É pigénétique et

Oncogenèse
Master II génétique

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Plan
Généralités
• I- Rappels

21/06/2016
• Cellule cancéreuse
• Processus de cancérisation
• II- Base moléculaire de la cancérogenèse
• Anomalies intrinsèques
• Anomalies extrinsèques
• III-Applications
• Diagnostiques
• Thérapeutiques
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Conclusion
Généralités
• Oncogenèse (du grec onkos= masse et genesis =

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naissance, formation..)
• Processus de transformation maligne  formation de
cancer
• Caractérisé par accumulation d’altérations génétiques
et épigénétique

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division cellulaire incontrôlée
Généralités
• Épigénétique
• Ensemble des mécanismes moléculaires ayant lieu au

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niveau du génome et de la régulation de l’expression
des gènes ( ADN est intacte)
• pouvant être influencés par l'environnement et
l'histoire individuelle
• potentiellement transmissibles d'une génération à
l'autre, et avec un caractère réversible

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 21/06/2016
I-Rappels

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Cellule cancéreuse
• Homéostasie tissulaire : équilibre entre

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• Prolifération cellulaire
• Différenciation ou spécialisation irréversible des
cellules
• Élimination: par sénescence ou par apoptose

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Cellule cancéreuse

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Cellule cancéreuse
• Équilibre maintenu par différents signaux sous la responsabilité

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des gènes.

Rupture équilibre
( fragile +++)

transformation cancéreuse :
Prolifération cellulaire incontrôlée
Insensibilité aux signaux extérieurs

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Anomalies génétiques et environnementaux
Cellule cancéreuse

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Cellule cancéreuse

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Cellule cancéreuse
• Caractéristiques:
• 1-Independence vis a vis des signaux de prolifération

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• 2- insensibilité aux signaux antiprolifératifs:
• Inactivation des 2 verrous du cycle cellulaire ( pRB
et p53)
• Leur orientation vers le système de dégradation des
protéines (le protéasome).
• 3-Résistance à l’apoptose:
• Activation facteurs anti)apoptotiques( bcl2…)
• Inhibitions p53 et facteurs pro-apoptotiques( BAX…)
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Cellule cancéreuse
• Caractéristiques:
• 4-Proliferation illimitée:

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• Réactivation de la télomérase
• Persistance des télomères
• 5- Néoangiogenèse
• 6- Interactions avec son environnement:
• Perte inhibition de contact
• Capacité de croissance des cellules transformées

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Cellule cancéreuse

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Processus de cancérisation
• Cancer: prolifération clonale (à partir d’une seule cellule)

21/06/2016
• Développement d’une tumeur survient par étapes
successives:
• une seule altération de l’ADN ne suffit pas
accumulation de plusieurs évènements génétiques
ou épigénétiques
• Avantage sélectif des cellules tumorales/cellules
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normales
Processus de cancérisation
• Développement d’une tumeur survient par étapes

21/06/2016
successives:
• Développement de /s populations cellulaires ayant
acquis des modifications génétiques supplémentaires
 pouvoir sélectif: meilleur pouvoir de prolifération
de survie ou invasif et transmission aux cellules filles
• La cellule cancéreuse est caractérisée par une instabilité
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génétique ( nombreuses anomalies chromosomiques)
Processus de cancérisation

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Processus de cancérisation

21/06/2016
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 21/06/2016
II- Base moléculaire de la
cancérogenèse

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Anomalie intrinsèques
• Cancer :
• anomalie intrinsèque de la cellule

21/06/2016
• altération de son génome (ADN).

• Origine :
• 1-Génétique
• 2-Epigénétique
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1-Anomalies génétiques
• Surviennent
• 90% des cas dans cellules somatiques  altérations

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acquises
• 10% des cas dans cellules germinales 
prédispositions héréditaires aux cancers

• Secondaires à l’intervention de facteurs exogènes ou

endogènes (agents chimiques, toxiques, infectieux…)

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1-Anomalies génétiques
• Type d’ altérations génétiques
• Mutations

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• Délétions chromosomiques
• Translocations
• Amplifications
• Réarrangements géniques
• Modification de l’expression ou de la fonction
biochimique des gènes

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1-Anomalies génétiques
• Altérations activent 2 grands groupes de gènes :
• Oncogènes (gain de fonction / mode dominant)

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• Gènes suppresseurs de tumeurs (perte de fonction/
mode récessif)
• Gènes impliqués dans le contrôle de la prolifération
et de la survie cellulaire
• Gènes de surveillance et de maintien de l’ intégrité́
du génome.

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Oncogènes et Proto-oncogènes(1)
• régulateurs positifs (moteurs) de la prolifération
cellulaire.

21/06/2016
• codent pour des protéines de différentes natures
• facteurs de transcription
• Facteurs de croissance
• récepteurs tyrosine kinase
•…

• Protéine régulant positivement la croissance ou la survie

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cellulaire
Oncogènes et Proto-oncogènes(2)
• Il suffit qu'un seul des 2 allèles soit altéré pour observer
l'effet oncogénique (mode dominant).

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• Exemples d’oncogènes:
• Gène RET (récepteur à activité́ tyrosine kinase) muté
• Her2
• Bcr-Abl
• N- Myc

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Oncogènes et Proto-oncogènes(3)

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Oncogènes et Proto-oncogènes(4)

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Gènes suppresseurs de tumeurs(1)
• Régulateurs négatifs (freins) de la prolifération cellulaire
ou activateurs de la mort cellulaire

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• Perte de leur fonction  progression tumorale
• Altération du gène suppresseur de tumeur

perte de fonction de la protéine correspondante

• 2 allèles du gène devant être altérés pour observer l'effet

oncogénique (mode récessif)
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Gènes suppresseurs de tumeurs(2)
• 1-Gènes impliqués dans le contrôle de la prolifération et
de la survie cellulaire (gatekeepers en anglais).

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• p53: perte de la E-cadhérine et des molécules du CMH
• pRb (protéine du rétinoblastome)
• Pour de tels gènes, la réintroduction dans la cellule
cancéreuse d'un gène fonctionnel aboutit à une
réversion du phénotype tumoral

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Gènes suppresseurs de tumeurs(3)
• 2-Gènes du maintien de l’intégrité́ du génome
(caretakers en anglais)

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• limitent le taux de mutation de l’ADN
• gènes de réparation de l’ADN au cours de la division
cellulaire
• leurs mutations n’ont pas de conséquences directes sur
la prolifération cellulaire, elles vont provoquer une
instabilité génétique accrue.
mutations de gènes qui eux seront des oncogènes ou des 29

suppresseurs de tumeurs.
Gènes suppresseurs de tumeurs(4)
• SYSTÈME MMR (MisMatch Repair): Microsatellites
• séquences faites de répétitions (x20) en tandem de

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nucléotides ubiquitaires dans le génome (AAA) ou (CACA..)
• Particulièrement fragiles et lors de la réplication de l’ADN,
elles peuvent être raccourcies ou rallongées
• En l’absence de réparation post-réplicative efficace dans la
tumeur, les erreurs persistent et se transmettent lors de la
réplication suivante

émergence et persistance d’allèles de taille différente au

niveau des cellules tumorales  instabilité des
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microsatellites
2-Anomalies épigénétiques
• Modifications de l’expression des gènes non liées à des
modifications de la séquence de l’ADN

21/06/2016
• Les cellules de 2 tissus différents ont le même génome
mais diffèrent par leur épigénome
• Modifications épigénétiques:

Cible = nucléosome (ADN + histone)

• Méthylations aberrantes de l’ADN au niveau des ilots
CpG
• Modifications post-traductionnelles des extrémités des
histones 31
Méthylation aberrantes des
ilots CpG(1)
• 4 à 6 % des cytosines sont methylées dans le génome
humain

21/06/2016
• Mécanisme: addition covalente d’un groupement méthyl
(CH3) en position 5 d’une cytosine dans un nucléotide
CpG
• Méthylation = signal de fermeture du gène
• En situation normale:
• Répartition de la méthylation au niveau des régions
codantes; inter-géniques et des éléments répétés
• +/- au niveau des promoteurs de certains gènes
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Méthylation aberrantes des
ilots CpG(2)
• En situation tumorale: méthylation inversée
• Hypométhylation le long du génome:

21/06/2016
• Réactivation des transposons
• Instabilités des chromosomes
• Activation de l’expression d’un proto-oncogène
• Hyperméthylation des régions promoteurs:
• Inhibition de la transcription des gènes
suppresseurs de tumeurs

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Méthylation aberrantes des
ilots CpG(3)
• Conséquence de la méthylation : phénomène d’
empreinte parentale

21/06/2016
• Processus responsable de l’ expression monoalléllique
d’un gène
• Phénomène réversible, héréditaire et affecte
l’expression des gènes
• Empreinte est tissu spécifique : processus de
méthylation de novo à des sites spécifiques dans les
cellules germinales (trentaine de gènes)
• Conflit d’intérêt parental: empreinte paternelle=
chromosome paternel non exprimé 34
Modifications des histones(1)
• En situation normale:
• acétylation des histones  chromatine relâchée,

21/06/2016
accessible aux complexes de transcription (FT, HAT
(protéines acétylant les histones, CA co-A
transcriptionnels)
• En situation tumorale:
• Modifications de la chromatine  « inactive » car
dans une configuration « condensée » ne permettant
pas l’accès aux facteurs de transcription, empêchant
ainsi l’expression des gènes associés.
35
Modifications des histones(2)
• Mécanismes de modifications:
• approchement des nucléosomes qui favorise

21/06/2016
l’inactivation de la chromatine
• les modifications post-transcriptionnelles des histones:
• Acétylation: activation de la transcription
• Méthylation: mono, di ou trimethylé
• Phosphorylation: activation expression génique
• SUMOylation : réprime expression génique
• Ubiquitination : active transcription génique
• ADP Ribosylation : mécanisme? Action synergique
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avec l’acétylation
Modifications des histones(3)
• Enzymes impliqués:
• DNA-méthyl-transférases (DNMT)

21/06/2016
• histones acétyl-transférases (HAT)
• les histones déacétyl-transférases (HDAC)
• les histones méthyl-transférases (HMT)
• les histones déméthyl-transférases (HDT).

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Modifications des histones(4)

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Modifications des histones(5)
• Au cours de la progression tumorale, il coexiste des anomalies

21/06/2016
génétiques souvent associées à une dérégulation
épigénétique, liée à la fois à une Hypométhylation globale de
régions centromériques et péricentromériques, et à une
Hyperméthylation aberrante des îlots CpG des régions
promotrices de gènes impliqués dans l’oncogenèse, conduisant
à une inactivation de gènes suppresseurs de tumeur impliqués
dans le cycle cellulaire (p15INK4B, p16INK4A), l’apoptose (p73),
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la réparation de l’ADN (MLH1), et l’angiogenèse (CDH1).
2-Anomalies épigénétiques

21/06/2016
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2-Anomalies épigénétiques

21/06/2016
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2-Anomalies épigénétiques

21/06/2016
42
2-Anomalies épigénétiques
• L’âge est à l’origine d’Hyperméthylation des promoteurs

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(cancer colorectal)
• Les facteurs environnementaux pourraient induire des
modifications épigénétiques +++ dont certaines
pourraient se transmettre aux générations
• Alcool?
• Stress?
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• Etat psychologique ?
Anomalies extrinsèques

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 21/06/2016
III-Applications

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Applications diagnostiques
• Techniques d’étude:
• Cytogénétique: caryotype, FISH  anomalies

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chromosomiques
• Biologie moléculaire: PCR+++  Hyperméthylation…
• Ex : gène p15 (CDKN2B): gène suppresseur de
tumeur situé sur le chromosome 9, qui code pour
un inhibiteur d’une cycline-dependant-kinase
(CDK),inhibant ainsi la progression du cycle
cellulaire de la phase G1 à la phase S

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Applications diagnostiques
• Meilleure compréhension de certaines pathologies
• HPV et cancer du col de l’ utérus

21/06/2016
• Hypométhylation et cancer colorectal
• Glioblastome de l’enfant et modification de l’histone
H3
• Gene N-Myc et neuroblastome
• Activité tyrosine kinase et Bcr-Abl
• Dans les maladies inflammatoires: LED et PR

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Applications diagnostiques

21/06/2016
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Applications thérapeutiques
• Thérapies ciblées :
• Génétiques

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• Epigénétique
• Un gène thérapeutique antitumoral peut être utilisé pour
tenter d’interférer avec les anomalies du cycle cellulaire
• pour détruire les cellules cancéreuses

• Pour augmenter leur reconnaissance et leur élimination

par le système immunitaire
49
• Pour ralentir leur invasion ou leur dissémination
Applications thérapeutiques

21/06/2016
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Applications thérapeutiques

21/06/2016
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Applications thérapeutiques
• Utilisation de biomarqueurs
• Freiner Hyperméthylation

21/06/2016
• Empêcher Hypométhylation
• Inhiber la compaction de l’ADN

• Palier aux phénomènes épigénétiques des cancers

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Conclusion
• Phénomènes épigénétiques:
• Complexes

21/06/2016
• Intriguées aux phénomènes génétiques
• Permis une compréhension de la pathogénie cancéreuse
et de leur transmission
• Amélioration des techniques de biologie moléculaire
• Développement de nouvelle thérapie ciblée pouvant agir en
amont de la formation de la cellule cancéreuse.

• Cependant il faut poursuivre les recherches pour mieux

comprendre la régulation de ces phénomènes 53
épigénétiques.
Références
•Roel H. Wilting, Jan-Hermen Dannenberg:
Epigenetic mechanisms in tumorigenesis, tumor cell heterogeneity and drug
resistance , Drug Resistance Updates 15 (2012) 21–38

21/06/2016
•Stephen B. Baylin : Epigenetics and Cancer

•CAROLINE OSPELT • STEFFEN GAY : Epigenetics , CHAPTER 22, PART 3 |

EFFECTOR MECHANISMS IN AUTOIMMUNITY AND INFLAMMATION

•Eric R. Fearon : Genetic and Epigenetic Alterations in Cancer , Part I: Science

of Clinical Oncology , Genetic and Epigenetic Alterations in Cancer • CHAPTER
13

54
•
 21/06/2016
Merci de votre attention

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