virales Epidémiques 070
Circuit de la SE au Maroc
SSE
(MS-DELM)
SSP
(Région)
REH
Laboratoires
CPE Secteur privé
(Délégation médicale)
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