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Agreg2014 Parties - 1 3
Agreg2014 Parties - 1 3
Alix Helme-Guizon
BCPST-Véto Lycée Le Fresne
alix.helme-guizon@educagri.fr
http://prepaangers.weebly.com
Ce diaporama est conçu pour être imprimé avec 4 diapo sur une même page A4
Définitions
• Une population est composée d’individus d’une même
espèce rencontrés dans un milieu donné (biotope), qui se
reproduisent et engendrent une descendance féconde.
• Les limites de la population peuvent être naturelles ou fixées
par l’expérimentateur pour une étude (on parle alors de
population statistique, exclu ici)
• Une population a une structure : densité, mouvement des
individus, proportion des individus dans chaque classe d’âge,
variabilité génétique, taille et organisation des surfaces
d’habitat.
Exemple de Problème à résoudre :
le compte des moutons sur une île
• 1932 introduction de moutons
sauvages de Soay (Ecosse) sur
l’île de Hirta, pour sauver la
race
• Race la plus proche des
moutons domestiques
• Pas de prédateur
Comptage annuel : effectifs varient du simple au double
d’une année sur l’autre!
I. L’effectif d’une population varie
au cours du temps
1.1) Les paramètres démographiques
contrôlent les effectifs de la population
Imaginez quels sont les facteurs
susceptibles de modifier les effectifs
d’une population naturelle
d’animaux ou de plantes
(=démographie)
Représentez-les sur un
schéma de synthèse
11.2. L’expérimentateur regroupe les
observations dans une table de survie
• Origine : assurance-vie début XXème siècle -> pour
déterminer espérance de vie moyenne
• Table de survie = recensement pour chaque âge du nombre
d’individus vivants dans une population
• Cohorte = groupe d’individus du même âge
• On calcule le taux de survie (ou de mortalité) de la cohorte
d’une tranche d’âge à une autre.
Table de survie de Spermophiles de Belding en Californie
FEMELLES MALES
Âge (an) Nb de Nb de Taux de Nb de vivants Nb de Taux de
vivants au morts mortalité au début de morts survie
début de durant l’intervalle durant
l’intervalle l’intervalle l’intervalle
0-1 337 207 0,61 349 227 0,65
1-2 252 125 0,5 248 140 0,56
2-3 127 60 0,47 108 74 0,69
3-4 67 32 0,48 34 23 0,68
4-5 35 16 0,46 11 9 0,82
5-6 19 10 0,53 2 2 1
6-7 9 4 0,44 0
D’après Campbell
7-8 5 1 0,2 Calculez les taux
8-9 4 3 0,75 de mortalité
manquants et
9-10 1 1 1 concluez
Diagnostic
11.3. Il existe 3 types de courbe de survie
À partir des tables
de survie, on trace
des courbes de
survie (souvent en
échelle
logarithmique)
NB : ici on est parti de
1000 naissances,et non
337 comme dans l’ex
précédent)
Campbell
Les 3 courbes de survie
Campbell
Les 3 courbes de survie
Très faible mortalité des jeunes
(soins à peu de rejetons) et des adultes
Mortalité
Très constante Grands
forte mammifères
mortalité Rongeurs,
juvénile invertébrés,
Plantes, certains lézards et
poissons, plantes annuelles
invertébrés
marins à
coquille
D’après Campbell
• Origine des 3 types de courbes de survie
– Le soin des adultes envers les jeunes détermine leur taux de survie
– Meilleur taux de survie : peu de descendants et beaucoup de soins
(stratégie dite « K ») =/ nb descendants abandonnés (« r »)
Fécondité
Taille
suffisante
ou âge
114.2) En cas de reproduction sexuée, le sex-ratio et la
fécondité déterminent le taux de reproduction
Le sex-ratio est le pourcentage de femelle
dans une population sexuée. Seules les
femelles produisent des descendants par
reproduction sexuée.
L’âge reproductif est l’âge à partir duquel une
femelle peut se reproduire, et sa fécondité le
nombre de descendants par femelle.
Campbell
À retenir
En absence d’échange avec une autre population, les deux principaux facteurs
qui déterminent la taille d’une population sont :
1. Le taux de survie des individus
2. Le taux de reproduction
dN/dt= rN
Déduisez-en l’aspect de la
courbe d’évolution
temporelle de la population
121.2. Dans un milieu aux ressources illimitées, la
population a théoriquement une croissance
exponentielle
Pour pouvoir utiliser l’équation précédente sur plus d’une saison reproductive, il faut
que :
- Les ressources du milieu soient illimitées : tous les individus ont accès à une
nourriture abondante
- Les individus se reproduisent au maximum de leurs capacités reproductives, sans
être influencés par la densité de population.
On a alors le taux maximal d’accroissement par individu par unité de temps r= rmax
Soit N=N0.e rt
http://max2.ese.u-psud.fr/epc/conservation/L3-BOE-ECEF/ppt/ECOI_DynPop_01032012.pdf
l’évolution de la
population
mondiale, entre
1900 et 2012
http://www.noorinfo.com/notes/Demographie-infographie-La-population-mondiale-multipliee-par-4-5-en-un-
siecle_b5794451.html
1966
Révolution culturelle
Enfant unique
Grand bond en
avant 40M morts
1.2. les effectifs peuvent dépendre de…
12.2. Facteurs dépendant de la densité
Facteurs indépendant Facteurs dépendant
de la densité de la densité
Climat : Compétition intraspécifique :
• Lumière, Température • Quantité de nourriture
• Humidité, Vent • Surpopulation (Réduction de la
• Sol fertilité)
• Qualité de la nourriture • Formation de territoires
• Migrations
• Cannibalisme
𝑑𝑁 𝑵
= rmax N 1−
𝑑𝑡 𝑲
Terme qui montre l’effet néfaste de la
densité de peuplement
Calcul de l’équation
de la courbe logistique
Il en résulte que, aussi longtemps que la population reste inferieure `a sa
capacité limite du milieu K, elle ne cesse de croitre (puisque N0 > 0).
Et on calcule facilement la limite, quand t tend vers l’infini, de l’expression
trouvée pour la solution N(t), qui vaut précisément K.
A l’inverse, si N(t) est supérieure à cette capacité, N(t) décroıt (puisque N0
< 0) et on vérifie facilement qu’elle tend également vers K.
Campbell
Le parc Kruger à la frontière entre l’Afrique du Sud et le Mozambique a
été colonisé par un petit groupe de 10 éléphants en 1905,
vraisemblablement venu du Mozambique. Des mesures de protection
strictes, à la fois des animaux et de leur habitat furent décidées dans ce
parc et maintenues tout au long du 20e siècle. Elles permirent une
croissance naturelle de cette population jusque dans les années 60, où
le parc devint surpeuplé, et les baobabs ravagés. Pour décider de
l’attitude à adopter pour gérer au mieux les populations de ce parc, les
responsables eurent recours à un modelé mathématique appelé modelé
logistique.
Montrez que ce modèle logistique peut bien rendre compte de l’évolution
de cette population.
t 1905 1923 1930 1939 1945 1950 1960 1970 1980 1990 2000
Nb 10 13 29 450 980 3010 5800 6500 7400 7200 7310
d’indi
vidus
122,5. Sans prédation ni compétition, les
populations unicellulaires suivent le modèle
logistique …
Bon modèle pour les cultures et élevages
de :
- Bactéries
- Unicellulaires : levures, daphnies,
paramécies
- Petits animaux : coléoptères, crustacés.
Campbell
… à conditions que le biotope reste stable…
Campbell
Ancienne édition
(supprimé dans la
nouvelle)
… mais l’ajustement n’est pas instantané
Dépassement
temporaire de la
capacité limite du
milieu
Le modèle suppose un ajustement
instantané de la taille de la
population aux capacités du milieu.
Or le manque de nourriture ralentit
la reproduction, mais les femelles
(ou cellules) ont des réserves ->
dépassement temporaire de la
capacité limite du milieu K.
Campbell
Le retard d’ajustement modifie la capacité limite du milieu
parasites
Capacité d’un
milieu
endommagé
122.6. La densité de population accroît la
compétition et diminue la fécondité
Compétition pour
Compétition les ressources Taux de fécondité À part ces
intraspécifique (nourriture ou la qui diminue avec relations
lumière (plantes) et les interactions interspécifiques,
Parfois rejets habitat ou territoire agressives
toxiques : levure le taux de
(animaux)
tolère seulement mortalité est
20% éthanol indépendant de
la densité !
Transmission de Relations
Prédation interspécifiques
pathogènes
Densité et fécondité
Campbell
Campbell
Conclusion sur l’évolution d’une population
fermée sans prédation
• Les facteurs du milieu sont indépendants de la densité et déterminent le
taux de survie
– Nourriture pour les animaux et unicellulaires, sels minéraux et lumière pour
les plantes
– Abri et territoire
– Aléas climatiques, agents pathogènes
– > L’effet du biotope est pris en compte dans le modèle de croissance
exponentiel
Quels peuvent
être les biais de
cette méthode?
Compétence : hypothèses
2 hypothèses pour expliquer ces cycles de 10 ans
Analyse de données,
raisonnement
𝑑𝑃
= a bH HP –bPP
𝑑𝑡
rH
Ṕ=
bH
Croissance de la
population de
réduction
prédateurs car il y a
croissance beaucoup de proies
Réduction du prédateur
Croissance de la proie La population
Croissance de proies croît
proie et car il n’y a pas
Isocline à
beaucoup de
l’équilibre du prédateur
𝒓 prédateurs
prédateur Ṕ= 𝒑
Réduction des
proies car il y
Réduction proie Croissance prédateur a trop de
et prédateur Réduction de la proie prédateurs
Isocline à l’équilibre
𝒓
du prédateur Ṕ= 𝒑
Indiquez sur le
graphique comment
évoluent les 2
populations (sans vous de proies
aider des courbes!)
Faible densité de la
population de proies
𝑑𝑁 𝑵
Équation logisitique = rmax N 1−
𝑑𝑡 𝑲
r= taux de K = capacité limite du milieu = nb
reproduction max d’individus que le milieu peut
individuel abriter et nourrir sans se dégrader.
Sélection Sélection
indépendante de dépendante de la
la densité densité
𝐾
N(t) = 𝐾−𝑁0
1+
𝑁0
𝑒 −𝑟𝑡
Stratégies démographiques
En théorie… …En réalité
Wikipedia
2) Homard : http://www.youtube.com/watch?v=h6nhOChpMck
-> À partir de 2ème min
- Lobster : Homard
- Shallows : haut-fonds
Conclusion sur l’évolution des populations
• Les facteurs qui contrôlent les effectifs d’une population sont la
natalité, la mortalité, le sex-ratio et la fécondité. Cela détermine
le taux d’accroissement r de cette population.
• Les facteurs du milieu sont indépendants de la densité et
déterminent le taux de survie. La capacité limite du milieu, K,
décrit sa capacité maximale à nourrir et abriter sans se dégrader.
Ces facteurs sont ceux qui limitent l’extension des populations
d’espèce à stratégie r (avec la prédation).
• La densité fait diminuer la fécondité par la compétition
intraspécifique. Cela limite les effectifs des population à stratégie
K.
• La prédation est un facteur de fluctuation des effectifs, selon un
modèle cyclique quand on a affaire à 1 espèce de proie pour 1
espèce de prédateur.
• Utilité : Les modèles mathématiques permettent de prédire
l’évolution des populations d’espèces protégées ou invasives et
sont une base pour prendre des décisions en matière de gestion
écologique.
Une prairie de montagne vient d’être dévastée
par une coulée de boue. Les premières espèces
à recoloniser cet espace seront :
1- Les chênes grâce aux glands produits par les
chênes adultes de la haie
2- Les herbacées, grâce aux akènes provenant
des prairies voisines
3- Les vaches, provenant du pré voisin
4- Les mulots, dès qu’ils pourront à nouveau
Un arbre est une espèce à stratégie creuser des terriers
1- « K »
2- « r » Une population de mulots présente de grandes fluctuations
d’effectifs, alors que la population de buses est stable. Ces
3- « K » et « r » fluctuations de la population de mulots sont dues à :
4- ni « K » ni « r » 1- La prédation, selon le modèle de Lokta-Volterra.
2- La stratégie « r » des mulots.
3- Au climat est très variable, ou des épidémies.
4- Il est impossible de le savoir.
II. L’espèce est formée de populations
interconnectées
2.1. Diversité des populations d’une espèce et notion
d’écotype
2.1.1. Il y a une grande diversité des populations d’une espèce
Parus caeruleus 18 mesures pour
analyser le phénotype
des populations
européennes,
d’Afrique du Nord et
des îles Canaries
1277 mâles
Petits oiseaux
Bec fin adapté aux aiguilles de Pin
21.2.Une métapopulation est ensemble de populations
interconnectées par la dispersion
La connectivité des populations d’une espèce est un gage
de son maintien dans le temps et l’espace
• Une population locale habite dans une tache d’habitat (« habitat patches »). À
un moment donné, une tache d’habitat peut être inoccupée, et peut alors être
colonisée par des individus provenant d’une autre tache.
• Les perturbations (biotope, prédateurs) sont susceptible de faire disparaitre
certaines populations locales.
• L’espèce ne disparait pas de cette zone par recolonisation à partir d’une autre
population locale. On parle de population Source et population Puits
• Cette connectivité limite les différences génétiques entre populations et
s’oppose à la spéciation (voir cours sur l’évolution)
dispersion
Population locale Population
SOURCE locale PUITS
Flux d’allèles
La métapopulation est l’ensemble de populations d'individus d'une
même espèce séparées spatialement ou temporellement et étant interconnectées par
la dispersion.
Village
corridor
Haies
Corridor
(trame verte) (trame bleue)
Population
Dispersion locale 1
Flux d’individus
ou de semences
Population
éteinte
dans cet Habitat
habitat inoccupé
actuellement
21.3. Les populations locales peuvent former
des écotypes ayant des adaptations locales
Un écotype est une population locale d'une espèce donnée qui présente des
caractéristiques nouvelles adaptées à un habitat particulier. Les caractéristiques
propres à l'écotype sont héréditaires.
Achillea millefolium
On a fait pousser des
graines provenant de
différentes altitudes
dans les mêmes
conditions, durant
plusieurs générations
Ricklefs et Miller
« écologie » De Boeck
2.2. les populations peuvent diverger
génétiquement… Effet fondateur
ou goulot d’étranglement
Adaptation Migration
interpopulationnelle
(par sélection naturelle)
Population
différente
évolution
La biodiversité des plantes alimentaires :
un enjeu largement ignoré
Vidéo sur la Pomme de Terre dont la biodiversité est maintenue par les paysans
des Andes (American Museum of Natural History) en anglais sous titré:
http://www.amnh.org/explore/science-
bulletins/(watch)/bio/documentaries/potato-biodiversity-ensuring-the-future
Threat = menace
Breeders = semenciers qui font des croisements
Nouveaux phénotypes
3.2. à l’équilibre, le modèle d’Hardy-Weinberg
permet de calculer les fréquences alléliques
32.1. Le modèle d’Hardy Weinberg repose un
accouplement aléatoire et une absence de sélection
5 Hypothèses :
1. Pas de mutation qui modifie les allèles étudiés;
2. La reproduction est sexuée, avec des croisements totalement
aléatoires = panmixie (gamètes équiprobables, pas de sélection du
partenaire, ni d’obstacles aux rencontres ni à l’autofécondation);
3. Pas de sélection naturelle qui modifierait la probabilité de survie
ou de transmission de certains génotypes;
4. La taille de la population est très grande, si bien qu’il n’y a pas de
dérive génétique
5. Il n’y a pas de flux génétique, c’est-à-dire d’apports ou de retraits
d’individus ou d’allèles à cette population par migration.
Évalue l’effet du brassage génétique seul, on parle de « modèle nul »
32.2. Dans ce cas, les fréquences alléliques
restent constantes
Campbell
• [AA] a une fréquence de p2, [aa] a une fréquence de q2
[Aa] a une fréquence de 2pq car c’est [aA] ou [Aa] selon l’origine maternelle ou
paternelle de chaque allèle.
• Justifiez que p2 +2pq +q2=1 : c’est la somme des fréquences de tous les
génotypes possibles, donc 100%
• [AA] forme 100% de gamètes ou spores [A]. Ils ont donc une fréquence de
1*p2
• [aa] forme 100% de gamètes [a]. Ils ont donc une fréquence de 1*q2
• [Aa] forme 50% de gamètes [A] et 50% de [a]. Chacun a une fréquence de
0,5*2pq =pq
• Donc un gamète [A] a une fréquence de : pq +p2; un [a] de pq +q2
• Par fécondation, on obtient les 3 mêmes génotypes qu’à la génération
précédente
• [AA] a une fréquence de (pq +p2)2 = p2 (p+q) 2 = p2 car p+q =1
• [aa] a une fréquence de (pq +q2)2 = q2 (p+q) 2 = q2 car p+q =1
• [aA] peut être une réunion de A et a ou a et A, sa fréquence est donc de 2(pq +
p2)(pq +q2)= 2p(q+p)q(p+q) =2pq
CCl : les fréquences restent constantes lors du brassage génétique
de la reproduction sexuée si les accouplements sont aléatoires.
3.3. les fréquences alléliques ne suivant pas le
modèle d’Hardy-Weinberg quand…
33.1) … il y a action de facteurs internes : déterminisme du sexe
Chez les mammifères le sexe est mâle déterminé chromosomiquement par la présence
du chromosome Y, et génétiquement par le gène SRY (Sex determining Region, Y
chromosome)
La fréquence de l’allèle normal SRY sur Y n’est En cas de mutation qui rend SRY non
pas p2 mais p, et p=1 chez les mâles; p= 0 chez fonctionnel, on obtient le
les femelles. En effet tous les XX qui sont mâles développement « par défaut » qui est
(3/20000) ont cet allèle. femelle, même avec XY.
m/s n° 4, vol. 1 1, avril 95
Cas de gènes portés par le chromosome X
Le daltonisme (cécité des couleurs rouge/vert) est un caractère
récessif lié au sexe qui, en France, atteint 8% des garçons et 0,45%
des filles.