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Cours de microbiologie générale

Programme du cours de microbiologie générale

1- Introduction à la microbiologie générale


Origines de l’Homme, pathologie antibiotiques, utilisation en bio-industrie

2- Nature et étendue du monde microbien: principes de la taxonomie,


principaux groupes de micro-organismes

3- Morphologie et ultrastructure des bactéries


Cytoplasme, membrane, paroi bactérienne, flagelles, pili, spore…

4- Classification des bactéries: Cyanobactéries, myxobactéries, spirochètes, enterobactéries,


rickettsies et chlamydies, mycoplasmes et archaebactéries

5- Nutrition: aliments, facteurs de croissance


Croissance: technique d’étude de la croissance

6- Métabolisme bactérien
7- Génétique bactérienne: mutation, transformation, conjugaison et transduction

8- Notions virologie: structure, classification, cycle viral, rétrovirus et bactériophages


Introduction à la microbiologie
générale
OrigineS de l’Homme ‫أصولا إلنسان‬
Putréfaction noir ‫حمأ م سنون‬

Adam est notre père et les micro-organismes du sol sont nos


ancêtres.
Pr Abdelkrim Khattabi

Séquençage d’ADN de l’homme en 2003 a montré que notre ADN


est un mélange d’ADN de différent origines, viral, bactériens et
autres, les rétrovirus représente environ 9% de notre ADN.
‫ُشَر ; ; ;َكاء يِف َما َر ;َز ;ْقنَا; ُك ْم فََأنتُ ْم فِ ِيه َس َو ;اء خَتَافُو;َن ُه ْم َك ِخي َفتِ ُك ْم َأن ُف َس ُك ْم‬
28 ‫سو;ر ;;ة الر;و;;م آية‬

‫من هم شركائنا؟‬
‫قيل هم ال;عبيد يف ز ;;من قسمت البشر;ية إىل أحر;ار و عبيد‬
‫يقال يف ز ;;من العو;ملة التجار;ية هم شر; ;;كاء يف مؤ;;سسة جتار;ية‬
‫ شر; ;;كاءنا يف أجسادنا و أر;ز;اقنا و كل حياتنا‬,‫أقو;;ل أن شر; ;;كاءنا هم البكتري;يا‬
‫د عبد الكر;;مي اخلطايب‬
Partenaires dans ce que nous vous avons attribué, en sorte que vous
soyez égaux, vous les craignez comme vous vous craignez vous-même
Sourate les Roumains verset 28 traduit en francais par Pr Abdelkrim Khattabi

Nos partenaires ce sont les micro-organismes qui habite toutes les


parties de notre corps (peau , muqueuse, vagin et intestin …) et qui
partagent avec nous nos moyens de subsistance et toutes notre vies.
Partenaires ‫ش ركاءن ا‬
- complète l’action des enzymes du tube digestif
- Sans bactéries le système immunitaire ne se développe pas,
ils éduquent le SI
- Produisent des vit et des minéraux absent dans notre
alimentation
- décompose les toxines et les substances chimiques
dangereuse
- Produisent des substances qui influent notre odorat,
corynebacterium et staphylocoques de la peau dominent
la microbiote de la peau (odeur de notre sueur)
Partenaires ‫ش ركاءن ا‬

- appendice: servait a ré-inoculer rapidement l’intestin


en souches favorable après perturbation

- En conclusion: aucun aspect de notre biologie


n’échappe a leur intervention
• Microscope : découverte des bactéries .

• Pasteurisation

• Stérilisation
Test des postulats de Koch

- une culture pure, inoculée à des animaux sains

fait apparaître la maladie

- un micro-organisme spécifique cause une maladie


spécifique.
Micro-organismes et leur environnement naturel

• Les bactéries vivent en associations: populations

• L’habitat: lieu de vie d’une population microbienne.

• L’étude dans leur habitat = écologie microbienne.


Impact des micro-organismes sur l’Homme et
ses activités
Les micro-organisme et l’agriculture

• Dépend des activités microbiennes, les légumes se


développent en association avec des bactéries et forment
sur leurs racines des structures appelées nodosités ou
nodules.
• Nodules = les bactéries convertissent l’azote
atmosphérique en ammonium (NH3), utilisés par les
plantes pour leur croissance.
• Chez les animaux d’élevage rumen, c’est les micro-
organismes qui digère le cellulose, composant majeur
des plantes.
• Effets néfastes, maladie microbienne des plantes et
des animaux.
Les micro-organismes et les aliments

- Détérioration des aliments = perte économique

- Conservation, congélation et déhydratation ont pour


objectif de préparer des aliments sains.

- Cependant ils sont utile pour les produits laitiers


(fromage, yaourts et beurre, conserves, saucisses)

- boulangers fermentation des levures.


Les micro-organismes, l’énergie et l’environnement

• Le gaz naturel (Méthane) est produit par des µorg


méthanogènes.
• Les déchets peuvent être convertis en biocarburants
comme le méthane et l’éthanol, par leur l’activité .
• ils peuvent servir au nettoyage des pollution =
bioremédiation (hydrocarbure, solvant, pesticides…)
Les micro-organisme et les applications futures

Biotechnologies

- les OGM peuvent synthétiser des produits à haute


valeur commercial .

- L’insuline humaine, hormone qui peut être synthétiser


en introduisant le gène d’insuline chez un micro-
organisme.

- Production des protéines d’interêt commercial par


génie génétique
Maladies microbienne de l’Homme

Infections de la peau

- Impétigo: Streptococcus aureus, Streptococcus pyogénes

- Acné: Propionibactérium acnes,

- Infections des blessures: Pseudomonas aeruginosa


Maladies respiratoire:

- Diphtérie: Corynebacterium diphteriae

- Tuberculose: Mycobacterium tuberculosis

- Pneumonie: Streptococcus pneumoniae, Klebsiella


pneumoniae
Maladies bactériennes de l’appareil digestif

- Ulcères gastrique: Helicobacter pylori

- Intoxication alimentaire:

E.coli; Salmonella Typhimurium, Vibrio cholerae,

Listeria monocytogenes…
Infections Urinaires

- maladies nosocomiales les plus fréquentes

E.coli (80%), Proteus mirabilis, Pseudomonas


aeroginosa
Maladie sexuellement transmissibles (MST)

- Gonorrhée: Neisseria gonorrhoeae

- Syphilis: Treponema pallidum

- Chlamydia: Chlamydia trachomatis

Maladies transmises par des vecteurs

- Peste: Yersinia pestis…..


Maladies virales de l’Homme

- Grippe: orthomyxovirus

- Varicelle: herpesvirus; Rubéole: togavirus

- Rougeole, Oreillons : paramyxovirus

- Syndrome d’Immuno Déficience Acquise (SIDA):


rétrovirus

- Hépatite A..: Picornavirus; Ebola: Flaviviridae


actuellement moindre mortalité (pathogène)
- processus des maladies

- Amélioration des pratiques sanitaire

- Découverte des agents antimicrobiens


Menace actuel
- Certain infection liée au syndrome
d’immunodéficience acquise (SIDA)
- Pathogène multirésistant aux antibiotiques

- Mortalité continue dans les pays en voie de


développement (tuberculose, diarrhées…etc)

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