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Cofacteurs et Coenzymes

1 – Les Cofacteurs
Certaines enzymes ne nécessitent aucun groupement chimique pour être activées outre leurs
propres acides aminés.
D’autres nécessitent la présence d’un groupement chimique: le cofacteur.

Les enzymes possèdent, en plus de leur partie protéique, l’apoenzyme,


une petite partie non protéique, le cofacteur.
Combinaison de l’apoenzyme et du cofacteur: Holoenzyme ayant une activité biologique.

Cofacteur:
 un ou plusieurs ions inorganique Fe2+, Mg2+, Mn2+ , Zn2+

Coenzyme:
 un complexe organique ou une molécule métalloorganique

Certaines enzymes nécessitent à la fois un coenzyme et un ou deux ions métalliques.

BCH 210 Vitamines et Coenzymes 2020-2021 2


Cofacteurs et Coenzymes
2 – Les Coenzymes
Les Coenzymes

Activateurs chimiques

Molécules organiques de petites tailles, liées par des liaisons faibles à l´enzyme

Cofacteurs organiques, Dérivés de vitamines

Les vitamines sont en général des précurseurs de coenzymes.

Les coenzymes sont définies comme des composés organiques de faibles poids
moléculaires, thermostables, nécessaires à l’ activité enzymatique.

La plupart des coenzymes sont liées aux enzymes par des forces non covalentes.
Celles (ainsi que les ions métalliques) qui établissent des liaisons covalentes avec les enzymes
peuvent aussi être appelées groupements prosthétiques.
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Cofacteurs et Coenzymes
2 – Les Coenzymes
Les enzymes qui requièrent des coenzymes comprennent celles qui catalysent:
Les réactions d’oxydoréduction (Classe 1) Classe 1: Oxydoréductases
(catalysent des réactions redox)
Le transfert de groupes (Classe 2)
Classe 2: Transférases
Les réactions d’ isomérisation (Classe 5) (catalysent le transfert d’un groupe d’une
molécule à une autre)
Les réactions qui forment des liaisons covalentes (Classe 6)
Classe 3: Hydrolases
(catalysent la coupure d’une liaison par
hydrolyse)

Classe 4: Lyases
(coupent ou forment des liaisons sans
participation d’une étape d’oxydation ou
d’hydrolyse)
Classe 5: Isomérases
(catalysent des modifications à l’intérieur
d’une molécule)
Classe 6: Ligases
(associent deux molécules grâce à
EA 2017 Etudiants IAMA l’énergie d’une liaison riche en énergie) 4
Cofacteurs et Coenzymes
2 – Les Coenzymes
Certaines coenzymes servant de transporteurs transitoires
d’atomes et de groupements fonctionnels spécifiques

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Cofacteurs et Coenzymes
2 – Les Coenzymes
Rappels Vitamines Précurseurs de Coenzymes

Selon leur solubilité, on distingue les vitamines liposolubles et les vitamines hydrosolubles.

Les vitamines liposolubles sont les vitamines A, D, E et K.

Les vitamines hydrosolubles sont toutes membres du complexe B (sauf la vitamine C).

Vitamines Hydrosolubles

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Cofacteurs et Coenzymes
2 – Les Coenzymes
 Vitamine B1, la Thiamine: La Thiamine active est la thiamine-diphosphate (TPP, « thiamine
pyrophosphate »). Il s’agit d’une coenzyme dans les réactions enzymatiques comportant le
transfert d’un groupement aldéhyde activé.

 Vitamine B2, la Riboflavine: De nombreuses enzymes à flavine renferment un ou plusieurs


atomes métalliques, tels le fer, comme des cofacteurs essentiels; il s’agit des métallo-
flavoprotéines.

 Vitamine B3, la Niacine: La Niacine active est le Nicotinamide Adénine Dinucléotide (NAD+) et
le Nicotinamide Adénine Dinucléotide Phosphate (NADP+). Ce sont les coenzymes de
nombreuses oxydoréductases.

 Vitamine B5, l’Acide Pantothénique: L’Acide Pantothénique existe sous deux formes actives : la
coenzyme A (CoA) et la protéine qui transporte les groupements acyles (Acyl Carrier Protein).

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2 – Les Coenzymes
 L’ Acide Folique: La forme active du folate est le tétrahydrofolate (H4Folate) THF. La
complexité des interactions de la vitamine B12 et du folate est une conséquence de leur
participation commune à la réaction catalysée par la méthionine synthase.

 La Vitamine B6, Pyridoxine, Pyridoxal, Pyridoxamine: La forme active est le phosphate de


pyridoxal. Il s’agit de la principale coenzyme ayant une activité de vitamine B6; le phosphate de
pyridoxamine peut aussi agir comme coenzyme active. Le phosphate de pyridoxal est la
coenzyme de plusieurs enzymes du métabolisme des acides aminés et intervient également
dans la glycogénolyse.

 La Biotine: La Biotine est liée dans l’organisme de façon covalente aux résidus lysine
d’enzymes qui catalysent des réactions de carboxylations grâce à leurs chaînes latérales lysine.
La Biotine est une coenzyme des carboxylases.

 La Vitamine B12, Cobalamine: Les formes actives sont la méthylcobalamine et la


désoxyadénosylcobalamine. La complexité des interactions de la vitamine B12 et du folate est
une conséquence de leur participation commune à la réaction catalysée par la méthionine
synthase. EA 2017 Etudiants IAMA 8
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2 – Les Coenzymes

La Vitamine C, Acide Ascorbique

Dans nombre de fonctions, le mécanisme d’action de l’acide ascorbique est loin d’être clair :
l’acide ascorbique n’agit pas toujours directement, mais il est nécessaire pour maintenir des
ions comme le Cu+ ou Fe2+ à l’état réduit. Il s’agit de cofacteurs métalliques intervenant
respectivement dans les monooxygénases et dans les dioxygénases.

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Cofacteurs et Coenzymes
3 – Les Ions métalliques
Les ions métalliques en tant qu´activateurs chimiques,
sont parfois nécessaires au bon fonctionnement du site actif de l´enzyme.

Les ions métalliques peuvent faciliter la fixation des substrats et la catalyse.

Plus de 25% de toutes les enzymes - contiennent des ions métalliques fermement liés
ou - requièrent des ions métalliques pour leur activité

Rôles des ions métalliques dans la catalyse enzymatique

Les métalloenzymes contiennent une quantité définie d’un ion métallique fonctionnel.

Les enzymes activées par les métaux ne les fixent pas aussi étroitement que ne le font les
métalloenzymes, mais, néanmoins, elles requièrent l’addition de métaux pour leur activation.

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Cofacteurs et Coenzymes
3 – Les Ions métalliques
Les ions métalliques accomplissent de multiples fonctions dans la catalyse.

Ils peuvent participer à chacun des quatre mécanismes permettant aux enzymes d’accélérer la
vitesse des réactions chimiques (à part l’énergie d’activation):

1) Catalyse générale acide-base: transfert d’un proton dans l’état de transition.

2) Catalyse covalente: l’enzyme subit une transformation correspondante à une liaison


covalente (acylation, phosphorylation, …) et permettant des intermédiaires de plus bas
niveaux énergétiques.

3) Proximité des réactifs: augmenter la concentration efficace des réactifs.

4) Induction d’une (ou des) tension(s) dans l’enzyme ou le substrat: tension, distorsion
moléculaire et changement de forme.
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Cofacteurs et Coenzymes
3 – Les Ions métalliques
Mise à part le Fer et le Mn qui interviennent dans les protéines à hème,
les ions métalliques les plus fréquemment utilisés dans la catalyse enzymatique: le Mg2+, le Cu2+,
D’autres ions métalliques (comme K+) importants pour l’activité de certaines enzymes.

Eléménts Inorganiques servant de cofacteurs pour les Enzymes

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