Nutrition bactérienne

I-Introduction :
Pour assurer sa croissance la bactérie a besoin généralement d’une source d’énergie, une source
de carbone, une source d’azote et d’autres éléments minéraux. De tels éléments sont appelés
besoins élémentaires. Certaines bactéries nécessitent des besoins spécifiques pour se multiplier,
de tels besoins sont appelés facteurs de croissance.

Selon la nature des besoins, on définit les types trophiques.

II- Besoins élémentaires :
II-1-Eau :
L'eau représente 70% du poids cellulaire total chez Escherichia coli. Elle solubilise les nutriments, et
joue un rôle important dans leur transport et ceci dans les deux sens. C’est le solvant de la vie,
où se déroulent toutes les réactions métaboliques (catabolisme et anabolisme).

Un paramètre appelé « activity of water », aw, ou activité de l'eau quantifie la disponibilité de

l'eau libre, non associée aux nutriments. Elle varie de 0 à 1.

Certains germes ne se développent que pour une valeur de l'Aw supérieure à 0,97. A l’opposé, les
bactéries halophiles qui nécessitent la présence de sel (NaCl, 1 à 15%) l’aw est de l’ordre de 0.75.

Les endospores peuvent survivre dans un environnement dépourvu d'eau libre. Le degré
d'humidité des aliments a une influence sur leur conservation et leur séchage. C’est un procédé de
conservation basé en partie sur la diminution de l'aw.

II-2- Source d’énergie :

Les bactéries peuvent utiliser comme source d’énergie

-Soit l’énergie lumineuse captée durant la photosynthèse (bactéries phototrophes)
-Soit l’énergie provenant de l’oxydation des molécules organiques et inorganiques (Bactéries
chimiotrophes)

a- Bactéries phototrophes :

Les bactéries phototrophes ou photosynthétiques possèdent obligatoirement un pigment

photosynthétique particulier appelé Bactériochlorophylle. Ces microorganismes obtiennent
leur énergie par des réactions photochimiques, c’est-à-dire l’énergie est fournie par la lumière
qui est captée par les microorganismes puis transformée en énergie chimique.
La photosynthèse bactérienne est différente de celle des plantes.
Chez les plantes la photosynthèse se traduit par :

Lumière
CO2 +H2O e (CH2O) + O2

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Cependant chez les bactéries phototrophes la photosynthèse se fait selon la réaction :

Lumière
CO2 + 2xH2 CH2O + 2x + H2O

xH2 est le donneur d’électrons généralement x=S. Selon les bactéries le donneur d’électrons
peut être une substance minérale, on parle de bactéries photolithotrophes.

Lumière
2CO2 + H2S+2H2O 2CH2O + H2SO4
C’est le cas des Thiorhodaceae (bactéries sulfureuses pourpres)

Lumière
CO2 + 2H2S CH2O + 2S + H2O
C’est le cas des Chlorobacteriaceae (bactéries sulfureuses vertes)

Le donneur d’électrons peut être une substance organique, on parle de bactéries

photoorganotrophes.

Lumière
CO2 + 2CH3CHOHCH3 2CH3COCH3 + CH2O + H2O
C’est le cas des Athiorhodaceae (bactéries pourpres non sulfureuses).

b - Bactéries chimiotrophes :
On les appelle aussi des chimiosynthétiques. Ce sont des bactéries qui tirent leur énergie par
oxydation des composés chimiques. Selon le donneur d’électrons, on distingue
Les chimiolithotrophes : Quand le donneur d’électrons est un composé minéral comme le fer,
le soufre ou l’azote. Ce sont des bactéries qui interviennent dans le cycle de la matière vivante
dans le sol et les eaux ; Exemple : Bactéries oxydant l’ammoniaque (Nitrosomonas), bactéries
oxydant les nitrites (Nitrobacter)
Les chimioorganotrophes : Le donneur d’électrons est un composé organique produisant
l’énergie par oxydation des composés organiques. Ce groupe représente la majorité des
bactéries à Gram négatif et la totalité des Gram positif et sont d’un intérêt médical reconnu.
La réaction type peut se résumer comme suit
DH2 + A D + AH2 + Energie D : donneur d’électrons A : accepteur d’électrons

II-3- Source de carbone :

C’est l’élément le plus abondant de la cellule. Il doit être apporté en quantité importante (peut
constituer jusqu’à 50% de la cellule). Le plus simple des composés carbonés est le CO2.
On distingue alors deux catégories de bactéries :

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Les bactéries qui ont la capacité de se développer dans un milieu inorganique contenant du
CO2 comme source de carbone, on les appelle des bactéries autotrophes.
Les bactéries qui exigent des composés organiques comme source de carbone, on les appelle
des hétérotrophes, c’est le cas de la plupart des bactéries d’intérêt médical (pathogène). Ces
bactéries ont la capacité de dégrader des substances hydrocarbonées comme les alcools, acide
acétique, acide lactique (molécule simple) et les polysaccharides (molécules complexes)
NB : Parmi les hétérotrophes, certaines espèces ont des exigences strictes Ex :
Pseudomonas methanica n’utilise que le méthane ou le méthanol.

II-4- Source d’azote :

Après le carbone c’est l’élément le plus important dans la cellule car il rentre dans la
composition des protéines bactériennes. L’azote représente 12% du poids sec des bactéries.
L’azote peut être fixé par la bactérie soit sous forme d’azote minéral ; Ex : les Rhizobium,
Azotobacter et les clostridiums, ou sous forme de NO2- (Nitrites) par Nitrobacter, soit sous
forme de composés organiques (R-NH2) dont les groupements aminés représentent la source
d’azote

II-5- Sources de phosphore et de soufre :

Le phosphore rentre dans la composition des acides nucléiques, de nombreux coenzymes et de
l’ATP. Il est incorporé dans la bactérie sous forme de phosphate inorganique. Il permet la
récupération, l’accumulation et la distribution de l’énergie dans la cellule.
Le soufre entre dans la composition des protéines précisément au niveau des groupements thiol
(-SH), des acides aminés (cystéine et méthionine).
Il est incorporé dans la cellule sous forme de sulfates, des composés soufrés organiques,
rarement sous forme de soufre réduit.
Il est également utilisé dans la synthèse des vitamines (Biotine, coenzyme)

II-6- Autres éléments minéraux :

Certains de ces éléments jouent un rôle dans l’équilibre physicochimique de la cellule, ce sont
notamment le sodium, le potassium, le magnésium et le chlore. On les appelle des
microéléments (par opposition aux macroéléments précédents)
Le potassium joue un rôle comme cofacteur enzymatique, le magnésium aussi, qui, en plus a une
fonction de stabilisateur de structures cellulaires

Le calcium joue un rôle important dans la résistance à la chaleur des endospores (chez Bacillus et
Clostridium). Il stabilise également la paroi des bactéries.

Le sodium est important pour la croissance des bactéries halophiles

Enfin le Fer, qui intervient dans la chaine respiratoire (bactéries aérobies), élément des
cytochromes au niveau de la membrane plasmique. Les bactéries possèdent des sidérophores qui
capturent le fer insoluble et le transportent à l’intérieur des cellules bactériennes.

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Quant aux oligoéléments Ils sont indispensables à la cellule en très faibles quantités. On peut citer
le cobalt, le zinc, le bore, le cuivre, le manganèse, le sélénium…Très importants pour le
fonctionnement des enzymes. Ils ne sont pas tous requis par une même espèce.

III- Besoins spécifiques (facteurs de croissance) :

Ce sont des métabolites essentiels dont certaines bactéries ont besoin, et qu’elles sont
incapables de synthétiser par défaut enzymatique (soit ils sont fournis par l’environnement ou
rajoutés dans le milieu de culture). On les appelle facteurs de croissance.
Ils peuvent appartenir à la classe des :
- Acides aminés
- Bases puriques et pyrimidiques
- Vitamine
Ils sont étroitement spécifiques, et actifs à des concentrations infimes.
Les bactéries exigeant des facteurs de croissance sont appelées bactéries auxotrophes. Les
bactéries non exigeantes sont dites prototrophes. Ex : Escherichia coli est une bactérie
prototrophe n’exigeant aucun facteur de croissance, elle se multiplie sur un milieu minimum.
La nutrition chez les microorganismes dépend de plusieurs paramètres physicochimiques, ces
derniers influencent directement la physiologie et donc la croissance des microorganismes.
Parmi ces paramètres on cite : La température, la quantité d’oxygène (O2), l’activité de l’eau,
le pH et la pression.

Type du besoin Nature du besoin Type trophique

Rayonnement
Phototrophe
lumineux

Source d'énergie
Oxydation de
composés organiques Chimiotrophe
ou inorganiques

Minéral Lithotrophe
Donneur d'électrons
Organique Organotrophe

Composé mineral Autotrophe

Source de carbone
Composé organique Hétérotrophe

Aucun besoin Prototrophe

Facteurs de
croissance
Nécessaires Auxotrophe