Microbiologie Mdicale

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I-

Dfinition :
La plupart des infections urinaires surviennent par voie ascendante (voie fcale ou cutane). On dfinit une infection urinaire comme tant une bactriurie 10 UFC/ml, selon la localisation de linfection on lappel cystite, urtrite, prostatite ou pylonphrite.

II-

Indication :
Brlures mictionnelles ; Fivre ; Chez la femme enceinte.

Rmq : 3 infections urinaires pendant un an => demander une cographie.

III-

Facteurs favorisantes les infections urinaires :

1- Facteurs lis lenvironnement :
PH > 6 (tat physiologique : PH < 5).

2- Facteurs lis la bactrie :

Certaines souches dE. Coli possdent des adhsines leurs facilitant leurs fixation la surface de la muqueuse urognitale leurs donnant ainsi une virulence particulire.

3- Facteurs lis au patient :

Anomalies congnitales de larbre urinaire (reflux vsico-urtral) ; Anomalies constitutionnelles (malformation du col vsical) ; Anomalies acquises (lithiase, faible taux dIgA scrtoires, diabte, grossesse, miction espaces.

IV-

Diagnostique biologique :
1- Recueil des urines : 2- Examen direct :
a- Examen macroscopique (prsomption dinfection):
Trouble (opaque ou translucide) ; Hmatique ; Prsence de sdiment (sil gne la lecture, le faire disparatre par chauffage).

b- Examen microscopique :
Urine non centrifuge : - Mlanger lurine par plusieurs retournements; - Observer (x40) dune goutte sur cellule de Malassez : Leucocyturie : si > 10 /ml est considre comme pathologique ; Comptage des hmaties : proviennent de lagression de la muqueuse pithliale vsicale ; Cristaux doxalates de Ca, Germes ; Cellules pithliales : desquamation naturelle. RAFUNIT | UDL 1

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Urine centrifuge (culot urinaire) : Si la leucocyturie est > 10 /ml, faire systmatiquement un Gram sur le culot urinaire (Cocci G+ Staph-Strept , BGN Klabs-Pseudo , Candida albicans). Rmq : - Toutes infection urinaire cause par Candida albicans demander un test e de glycmie (patient diabtique). - Ne pas oublier de faire une coloration de Ziehl Nelson sil ya leucocyturie sans bactriurie.

c- Mise en culture et numration bactrienne :

Technique de lanse calibre : Grce une anse de platine priodiquement calibre (10l), ensemencer sur 3 stries parallles + incubation 37C pendant 24H. OBS : - pas de colonies (culture strile) ; - 1 seul strie => bactriurie < 10 UFC/ml; - 2 stries => bactriurie entre 10 et 10 UFC/ml; - 3 stries => bactriurie >10 UFC/ml. Technique la lame immerge : Cela consiste immerger dans lurine une lame dont chacune des faces est recouvertes dun milieu glos diffrent, laisser goutter et incuber 24H 37C. La lecture se fait en comparant la densit des colonies par rapport une gamme talon [10 ,10 , 10 ]. Technique de numration de rfrence :

Aprs incubation 37C pendant 24H, chaque colonie qui pousse correspond 10 UFC/ml. La numration de la bactriurie est indispensable car elle permettra de faire la diffrence entre infection urinaire et une contamination par la flore saprophyte.

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V-

Antibiogramme avec identification des germes :

Les colonies seront ensemences dans des mini galeries biochimiques (TSI, Ure-indol, citrate de Simons ) en se basant sur les critres biochimiques de chaque germe. Lantibiogramme est systmatique, ralis sur glose de Muller Hinton avec un choix dantibiotique qui se fera en fonction du germe isol.

VI-

Critres de linterprtation de lECB des urines : Leucocyturie

< >

Bactriurie
< 10 UFC/ml 10 UFC/ml 10 UFC/ml

Culture
Ngative (+) 1 seule espce (+) Entrobactrie

Interprtation
Urine strile. I.U certaine. I.U dbutante. - I.U possible plusieurs espces ou dune espce contaminante. - Refaire un ECBU de contrle. Cas spcifique du bacille tuberculeux (faire une coloration de Ziehl Nelson. - I.U dbutante possible. - Contamination possible.

10 UFC/ml

(+) 2 ou 3 espces

< 10 UFC/ml

Ngative

<

10 - 10 UFC/ml

(+)

VII-

Germes responsables :
E. Coli ; Klabsiella ; Pseudomonas aurginosa ; Cocci gram (+) : Staphylococcus aureus Streptococcus du groupe D (en milieu hospitalier). Candida albicans chez les diabtiques dsquilibrs ou immunodficients ; Bacille tuberculleux ;

Il nest pas impossible de trouver une ou plusieurs tiologies. Rmq : Schistosoma heamatobium est un parasite responsable de la bilharziose urognitale en zone dendmie.

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