UNIVERSITE MARIEN NGOUABI

FACULTE DES SCIENCES ET TECHNIQUES

DEPARTEMENT DE BIOLOGIE

Parcours : Licence
Niveau: Licence III biologie
Numéro du groupe : VI BCM

THEME : Facteurs Influençant l’extraction des protéines

Présenté par :
OKO-MODET Benjamin D
AKOUALA MBAN Verdi R
LOUKOSSI Grace R
BOUKAS Victoire
NGUIMBI Bertron C
EGNANGA Chadie R
ELALE Reich A
TATI Félie A
MBOUALA K Yvanhe

Année : 2020-2021

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Introduction
L’extraction des protéines est une technique de la biologie moléculaire qui
consiste à isoler les protéines des autres constituants cellulaires. Elle se déroule
en plusieurs étapes allant de la lyse à la purification. Il est important de prendre
en compte les facteurs qui peuvent influencer celle-ci

Rappel

Quel que soit le type cellulaire choisit pour obtenir notre protéine il faut faire
une extraction. Pour cela il existe plusieurs méthodes pour briser la cellule parmi
lesquelles la méthode enzymatique en utilisant la protéinase kinase (cas d’une
cellule eucaryote) puis l’élimination des débris cellulaire par centrifugation.

Le principe de la centrifugation réside en une décantation accélérée qui au cours

de la séparation des composés dans le fluide r de l’axe de rotation sont soumis à
différentes forces : La force de la pesanteur descendante, la poussée
d’Archimède, la force de l’inertie, la force centripète et la force centrifuge. La
séparation s’opère sous l’action de la force centrifuge sur le composé.

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La loi de STOKES : La force exercée pour l’accélération à haute
2𝑟 2 𝑔𝑑þ
vitesse de la solution a séparé est régis par cette loi 𝑉𝑠 =
9𝑛

r : rayon de la particule en solution

𝑑þ: Difference de densité enytre la paticule et le milieu

g : accélération due à la force centrifuge

n : viscosité du milieu

2𝜋
La vitesse angulaire :𝜔 =
𝑇
𝑑𝜔
L’accélération angulaire : a=
𝑑𝑡
𝑚𝑣 2
La force centrifuge :𝐹𝑐 =
𝑅

I- Facteurs influençant l’extraction des protéines

Il existe deux types de facteurs pouvant influencer l’extraction des
protéines à savoir : les facteurs intrinsèques et les facteurs extrinsèques

I-1- Les facteurs intrinsèques

Ce sont des facteurs qui sont liés à la protéine elle-même. De ce fait
nous aurons :
L’intégrité de la protéine c’est-à-dire la conformation et la
stabilité de la protéine
La concentration de la protéine car lorsque celle-ci est
fortement concentrer, elle formera des corps d’inclusions
conduisant aux agrégats d’où la dénaturation de la protéine

L’activation des enzymes

I-2- Les facteurs extrinsèques

Ce sont des facteurs qui sont liés à l’environnement dans lequel notre
protéine se trouve. Parmi ces facteurs nous avons :

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Le PH
Les variations de PH peuvent provoquer des changements d’ionisation des
groupements impliqués dans la réaction de catalyse ou dans la fixation du
substrat

La température
Elle entraine en général une augmentation de la vitesse des réactions. Toutes
fois, au-delà d’une certaine valeur seuil propre à chaque couple protéine/
catalyseur, la variation de la température peut provoquer une altération de leur
structure tertiaire en affectant le type et la force des interactions
intramoléculaires. Or ces interactions régissent la stabilité de la structure ce qui
conduit à la perte de la fonction biologique

La solubilité
Les protéines possèdent de nombreux groupements ionisables dont les valeurs
de PKa sont différentes. Ainsi comme pour les acides aminés, les protéines
possèdent une charge nette de 0 au PH isoélectrique. Donc à ce PH les
interactions avec les molécules de solvant sont réduites. Elle est exprimée par la
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force ionique I= ∑ 𝐶𝑖 𝑍𝑖 2
2

𝐶𝑖 : Concentration de chaque espèce ionique i

𝑍𝑖 : leur charge electrique

. La solubilité des protéines dans une solution aqueuse contenant des sels dépend
de deux effets antagonistes à savoir :

L’effet salting in : Dans cet effet il y a une augmentation de la

solubilité d’une protéine dans l’eau par l’ajout de faible concentration de

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 sels. En effet les interactions d’avantages privilégiés d’où on parle d’effet
hydratant

L’effet salting out : Ici il y a diminution de la solubilité d’une

protéine dans l’eau par l’ajout de haute concentration en sels car les
interactions qui sont privilégiés ici sont des interactions hydrophobes d’où
on parle d’effet rélargant

Conclusion
En conclusion, il est nécessaire de réaliser au préalable une étude in silico car
elle nous permettra de faire une prédiction sur le PH, la température, la solubilité
ainsi que les facteurs propres à la protéine d’intérêt permettant à cette dernière
de garder son intégrité

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